data_7Y5Q # _model_server_result.job_id tU_bAVpveuGygRJveogECw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 01:18:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7y5q # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1601}' # _entry.id 7Y5Q # _exptl.entry_id 7Y5Q _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 1532 A CYS 1135 1_555 A SG CYS 1586 A CYS 1189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 1544 A CYS 1147 1_555 A SG CYS 1555 A CYS 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 1559 A CYS 1162 1_555 A SG CYS 1597 A CYS 1200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 1602 A CYS 1205 1_555 A SG CYS 1646 A CYS 1249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 1617 A CYS 1220 1_555 A SG CYS 1627 A CYS 1230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 1631 A CYS 1234 1_555 A SG CYS 1659 A CYS 1262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 1663 A CYS 1266 1_555 A SG CYS 1716 A CYS 1319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 1679 A CYS 1282 1_555 A SG CYS 1690 A CYS 1293 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 1694 A CYS 1297 1_555 A SG CYS 1727 A CYS 1330 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 1732 A CYS 1335 1_555 A SG CYS 1775 A CYS 1378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1745 A CYS 1348 1_555 A SG CYS 1755 A CYS 1358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1809 A CYS 1412 1_555 A SG CYS 1819 A CYS 1422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1823 A CYS 1426 1_555 A SG CYS 1871 A CYS 1474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1875 A CYS 1478 1_555 A SG CYS 1893 A CYS 1496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 1884 A CYS 1487 1_555 A SG CYS 1900 A CYS 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 1901 A CYS 1504 1_555 A SG CYS 1925 A CYS 1528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 A SG CYS 1917 A CYS 1520 1_555 A SG CYS 1923 A CYS 1526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 461 B CYS 64 1_555 B SG CYS 552 B CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 644 B CYS 247 1_555 B SG CYS 904 B CYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 649 B CYS 252 1_555 B SG CYS 974 B CYS 577 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 731 B CYS 334 1_555 B SG CYS 745 B CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 741 B CYS 344 1_555 B SG CYS 757 B CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 791 B CYS 394 1_555 B SG CYS 802 B CYS 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 900 B CYS 503 1_555 B SG CYS 939 B CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 929 B CYS 532 1_555 B SG CYS 960 B CYS 563 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1027 B CYS 630 1_555 B SG CYS 1198 B CYS 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 1030 B CYS 633 1_555 B SG CYS 1195 B CYS 798 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 1049 B CYS 652 1_555 C SG CYS 120 C CYS 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 1070 B CYS 673 1_555 B SG CYS 1152 B CYS 755 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 1092 B CYS 695 1_555 B SG CYS 1098 B CYS 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 1264 B CYS 867 1_555 B SG CYS 1292 B CYS 895 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 1277 B CYS 880 1_555 B SG CYS 1288 B CYS 891 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 1300 B CYS 903 1_555 B SG CYS 1307 B CYS 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 1316 B CYS 919 1_555 B SG CYS 1328 B CYS 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 1353 B CYS 956 1_555 B SG CYS 1387 B CYS 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 1368 B CYS 971 1_555 B SG CYS 1456 B CYS 1059 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 56 C CYS 56 1_555 C SG CYS 70 C CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 65 C CYS 65 1_555 C SG CYS 85 C CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 76 C CYS 76 1_555 C SG CYS 125 C CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 109 C CYS 109 1_555 C SG CYS 139 C CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 146 C CYS 146 1_555 C SG CYS 181 C CYS 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 197 C CYS 197 1_555 C SG CYS 205 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc1 B NE2 HIS 879 B HIS 482 1_555 D ZN ZN . B ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc2 B NE2 HIS 883 B HIS 486 1_555 D ZN ZN . B ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc3 B NE2 HIS 889 B HIS 492 1_555 D ZN ZN . B ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7Y5Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id D _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 3 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id B _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 1601 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 141.201 _atom_site.Cartn_y 93.753 _atom_site.Cartn_z 124.418 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 19.75 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1601 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 48 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 36 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #