data_7ZZH
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.pdbx_description            (1~{R},22~{R},23~{S},24~{R})-14-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-7-azanyl-23,24-bis(oxidanyl)-25-oxa-2,4,6,9,14,17,20-heptazatetracyclo[20.2.1.0^{2,10}.0^{3,8}]pentacosa-3(8),4,6,9-tetraen-11-yne-16,19-dione 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.pdbx_unique_axis    ? 
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_symmetry.Int_Tables_number        23 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
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_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
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_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2,3,4 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_655 -x+1,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 62.908 0 0 
3 'crystal symmetry operation' 3_655 -x+1,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 62.908 0 0 
4 'crystal symmetry operation' 4_555 x,-y,-z 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 0 0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             C 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C27 H31 N13 O8' 
_chem_comp.formula_weight    665.617 
_chem_comp.id                KIO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              (1~{R},22~{R},23~{S},24~{R})-14-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-7-azanyl-23,24-bis(oxidanyl)-25-oxa-2,4,6,9,14,17,20-heptazatetracyclo[20.2.1.0^{2,10}.0^{3,8}]pentacosa-3(8),4,6,9-tetraen-11-yne-16,19-dione 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N C KIO sing 193 n n 
C C3 KIO doub 194 n y 
C N1 KIO sing 195 n y 
N3 C3 KIO sing 196 n y 
N3 C4 KIO doub 197 n y 
C3 C2 KIO sing 198 n y 
N1 C1 KIO doub 199 n y 
C4 N4 KIO sing 200 n y 
C26 O7 KIO sing 201 n n 
C26 C25 KIO sing 202 n n 
C26 C5 KIO sing 203 n n 
O6 C25 KIO sing 204 n n 
C2 N4 KIO sing 205 n y 
C2 N2 KIO doub 206 n y 
C1 N2 KIO sing 207 n y 
N4 C5 KIO sing 208 n n 
C25 C6 KIO sing 209 n n 
C5 O KIO sing 210 n n 
C6 O KIO sing 211 n n 
C6 C7 KIO sing 212 n n 
C7 N5 KIO sing 213 n n 
N7 C13 KIO sing 214 n n 
C13 N8 KIO doub 215 n y 
C13 C12 KIO sing 216 n y 
N5 C22 KIO sing 217 n n 
N5 C8 KIO sing 218 n n 
N8 C14 KIO sing 219 n y 
N6 C12 KIO sing 220 n y 
N6 C11 KIO doub 221 n y 
C22 C21 KIO sing 222 n n 
C12 C15 KIO doub 223 n y 
N12 C20 KIO sing 224 n n 
N12 C21 KIO sing 225 n n 
C18 N11 KIO sing 226 n n 
C18 C17 KIO sing 227 n n 
N11 C19 KIO sing 228 n n 
C14 N9 KIO doub 229 n y 
C8 C9 KIO sing 230 n n 
C9 C10 KIO trip 231 n n 
O1 C17 KIO sing 232 n n 
O1 C16 KIO sing 233 n n 
C11 C10 KIO sing 234 n n 
C11 N10 KIO sing 235 n y 
C15 N9 KIO sing 236 n y 
C15 N10 KIO sing 237 n y 
C19 C20 KIO sing 238 n n 
C19 O2 KIO doub 239 n n 
C21 O3 KIO doub 240 n n 
N10 C16 KIO sing 241 n n 
C17 C23 KIO sing 242 n n 
C16 C24 KIO sing 243 n n 
C23 C24 KIO sing 244 n n 
C23 O4 KIO sing 245 n n 
C24 O5 KIO sing 246 n n 
C7 H1 KIO sing 247 n n 
C7 H2 KIO sing 248 n n 
C8 H3 KIO sing 249 n n 
C8 H4 KIO sing 250 n n 
C1 H5 KIO sing 251 n n 
O5 H6 KIO sing 252 n n 
C5 H7 KIO sing 253 n n 
C6 H8 KIO sing 254 n n 
C4 H9 KIO sing 255 n n 
O4 H10 KIO sing 256 n n 
N H11 KIO sing 257 n n 
N H12 KIO sing 258 n n 
C14 H13 KIO sing 259 n n 
C16 H14 KIO sing 260 n n 
C17 H15 KIO sing 261 n n 
C18 H16 KIO sing 262 n n 
C18 H17 KIO sing 263 n n 
C20 H18 KIO sing 264 n n 
C20 H19 KIO sing 265 n n 
C22 H20 KIO sing 266 n n 
C22 H21 KIO sing 267 n n 
C23 H22 KIO sing 268 n n 
C24 H23 KIO sing 269 n n 
C25 H24 KIO sing 270 n n 
C26 H25 KIO sing 271 n n 
N11 H26 KIO sing 272 n n 
N12 H27 KIO sing 273 n n 
N7 H29 KIO sing 274 n n 
N7 H30 KIO sing 275 n n 
O6 H31 KIO sing 276 n n 
O7 H32 KIO sing 277 n n 
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_atom_sites.entry_id                     7ZZH 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013373 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008415 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
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_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 CIT A 1 301 1 CIT CIT . 
C 3 KIO A 1 302 1 KIO XXX . 
D 4 HOH A 1 401 2 HOH HOH . 
D 4 HOH A 2 402 66 HOH HOH . 
D 4 HOH A 3 403 32 HOH HOH . 
D 4 HOH A 4 404 24 HOH HOH . 
D 4 HOH A 5 405 74 HOH HOH . 
D 4 HOH A 6 406 27 HOH HOH . 
D 4 HOH A 7 407 63 HOH HOH . 
D 4 HOH A 8 408 65 HOH HOH . 
D 4 HOH A 9 409 5 HOH HOH . 
D 4 HOH A 10 410 39 HOH HOH . 
D 4 HOH A 11 411 9 HOH HOH . 
D 4 HOH A 12 412 56 HOH HOH . 
D 4 HOH A 13 413 31 HOH HOH . 
D 4 HOH A 14 414 4 HOH HOH . 
D 4 HOH A 15 415 1 HOH HOH . 
D 4 HOH A 16 416 54 HOH HOH . 
D 4 HOH A 17 417 37 HOH HOH . 
D 4 HOH A 18 418 16 HOH HOH . 
D 4 HOH A 19 419 28 HOH HOH . 
D 4 HOH A 20 420 12 HOH HOH . 
D 4 HOH A 21 421 15 HOH HOH . 
D 4 HOH A 22 422 8 HOH HOH . 
D 4 HOH A 23 423 42 HOH HOH . 
D 4 HOH A 24 424 41 HOH HOH . 
D 4 HOH A 25 425 10 HOH HOH . 
D 4 HOH A 26 426 64 HOH HOH . 
D 4 HOH A 27 427 13 HOH HOH . 
D 4 HOH A 28 428 17 HOH HOH . 
D 4 HOH A 29 429 33 HOH HOH . 
D 4 HOH A 30 430 14 HOH HOH . 
D 4 HOH A 31 431 35 HOH HOH . 
D 4 HOH A 32 432 3 HOH HOH . 
D 4 HOH A 33 433 43 HOH HOH . 
D 4 HOH A 34 434 19 HOH HOH . 
D 4 HOH A 35 435 11 HOH HOH . 
D 4 HOH A 36 436 18 HOH HOH . 
D 4 HOH A 37 437 7 HOH HOH . 
D 4 HOH A 38 438 82 HOH HOH . 
D 4 HOH A 39 439 70 HOH HOH . 
D 4 HOH A 40 440 20 HOH HOH . 
D 4 HOH A 41 441 23 HOH HOH . 
D 4 HOH A 42 442 60 HOH HOH . 
D 4 HOH A 43 443 71 HOH HOH . 
D 4 HOH A 44 444 22 HOH HOH . 
D 4 HOH A 45 445 47 HOH HOH . 
D 4 HOH A 46 446 46 HOH HOH . 
D 4 HOH A 47 447 44 HOH HOH . 
D 4 HOH A 48 448 26 HOH HOH . 
D 4 HOH A 49 449 53 HOH HOH . 
D 4 HOH A 50 450 57 HOH HOH . 
D 4 HOH A 51 451 50 HOH HOH . 
D 4 HOH A 52 452 40 HOH HOH . 
D 4 HOH A 53 453 79 HOH HOH . 
D 4 HOH A 54 454 29 HOH HOH . 
D 4 HOH A 55 455 80 HOH HOH . 
D 4 HOH A 56 456 36 HOH HOH . 
D 4 HOH A 57 457 67 HOH HOH . 
D 4 HOH A 58 458 52 HOH HOH . 
D 4 HOH A 59 459 81 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
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_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
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_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
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_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 N N1 KIO . . . C 3 19.671 4.242 7.728 1 38.74 ? N1 KIO 302 A 1 
HETATM 2 C C7 KIO . . . C 3 13.991 9.893 10.495 1 43.16 ? C7 KIO 302 A 1 
HETATM 3 C C8 KIO . . . C 3 14.343 10.799 12.747 1 46.12 ? C8 KIO 302 A 1 
HETATM 4 N N2 KIO . . . C 3 19.205 6.37 8.755 1 40.36 ? N2 KIO 302 A 1 
HETATM 5 C C9 KIO . . . C 3 15.791 11.06 12.815 1 44.49 ? C9 KIO 302 A 1 
HETATM 6 O O1 KIO . . . C 3 18.854 8.358 12.836 1 47.56 ? O1 KIO 302 A 1 
HETATM 7 C C1 KIO . . . C 3 19.989 5.348 8.408 1 40.44 ? C1 KIO 302 A 1 
HETATM 8 O O5 KIO . . . C 3 18.559 9.385 16.223 1 52.59 ? O5 KIO 302 A 1 
HETATM 9 C C5 KIO . . . C 3 16.932 8.372 9.049 1 39.36 ? C5 KIO 302 A 1 
HETATM 10 C C6 KIO . . . C 3 15.404 9.846 9.948 1 44.13 ? C6 KIO 302 A 1 
HETATM 11 N N3 KIO . . . C 3 16.133 5.266 7.301 1 42.55 ? N3 KIO 302 A 1 
HETATM 12 C C4 KIO . . . C 3 15.835 6.43 7.83 1 44.5 ? C4 KIO 302 A 1 
HETATM 13 O O4 KIO . . . C 3 18.312 6.785 15.842 1 57.38 ? O4 KIO 302 A 1 
HETATM 14 C C3 KIO . . . C 3 17.474 5.098 7.608 1 41.36 ? C3 KIO 302 A 1 
HETATM 15 O O3 KIO . . . C 3 12.798 7.677 14.365 1 65.92 ? O3 KIO 302 A 1 
HETATM 16 C C2 KIO . . . C 3 17.954 6.183 8.327 1 42.98 ? C2 KIO 302 A 1 
HETATM 17 N N4 KIO . . . C 3 16.888 7.038 8.461 1 43.21 ? N4 KIO 302 A 1 
HETATM 18 N N KIO . . . C 3 18.105 2.989 6.583 1 37.23 ? N KIO 302 A 1 
HETATM 19 C C KIO . . . C 3 18.401 4.082 7.3 1 39.23 ? C KIO 302 A 1 
HETATM 20 O O KIO . . . C 3 15.9 8.497 10.013 1 41.56 ? O KIO 302 A 1 
HETATM 21 C C10 KIO . . . C 3 16.965 11.205 12.97 1 39.22 ? C10 KIO 302 A 1 
HETATM 22 C C11 KIO . . . C 3 18.344 11.482 12.848 1 37.75 ? C11 KIO 302 A 1 
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HETATM 25 C C14 KIO . . . C 3 22.697 11.504 12.704 1 36.84 ? C14 KIO 302 A 1 
HETATM 26 C C15 KIO . . . C 3 20.532 11.186 12.986 1 40.32 ? C15 KIO 302 A 1 
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HETATM 31 C C20 KIO . . . C 3 13.981 5.518 13.077 1 63.47 ? C20 KIO 302 A 1 
HETATM 32 C C21 KIO . . . C 3 13.014 7.742 13.156 1 60.77 ? C21 KIO 302 A 1 
HETATM 33 C C22 KIO . . . C 3 12.749 9.015 12.373 1 53.28 ? C22 KIO 302 A 1 
HETATM 34 C C23 KIO . . . C 3 17.754 7.552 14.783 1 58.39 ? C23 KIO 302 A 1 
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HETATM 36 C C25 KIO . . . C 3 15.465 10.196 8.466 1 36.07 ? C25 KIO 302 A 1 
HETATM 37 C C26 KIO . . . C 3 16.755 9.5 8.015 1 36.93 ? C26 KIO 302 A 1 
HETATM 38 N N10 KIO . . . C 3 19.322 10.594 13.287 1 40.18 ? N10 KIO 302 A 1 
HETATM 39 N N11 KIO . . . C 3 16.21 6.353 12.635 1 49.41 ? N11 KIO 302 A 1 
HETATM 40 N N12 KIO . . . C 3 13.538 6.744 12.447 1 57.52 ? N12 KIO 302 A 1 
HETATM 41 N N5 KIO . . . C 3 13.997 9.635 11.938 1 49.96 ? N5 KIO 302 A 1 
HETATM 42 N N6 KIO . . . C 3 18.838 12.579 12.306 1 37.76 ? N6 KIO 302 A 1 
HETATM 43 N N7 KIO . . . C 3 21.155 14.365 11.318 1 36.76 ? N7 KIO 302 A 1 
HETATM 44 N N8 KIO . . . C 3 22.547 12.69 12.101 1 37.84 ? N8 KIO 302 A 1 
HETATM 45 N N9 KIO . . . C 3 21.757 10.685 13.184 1 36.52 ? N9 KIO 302 A 1 
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