data_7Z0T
#
_model_server_result.job_id            Ijd196SBaeSXdzqwxsC0Sw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-09-10 00:22:47' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7z0t 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":301}' 
#
_entry.id    7Z0T 
#
_exptl.entry_id    7Z0T 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          10 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7Z0T 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7Z0T 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    heptameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      7 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 10 J N N 
? 10 K N N 
? 10 L N N 
? 10 M N N 
? 10 N N N 
? 10 O N N 
? 10 P N N 
? 10 R N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 B SG CYS 253 E CYS 241 1_555 H NI NI . E NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc2 B SG CYS 256 E CYS 244 1_555 H NI NI . E NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 256 E CYS 244 1_555 I FE FCO . E FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 543 E CYS 531 1_555 H NI NI . E NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? 
metalc ? metalc5 B SG CYS 546 E CYS 534 1_555 H NI NI . E NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc6 B SG CYS 546 E CYS 534 1_555 I FE FCO . E FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc7 C SG CYS 12 B CYS 12 1_555 J FE4 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc8 C SG CYS 15 B CYS 15 1_555 J FE1 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc9 C SG CYS 18 B CYS 18 1_555 J FE3 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc10 C SG CYS 22 B CYS 22 1_555 K FE3 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc11 C SG CYS 51 B CYS 51 1_555 L FE1 SF4 . B SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc12 C SG CYS 54 B CYS 54 1_555 L FE4 SF4 . B SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 59 B CYS 59 1_555 L FE2 SF4 . B SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 63 B CYS 63 1_555 M FE4 SF4 . B SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 82 B CYS 82 1_555 M FE2 SF4 . B SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 85 B CYS 85 1_555 M FE3 SF4 . B SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 88 B CYS 88 1_555 M FE1 SF4 . B SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 92 B CYS 92 1_555 L FE3 SF4 . B SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 143 B CYS 143 1_555 K FE4 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc20 C SG CYS 146 B CYS 146 1_555 K FE2 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 155 B CYS 155 1_555 K FE1 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc22 C SG CYS 159 B CYS 159 1_555 J FE2 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc23 D SG CYS 48 G CYS 48 1_555 N FE1 SF4 . G SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc24 D SG CYS 51 G CYS 51 1_555 N FE2 SF4 . G SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc25 D SG CYS 115 G CYS 115 1_555 N FE3 SF4 . G SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc26 D SG CYS 145 G CYS 145 1_555 N FE4 SF4 . G SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc27 E SG CYS 40 F CYS 40 1_555 O FE3 SF4 . F SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? 
metalc ? metalc28 E SG CYS 43 F CYS 43 1_555 O FE1 SF4 . F SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc29 E SG CYS 46 F CYS 46 1_555 O FE2 SF4 . F SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? 
metalc ? metalc30 E SG CYS 50 F CYS 50 1_555 P FE1 SF4 . F SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc31 E SG CYS 75 F CYS 75 1_555 P FE3 SF4 . F SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc32 E SG CYS 78 F CYS 78 1_555 P FE2 SF4 . F SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc33 E SG CYS 81 F CYS 81 1_555 P FE4 SF4 . F SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc34 E SG CYS 85 F CYS 85 1_555 O FE4 SF4 . F SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? 
metalc ? metalc35 E SG CYS 117 F CYS 117 1_555 Q FE FE . F FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc36 E SG CYS 120 F CYS 120 1_555 Q FE FE . F FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc37 E SG CYS 155 F CYS 155 1_555 Q FE FE . F FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc38 E SG CYS 158 F CYS 158 1_555 Q FE FE . F FE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc39 G SG CYS 8 A CYS 8 1_555 R FE2 SF4 . A SF4 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc40 G SG CYS 11 A CYS 11 1_555 R FE4 SF4 . A SF4 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc41 G SG CYS 15 A CYS 15 1_555 R FE3 SF4 . A SF4 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc42 G SG CYS 42 A CYS 42 1_555 R FE1 SF4 . A SF4 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc43 G SE SEC 140 A SEC 140 1_555 U MO 6MO . A 6MO 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc44 S S12 MGD . A MGD 801 1_555 U MO 6MO . A 6MO 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc45 S S13 MGD . A MGD 801 1_555 U MO 6MO . A 6MO 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc46 T S12 MGD . A MGD 802 1_555 U MO 6MO . A 6MO 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc47 T S13 MGD . A MGD 802 1_555 U MO 6MO . A 6MO 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 385 n n 
FE1 S3 SF4 sing 386 n n 
FE1 S4 SF4 sing 387 n n 
FE2 S1 SF4 sing 388 n n 
FE2 S3 SF4 sing 389 n n 
FE2 S4 SF4 sing 390 n n 
FE3 S1 SF4 sing 391 n n 
FE3 S2 SF4 sing 392 n n 
FE3 S4 SF4 sing 393 n n 
FE4 S1 SF4 sing 394 n n 
FE4 S2 SF4 sing 395 n n 
FE4 S3 SF4 sing 396 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7Z0T 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
H 8 NI E 1 601 589 NI NI . 
I 9 FCO E 1 602 590 FCO FCO . 
J 10 SF4 B 1 301 204 SF4 SF4 . 
K 10 SF4 B 1 302 205 SF4 SF4 . 
L 10 SF4 B 1 303 206 SF4 SF4 . 
M 10 SF4 B 1 304 207 SF4 SF4 . 
N 10 SF4 G 1 301 256 SF4 SF4 . 
O 10 SF4 F 1 201 182 SF4 SF4 . 
P 10 SF4 F 1 202 183 SF4 SF4 . 
Q 11 FE F 1 203 184 FE FE . 
R 10 SF4 A 1 800 800 SF4 SF4 . 
S 12 MGD A 1 801 801 MGD MGD . 
T 12 MGD A 1 802 802 MGD MGD . 
U 13 6MO A 1 803 803 6MO 6MO . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . N 10 175.816 216.363 211.766 1 54.21 ? FE1 SF4 301 G 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . N 10 175.159 216.071 209.169 1 54.21 ? FE2 SF4 301 G 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . N 10 176.174 218.436 210.066 1 54.21 ? FE3 SF4 301 G 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . N 10 173.697 217.696 210.789 1 54.21 ? FE4 SF4 301 G 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . N 10 174.39 218.138 208.725 1 54.21 ? S1 SF4 301 G 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . N 10 175.296 218.516 212.132 1 54.21 ? S2 SF4 301 G 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . N 10 173.925 215.438 210.983 1 54.21 ? S3 SF4 301 G 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . N 10 177.23 216.397 209.981 1 54.21 ? S4 SF4 301 G 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              27 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    25 
_model_server_stats.query_time_ms           350 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           8 
#