data_7Y20 # _model_server_result.job_id DywltJesQsE63hWxs4cLOg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:14:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7y20 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"VA","auth_seq_id":1402}' # _entry.id 7Y20 # _exptl.entry_id 7Y20 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 27 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7Y20 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7Y20 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 MA N N ? 4 NA N N ? 4 OA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N ? 4 ZA N N ? 4 AB N N ? 4 BB N N ? 4 CB N N ? 4 DB N N ? 4 EB N N ? 4 FB N N ? 4 GB N N ? 4 HB N N ? 4 IB N N ? 4 JB N N ? 4 KB N N ? 4 LB N N ? 4 MB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n F NAG 1 E 1 NAG A 1406 NAG 3 n F NAG 2 E 2 NAG A 1407 NAG 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 1408 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 1409 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 1413 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 1414 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 1415 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 1416 NAG 3 n J NAG 1 J 1 NAG A 1417 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG A 1418 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG A 1419 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG A 1420 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG A 1421 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG A 1422 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG A 1423 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG A 1424 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG B 1406 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG B 1407 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG B 1408 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG B 1409 NAG 3 n P NAG 1 P 1 NAG B 1414 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG B 1415 NAG 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1416 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1417 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG B 1418 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG B 1419 NAG 3 n S NAG 1 S 1 NAG B 1420 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG B 1421 NAG 3 n T NAG 1 T 1 NAG B 1422 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG B 1423 NAG 3 n U NAG 1 U 1 NAG C 1406 NAG 3 n U NAG 2 U 2 NAG C 1407 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG C 1408 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG C 1409 NAG 3 n W NAG 1 W 1 NAG C 1413 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG C 1414 NAG 3 n X NAG 1 X 1 NAG C 1415 NAG 3 n X NAG 2 X 2 NAG C 1416 NAG 3 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 1417 NAG 3 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 1418 NAG 3 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1419 NAG 3 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1420 NAG 3 n AA NAG 1 a 1 NAG C 1421 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG C 1422 NAG 3 n BA NAG 1 b 1 NAG C 1423 NAG 3 n BA NAG 2 b 2 NAG C 1424 NAG 3 n CA NAG 1 c 1 NAG D 901 NAG 3 n CA NAG 2 c 2 NAG D 902 NAG 3 n DA NAG 1 d 1 NAG D 903 NAG 3 n DA NAG 2 d 2 NAG D 904 NAG 3 n EA NAG 1 e 1 NAG D 905 NAG 3 n EA NAG 2 e 2 NAG D 906 NAG 3 n FA NAG 1 f 1 NAG D 908 NAG 3 n FA NAG 2 f 2 NAG D 909 NAG 3 n GA NAG 1 g 1 NAG D 910 NAG 3 n GA NAG 2 g 2 NAG D 911 NAG 3 n HA NAG 1 h 1 NAG F 901 NAG 3 n HA NAG 2 h 2 NAG F 902 NAG 3 n IA NAG 1 i 1 NAG F 903 NAG 3 n IA NAG 2 i 2 NAG F 904 NAG 3 n JA NAG 1 j 1 NAG F 905 NAG 3 n JA NAG 2 j 2 NAG F 906 NAG 3 n KA NAG 1 k 1 NAG F 908 NAG 3 n KA NAG 2 k 2 NAG F 909 NAG 3 n LA NAG 1 l 1 NAG F 910 NAG 3 n LA NAG 2 l 2 NAG F 911 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 129 A CYS 131 1_555 A SG CYS 161 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 285 A CYS 291 1_555 A SG CYS 295 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.968 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 330 A CYS 336 1_555 A SG CYS 355 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.85 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 373 A CYS 379 1_555 A SG CYS 426 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 385 A CYS 391 1_555 A SG CYS 519 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.843 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 474 A CYS 480 1_555 A SG CYS 482 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 532 A CYS 538 1_555 A SG CYS 584 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 611 A CYS 617 1_555 A SG CYS 643 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 656 A CYS 662 1_555 A SG CYS 665 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 732 A CYS 738 1_555 A SG CYS 754 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 737 A CYS 743 1_555 A SG CYS 743 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1026 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1037 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1076 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1120 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 129 B CYS 131 1_555 B SG CYS 161 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 285 B CYS 291 1_555 B SG CYS 295 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 330 B CYS 336 1_555 B SG CYS 355 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 373 B CYS 379 1_555 B SG CYS 426 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 385 B CYS 391 1_555 B SG CYS 519 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 