data_7X8X
#
_model_server_result.job_id            pO5WK6uL5VVtYcg7s_qdkA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-20 12:37:43' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7x8x 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"RB","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    7X8X 
#
_exptl.entry_id    7X8X 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              583.653 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            4-[1-[3-[4-[(4-fluoranyl-2-methyl-1H-indol-5-yl)oxy]-6-methoxy-quinazolin-7-yl]oxypropyl]piperidin-4-yl]benzamide 
_entity.pdbx_number_of_molecules    14 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          95.02 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7X8X 
_cell.length_a            207.51 
_cell.length_b            182.5 
_cell.length_c            188.7 
_cell.Z_PDB               112 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7X8X 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    'C 2y' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? 28-meric 28 author_defined_assembly 1 
? 28-meric 28 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,W,Y,AA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,EB,GB,HB,KB,MB,OB,QB 1 1 
B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X,Z,BA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,FB,IB,JB,LB,NB,PB,RB 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 EB N N 
? 4 FB N N 
? 4 GB N N 
? 4 HB N N 
? 4 IB N N 
? 4 JB N N 
? 4 KB N N 
? 4 LB N N 
? 4 MB N N 
? 4 NB N N 
? 4 OB N N 
? 4 PB N N 
? 4 QB N N 
? 4 RB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 CA C BEZ 1 c BEZ 1 1_555 CA N LEU 2 c LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? 
covale ? covale2 DA C BEZ 1 e BEZ 1 1_555 DA N LEU 2 e LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? 
covale ? covale3 EA C BEZ 1 f BEZ 1 1_555 EA N LEU 2 f LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
covale ? covale4 FA C BEZ 1 g BEZ 1 1_555 FA N LEU 2 g LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? 
covale ? covale5 GA C BEZ 1 h BEZ 1 1_555 GA N LEU 2 h LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? 
covale ? covale6 HA C BEZ 1 i BEZ 1 1_555 HA N LEU 2 i LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? 
covale ? covale7 IA C BEZ 1 j BEZ 1 1_555 IA N LEU 2 j LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? 
covale ? covale8 JA C BEZ 1 k BEZ 1 1_555 JA N LEU 2 k LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? 
covale ? covale9 KA C BEZ 1 l BEZ 1 1_555 KA N LEU 2 l LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? 
covale ? covale10 LA C BEZ 1 m BEZ 1 1_555 LA N LEU 2 m LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? 
covale ? covale11 MA C BEZ 1 n BEZ 1 1_555 MA N LEU 2 n LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? 
covale ? covale12 NA C BEZ 1 o BEZ 1 1_555 NA N LEU 2 o LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? 
covale ? covale13 OA C BEZ 1 p BEZ 1 1_555 OA N LEU 2 p LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? 
covale ? covale14 PA C BEZ 1 q BEZ 1 1_555 PA N LEU 2 q LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? 
covale ? covale15 QA C BEZ 1 r BEZ 1 1_555 QA N LEU 2 r LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? 
covale ? covale16 RA C BEZ 1 s BEZ 1 1_555 RA N LEU 2 s LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? 
covale ? covale17 SA C BEZ 1 t BEZ 1 1_555 SA N LEU 2 t LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? 
covale ? covale18 TA C BEZ 1 u BEZ 1 1_555 TA N LEU 2 u LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? 
covale ? covale19 UA C BEZ 1 v BEZ 1 1_555 UA N LEU 2 v LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? 
covale ? covale20 VA C BEZ 1 w BEZ 1 1_555 VA N LEU 2 w LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? 
covale ? covale21 WA C BEZ 1 x BEZ 1 1_555 WA N LEU 2 x LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? 
covale ? covale22 XA C BEZ 1 y BEZ 1 1_555 XA N LEU 2 y LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? 
covale ? covale23 YA C BEZ 1 z BEZ 1 1_555 YA N LEU 2 z LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? 
covale ? covale24 ZA C BEZ 1 0 BEZ 1 1_555 ZA N LEU 2 0 LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? 
covale ? covale25 AB C BEZ 1 1 BEZ 1 1_555 AB N LEU 2 1 LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale26 BB C BEZ 1 2 BEZ 1 1_555 BB N LEU 2 2 LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? 
covale ? covale27 CB C BEZ 1 3 BEZ 1 1_555 CB N LEU 2 3 LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? 
covale ? covale28 DB C BEZ 1 4 BEZ 1 1_555 DB N LEU 2 4 LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? 
#
_chem_comp.formula           'C33 H34 F N5 O4' 
_chem_comp.formula_weight    583.653 
_chem_comp.id                AI4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              4-[1-[3-[4-[(4-fluoranyl-2-methyl-1H-indol-5-yl)oxy]-6-methoxy-quinazolin-7-yl]oxypropyl]piperidin-4-yl]benzamide 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C27 N28 AI4 sing 1 n n 
C27 C26 AI4 sing 2 n n 
C33 N28 AI4 sing 3 n n 
C33 C32 AI4 sing 4 n n 
N28 C30 AI4 sing 5 n n 
C32 C34 AI4 sing 6 n n 
C26 C25 AI4 sing 7 n n 
C30 C31 AI4 sing 8 n n 
C34 C31 AI4 sing 9 n n 
C34 C35 AI4 sing 10 n n 
C25 O11 AI4 sing 11 n n 
C36 C35 AI4 doub 12 n y 
C36 C37 AI4 sing 13 n y 
C35 C40 AI4 sing 14 n y 
C37 C38 AI4 doub 15 n y 
O11 C02 AI4 sing 16 n n 
C40 C39 AI4 doub 17 n y 
O12 C01 AI4 sing 18 n n 
O12 C29 AI4 sing 19 n n 
C38 C39 AI4 sing 20 n y 
C38 C41 AI4 sing 21 n n 
C02 C01 AI4 doub 22 n y 
C02 C03 AI4 sing 23 n y 
O43 C41 AI4 doub 24 n n 
C01 C06 AI4 sing 25 n y 
C41 N42 AI4 sing 26 n n 
C03 C04 AI4 doub 27 n y 
C06 C05 AI4 doub 28 n y 
C04 C05 AI4 sing 29 n y 
C04 N07 AI4 sing 30 n y 
C05 C10 AI4 sing 31 n y 
N07 C08 AI4 doub 32 n y 
C10 O13 AI4 sing 33 n n 
C10 N09 AI4 doub 34 n y 
C08 N09 AI4 sing 35 n y 
O13 C14 AI4 sing 36 n n 
C14 C19 AI4 sing 37 n y 
C14 C15 AI4 doub 38 n y 
C19 C18 AI4 doub 39 n y 
F23 C15 AI4 sing 40 n n 
C18 C17 AI4 sing 41 n y 
C15 C16 AI4 sing 42 n y 
C17 C16 AI4 doub 43 n y 
C17 N22 AI4 sing 44 n y 
C16 C20 AI4 sing 45 n y 
N22 C21 AI4 sing 46 n y 
C20 C21 AI4 doub 47 n y 
C21 C24 AI4 sing 48 n n 
C20 H201 AI4 sing 49 n n 
C24 H242 AI4 sing 50 n n 
C24 H241 AI4 sing 51 n n 
C24 H243 AI4 sing 52 n n 
C26 H261 AI4 sing 53 n n 
C26 H262 AI4 sing 54 n n 
C03 H031 AI4 sing 55 n n 
C06 H061 AI4 sing 56 n n 
C08 H081 AI4 sing 57 n n 
C18 H181 AI4 sing 58 n n 
C19 H191 AI4 sing 59 n n 
C25 H252 AI4 sing 60 n n 
C25 H251 AI4 sing 61 n n 
C27 H271 AI4 sing 62 n n 
C27 H272 AI4 sing 63 n n 
C29 H292 AI4 sing 64 n n 
C29 H291 AI4 sing 65 n n 
C29 H293 AI4 sing 66 n n 
C30 H301 AI4 sing 67 n n 
C31 H311 AI4 sing 68 n n 
C32 H321 AI4 sing 69 n n 
C33 H331 AI4 sing 70 n n 
C36 H361 AI4 sing 71 n n 
C37 H371 AI4 sing 72 n n 
C39 H391 AI4 sing 73 n n 
C40 H401 AI4 sing 74 n n 
N22 H1 AI4 sing 75 n n 
N42 H421 AI4 sing 76 n n 
N42 H422 AI4 sing 77 n n 
C30 H2 AI4 sing 78 n n 
C31 H3 AI4 sing 79 n n 
C32 H4 AI4 sing 80 n n 
C33 H5 AI4 sing 81 n n 
C34 H6 AI4 sing 82 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7X8X 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.004819 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000423 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.005479 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00532 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
EB 4 AI4 B 1 201 8 AI4 LIG . 
FB 4 AI4 R 1 201 4 AI4 LIG . 
GB 4 AI4 F 1 301 11 AI4 LIG . 
HB 4 AI4 I 1 201 9 AI4 LIG . 
IB 4 AI4 U 1 201 2 AI4 LIG . 
JB 4 AI4 V 1 301 1 AI4 LIG . 
KB 4 AI4 K 1 201 12 AI4 LIG . 
LB 4 AI4 W 1 201 5 AI4 LIG . 
MB 4 AI4 M 1 201 10 AI4 LIG . 
NB 4 AI4 Y 1 201 3 AI4 LIG . 
OB 4 AI4 N 1 301 301 AI4 LIG . 
PB 4 AI4 Z 1 201 7 AI4 LIG . 
QB 4 AI4 G 1 201 201 AI4 LIG . 
RB 4 AI4 b 1 201 6 AI4 LIG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C10 AI4 . . . RB 4 71.756 7.674 -12.842 1 121.46 ? C10 AI4 201 b 1 
HETATM 2 C C15 AI4 . . . RB 4 74.15 6.514 -14.603 1 113.89 ? C15 AI4 201 b 1 
HETATM 3 C C17 AI4 . . . RB 4 76.554 6.871 -14.953 1 115.88 ? C17 AI4 201 b 1 
HETATM 4 C C20 AI4 . . . RB 4 75.512 5.933 -16.748 1 117.05 ? C20 AI4 201 b 1 
HETATM 5 C C21 AI4 . . . RB 4 76.873 6.097 -17.025 1 114.03 ? C21 AI4 201 b 1 
HETATM 6 C C24 AI4 . . . RB 4 77.61 5.742 -18.327 1 118.67 ? C24 AI4 201 b 1 
HETATM 7 C C26 AI4 . . . RB 4 65.318 7.871 -7.977 1 153.91 ? C26 AI4 201 b 1 
HETATM 8 C C01 AI4 . . . RB 4 69.353 6.31 -10.115 1 118.09 ? C01 AI4 201 b 1 
HETATM 9 C C02 AI4 . . . RB 4 68.113 6.874 -10.568 1 118.6 ? C02 AI4 201 b 1 
HETATM 10 C C03 AI4 . . . RB 4 68.104 7.676 -11.724 1 119.04 ? C03 AI4 201 b 1 
HETATM 11 C C04 AI4 . . . RB 4 69.339 7.93 -12.472 1 118.94 ? C04 AI4 201 b 1 
HETATM 12 C C05 AI4 . . . RB 4 70.546 7.382 -12.041 1 125.48 ? C05 AI4 201 b 1 
HETATM 13 C C06 AI4 . . . RB 4 70.556 6.56 -10.833 1 120.67 ? C06 AI4 201 b 1 
HETATM 14 C C08 AI4 . . . RB 4 70.428 8.952 -14.314 1 108.69 ? C08 AI4 201 b 1 
HETATM 15 C C14 AI4 . . . RB 4 74.225 7.076 -13.328 1 114.19 ? C14 AI4 201 b 1 
HETATM 16 C C16 AI4 . . . RB 4 75.329 6.43 -15.411 1 118.9 ? C16 AI4 201 b 1 
HETATM 17 C C18 AI4 . . . RB 4 76.676 7.419 -13.642 1 107.23 ? C18 AI4 201 b 1 
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