data_7YLY # _model_server_result.job_id fykS0KAW1bJHwilY9ZouLg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 13:02:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7yly # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":603}' # _entry.id 7YLY # _exptl.entry_id 7YLY _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 83.977 _entity.id 12 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ALUMINUM FLUORIDE' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7YLY _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7YLY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 12 U N N ? 12 X N N ? 12 AA N N ? 12 DA N N ? 12 GA N N ? 12 JA N N ? 12 OA N N ? 12 RA N N ? 12 UA N N ? 12 XA N N ? 12 AB N N ? 12 DB N N ? 12 GB N N ? 12 LB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 S O3B ADP . A ADP 601 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? metalc ? metalc2 S O1A ADP . A ADP 601 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc3 S O3A ADP . A ADP 601 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc4 B OD1 ASP 90 B ASP 90 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? metalc ? metalc5 V O1B ADP . B ADP 601 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc6 V O2B ADP . B ADP 601 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? metalc ? metalc7 V O2A ADP . B ADP 601 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc8 C OD1 ASP 91 D ASP 91 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc9 C OG SER 157 D SER 157 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc10 Y O2B ADP . D ADP 601 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc11 Y O2A ADP . D ADP 601 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc12 BA O2B ADP . E ADP 601 1_555 CA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc13 BA O3A ADP . E ADP 601 1_555 CA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc14 E OD1 ASP 91 G ASP 91 1_555 FA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc15 EA O1A ADP . G ADP 601 1_555 FA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc16 EA O3A ADP . G ADP 601 1_555 FA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? metalc ? metalc17 F OD1 ASP 96 H ASP 96 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc18 HA O1A ADP . H ADP 601 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc19 HA O3A ADP . H ADP 601 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc20 KA MG MG . Q MG 601 1_555 LA O3A ADP . Q ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? metalc ? metalc21 KA MG MG . Q MG 601 1_555 LA O3B ADP . Q ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc22 I OD1 ASP 89 Z ASP 89 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc23 MA O1A ADP . Z ADP 601 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc24 MA O2A ADP . Z ADP 601 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? metalc ? metalc25 MA O3A ADP . Z ADP 601 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? metalc ? metalc26 J OD1 ASP 96 a ASP 96 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc27 J OD2 ASP 96 a ASP 96 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? metalc ? metalc28 PA O1B ADP . a ADP 601 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc29 PA O1A ADP . a ADP 601 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc30 PA O2A ADP . a ADP 601 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc31 K OD1 ASP 90 b ASP 90 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc32 K OD2 ASP 90 b ASP 90 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.979 ? metalc ? metalc33 SA O3B ADP . b ADP 601 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc34 SA O2A ADP . b ADP 601 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? metalc ? metalc35 L OD1 ASP 91 d ASP 91 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? metalc ? metalc36 L O SER 157 d SER 157 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc ? metalc37 VA O2B ADP . d ADP 601 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? metalc ? metalc38 VA O2A ADP . d ADP 601 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc39 M OD1 ASP 117 e ASP 