532 B CYS 538 1_555 B SG CYS 584 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 611 B CYS 617 1_555 B SG CYS 643 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 656 B CYS 662 1_555 B SG CYS 665 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 732 B CYS 738 1_555 B SG CYS 754 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 737 B CYS 743 1_555 B SG CYS 743 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1026 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1037 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1076 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1120 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 129 C CYS 131 1_555 C SG CYS 161 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 285 C CYS 291 1_555 C SG CYS 295 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.863 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 330 C CYS 336 1_555 C SG CYS 355 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 373 C CYS 379 1_555 C SG CYS 426 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 385 C CYS 391 1_555 C SG CYS 519 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 474 C CYS 480 1_555 C SG CYS 482 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 532 C CYS 538 1_555 C SG CYS 584 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 611 C CYS 617 1_555 C SG CYS 643 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 656 C CYS 662 1_555 C SG CYS 665 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 732 C CYS 738 1_555 C SG CYS 754 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 737 C CYS 743 1_555 C SG CYS 743 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 1026 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1037 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1076 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1120 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? disulf ? disulf39 D SG CYS 134 D CYS 133 1_555 D SG CYS 142 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 345 D CYS 344 1_555 D SG CYS 362 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 531 D CYS 530 1_555 D SG CYS 543 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf42 E SG CYS 134 F CYS 133 1_555 E SG CYS 142 F CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 345 F CYS 344 1_555 E SG CYS 362 F CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 531 F CYS 530 1_555 E SG CYS 543 F CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 120 A ASN 122 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 160 A ASN 165 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 228 A ASN 234 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 276 A ASN 282 1_555 QA C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 325 A ASN 331 1_555 F C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 337 A ASN 343 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 597 A ASN 603 1_555 RA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 610 A ASN 616 1_555 SA C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 651 A ASN 657 1_555 TA C1 NAG . A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 703 A ASN 709 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 711 A ASN 717 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 795 A ASN 801 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1068 A ASN 1074 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1092 A ASN 1098 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1128 A ASN 1134 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.556 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 120 B ASN 122 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 160 B ASN 165 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 228 B ASN 234 1_555 XA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 276 B ASN 282 1_555 YA C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 325 B ASN 331 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 337 B ASN 343 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.593 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 597 B ASN 603 1_555 ZA C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 610 B ASN 616 1_555 AB C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 651 B ASN 657 1_555 BB C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 703 B ASN 709 1_555 CB C1 NAG . B NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 711 B ASN 717 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 795 B ASN 801 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 1068 B ASN 1074 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 1092 B ASN 1098 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 1128 B ASN 1134 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 61 C ASN 61 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 120 C ASN 122 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 160 C ASN 165 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 228 C ASN 234 1_555 GB C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 276 C ASN 282 1_555 HB C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 325 C ASN 331 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 337 C ASN 343 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 597 C ASN 603 1_555 IB C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 610 C ASN 616 1_555 JB C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 651 C ASN 657 1_555 KB C1 NAG . C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 703 C ASN 709 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 711 C ASN 717 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 795 C ASN 801 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 1068 C ASN 1074 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 1092 C ASN 1098 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 1128 C ASN 1134 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale49 D ND2 ASN 54 D ASN 53 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale50 D ND2 ASN 91 D ASN 90 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale51 D ND2 ASN 104 D ASN 103 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale52 D ND2 ASN 323 D ASN 322 1_555 LB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale53 D ND2 ASN 433 D ASN 432 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale54 D ND2 ASN 547 D ASN 546 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale55 E ND2 ASN 54 F ASN 53 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale56 E ND2 ASN 91 F ASN 90 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale57 E ND2 ASN 104 F ASN 103 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale58 E ND2 ASN 323 F ASN 322 1_555 MB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale59 E ND2 ASN 433 F ASN 432 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale60 E ND2 ASN 547 F ASN 546 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale61 F O4 NAG . E NAG 1 1_555 F C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale62 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale64 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale65 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale66 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale67 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale68 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale69 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale70 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale71 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale72 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale73 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale74 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale75 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale76 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale77 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale78 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale79 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale80 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale81 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale82 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale83 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale84 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale85 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale86 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale87 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale88 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale89 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale90 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale91 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale92 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale93 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7Y20 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code MA 4 NAG A 1 1401 1401 NAG NAG . NA 4 NAG A 1 1402 1402 NAG NAG . OA 4 NAG A 1 1403 1403 NAG NAG . PA 4 NAG A 1 1404 1404 NAG NAG . QA 4 NAG A 1 1405 1405 NAG NAG . RA 4 NAG A 1 1406 1410 NAG NAG . SA 4 NAG A 1 1407 1411 NAG NAG . TA 4 NAG A 1 1408 1412 NAG NAG . UA 4 NAG B 1 1401 1401 NAG NAG . VA 4 NAG B 1 1402 1402 NAG NAG . WA 4 NAG B 1 1403 1403 NAG NAG . XA 4 NAG B 1 1404 1404 NAG NAG . YA 4 NAG B 1 1405 1405 NAG NAG . ZA 4 NAG B 1 1406 1410 NAG NAG . AB 4 NAG B 1 1407 1411 NAG NAG . BB 4 NAG B 1 1408 1412 NAG NAG . CB 4 NAG B 1 1409 1413 NAG NAG . DB 4 NAG C 1 1401 1401 NAG NAG . EB 4 NAG C 1 1402 1402 NAG NAG . FB 4 NAG C 1 1403 1403 NAG NAG . GB 4 NAG C 1 1404 1404 NAG NAG . HB 4 NAG C 1 1405 1405 NAG NAG . IB 4 NAG C 1 1406 1410 NAG NAG . JB 4 NAG C 1 1407 1411 NAG NAG . KB 4 NAG C 1 1408 1412 NAG NAG . LB 4 NAG D 1 701 907 NAG NAG . MB 4 NAG F 1 701 907 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . VA 4 182.561 222.499 140.218 1 67.9 ? C1 NAG 1402 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . VA 4 182.4 223.894 139.632 1 67.9 ? C2 NAG 1402 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . VA 4 181.406 223.857 138.482 1 67.9 ? C3 NAG 1402 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . VA 4 181.863 222.851 137.434 1 67.9 ? C4 NAG 1402 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . VA 4 182.129 221.486 138.067 1 67.9 ? C5 NAG 1402 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . VA 4 182.771 220.523 137.099 1 67.9 ? C6 NAG 1402 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . VA 4 182.735 225.947 140.912 1 67.9 ? C7 NAG 1402 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . VA 4 182.19 226.869 141.956 1 67.9 ? C8 NAG 1402 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . VA 4 181.991 224.872 140.626 1 67.9 ? N2 NAG 1402 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . VA 4 181.302 225.147 137.892 1 67.9 ? O3 NAG 1402 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . VA 4 180.86 222.706 136.435 1 67.9 ? O4 NAG 1402 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . VA 4 183.018 221.599 139.194 1 67.9 ? O5 NAG 1402 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . VA 4 184.02 221.024 136.633 1 67.9 ? O6 NAG 1402 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . VA 4 183.801 226.165 140.346 1 67.9 ? O7 NAG 1402 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 278 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #