data_7YBH # _model_server_result.job_id 6MrRlTI17mYsmUlWzb1ZSA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:48:17' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7ybh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"YA","auth_seq_id":1305}' # _entry.id 7YBH # _exptl.entry_id 7YBH _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 17 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 4 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG D 1 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG D 2 NAG 2 n E NAG 1 E 1 NAG E 1 NAG 2 n E NAG 2 E 2 NAG E 2 NAG 3 n F NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 3 n F NAG 2 F 2 NAG F 2 NAG 3 n F BMA 3 F 3 BMA F 3 BMA 3 n G NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG G 2 NAG 3 n G BMA 3 G 3 BMA G 3 BMA 3 n H NAG 1 H 1 NAG H 1 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG H 2 NAG 3 n H BMA 3 H 3 BMA H 3 BMA 2 n I NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 2 n I NAG 2 I 2 NAG I 2 NAG 4 n J NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG J 2 NAG 4 n J BMA 3 J 3 BMA J 3 BMA 4 n J MAN 4 J 4 MAN J 4 MAN 3 n K NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG K 2 NAG 3 n K BMA 3 K 3 BMA K 3 BMA 2 n L NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 2 n L NAG 2 L 2 NAG L 2 NAG 2 n M NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 2 n M NAG 2 M 2 NAG M 2 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG N 1 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG N 2 NAG 3 n N BMA 3 N 3 BMA N 3 BMA 3 n O NAG 1 O 1 NAG O 1 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG O 2 NAG 3 n O BMA 3 O 3 BMA O 3 BMA 3 n P NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG P 2 NAG 3 n P BMA 3 P 3 BMA P 3 BMA 2 n Q NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 2 n Q NAG 2 Q 2 NAG Q 2 NAG 2 n R NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 2 n R NAG 2 R 2 NAG R 2 NAG 3 n S NAG 1 S 1 NAG S 1 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG S 2 NAG 3 n S BMA 3 S 3 BMA S 3 BMA 2 n T NAG 1 T 1 NAG T 1 NAG 2 n T NAG 2 T 2 NAG T 2 NAG 2 n U NAG 1 U 1 NAG U 1 NAG 2 n U NAG 2 U 2 NAG U 2 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG V 1 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG V 2 NAG 3 n V BMA 3 V 3 BMA V 3 BMA 2 n W NAG 1 W 1 NAG W 1 NAG 2 n W NAG 2 W 2 NAG W 2 NAG 2 n X NAG 1 X 1 NAG X 1 NAG 2 n X NAG 2 X 2 NAG X 2 NAG 2 n Y NAG 1 Y 1 NAG Y 1 NAG 2 n Y NAG 2 Y 2 NAG Y 2 NAG 2 n Z NAG 1 Z 1 NAG Z 1 NAG 2 n Z NAG 2 Z 2 NAG Z 2 NAG 3 n AA NAG 1 a 1 NAG a 1 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG a 2 NAG 3 n AA BMA 3 a 3 BMA a 3 BMA 2 n BA NAG 1 b 1 NAG b 1 NAG 2 n BA NAG 2 b 2 NAG b 2 NAG 3 n CA NAG 1 c 1 NAG c 1 NAG 3 n CA NAG 2 c 2 NAG c 2 NAG 3 n CA BMA 3 c 3 BMA c 3 BMA 3 n DA NAG 1 d 1 NAG d 1 NAG 3 n DA NAG 2 d 2 NAG d 2 NAG 3 n DA BMA 3 d 3 BMA d 3 BMA 3 n EA NAG 1 e 1 NAG e 1 NAG 3 n EA NAG 2 e 2 NAG e 2 NAG 3 n EA BMA 3 e 3 BMA e 3 BMA 2 n FA NAG 1 f 1 NAG f 1 NAG 2 n FA NAG 2 f 2 NAG f 2 NAG 3 n GA NAG 1 g 1 NAG g 1 NAG 3 n GA NAG 2 g 2 NAG g 2 NAG 3 n GA BMA 3 g 3 BMA g 3 BMA 3 n HA NAG 1 h 1 NAG h 1 NAG 3 n HA NAG 2 h 2 NAG h 2 NAG 3 n HA BMA 3 h 3 BMA h 3 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 A SG CYS 136 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 131 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 284 A CYS 284 1_555 A SG CYS 294 A CYS 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 329 A CYS 329 1_555 A SG CYS 354 A CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 372 A CYS 372 1_555 A SG CYS 425 A CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 384 A CYS 384 1_555 A SG CYS 518 A CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 473 A CYS 473 1_555 A SG CYS 481 A CYS 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 531 A CYS 531 1_555 A SG CYS 583 A CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 610 A CYS 610 1_555 A SG CYS 642 A CYS 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 655 A CYS 655 1_555 A SG CYS 664 A CYS 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 731 A CYS 731 1_555 A SG CYS 753 A CYS 753 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 736 A CYS 736 1_555 A SG CYS 742 A CYS 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 833 A CYS 833 1_555 A SG CYS 844 A CYS 844 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1025 A CYS 1025 1_555 A SG CYS 1036 A CYS 1036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 1075 A CYS 1075 1_555 A SG CYS 1119 A CYS 1119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 15 B CYS 15 1_555 B SG CYS 136 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 131 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 284 B CYS 284 1_555 B SG CYS 294 B CYS 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 329 B CYS 329 1_555 B SG CYS 354 B CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 372 B CYS 372 1_555 B SG CYS 425 B CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 384 B CYS 384 1_555 B SG CYS 518 B CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 473 B CYS 473 1_555 B SG CYS 481 B CYS 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 531 B CYS 531 1_555 B SG CYS 583 B CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 610 B CYS 610 1_555 B SG CYS 642 B CYS 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 655 B CYS 655 1_555 B SG CYS 664 B CYS 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 731 B CYS 731 1_555 B SG CYS 753 B CYS 753 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 736 B CYS 736 1_555 B SG CYS 742 B CYS 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 1025 B CYS 1025 1_555 B SG CYS 1036 B CYS 1036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 1075 B CYS 1075 1_555 B SG CYS 1119 B CYS 1119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 15 C CYS 15 1_555 C SG CYS 136 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 131 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 284 C CYS 284 1_555 C SG CYS 294 C CYS 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 329 C CYS 329 1_555 C SG CYS 354 C CYS 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 384 C CYS 384 1_555 C SG CYS 518 C CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 473 C CYS 473 1_555 C SG CYS 481 C CYS 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 531 C CYS 531 1_555 C SG CYS 583 C CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 610 C CYS 610 1_555 C SG CYS 642 C CYS 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 655 C CYS 655 1_555 C SG CYS 664 C CYS 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 731 C CYS 731 1_555 C SG CYS 753 C CYS 753 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 736 C CYS 736 1_555 C SG CYS 742 C CYS 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 1025 C CYS 1025 1_555 C SG CYS 1036 C CYS 1036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 1075 C CYS 1075 1_555 C SG CYS 1119 C CYS 1119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 122 A ASN 122 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 234 A ASN 234 1_555 LA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 275 A ASN 275 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 336 A ASN 336 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 596 A ASN 596 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 609 A ASN 609 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 650 A ASN 650 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 702 A ASN 702 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 710 A ASN 710 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 794 A ASN 794 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1067 A ASN 1067 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1091 A ASN 1091 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1127 A ASN 1127 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 275 B ASN 275 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 324 B ASN 324 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 336 B ASN 336 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 596 B ASN 596 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 609 B ASN 609 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 650 B ASN 650 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 702 B ASN 702 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 710 B ASN 710 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 794 B ASN 794 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 1067 B ASN 1067 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 1091 B ASN 1091 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 1127 B ASN 1127 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 61 C ASN 61 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 165 C ASN 165 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 234 C ASN 234 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 275 C ASN 275 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 324 C ASN 324 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 336 C ASN 336 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 596 C ASN 596 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 609 C ASN 609 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 650 C ASN 650 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 702 C ASN 702 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 710 C ASN 710 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 794 C ASN 794 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 1067 C ASN 1067 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 1091 C ASN 1091 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 1127 C ASN 1127 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale46 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale47 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale48 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale49 F O4 NAG . F NAG 2 1_555 F C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale50 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale51 G O4 NAG . G NAG 2 1_555 G C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale52 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale53 H O4 NAG . H NAG 2 1_555 H C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale54 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale55 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale56 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale57 J O3 BMA . J BMA 3 1_555 J C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale58 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale59 K O4 NAG . K NAG 2 1_555 K C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale60 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale61 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale62 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale63 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale64 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale65 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale66 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale67 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale68 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale69 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale70 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale71 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale72 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale73 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale74 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale75 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale76 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale77 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale78 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale79 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale80 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale81 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale82 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale83 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale84 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale85 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale86 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale87 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale88 EA O4 NAG . e NAG 2 1_555 EA C1 BMA . e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale89 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale90 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale91 GA O4 NAG . g NAG 2 1_555 GA C1 BMA . g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale92 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale93 HA O4 NAG . h NAG 2 1_555 HA C1 BMA . h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7YBH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code IA 5 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . JA 5 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . KA 5 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . LA 5 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . MA 5 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . NA 5 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . OA 5 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . PA 5 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . QA 5 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . RA 5 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . SA 5 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . TA 5 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . UA 5 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . VA 5 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . WA 5 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . XA 5 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . YA 5 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . YA 5 216.803 159.054 192.723 1 111.35 ? C1 NAG 1305 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . YA 5 218.318 159.05 192.899 1 111.35 ? C2 NAG 1305 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . YA 5 218.948 158.003 191.987 1 111.35 ? C3 NAG 1305 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . YA 5 218.302 156.642 192.215 1 111.35 ? C4 NAG 1305 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . YA 5 216.782 156.742 192.101 1 111.35 ? C5 NAG 1305 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . YA 5 216.078 155.456 192.464 1 111.35 ? C6 NAG 1305 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . YA 5 218.984 161.318 193.563 1 111.35 ? C7 NAG 1305 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . YA 5 219.589 162.613 193.113 1 111.35 ? C8 NAG 1305 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . YA 5 218.88 160.364 192.631 1 111.35 ? N2 NAG 1305 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . YA 5 220.345 157.926 192.245 1 111.35 ? O3 NAG 1305 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . YA 5 218.782 155.714 191.248 1 111.35 ? O4 NAG 1305 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . YA 5 216.286 157.751 192.995 1 111.35 ? O5 NAG 1305 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . YA 5 216.14 155.207 193.861 1 111.35 ? O6 NAG 1305 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . YA 5 218.603 161.143 194.716 1 111.35 ? O7 NAG 1305 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 29 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 342 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #