data_7YR1 # _model_server_result.job_id 0yW0nlmwncUsDY0yI2ftfg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 11:21:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7yr1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"WA","auth_seq_id":1308}' # _entry.id 7YR1 # _exptl.entry_id 7YR1 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7YR1 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7YR1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 I 1 NAG A 1142 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG A 1143 NAG 4 n K NAG 1 J 1 NAG A 1146 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG A 1147 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG A 1153 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG A 1154 NAG 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 1155 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG A 1156 NAG 5 n M BMA 3 M 3 BMA A 1157 BMA 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 1158 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 1159 NAG 5 n N BMA 3 N 3 BMA A 1160 BMA 4 n O NAG 1 O 1 NAG A 1161 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG A 1162 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG A 1163 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG A 1164 NAG 5 n P BMA 3 P 3 BMA A 1165 BMA 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1166 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1167 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG B 1142 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG B 1143 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 1146 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 1147 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG B 1153 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG B 1154 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG B 1155 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG B 1156 NAG 5 n U BMA 3 U 3 BMA B 1157 BMA 5 n V NAG 1 V 1 NAG B 1158 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG B 1159 NAG 5 n V BMA 3 V 3 BMA B 1160 BMA 4 n W NAG 1 W 1 NAG B 1161 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG B 1162 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG B 1163 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG B 1164 NAG 5 n X BMA 3 X 3 BMA B 1165 BMA 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG B 1166 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG B 1167 NAG 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1142 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1143 NAG 4 n AA NAG 1 a 1 NAG C 1146 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG C 1147 NAG 4 n BA NAG 1 b 1 NAG C 1153 NAG 4 n BA NAG 2 b 2 NAG C 1154 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG C 1155 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG C 1156 NAG 5 n CA BMA 3 c 3 BMA C 1157 BMA 5 n DA NAG 1 d 1 NAG C 1158 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG C 1159 NAG 5 n DA BMA 3 d 3 BMA C 1160 BMA 4 n EA NAG 1 e 1 NAG C 1161 NAG 4 n EA NAG 2 e 2 NAG C 1162 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG C 1163 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG C 1164 NAG 5 n FA BMA 3 f 3 BMA C 1165 BMA 4 n GA NAG 1 g 1 NAG C 1166 NAG 4 n GA NAG 2 g 2 NAG C 1167 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 128 A CYS 131 1_555 A SG CYS 163 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 288 A CYS 291 1_555 A SG CYS 298 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 333 A CYS 336 1_555 A SG CYS 358 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 376 A CYS 379 1_555 A SG CYS 429 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 388 A CYS 391 1_555 A SG CYS 522 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 477 A CYS 480 1_555 A SG CYS 485 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 614 A CYS 617 1_555 A SG CYS 646 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 659 A CYS 662 1_555 A SG CYS 668 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 735 A CYS 738 1_555 A SG CYS 757 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 740 A CYS 743 1_555 A SG CYS 746 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1029 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1040 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1079 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1123 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 21 H CYS 22 1_555 B SG CYS 94 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 22 L CYS 23 1_555 C SG CYS 87 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 128 B CYS 131 1_555 D SG CYS 163 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 288 B CYS 291 1_555 D SG CYS 298 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 333 B CYS 336 1_555 D SG CYS 358 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 376 B CYS 379 1_555 D SG CYS 429 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 388 B CYS 391 1_555 D SG CYS 522 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 477 B CYS 480 1_555 D SG CYS 485 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 D SG CYS 614 B CYS 617 1_555 D SG CYS 646 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 659 B CYS 662 1_555 D SG CYS 668 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 735 B CYS 738 1_555 D SG CYS 757 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 740 B CYS 743 1_555 D SG CYS 746 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 1029 B CYS 1032 1_555 D SG CYS 1040 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 1079 B CYS 1082 1_555 D SG CYS 1123 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 21 D CYS 22 1_555 E SG CYS 94 D CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 F SG CYS 22 F CYS 23 1_555 F SG CYS 87 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 128 C CYS 131 1_555 G SG CYS 163 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 288 C CYS 291 1_555 G SG CYS 298 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 333 C CYS 336 1_555 G SG CYS 358 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf32 G SG CYS 376 C CYS 379 1_555 G SG CYS 429 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf33 G SG CYS 388 C CYS 391 1_555 G SG CYS 522 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 G SG CYS 477 C CYS 480 1_555 G SG CYS 485 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 G SG CYS 614 C CYS 617 1_555 G SG CYS 646 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 G SG CYS 659 C CYS 662 1_555 G SG CYS 668 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 G SG CYS 735 C CYS 738 1_555 G SG CYS 757 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 G SG CYS 740 C CYS 743 1_555 G SG CYS 746 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf39 G SG CYS 1029 C CYS 1032 1_555 G SG CYS 1040 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf40 G SG CYS 1079 C CYS 1082 1_555 G SG CYS 1123 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf41 H SG CYS 21 E CYS 22 1_555 H SG CYS 94 E CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf42 I SG CYS 22 G CYS 23 1_555 I SG CYS 87 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 A ASN 61 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 119 A ASN 122 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 162 A ASN 165 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 231 A ASN 234 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 279 A ASN 282 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 328 A ASN 331 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 340 A ASN 343 1_555 LA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 600 A ASN 603 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 613 A ASN 616 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 654 A ASN 657 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 706 A ASN 709 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 714 A ASN 717 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 798 A ASN 801 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1071 A ASN 1074 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1095 A ASN 1098 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1131 A ASN 1134 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 58 B ASN 61 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 119 B ASN 122 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 162 B ASN 165 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 231 B ASN 234 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 279 B ASN 282 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 328 B ASN 331 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 340 B ASN 343 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 600 B ASN 603 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 613 B ASN 616 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 654 B ASN 657 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 706 B ASN 709 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 714 B ASN 717 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 798 B ASN 801 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 1071 B ASN 1074 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale31 D ND2 ASN 1095 B ASN 1098 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale32 D ND2 ASN 1131 B ASN 1134 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 58 C ASN 61 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale34 G ND2 ASN 119 C ASN 122 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale35 G ND2 ASN 162 C ASN 165 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 231 C ASN 234 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale37 G ND2 ASN 279 C ASN 282 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale38 G ND2 ASN 328 C ASN 331 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale39 G ND2 ASN 340 C ASN 343 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale40 G ND2 ASN 600 C ASN 603 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale41 G ND2 ASN 613 C ASN 616 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale42 G ND2 ASN 654 C ASN 657 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale43 G ND2 ASN 706 C ASN 709 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 714 C ASN 717 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 798 C ASN 801 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale46 G ND2 ASN 1071 C ASN 1074 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale47 G ND2 ASN 1095 C ASN 1098 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale48 G ND2 ASN 1131 C ASN 1134 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale49 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale50 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale51 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale52 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale53 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale54 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale55 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale57 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale58 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale59 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale60 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale61 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale62 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale64 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale65 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale66 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale67 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale68 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale70 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale71 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale73 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale74 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale75 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale76 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale77 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale78 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale79 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale80 FA O4 NAG . f NAG 2 1_555 FA C1 BMA . f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale81 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7YR1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code HA 6 NAG A 1 1301 1141 NAG NAG . IA 6 NAG A 1 1302 1144 NAG NAG . JA 6 NAG A 1 1303 1145 NAG NAG . KA 6 NAG A 1 1304 1148 NAG NAG . LA 6 NAG A 1 1305 1149 NAG NAG . MA 6 NAG A 1 1306 1150 NAG NAG . NA 6 NAG A 1 1307 1151 NAG NAG . OA 6 NAG A 1 1308 1152 NAG NAG . PA 6 NAG B 1 1301 1141 NAG NAG . QA 6 NAG B 1 1302 1144 NAG NAG . RA 6 NAG B 1 1303 1145 NAG NAG . SA 6 NAG B 1 1304 1148 NAG NAG . TA 6 NAG B 1 1305 1149 NAG NAG . UA 6 NAG B 1 1306 1150 NAG NAG . VA 6 NAG B 1 1307 1151 NAG NAG . WA 6 NAG B 1 1308 1152 NAG NAG . XA 6 NAG C 1 1301 1141 NAG NAG . YA 6 NAG C 1 1302 1144 NAG NAG . ZA 6 NAG C 1 1303 1145 NAG NAG . AB 6 NAG C 1 1304 1148 NAG NAG . BB 6 NAG C 1 1305 1149 NAG NAG . CB 6 NAG C 1 1306 1150 NAG NAG . DB 6 NAG C 1 1307 1151 NAG NAG . EB 6 NAG C 1 1308 1152 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . WA 6 183.088 238.108 224.136 1 117.55 ? C1 NAG 1308 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . WA 6 183.436 239.286 225.049 1 117.55 ? C2 NAG 1308 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . WA 6 184.395 240.24 224.343 1 117.55 ? C3 NAG 1308 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . WA 6 185.617 239.486 223.835 1 117.55 ? C4 NAG 1308 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . WA 6 185.182 238.314 222.962 1 117.55 ? C5 NAG 1308 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . WA 6 186.339 237.454 222.511 1 117.55 ? C6 NAG 1308 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . WA 6 181.571 239.693 226.593 1 117.55 ? C7 NAG 1308 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . WA 6 180.357 240.524 226.875 1 117.55 ? C8 NAG 1308 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . WA 6 182.238 239.992 225.473 1 117.55 ? N2 NAG 1308 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . WA 6 184.795 241.261 225.249 1 117.55 ? O3 NAG 1308 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . WA 6 186.447 240.357 223.076 1 117.55 ? O4 NAG 1308 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . WA 6 184.294 237.461 223.7 1 117.55 ? O5 NAG 1308 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . WA 6 187.571 238.156 222.6 1 117.55 ? O6 NAG 1308 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . WA 6 181.931 238.791 227.342 1 117.55 ? O7 NAG 1308 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 18 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 40 _model_server_stats.query_time_ms 393 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #