data_7XOB # _model_server_result.job_id ga-Q9BiuEzSRySqOWE4Czw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:23:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7xob # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"PA","auth_seq_id":901}' # _entry.id 7XOB # _exptl.entry_id 7XOB _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 BA N N ? 4 PA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 128 A CYS 131 1_555 A SG CYS 163 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 288 A CYS 291 1_555 A SG CYS 298 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 333 A CYS 336 1_555 A SG CYS 358 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 376 A CYS 379 1_555 A SG CYS 429 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 388 A CYS 391 1_555 A SG CYS 522 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 477 A CYS 480 1_555 A SG CYS 485 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 535 A CYS 538 1_555 A SG CYS 587 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 614 A CYS 617 1_555 A SG CYS 646 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 659 A CYS 662 1_555 A SG CYS 668 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 735 A CYS 738 1_555 A SG CYS 757 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 740 A CYS 743 1_555 A SG CYS 746 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1029 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1040 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1079 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1123 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 288 B CYS 291 1_555 B SG CYS 298 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 376 B CYS 379 1_555 B SG CYS 429 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 477 B CYS 480 1_555 B SG CYS 485 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 614 B CYS 617 1_555 B SG CYS 646 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 659 B CYS 662 1_555 B SG CYS 668 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 1029 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1040 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 1079 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1123 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 133 D CYS 133 1_555 C SG CYS 141 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 344 D CYS 344 1_555 C SG CYS 361 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 530 D CYS 530 1_555 C SG CYS 542 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 128 C CYS 131 1_555 D SG CYS 163 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 288 C CYS 291 1_555 D SG CYS 298 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 333 C CYS 336 1_555 D SG CYS 358 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 376 C CYS 379 1_555 D SG CYS 429 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 388 C CYS 391 1_555 D SG CYS 522 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 477 C CYS 480 1_555 D SG CYS 485 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 535 C CYS 538 1_555 D SG CYS 587 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 614 C CYS 617 1_555 D SG CYS 646 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf32 D SG CYS 659 C CYS 662 1_555 D SG CYS 668 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 D SG CYS 735 C CYS 738 1_555 D SG CYS 757 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 740 C CYS 743 1_555 D SG CYS 746 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 D SG CYS 1029 C CYS 1032 1_555 D SG CYS 1040 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 1079 C CYS 1082 1_555 D SG CYS 1123 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 E SG CYS 133 E CYS 133 1_555 E SG CYS 141 E CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf38 E SG CYS 344 E CYS 344 1_555 E SG CYS 361 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 E SG CYS 530 E CYS 530 1_555 E SG CYS 542 E CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 A ASN 61 1_555 M C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 119 A ASN 122 1_555 N C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 328 A ASN 331 1_555 P C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 600 A ASN 603 1_555 K C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 613 A ASN 616 1_555 J C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 654 A ASN 657 1_555 O C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 706 A ASN 709 1_555 I C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 798 A ASN 801 1_555 H C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 1071 A ASN 1074 1_555 F C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 1095 A ASN 1098 1_555 G C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 1131 A ASN 1134 1_555 L C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 58 B ASN 61 1_555 X C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 119 B ASN 122 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 328 B ASN 331 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 600 B ASN 603 1_555 R C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 613 B ASN 616 1_555 V C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 654 B ASN 657 1_555 Q C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 706 B ASN 709 1_555 U C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 798 B ASN 801 1_555 T C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 1071 B ASN 1074 1_555 S C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 1095 B ASN 1098 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 1131 B ASN 1134 1_555 W C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 53 D ASN 53 1_555 DA C1 NAG . D NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 546 D ASN 546 1_555 CA C1 NAG . D NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 58 C ASN 61 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 119 C ASN 122 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 328 C ASN 331 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 600 C ASN 603 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 613 C ASN 616 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 654 C ASN 657 1_555 IA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale31 D ND2 ASN 706 C ASN 709 1_555 HA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale32 D ND2 ASN 798 C ASN 801 1_555 GA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale33 D ND2 ASN 1071 C ASN 1074 1_555 EA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale34 D ND2 ASN 1095 C ASN 1098 1_555 FA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale35 D ND2 ASN 1131 C ASN 1134 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 53 E ASN 53 1_555 RA C1 NAG . E NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 546 E ASN 546 1_555 QA C1 NAG . E NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7XOB _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 3 NAG A 1 1301 1316 NAG NAG . G 3 NAG A 1 1302 1317 NAG NAG . H 3 NAG A 1 1303 1318 NAG NAG . I 3 NAG A 1 1304 1319 NAG NAG . J 3 NAG A 1 1305 1321 NAG NAG . K 3 NAG A 1 1306 1322 NAG NAG . L 3 NAG A 1 1307 1323 NAG NAG . M 3 NAG A 1 1308 1324 NAG NAG . N 3 NAG A 1 1309 1325 NAG NAG . O 3 NAG A 1 1310 1327 NAG NAG . P 3 NAG A 1 1311 1328 NAG NAG . Q 3 NAG B 1 1301 1316 NAG NAG . R 3 NAG B 1 1302 1317 NAG NAG . S 3 NAG B 1 1303 1318 NAG NAG . T 3 NAG B 1 1304 1320 NAG NAG . U 3 NAG B 1 1305 1321 NAG NAG . V 3 NAG B 1 1306 1322 NAG NAG . W 3 NAG B 1 1307 1323 NAG NAG . X 3 NAG B 1 1308 1324 NAG NAG . Y 3 NAG B 1 1309 1325 NAG NAG . Z 3 NAG B 1 1310 1326 NAG NAG . AA 3 NAG B 1 1311 1327 NAG NAG . BA 4 ZN D 1 901 801 ZN ZN . CA 3 NAG D 1 902 805 NAG NAG . DA 3 NAG D 1 903 806 NAG NAG . EA 3 NAG C 1 1301 1316 NAG NAG . FA 3 NAG C 1 1302 1317 NAG NAG . GA 3 NAG C 1 1303 1318 NAG NAG . HA 3 NAG C 1 1304 1319 NAG NAG . IA 3 NAG C 1 1305 1320 NAG NAG . JA 3 NAG C 1 1306 1321 NAG NAG . KA 3 NAG C 1 1307 1322 NAG NAG . LA 3 NAG C 1 1308 1323 NAG NAG . MA 3 NAG C 1 1309 1324 NAG NAG . NA 3 NAG C 1 1310 1325 NAG NAG . OA 3 NAG C 1 1311 1326 NAG NAG . PA 4 ZN E 1 901 801 ZN ZN . QA 3 NAG E 1 902 805 NAG NAG . RA 3 NAG E 1 903 806 NAG NAG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id PA _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 252.836 _atom_site.Cartn_y 208.577 _atom_site.Cartn_z 269.597 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 95.15 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 901 _atom_site.auth_asym_id E _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 23 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 40 _model_server_stats.query_time_ms 315 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 1 #