data_7W2L
#
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_model_server_result.datetime_utc      '2025-07-08 13:18:16' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"XB","auth_seq_id":201}' 
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_entry.id    7W2L 
#
_exptl.entry_id    7W2L 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          48 
_entity.src_method                  syn 
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_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
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_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    45-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      45 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 48 YA N N 
? 48 IB N N 
? 48 KB N N 
? 48 RB N N 
? 48 VB N N 
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? 48 XB N N 
? 48 YB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 E SG CYS 11 F CYS 24 1_555 E SG CYS 45 F CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf2 T SG CYS 17 V CYS 18 1_555 T SG CYS 74 V CYS 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? 
disulf ? disulf3 T SG CYS 94 V CYS 95 1_555 T SG CYS 114 V CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
disulf ? disulf4 BA SG CYS 112 d CYS 113 1_555 BA SG CYS 124 d CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf5 FA SG CYS 32 h CYS 33 1_555 FA SG CYS 65 h CYS 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf6 FA SG CYS 42 h CYS 43 1_555 FA SG CYS 55 h CYS 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf7 RA SG CYS 69 v CYS 69 1_555 RA SG CYS 80 v CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
covale ? covale1 C SG CYS 31 C CYS 71 1_555 ZA S1 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? 
covale ? covale2 F CB SER 44 G SER 112 1_555 AB O1 8Q1 . G 8Q1 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.533 ? 
covale ? covale3 P C HIS 84 Q HIS 117 1_555 P N 2MR 85 Q 2MR 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale4 P C 2MR 85 Q 2MR 118 1_555 P N GLY 86 Q GLY 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale5 V CB SER 44 X SER 112 1_555 LB O1 8Q1 . X 8Q1 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.544 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 352 A CYS 379 1_555 TA FE4 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 355 A CYS 382 1_555 TA FE1 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 358 A CYS 385 1_555 TA FE3 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 398 A CYS 425 1_555 TA FE2 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc5 B SG CYS 77 B CYS 113 1_555 WA FE1 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc6 B SG CYS 80 B CYS 116 1_555 WA FE2 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc7 B SG CYS 83 B CYS 119 1_555 WA FE3 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc8 B SG CYS 87 B CYS 123 1_555 XA FE1 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 116 B CYS 152 1_555 XA FE2 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc10 B SG CYS 119 B CYS 155 1_555 XA FE4 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 122 B CYS 158 1_555 XA FE3 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 126 B CYS 162 1_555 WA FE4 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 31 C CYS 71 1_555 ZA FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 32 C CYS 72 1_555 ZA FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 96 C CYS 136 1_555 ZA FE4 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 126 C CYS 166 1_555 ZA FE1 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc17 ZA FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 P NE2 HIS 190 Q HIS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? 
metalc ? metalc18 L SG CYS 36 M CYS 64 1_555 FB FE2 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc19 L SG CYS 47 M CYS 75 1_555 FB FE2 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc20 L SG CYS 50 M CYS 78 1_555 FB FE1 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc21 L SG CYS 64 M CYS 92 1_555 FB FE1 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc22 L NE2 HIS 96 M HIS 124 1_555 DB FE3 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
metalc ? metalc23 L SG CYS 100 M CYS 128 1_555 DB FE2 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc24 L SG CYS 103 M CYS 131 1_555 DB FE1 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? 
metalc ? metalc25 L OE1 GLN 105 M GLN 133 1_555 GB MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc26 L SG CYS 109 M CYS 137 1_555 DB FE4 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc27 L SG CYS 148 M CYS 176 1_555 EB FE4 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc28 L SG CYS 151 M CYS 179 1_555 EB FE1 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc29 L SG CYS 154 M CYS 182 1_555 EB FE3 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc30 L SG CYS 198 M CYS 226 1_555 EB FE2 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc31 L O VAL 200 M VAL 228 1_555 GB MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? 
metalc ? metalc32 L O LEU 203 M LEU 231 1_555 GB MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? 
metalc ? metalc33 N SG CYS 103 O CYS 135 1_555 HB FE1 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc34 N SG CYS 108 O CYS 140 1_555 HB FE1 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc35 N SG CYS 144 O CYS 176 1_555 HB FE2 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc36 N SG CYS 148 O CYS 180 1_555 HB FE2 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc37 R SG CYS 59 T CYS 86 1_555 JB ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc38 R NE2 HIS 68 T HIS 95 1_555 JB ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc39 R SG CYS 84 T CYS 111 1_555 JB ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
#
_chem_comp.formula           'C41 H78 N O8 P' 
_chem_comp.formula_weight    744.034 
_chem_comp.id                PEE 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     DOPE 
#
_atom_sites.entry_id                     7W2L 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
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_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
TA 45 SF4 A 1 501 501 SF4 SF4 . 
UA 46 FMN A 1 502 502 FMN FMN . 
VA 47 NAI A 1 503 503 NAI NAI . 
WA 45 SF4 B 1 301 301 SF4 SF4 . 
XA 45 SF4 B 1 302 302 SF4 SF4 . 
YA 48 PEE B 1 303 401 PEE PEE . 
ZA 45 SF4 C 1 301 301 SF4 SF4 . 
AB 49 8Q1 G 1 201 201 8Q1 8Q1 . 
BB 50 CDL I 1 201 202 CDL CDL . 
CB 51 NDP J 1 401 401 NDP NDP . 
DB 45 SF4 M 1 801 801 SF4 SF4 . 
EB 45 SF4 M 1 802 802 SF4 SF4 . 
FB 52 FES M 1 803 803 FES FES . 
GB 53 MG M 1 804 805 MG MG . 
HB 52 FES O 1 301 301 FES FES . 
IB 48 PEE Q 1 501 718 PEE PEE . 
JB 54 ZN T 1 201 150 ZN ZN . 
KB 48 PEE U 1 101 101 PEE PEE . 
LB 49 8Q1 X 1 201 201 8Q1 8Q1 . 
MB 50 CDL a 1 201 201 CDL CDL . 
NB 55 PLX a 1 202 101 PLX PLX . 
OB 55 PLX g 1 201 705 PLX PLX . 
PB 50 CDL g 1 202 102 CDL CDL . 
QB 50 CDL i 1 401 401 CDL CDL . 
RB 48 PEE j 1 201 311 PEE PEE . 
SB 55 PLX j 1 202 203 PLX PLX . 
TB 50 CDL l 1 701 712 CDL CDL . 
UB 50 CDL l 1 702 713 CDL CDL . 
VB 48 PEE l 1 703 719 PEE PEE . 
WB 48 PEE l 1 704 720 PEE PEE . 
XB 48 PEE m 1 201 202 PEE PEE . 
YB 48 PEE r 1 501 202 PEE PEE . 
ZB 55 PLX r 1 502 201 PLX PLX . 
AC 50 CDL r 1 503 714 CDL CDL . 
BC 56 UQ s 1 401 403 UQ UQ . 
CC 57 ADP w 1 401 401 ADP ADP . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C27 PEE . . . XB 48 133.855 143.399 126.926 1 35.24 ? C27 PEE 201 m 1 
HETATM 2 C C26 PEE . . . XB 48 134.656 144.315 126.001 1 37.76 ? C26 PEE 201 m 1 
HETATM 3 C C25 PEE . . . XB 48 133.857 144.749 124.779 1 33.28 ? C25 PEE 201 m 1 
HETATM 4 C C24 PEE . . . XB 48 133.553 146.246 124.787 1 38.97 ? C24 PEE 201 m 1 
HETATM 5 C C23 PEE . . . XB 48 132.453 146.606 123.791 1 38.3 ? C23 PEE 201 m 1 
HETATM 6 C C22 PEE . . . XB 48 132.882 146.333 122.351 1 36.38 ? C22 PEE 201 m 1 
HETATM 7 C C21 PEE . . . XB 48 131.801 145.606 121.544 1 38.18 ? C21 PEE 201 m 1 
HETATM 8 C C20 PEE . . . XB 48 132.134 145.549 120.052 1 40.44 ? C20 PEE 201 m 1 
HETATM 9 C C19 PEE . . . XB 48 132.108 144.125 119.493 1 36.66 ? C19 PEE 201 m 1 
HETATM 10 C C18 PEE . . . XB 48 132.242 144.107 117.969 1 35.98 ? C18 PEE 201 m 1 
HETATM 11 C C17 PEE . . . XB 48 131.912 142.739 117.371 1 34.68 ? C17 PEE 201 m 1 
HETATM 12 C C16 PEE . . . XB 48 132.074 142.705 115.852 1 41.04 ? C16 PEE 201 m 1 
HETATM 13 C C15 PEE . . . XB 48 130.777 143.054 115.12 1 37.88 ? C15 PEE 201 m 1 
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HETATM 29 C C5 PEE . . . XB 48 132.699 133.453 107.411 1 39.47 ? C5 PEE 201 m 1 
HETATM 30 N N PEE . . . XB 48 131.809 132.707 106.54 1 24.04 ? N PEE 201 m 1 
HETATM 31 C C3 PEE . . . XB 48 132.731 136.868 113.375 1 35.13 ? C3 PEE 201 m 1 
HETATM 32 O O3 PEE . . . XB 48 132.828 135.707 114.153 1 32.29 ? O3 PEE 201 m 1 
HETATM 33 C C30 PEE . . . XB 48 133.585 135.825 115.326 1 36.78 ? C30 PEE 201 m 1 
HETATM 34 O O5 PEE . . . XB 48 134.402 135.007 115.573 1 44.16 ? O5 PEE 201 m 1 
HETATM 35 C C31 PEE . . . XB 48 133.364 136.982 116.304 1 28.85 ? C31 PEE 201 m 1 
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