data_7WYI
#
_model_server_result.job_id            YtyZebD75c7JtbVe0BvNPw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 13:40:55' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7wyi 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"DE","auth_seq_id":607}' 
#
_entry.id    7WYI 
#
_exptl.entry_id    7WYI 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              893.489 
_entity.id                          17 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLOROPHYLL A' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    155 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7WYI 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7WYI 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    pentadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      15 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 17 Q N N 
? 17 R N N 
? 17 S N N 
? 17 T N N 
? 17 U N N 
? 17 V N N 
? 17 W N N 
? 17 X N N 
? 17 Y N N 
? 17 Z N N 
? 17 AA N N 
? 17 BA N N 
? 17 CA N N 
? 17 DA N N 
? 17 EA N N 
? 17 FA N N 
? 17 GA N N 
? 17 HA N N 
? 17 IA N N 
? 17 JA N N 
? 17 KA N N 
? 17 LA N N 
? 17 MA N N 
? 17 NA N N 
? 17 OA N N 
? 17 PA N N 
? 17 QA N N 
? 17 RA N N 
? 17 SA N N 
? 17 TA N N 
? 17 UA N N 
? 17 VA N N 
? 17 WA N N 
? 17 XA N N 
? 17 YA N N 
? 17 ZA N N 
? 17 AB N N 
? 17 BB N N 
? 17 DB N N 
? 17 EB N N 
? 17 FB N N 
? 17 GB N N 
? 17 HB N N 
? 17 JB N N 
? 17 KB N N 
? 17 LB N N 
? 17 MB N N 
? 17 NB N N 
? 17 OB N N 
? 17 PB N N 
? 17 QB N N 
? 17 RB N N 
? 17 SB N N 
? 17 TB N N 
? 17 UB N N 
? 17 VB N N 
? 17 WB N N 
? 17 XB N N 
? 17 YB N N 
? 17 ZB N N 
? 17 AC N N 
? 17 BC N N 
? 17 CC N N 
? 17 DC N N 
? 17 EC N N 
? 17 FC N N 
? 17 GC N N 
? 17 HC N N 
? 17 IC N N 
? 17 JC N N 
? 17 KC N N 
? 17 LC N N 
? 17 MC N N 
? 17 NC N N 
? 17 OC N N 
? 17 PC N N 
? 17 QC N N 
? 17 RC N N 
? 17 SC N N 
? 17 WC N N 
? 17 XC N N 
? 17 YC N N 
? 17 ZC N N 
? 17 BD N N 
? 17 CD N N 
? 17 DD N N 
? 17 ED N N 
? 17 FD N N 
? 17 GD N N 
? 17 HD N N 
? 17 ID N N 
? 17 JD N N 
? 17 KD N N 
? 17 LD N N 
? 17 MD N N 
? 17 ND N N 
? 17 OD N N 
? 17 PD N N 
? 17 RD N N 
? 17 SD N N 
? 17 TD N N 
? 17 UD N N 
? 17 VD N N 
? 17 WD N N 
? 17 XD N N 
? 17 YD N N 
? 17 ZD N N 
? 17 AE N N 
? 17 BE N N 
? 17 DE N N 
? 17 EE N N 
? 17 FE N N 
? 17 GE N N 
? 17 HE N N 
? 17 IE N N 
? 17 JE N N 
? 17 KE N N 
? 17 LE N N 
? 17 ME N N 
? 17 NE N N 
? 17 OE N N 
? 17 PE N N 
? 17 RE N N 
? 17 SE N N 
? 17 TE N N 
? 17 UE N N 
? 17 VE N N 
? 17 WE N N 
? 17 XE N N 
? 17 YE N N 
? 17 AF N N 
? 17 BF N N 
? 17 CF N N 
? 17 DF N N 
? 17 EF N N 
? 17 FF N N 
? 17 GF N N 
? 17 HF N N 
? 17 IF N N 
? 17 KF N N 
? 17 LF N N 
? 17 MF N N 
? 17 NF N N 
? 17 OF N N 
? 17 PF N N 
? 17 QF N N 
? 17 SF N N 
? 17 TF N N 
? 17 UF N N 
? 17 VF N N 
? 17 WF N N 
? 17 XF N N 
? 17 BG N N 
? 17 CG N N 
? 17 DG N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O THR 498 A THR 498 1_555 WA MG CLA . A CLA 834 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.956 ? 
metalc ? metalc2 H O TRP 35 1 TRP 39 1_555 AD MG CHL . 1 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? 
metalc ? metalc3 J O TRP 33 7 TRP 33 1_555 XD MG CLA . 7 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? 
metalc ? metalc4 J O SER 237 7 SER 237 1_555 KE MG CLA . 7 CLA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? 
metalc ? metalc5 K O TRP 30 8 TRP 30 1_555 LE MG CLA . 8 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.852 ? 
metalc ? metalc6 K O SER 239 8 SER 239 1_555 YE MG CLA . 8 CLA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.868 ? 
metalc ? metalc7 L O TRP 39 Z TRP 39 1_555 ZE MG CHL . Z CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc8 N O TRP 35 5 TRP 35 1_555 GF MG CLA . 5 CLA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? 
metalc ? metalc9 O O TRP 32 6 TRP 32 1_555 UF MG CLA . 6 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? 
metalc ? metalc10 O O VAL 223 6 VAL 223 1_555 CG MG CLA . 6 CLA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? 
#
_chem_comp.formula           'C55 H72 Mg N4 O5' 
_chem_comp.formula_weight    893.489 
_chem_comp.id                CLA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLOROPHYLL A' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
MG NA CLA sing 359 n n 
MG NB CLA sing 360 n n 
MG NC CLA sing 361 n n 
MG ND CLA sing 362 n n 
CHA C1A CLA sing 363 n n 
CHA C4D CLA doub 364 n n 
CHA CBD CLA sing 365 n n 
CHB C4A CLA doub 366 n n 
CHB C1B CLA sing 367 n n 
CHB HHB CLA sing 368 n n 
CHC C4B CLA sing 369 n n 
CHC C1C CLA doub 370 n n 
CHC HHC CLA sing 371 n n 
CHD C4C CLA sing 372 n n 
CHD C1D CLA doub 373 n n 
CHD HHD CLA sing 374 n n 
NA C1A CLA doub 375 n n 
NA C4A CLA sing 376 n n 
C1A C2A CLA sing 377 n n 
C2A C3A CLA sing 378 n n 
C2A CAA CLA sing 379 n n 
C2A H2A CLA sing 380 n n 
C3A C4A CLA sing 381 n n 
C3A CMA CLA sing 382 n n 
C3A H3A CLA sing 383 n n 
CMA HMA1 CLA sing 384 n n 
CMA HMA2 CLA sing 385 n n 
CMA HMA3 CLA sing 386 n n 
CAA CBA CLA sing 387 n n 
CAA HAA1 CLA sing 388 n n 
CAA HAA2 CLA sing 389 n n 
CBA CGA CLA sing 390 n n 
CBA HBA1 CLA sing 391 n n 
CBA HBA2 CLA sing 392 n n 
CGA O1A CLA doub 393 n n 
CGA O2A CLA sing 394 n n 
O2A C1 CLA sing 395 n n 
NB C1B CLA sing 396 n y 
NB C4B CLA sing 397 n y 
C1B C2B CLA doub 398 n y 
C2B C3B CLA sing 399 n y 
C2B CMB CLA sing 400 n n 
C3B C4B CLA doub 401 n y 
C3B CAB CLA sing 402 n n 
CMB HMB1 CLA sing 403 n n 
CMB HMB2 CLA sing 404 n n 
CMB HMB3 CLA sing 405 n n 
CAB CBB CLA doub 406 n n 
CAB HAB CLA sing 407 n n 
CBB HBB1 CLA sing 408 n n 
CBB HBB2 CLA sing 409 n n 
NC C1C CLA sing 410 n n 
NC C4C CLA doub 411 n n 
C1C C2C CLA sing 412 n n 
C2C C3C CLA doub 413 n n 
C2C CMC CLA sing 414 n n 
C3C C4C CLA sing 415 n n 
C3C CAC CLA sing 416 n n 
CMC HMC1 CLA sing 417 n n 
CMC HMC2 CLA sing 418 n n 
CMC HMC3 CLA sing 419 n n 
CAC CBC CLA sing 420 n n 
CAC HAC1 CLA sing 421 n n 
CAC HAC2 CLA sing 422 n n 
CBC HBC1 CLA sing 423 n n 
CBC HBC2 CLA sing 424 n n 
CBC HBC3 CLA sing 425 n n 
ND C1D CLA sing 426 n n 
ND C4D CLA sing 427 n n 
C1D C2D CLA sing 428 n n 
C2D C3D CLA doub 429 n n 
C2D CMD CLA sing 430 n n 
C3D C4D CLA sing 431 n n 
C3D CAD CLA sing 432 n n 
CMD HMD1 CLA sing 433 n n 
CMD HMD2 CLA sing 434 n n 
CMD HMD3 CLA sing 435 n n 
CAD OBD CLA doub 436 n n 
CAD CBD CLA sing 437 n n 
CBD CGD CLA sing 438 n n 
CBD HBD CLA sing 439 n n 
CGD O1D CLA doub 440 n n 
CGD O2D CLA sing 441 n n 
O2D CED CLA sing 442 n n 
CED HED1 CLA sing 443 n n 
CED HED2 CLA sing 444 n n 
CED HED3 CLA sing 445 n n 
C1 C2 CLA sing 446 n n 
C1 H11 CLA sing 447 n n 
C1 H12 CLA sing 448 n n 
C2 C3 CLA doub 449 e n 
C2 H2 CLA sing 450 n n 
C3 C4 CLA sing 451 n n 
C3 C5 CLA sing 452 n n 
C4 H41 CLA sing 453 n n 
C4 H42 CLA sing 454 n n 
C4 H43 CLA sing 455 n n 
C5 C6 CLA sing 456 n n 
C5 H51 CLA sing 457 n n 
C5 H52 CLA sing 458 n n 
C6 C7 CLA sing 459 n n 
C6 H61 CLA sing 460 n n 
C6 H62 CLA sing 461 n n 
C7 C8 CLA sing 462 n n 
C7 H71 CLA sing 463 n n 
C7 H72 CLA sing 464 n n 
C8 C9 CLA sing 465 n n 
C8 C10 CLA sing 466 n n 
C8 H8 CLA sing 467 n n 
C9 H91 CLA sing 468 n n 
C9 H92 CLA sing 469 n n 
C9 H93 CLA sing 470 n n 
C10 C11 CLA sing 471 n n 
C10 H101 CLA sing 472 n n 
C10 H102 CLA sing 473 n n 
C11 C12 CLA sing 474 n n 
C11 H111 CLA sing 475 n n 
C11 H112 CLA sing 476 n n 
C12 C13 CLA sing 477 n n 
C12 H121 CLA sing 478 n n 
C12 H122 CLA sing 479 n n 
C13 C14 CLA sing 480 n n 
C13 C15 CLA sing 481 n n 
C13 H13 CLA sing 482 n n 
C14 H141 CLA sing 483 n n 
C14 H142 CLA sing 484 n n 
C14 H143 CLA sing 485 n n 
C15 C16 CLA sing 486 n n 
C15 H151 CLA sing 487 n n 
C15 H152 CLA sing 488 n n 
C16 C17 CLA sing 489 n n 
C16 H161 CLA sing 490 n n 
C16 H162 CLA sing 491 n n 
C17 C18 CLA sing 492 n n 
C17 H171 CLA sing 493 n n 
C17 H172 CLA sing 494 n n 
C18 C19 CLA sing 495 n n 
C18 C20 CLA sing 496 n n 
C18 H18 CLA sing 497 n n 
C19 H191 CLA sing 498 n n 
C19 H192 CLA sing 499 n n 
C19 H193 CLA sing 500 n n 
C20 H201 CLA sing 501 n n 
C20 H202 CLA sing 502 n n 
C20 H203 CLA sing 503 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7WYI 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
P 16 CL0 A 1 801 801 CL0 CL0 . 
Q 17 CLA A 1 802 802 CLA CLA . 
R 17 CLA A 1 803 803 CLA CLA . 
S 17 CLA A 1 804 804 CLA CLA . 
T 17 CLA A 1 805 805 CLA CLA . 
U 17 CLA A 1 806 806 CLA CLA . 
V 17 CLA A 1 807 807 CLA CLA . 
W 17 CLA A 1 808 808 CLA CLA . 
X 17 CLA A 1 809 809 CLA CLA . 
Y 17 CLA A 1 810 810 CLA CLA . 
Z 17 CLA A 1 811 811 CLA CLA . 
AA 17 CLA A 1 812 812 CLA CLA . 
BA 17 CLA A 1 813 813 CLA CLA . 
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DA 17 CLA A 1 815 815 CLA CLA . 
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