data_7WAE
#
_model_server_result.job_id            yVg5QsuEtNtjCafikSYhgw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-27 22:27:13' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7wae 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":102}' 
#
_entry.id    7WAE 
#
_exptl.entry_id    7WAE 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              175.209 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ARGININE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7WAE 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7WAE 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    octameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      8 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 CA N N 
? 6 DA N N 
? 6 EA N N 
? 6 FA N N 
? 6 GA N N 
? 6 HA N N 
? 6 IA N N 
? 6 JA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 E CG ASP 3 J ASP 3 1_555 CA N ARG . J ARG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
covale ? covale2 E CG ASP 4 J ASP 5 1_555 DA N ARG . J ARG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale3 F CG ASP 3 K ASP 3 1_555 EA N ARG . K ARG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
covale ? covale4 F CG ASP 4 K ASP 5 1_555 FA N ARG . K ARG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale5 G CG ASP 3 L ASP 3 1_555 GA N ARG . L ARG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale6 G CG ASP 4 L ASP 5 1_555 HA N ARG . L ARG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale7 H CG ASP 3 M ASP 3 1_555 IA N ARG . M ARG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale8 H CG ASP 4 M ASP 5 1_555 JA N ARG . M ARG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLU 450 A GLU 450 1_555 I MG MG . A MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 450 A GLU 450 1_555 I MG MG . A MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc3 A OG1 THR 500 A THR 500 1_555 J MG MG . A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? 
metalc ? metalc4 A OG1 THR 522 A THR 522 1_555 J MG MG . A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
metalc ? metalc5 A OE2 GLU 558 A GLU 558 1_555 J MG MG . A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? 
metalc ? metalc6 I MG MG . A MG 1001 1_555 K O2G AGS . A AGS 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? 
metalc ? metalc7 J MG MG . A MG 1002 1_555 L O3G AGS . A AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc8 J MG MG . A MG 1002 1_555 L O2B AGS . A AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc9 J MG MG . A MG 1002 1_555 L O3A AGS . A AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.953 ? 
metalc ? metalc10 B OD2 ASP 431 B ASP 431 1_555 N MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc11 B OE1 GLU 450 B GLU 450 1_555 M MG MG . B MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc12 B OE2 GLU 450 B GLU 450 1_555 M MG MG . B MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? 
metalc ? metalc13 B OE2 GLU 450 B GLU 450 1_555 N MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc14 B OD1 ASN 452 B ASN 452 1_555 M MG MG . B MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? 
metalc ? metalc15 B OG1 THR 500 B THR 500 1_555 O MG MG . B MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
metalc ? metalc16 B OG1 THR 522 B THR 522 1_555 O MG MG . B MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc17 B OE2 GLU 558 B GLU 558 1_555 O MG MG . B MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? 
metalc ? metalc18 M MG MG . B MG 1001 1_555 P O2G AGS . B AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? 
metalc ? metalc19 O MG MG . B MG 1003 1_555 Q O2B AGS . B AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.009 ? 
metalc ? metalc20 O MG MG . B MG 1003 1_555 Q O3A AGS . B AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.975 ? 
metalc ? metalc21 O MG MG . B MG 1003 1_555 Q O3G AGS . B AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
metalc ? metalc22 C OD1 ASN 266 C ASN 266 1_555 R MG MG . C MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? 
metalc ? metalc23 C OE1 GLU 450 C GLU 450 1_555 R MG MG . C MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.851 ? 
metalc ? metalc24 C OE2 GLU 450 C GLU 450 1_555 R MG MG . C MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.859 ? 
metalc ? metalc25 C OE2 GLU 450 C GLU 450 1_555 S MG MG . C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? 
metalc ? metalc26 C OD1 ASN 452 C ASN 452 1_555 R MG MG . C MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? 
metalc ? metalc27 C OG1 THR 500 C THR 500 1_555 T MG MG . C MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? 
metalc ? metalc28 C OG1 THR 522 C THR 522 1_555 T MG MG . C MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc29 R MG MG . C MG 1001 1_555 U O2G AGS . C AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? 
metalc ? metalc30 S MG MG . C MG 1002 1_555 U O3G AGS . C AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc31 T MG MG . C MG 1003 1_555 V O3G AGS . C AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? 
metalc ? metalc32 T MG MG . C MG 1003 1_555 V O2B AGS . C AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
metalc ? metalc33 D OD1 ASN 266 D ASN 266 1_555 W MG MG . D MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc34 D OD2 ASP 431 D ASP 431 1_555 X MG MG . D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc35 D OE1 GLU 450 D GLU 450 1_555 W MG MG . D MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.888 ? 
metalc ? metalc36 D OE2 GLU 450 D GLU 450 1_555 W MG MG . D MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? 
metalc ? metalc37 D OE2 GLU 450 D GLU 450 1_555 X MG MG . D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc38 D OD1 ASN 452 D ASN 452 1_555 W MG MG . D MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc39 D OG1 THR 500 D THR 500 1_555 Y MG MG . D MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
metalc ? metalc40 D OG1 THR 522 D THR 522 1_555 Y MG MG . D MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
metalc ? metalc41 W MG MG . D MG 1001 1_555 Z O2G AGS . D AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? 
metalc ? metalc42 X MG MG . D MG 1002 1_555 Z O3G AGS . D AGS 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? 
metalc ? metalc43 Y MG MG . D MG 1003 1_555 AA O3G AGS . D AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc44 Y MG MG . D MG 1003 1_555 AA O2B AGS . D AGS 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H15 N4 O2 1' 
_chem_comp.formula_weight    175.209 
_chem_comp.id                ARG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     y 
_chem_comp.name              ARGININE 
_chem_comp.type              'l-peptide linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N CA ARG sing 62 n n 
N H ARG sing 63 n n 
N H2 ARG sing 64 n n 
CA C ARG sing 65 n n 
CA CB ARG sing 66 n n 
CA HA ARG sing 67 n n 
C O ARG doub 68 n n 
C OXT ARG sing 69 n n 
CB CG ARG sing 70 n n 
CB HB2 ARG sing 71 n n 
CB HB3 ARG sing 72 n n 
CG CD ARG sing 73 n n 
CG HG2 ARG sing 74 n n 
CG HG3 ARG sing 75 n n 
CD NE ARG sing 76 n n 
CD HD2 ARG sing 77 n n 
CD HD3 ARG sing 78 n n 
NE CZ ARG sing 79 n n 
NE HE ARG sing 80 n n 
CZ NH1 ARG sing 81 n n 
CZ NH2 ARG doub 82 n n 
NH1 HH11 ARG sing 83 n n 
NH1 HH12 ARG sing 84 n n 
NH2 HH21 ARG sing 85 n n 
NH2 HH22 ARG sing 86 n n 
OXT HXT ARG sing 87 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7WAE 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 3 MG A 1 1001 1 MG MG . 
J 3 MG A 1 1002 3 MG MG . 
K 4 AGS A 1 1003 4 AGS AGS . 
L 4 AGS A 1 1004 5 AGS AGS . 
M 3 MG B 1 1001 1 MG MG . 
N 3 MG B 1 1002 2 MG MG . 
O 3 MG B 1 1003 3 MG MG . 
P 4 AGS B 1 1004 4 AGS AGS . 
Q 4 AGS B 1 1005 5 AGS AGS . 
R 3 MG C 1 1001 1 MG MG . 
S 3 MG C 1 1002 2 MG MG . 
T 3 MG C 1 1003 3 MG MG . 
U 4 AGS C 1 1004 4 AGS AGS . 
V 4 AGS C 1 1005 5 AGS AGS . 
W 3 MG D 1 1001 1 MG MG . 
X 3 MG D 1 1002 2 MG MG . 
Y 3 MG D 1 1003 3 MG MG . 
Z 4 AGS D 1 1004 4 AGS AGS . 
AA 4 AGS D 1 1005 5 AGS AGS . 
BA 5 ASP D 1 1006 1 ASP ASP . 
CA 6 ARG J 1 101 6 ARG 7ID . 
DA 6 ARG J 1 102 6 ARG 7ID . 
EA 6 ARG K 1 101 6 ARG 7ID . 
FA 6 ARG K 1 102 6 ARG 7ID . 
GA 6 ARG L 1 101 6 ARG 7ID . 
HA 6 ARG L 1 102 6 ARG 7ID . 
IA 6 ARG M 1 101 6 ARG 7ID . 
JA 6 ARG M 1 102 6 ARG 7ID . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 N N ARG . . . DA 6 202.278 152.335 162.21 1 85.07 ? N ARG 102 J 1 
HETATM 2 C CA ARG . . . DA 6 202.398 151.553 163.449 1 85.07 ? CA ARG 102 J 1 
HETATM 3 C C ARG . . . DA 6 203.305 150.345 163.207 1 85.07 ? C ARG 102 J 1 
HETATM 4 O O ARG . . . DA 6 203.404 149.938 162.03 1 85.07 ? O ARG 102 J 1 
HETATM 5 C CB ARG . . . DA 6 201.014 151.072 163.887 1 85.07 ? CB ARG 102 J 1 
HETATM 6 C CG ARG . . . DA 6 201.098 150.499 165.302 1 85.07 ? CG ARG 102 J 1 
HETATM 7 C CD ARG . . . DA 6 200.069 151.192 166.197 1 85.07 ? CD ARG 102 J 1 
HETATM 8 N NE ARG . . . DA 6 200.746 151.78 167.361 1 85.07 ? NE ARG 102 J 1 
HETATM 9 C CZ ARG . . . DA 6 200.743 151.233 168.583 1 85.07 ? CZ ARG 102 J 1 
HETATM 10 N NH1 ARG . . . DA 6 201.387 151.839 169.59 1 85.07 ? NH1 ARG 102 J 1 
HETATM 11 N NH2 ARG . . . DA 6 200.097 150.08 168.799 1 85.07 ? NH2 ARG 102 J 1 
HETATM 12 O OXT ARG . . . DA 6 203.877 149.856 164.205 1 85.07 ? OXT ARG 102 J 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              30 
_model_server_stats.parse_time_ms           26 
_model_server_stats.create_model_time_ms    73 
_model_server_stats.query_time_ms           912 
_model_server_stats.encode_time_ms          17 
_model_server_stats.element_count           12 
#