117 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc40 YA O2A ADP . e ADP 601 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc41 YA O3A ADP . e ADP 601 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc42 N OD1 ASP 91 g ASP 91 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? metalc ? metalc43 BB O2A ADP . g ADP 601 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc44 BB O3A ADP . g ADP 601 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc45 O OD1 ASP 96 h ASP 96 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc46 EB O2B ADP . h ADP 601 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? metalc ? metalc47 EB O3B ADP . h ADP 601 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? metalc ? metalc48 EB O3A ADP . h ADP 601 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc49 Q OD1 ASP 98 q ASP 98 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc ? metalc50 HB O3B ADP . q ADP 601 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc51 R OD1 ASP 89 z ASP 89 1_555 KB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc52 R OD2 ASP 89 z ASP 89 1_555 KB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc ? metalc53 JB O1A ADP . z ADP 601 1_555 KB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc54 JB O3A ADP . z ADP 601 1_555 KB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? # _chem_comp.formula 'Al F3' _chem_comp.formula_weight 83.977 _chem_comp.id AF3 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ALUMINUM FLUORIDE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag AL F1 AF3 sing 45 n n AL F2 AF3 sing 46 n n AL F3 AF3 sing 47 n n # _atom_sites.entry_id 7YLY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 10 ADP A 1 601 601 ADP ADP . T 11 MG A 1 602 602 MG MG . U 12 AF3 A 1 603 603 AF3 AF3 . V 10 ADP B 1 601 601 ADP ADP . W 11 MG B 1 602 602 MG MG . X 12 AF3 B 1 603 603 AF3 AF3 . Y 10 ADP D 1 601 601 ADP ADP . Z 11 MG D 1 602 602 MG MG . AA 12 AF3 D 1 603 603 AF3 AF3 . BA 10 ADP E 1 601 601 ADP ADP . CA 11 MG E 1 602 602 MG MG . DA 12 AF3 E 1 603 603 AF3 AF3 . EA 10 ADP G 1 601 601 ADP ADP . FA 11 MG G 1 602 602 MG MG . GA 12 AF3 G 1 603 603 AF3 AF3 . HA 10 ADP H 1 601 601 ADP ADP . IA 11 MG H 1 602 602 MG MG . JA 12 AF3 H 1 603 603 AF3 AF3 . KA 11 MG Q 1 601 601 MG MG . LA 10 ADP Q 1 602 602 ADP ADP . MA 10 ADP Z 1 601 601 ADP ADP . NA 11 MG Z 1 602 602 MG MG . OA 12 AF3 Z 1 603 603 AF3 AF3 . PA 10 ADP a 1 601 601 ADP ADP . QA 11 MG a 1 602 602 MG MG . RA 12 AF3 a 1 603 603 AF3 AF3 . SA 10 ADP b 1 601 601 ADP ADP . TA 11 MG b 1 602 602 MG MG . UA 12 AF3 b 1 603 603 AF3 AF3 . VA 10 ADP d 1 601 601 ADP ADP . WA 11 MG d 1 602 602 MG MG . XA 12 AF3 d 1 603 603 AF3 AF3 . YA 10 ADP e 1 601 601 ADP ADP . ZA 11 MG e 1 602 602 MG MG . AB 12 AF3 e 1 603 603 AF3 AF3 . BB 10 ADP g 1 601 601 ADP ADP . CB 11 MG g 1 602 602 MG MG . DB 12 AF3 g 1 603 603 AF3 AF3 . EB 10 ADP h 1 601 601 ADP ADP . FB 11 MG h 1 602 602 MG MG . GB 12 AF3 h 1 603 603 AF3 AF3 . HB 10 ADP q 1 601 601 ADP ADP . IB 11 MG q 1 602 602 MG MG . JB 10 ADP z 1 601 601 ADP ADP . KB 11 MG z 1 602 602 MG MG . LB 12 AF3 z 1 603 603 AF3 AF3 . MB 13 HOH A 1 701 701 HOH HOH . NB 13 HOH B 1 701 701 HOH HOH . OB 13 HOH D 1 701 701 HOH HOH . PB 13 HOH E 1 701 701 HOH HOH . QB 13 HOH G 1 701 701 HOH HOH . RB 13 HOH H 1 701 701 HOH HOH . SB 13 HOH Z 1 701 701 HOH HOH . TB 13 HOH a 1 701 701 HOH HOH . UB 13 HOH b 1 701 701 HOH HOH . VB 13 HOH d 1 701 701 HOH HOH . WB 13 HOH e 1 701 701 HOH HOH . XB 13 HOH g 1 701 701 HOH HOH . YB 13 HOH h 1 701 701 HOH HOH . ZB 13 HOH z 1 701 701 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 AL AL AF3 . . . DA 12 146.004 194.898 208.744 1 99.03 ? AL AF3 603 E 1 HETATM 2 F F1 AF3 . . . DA 12 146.513 194.434 210.307 1 99.03 ? F1 AF3 603 E 1 HETATM 3 F F2 AF3 . . . DA 12 146.191 196.519 208.23 1 99.03 ? F2 AF3 603 E 1 HETATM 4 F F3 AF3 . . . DA 12 145.179 193.775 207.755 1 99.03 ? F3 AF3 603 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 33 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 133 _model_server_stats.query_time_ms 440 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 4 #