data_7YE5 # _model_server_result.job_id PQA2mXn1NhirDcs08SBE2A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-09 02:23:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7ye5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":1301}' # _entry.id 7YE5 # _exptl.entry_id 7YE5 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7YE5 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7YE5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 N N N ? 5 O N N ? 5 P N N ? 5 Q N N ? 5 R N N ? 5 S N N ? 5 T N N ? 5 U N N ? 5 V N N ? 5 W N N ? 5 X N N ? 5 Y N N ? 5 Z N N ? 5 AA N N ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n H NAG 1 D 1 NAG A 1307 NAG 4 n H NAG 2 D 2 NAG A 1308 NAG 4 n I NAG 1 E 1 NAG A 1309 NAG 4 n I NAG 2 E 2 NAG A 1310 NAG 4 n J NAG 1 F 1 NAG B 1307 NAG 4 n J NAG 2 F 2 NAG B 1308 NAG 4 n K NAG 1 J 1 NAG B 1309 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG B 1310 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG C 1307 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG C 1308 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG C 1309 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG C 1310 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 A SG CYS 136 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 131 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 291 A CYS 291 1_555 A SG CYS 301 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 336 A CYS 336 1_555 A SG CYS 361 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 A SG CYS 432 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 391 A CYS 391 1_555 A SG CYS 525 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 480 A CYS 480 1_555 A SG CYS 488 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 538 A CYS 538 1_555 A SG CYS 590 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 617 A CYS 617 1_555 A SG CYS 649 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 662 A CYS 662 1_555 A SG CYS 671 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 738 A CYS 738 1_555 A SG CYS 760 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 743 A CYS 743 1_555 A SG CYS 749 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1043 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1082 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1126 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 15 B CYS 15 1_555 B SG CYS 136 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 131 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 291 B CYS 291 1_555 B SG CYS 301 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 336 B CYS 336 1_555 B SG CYS 361 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 379 B CYS 379 1_555 B SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 391 B CYS 391 1_555 B SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 480 B CYS 480 1_555 B SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 538 B CYS 538 1_555 B SG CYS 590 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 662 B CYS 662 1_555 B SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 738 B CYS 738 1_555 B SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 743 B CYS 743 1_555 B SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 15 C CYS 15 1_555 C SG CYS 136 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 131 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 291 C CYS 291 1_555 C SG CYS 301 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 336 C CYS 336 1_555 C SG CYS 361 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 379 C CYS 379 1_555 C SG CYS 432 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 391 C CYS 391 1_555 C SG CYS 525 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 480 C CYS 480 1_555 C SG CYS 488 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 538 C CYS 538 1_555 C SG CYS 590 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 617 C CYS 617 1_555 C SG CYS 649 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 662 C CYS 662 1_555 C SG CYS 671 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 738 C CYS 738 1_555 C SG CYS 760 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 743 C CYS 743 1_555 C SG CYS 749 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 1032 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1043 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 1082 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1126 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 D SG CYS 22 H CYS 22 1_555 D SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf44 D SG CYS 151 H CYS 151 1_555 D SG CYS 207 H CYS 207 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf45 D SG CYS 151 H CYS 151 1_555 D SG CYS 207 H CYS 207 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf46 E SG CYS 22 L CYS 22 1_555 E SG CYS 90 L CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf47 E SG CYS 139 L CYS 139 1_555 E SG CYS 198 L CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf48 F SG CYS 22 G CYS 22 1_555 F SG CYS 96 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf49 F SG CYS 151 G CYS 151 1_555 F SG CYS 207 G CYS 207 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf50 F SG CYS 151 G CYS 151 1_555 F SG CYS 207 G CYS 207 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf51 G SG CYS 22 I CYS 22 1_555 G SG CYS 90 I CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf52 G SG CYS 139 I CYS 139 1_555 G SG CYS 198 I CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 282 A ASN 282 1_555 N C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 331 A ASN 331 1_555 O C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 603 A ASN 603 1_555 P C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 616 A ASN 616 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 657 A ASN 657 1_555 R C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 709 A ASN 709 1_555 S C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 717 A ASN 717 1_555 H C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 801 A ASN 801 1_555 I C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 1098 A ASN 1098 1_555 T C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 1134 A ASN 1134 1_555 U C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 V C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 331 B ASN 331 1_555 W C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.257 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 603 B ASN 603 1_555 X C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 616 B ASN 616 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 657 B ASN 657 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 709 B ASN 709 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 717 B ASN 717 1_555 J C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 801 B ASN 801 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 1098 B ASN 1098 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 1134 B ASN 1134 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 282 C ASN 282 1_555 DA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 331 C ASN 331 1_555 EA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 603 C ASN 603 1_555 FA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 616 C ASN 616 1_555 GA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 657 C ASN 657 1_555 HA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 709 C ASN 709 1_555 IA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 717 C ASN 717 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 801 C ASN 801 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 1098 C ASN 1098 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 1134 C ASN 1134 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale31 H O4 NAG . D NAG 1 1_555 H C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 I O4 NAG . E NAG 1 1_555 I C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale33 J O4 NAG . F NAG 1 1_555 J C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale34 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale35 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7YE5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code N 5 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . O 5 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . P 5 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . Q 5 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . R 5 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . S 5 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . T 5 NAG A 1 1307 1311 NAG NAG . U 5 NAG A 1 1308 1312 NAG NAG . V 5 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . W 5 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . X 5 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . Y 5 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . Z 5 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . AA 5 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . BA 5 NAG B 1 1307 1311 NAG NAG . CA 5 NAG B 1 1308 1312 NAG NAG . DA 5 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . EA 5 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . FA 5 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . GA 5 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . HA 5 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . IA 5 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . JA 5 NAG C 1 1307 1311 NAG NAG . KA 5 NAG C 1 1308 1312 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . N 5 205.384 194.834 168.252 1 555.52 ? C1 NAG 1301 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . N 5 206.683 195.641 168.277 1 555.52 ? C2 NAG 1301 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . N 5 207.728 194.968 167.4 1 555.52 ? C3 NAG 1301 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . N 5 207.843 193.489 167.742 1 555.52 ? C4 NAG 1301 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . N 5 206.484 192.816 167.687 1 555.52 ? C5 NAG 1301 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . N 5 206.553 191.327 167.998 1 555.52 ? C6 NAG 1301 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . N 5 206.721 198.068 168.617 1 555.52 ? C7 NAG 1301 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . N 5 206.425 199.408 168.011 1 555.52 ? C8 NAG 1301 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . N 5 206.456 197.012 167.844 1 555.52 ? N2 NAG 1301 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . N 5 209 195.569 167.633 1 555.52 ? O3 NAG 1301 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . N 5 208.721 192.85 166.816 1 555.52 ? O4 NAG 1301 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . N 5 205.683 193.493 168.643 1 555.52 ? O5 NAG 1301 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . N 5 207.376 191.062 169.141 1 555.52 ? O6 NAG 1301 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . N 5 207.176 197.956 169.744 1 555.52 ? O7 NAG 1301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 21 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 40 _model_server_stats.query_time_ms 315 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #