data_7YQY # _model_server_result.job_id 6O3lrUnkAJ_h4l5IR14k0Q _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:50:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7yqy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"OA","auth_seq_id":1307}' # _entry.id 7YQY # _exptl.entry_id 7YQY _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 45 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7YQY _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7YQY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 V N N ? 6 W N N ? 6 X N N ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N ? 6 FB N N ? 6 GB N N ? 6 HB N N ? 6 IB N N ? 6 JB N N ? 6 KB N N ? 6 LB N N ? 6 MB N N ? 6 NB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 D 1 NAG D 1 NAG 4 n J NAG 2 D 2 NAG D 2 NAG 4 n K NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 4 n K NAG 2 K 2 NAG K 2 NAG 4 n L NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 4 n L NAG 2 L 2 NAG L 2 NAG 5 n M NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG M 2 NAG 5 n M BMA 3 M 3 BMA M 3 BMA 5 n M FUC 4 M 4 FUC M 4 FUC 4 n N NAG 1 N 1 NAG N 1 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG N 2 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG O 1 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG O 2 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG P 2 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG Q 2 NAG 5 n Q BMA 3 Q 3 BMA Q 3 BMA 5 n Q FUC 4 Q 4 FUC Q 4 FUC 4 n R NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG R 2 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG S 1 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG S 2 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG T 1 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG T 2 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG U 1 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG U 2 NAG 5 n U BMA 3 U 3 BMA U 3 BMA 5 n U FUC 4 U 4 FUC U 4 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 128 A CYS 131 1_555 A SG CYS 163 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 288 A CYS 291 1_555 A SG CYS 298 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 333 A CYS 336 1_555 A SG CYS 358 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 388 A CYS 391 1_555 A SG CYS 522 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 477 A CYS 480 1_555 A SG CYS 485 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 614 A CYS 617 1_555 A SG CYS 646 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 659 A CYS 662 1_555 A SG CYS 668 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 735 A CYS 738 1_555 A SG CYS 757 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 740 A CYS 743 1_555 A SG CYS 746 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 1029 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1040 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1079 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1123 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 128 B CYS 131 1_555 B SG CYS 163 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 288 B CYS 291 1_555 B SG CYS 298 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 333 B CYS 336 1_555 B SG CYS 358 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 388 B CYS 391 1_555 B SG CYS 522 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 477 B CYS 480 1_555 B SG CYS 485 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 614 B CYS 617 1_555 B SG CYS 646 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 659 B CYS 662 1_555 B SG CYS 668 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 735 B CYS 738 1_555 B SG CYS 757 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 740 B CYS 743 1_555 B SG CYS 746 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 1029 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1040 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 1079 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1123 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 128 C CYS 131 1_555 C SG CYS 163 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 C SG CYS 288 C CYS 291 1_555 C SG CYS 298 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 333 C CYS 336 1_555 C SG CYS 358 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 388 C CYS 391 1_555 C SG CYS 522 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 477 C CYS 480 1_555 C SG CYS 485 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 614 C CYS 617 1_555 C SG CYS 646 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 659 C CYS 662 1_555 C SG CYS 668 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 735 C CYS 738 1_555 C SG CYS 757 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 740 C CYS 743 1_555 C SG CYS 746 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 1029 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1040 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 1079 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1123 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 23 F CYS 23 1_555 D SG CYS 89 F CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 E SG CYS 23 G CYS 23 1_555 E SG CYS 89 G CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 F SG CYS 22 H CYS 22 1_555 F SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 G SG CYS 22 I CYS 22 1_555 G SG CYS 96 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf38 H SG CYS 22 J CYS 22 1_555 H SG CYS 96 J CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 I SG CYS 23 E CYS 23 1_555 I SG CYS 89 E CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 279 A ASN 282 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 328 A ASN 331 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 600 A ASN 603 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 613 A ASN 616 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 654 A ASN 657 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 706 A ASN 709 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 714 A ASN 717 1_555 J C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 798 A ASN 801 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 1071 A ASN 1074 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 1095 A ASN 1098 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 1131 A ASN 1134 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 58 B ASN 61 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 71 B ASN 74 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 119 B ASN 122 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 146 B ASN 149 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 162 B ASN 165 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 231 B ASN 234 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 279 B ASN 282 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 328 B ASN 331 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 600 B ASN 603 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 613 B ASN 616 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 654 B ASN 657 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 706 B ASN 709 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 714 B ASN 717 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 798 B ASN 801 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 1071 B ASN 1074 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 1095 B ASN 1098 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 1131 B ASN 1134 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 58 C ASN 61 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 71 C ASN 74 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 119 C ASN 122 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 146 C ASN 149 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 162 C ASN 165 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 231 C ASN 234 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 279 C ASN 282 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 328 C ASN 331 1_555 MB C1 NAG . C NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 600 C ASN 603 1_555 GB C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 613 C ASN 616 1_555 HB C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 654 C ASN 657 1_555 IB C1 NAG . C NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 706 C ASN 709 1_555 JB C1 NAG . C NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 714 C ASN 717 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 798 C ASN 801 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 1071 C ASN 1074 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 1095 C ASN 1098 1_555 KB C1 NAG . C NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 1131 C ASN 1134 1_555 LB C1 NAG . C NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale46 J O4 NAG . D NAG 1 1_555 J C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale47 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale48 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale49 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale50 M O6 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 FUC . M FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale51 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale52 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale53 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale54 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale56 Q O6 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 FUC . Q FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale57 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale58 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale59 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale60 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale61 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale62 U O6 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 FUC . U FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale63 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 282 n n C1 O1 NAG sing 283 n n C1 O5 NAG sing 284 n n C1 H1 NAG sing 285 n n C2 C3 NAG sing 286 n n C2 N2 NAG sing 287 n n C2 H2 NAG sing 288 n n C3 C4 NAG sing 289 n n C3 O3 NAG sing 290 n n C3 H3 NAG sing 291 n n C4 C5 NAG sing 292 n n C4 O4 NAG sing 293 n n C4 H4 NAG sing 294 n n C5 C6 NAG sing 295 n n C5 O5 NAG sing 296 n n C5 H5 NAG sing 297 n n C6 O6 NAG sing 298 n n C6 H61 NAG sing 299 n n C6 H62 NAG sing 300 n n C7 C8 NAG sing 301 n n C7 N2 NAG sing 302 n n C7 O7 NAG doub 303 n n C8 H81 NAG sing 304 n n C8 H82 NAG sing 305 n n C8 H83 NAG sing 306 n n N2 HN2 NAG sing 307 n n O1 HO1 NAG sing 308 n n O3 HO3 NAG sing 309 n n O4 HO4 NAG sing 310 n n O6 HO6 NAG sing 311 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7YQY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 6 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . W 6 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . X 6 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . Y 6 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . Z 6 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . AA 6 NAG A 1 1306 1307 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 1307 1308 NAG NAG . CA 6 NAG A 1 1308 1309 NAG NAG . DA 6 NAG A 1 1309 1310 NAG NAG . EA 6 NAG A 1 1310 1311 NAG NAG . FA 6 NAG A 1 1311 1312 NAG NAG . GA 6 NAG A 1 1312 1313 NAG NAG . HA 6 NAG A 1 1313 1314 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . MA 6 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . NA 6 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . OA 6 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . PA 6 NAG B 1 1308 1308 NAG NAG . QA 6 NAG B 1 1309 1309 NAG NAG . RA 6 NAG B 1 1310 1310 NAG NAG . SA 6 NAG B 1 1311 1311 NAG NAG . TA 6 NAG B 1 1312 1312 NAG NAG . UA 6 NAG B 1 1313 1313 NAG NAG . VA 6 NAG B 1 1314 1314 NAG NAG . WA 6 NAG B 1 1315 1315 NAG NAG . XA 6 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . YA 6 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . ZA 6 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . AB 6 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . BB 6 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . CB 6 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . DB 6 NAG C 1 1307 1307 NAG NAG . EB 6 NAG C 1 1308 1308 NAG NAG . FB 6 NAG C 1 1309 1309 NAG NAG . GB 6 NAG C 1 1310 1311 NAG NAG . HB 6 NAG C 1 1311 1312 NAG NAG . IB 6 NAG C 1 1312 1313 NAG NAG . JB 6 NAG C 1 1313 1314 NAG NAG . KB 6 NAG C 1 1314 1315 NAG NAG . LB 6 NAG C 1 1315 1316 NAG NAG . MB 6 NAG C 1 1316 1317 NAG NAG . NB 6 NAG J 1 201 201 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . OA 6 165.84 158.177 171.616 1 102.73 ? C1 NAG 1307 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . OA 6 164.377 158.483 171.917 1 102.73 ? C2 NAG 1307 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . OA 6 163.533 158.444 170.635 1 102.73 ? C3 NAG 1307 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . OA 6 164.218 157.686 169.499 1 102.73 ? C4 NAG 1307 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . OA 6 165.668 158.122 169.261 1 102.73 ? C5 NAG 1307 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . OA 6 165.813 159.075 168.097 1 102.73 ? C6 NAG 1307 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . OA 6 163.768 156.265 172.847 1 102.73 ? C7 NAG 1307 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . OA 6 163.16 155.559 174.022 1 102.73 ? C8 NAG 1307 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . OA 6 163.827 157.601 172.938 1 102.73 ? N2 NAG 1307 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . OA 6 163.249 159.775 170.221 1 102.73 ? O3 NAG 1307 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . OA 6 164.175 156.283 169.74 1 102.73 ? O4 NAG 1307 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . OA 6 166.207 158.792 170.408 1 102.73 ? O5 NAG 1307 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . OA 6 165.834 160.426 168.534 1 102.73 ? O6 NAG 1307 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . OA 6 164.183 155.653 171.868 1 102.73 ? O7 NAG 1307 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 61 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #