data_7Y82 # _model_server_result.job_id 8pMBNAEbQv2x1ypuxk2K6A _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 00:52:32' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7y82 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1801}' # _entry.id 7Y82 # _exptl.entry_id 7Y82 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7Y82 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7Y82 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 D N N ? 4 E N N ? 4 F N N ? 4 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 94 A CYS 88 1_555 H ZN ZN . A ZN 1805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 127 A CYS 121 1_555 H ZN ZN . A ZN 1805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 133 A CYS 127 1_555 H ZN ZN . A ZN 1805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 136 A CYS 130 1_555 H ZN ZN . A ZN 1805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc5 A O GLY 140 A GLY 134 1_555 G MG MG . A MG 1804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 143 A ASP 137 1_555 G MG MG . A MG 1804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.887 ? metalc ? metalc7 A O ALA 145 A ALA 139 1_555 G MG MG . A MG 1804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 497 A CYS 491 1_555 E ZN ZN . A ZN 1802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc9 A SG CYS 509 A CYS 503 1_555 E ZN ZN . A ZN 1802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc10 A SG CYS 512 A CYS 506 1_555 E ZN ZN . A ZN 1802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc11 A ND1 HIS 753 A HIS 747 1_555 D ZN ZN . A ZN 1801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc12 A SG CYS 756 A CYS 750 1_555 D ZN ZN . A ZN 1801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc13 A SG CYS 758 A CYS 752 1_555 D ZN ZN . A ZN 1801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc14 A SG CYS 761 A CYS 755 1_555 D ZN ZN . A ZN 1801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc15 A SG CYS 1024 A CYS 1018 1_555 F ZN ZN . A ZN 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc16 A SG CYS 1412 A CYS 1406 1_555 F ZN ZN . A ZN 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc17 A SG CYS 1420 A CYS 1414 1_555 F ZN ZN . A ZN 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc18 A SG CYS 1423 A CYS 1417 1_555 F ZN ZN . A ZN 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc19 G MG MG . A MG 1804 1_555 B OP2 U 26 B U 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.893 ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog1 B O2 U 23 B U 23 1_555 B N6 A 25 B A 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N1 A 35 B A 35 1_555 C N3 U 40 C U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B N6 A 35 B A 35 1_555 C O4 U 40 C U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N3 C 36 B C 36 1_555 C N1 G 39 C G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N4 C 36 B C 36 1_555 C O6 G 39 C G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O2 C 36 B C 36 1_555 C N2 G 39 C G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N3 C 37 B C 37 1_555 C N1 G 38 C G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N4 C 37 B C 37 1_555 C O6 G 38 C G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B O2 C 37 B C 37 1_555 C N2 G 38 C G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog10 B N3 C 38 B C 38 1_555 C N2 G 37 C G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog11 B O2 C 38 B C 38 1_555 C N1 G 37 C G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N1 A 39 B A 39 1_555 C N3 U 36 C U 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N6 A 39 B A 39 1_555 C O4 U 36 C U 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog14 B N3 U 41 B U 41 1_555 C N1 A 34 C A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N3 U 42 B U 42 1_555 C N1 A 33 C A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B O4 U 42 B U 42 1_555 C N6 A 33 C A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N3 U 43 B U 43 1_555 C N1 A 32 C A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B O4 U 43 B U 43 1_555 C N6 A 32 C A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N3 U 44 B U 44 1_555 C N1 A 31 C A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B O4 U 44 B U 44 1_555 C N6 A 31 C A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N3 C 45 B C 45 1_555 C N1 G 30 C G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N4 C 45 B C 45 1_555 C O6 G 30 C G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O2 C 45 B C 45 1_555 C N2 G 30 C G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N1 G 47 B G 47 1_555 C N3 C 28 C C 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N2 G 47 B G 47 1_555 C O2 C 28 C C 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B O6 G 47 B G 47 1_555 C N4 C 28 C C 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N3 C 48 B C 48 1_555 C N1 G 27 C G 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N4 C 48 B C 48 1_555 C O6 G 27 C G 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B O2 C 48 B C 48 1_555 C N2 G 27 C G 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N3 C 49 B C 49 1_555 C N1 G 26 C G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N4 C 49 B C 49 1_555 C O6 G 26 C G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B O2 C 49 B C 49 1_555 C N2 G 26 C G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N3 C 50 B C 50 1_555 C N1 G 25 C G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N4 C 50 B C 50 1_555 C O6 G 25 C G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B O2 C 50 B C 50 1_555 C N2 G 25 C G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N3 C 51 B C 51 1_555 C N1 G 24 C G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N4 C 51 B C 51 1_555 C O6 G 24 C G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B O2 C 51 B C 51 1_555 C N2 G 24 C G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N1 G 52 B G 52 1_555 C N3 C 23 C C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N2 G 52 B G 52 1_555 C O2 C 23 C C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O6 G 52 B G 52 1_555 C N4 C 23 C C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N1 G 53 B G 53 1_555 C N3 C 22 C C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N2 G 53 B G 53 1_555 C O2 C 22 C C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B O6 G 53 B G 53 1_555 C N4 C 22 C C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N1 A 54 B A 54 1_555 C N3 U 21 C U 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N6 A 54 B A 54 1_555 C O4 U 21 C U 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B N3 C 55 B C 55 1_555 C N1 G 20 C G -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B N4 C 55 B C 55 1_555 C O6 G 20 C G -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B O2 C 55 B C 55 1_555 C N2 G 20 C G -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B N3 U 56 B U 56 1_555 C N1 A 19 C A -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B O4 U 56 B U 56 1_555 C N6 A 19 C A -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B N3 C 57 B C 57 1_555 C N1 G 18 C G -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 B N4 C 57 B C 57 1_555 C O6 G 18 C G -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 B O2 C 57 B C 57 1_555 C N2 G 18 C G -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 B N3 C 58 B C 58 1_555 C N1 G 17 C G -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N4 C 58 B C 58 1_555 C O6 G 17 C G -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B O2 C 58 B C 58 1_555 C N2 G 17 C G -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B N1 A 59 B A 59 1_555 C N3 U 16 C U -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 B N6 A 59 B A 59 1_555 C O4 U 16 C U -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7Y82 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 ZN A 1 1801 1701 ZN ZN . E 4 ZN A 1 1802 1702 ZN ZN . F 4 ZN A 1 1803 1703 ZN ZN . G 5 MG A 1 1804 1704 MG MG . H 4 ZN A 1 1805 1705 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 125.8 _atom_site.Cartn_y 160.27 _atom_site.Cartn_z 130.463 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 87.83 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1801 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 34 _model_server_stats.query_time_ms 299 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #