data_8APE
#
_model_server_result.job_id            IwS9Lw-Ix9SLYw1gyyR1_Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 05:57:35' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8ape 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"UB","auth_seq_id":203}' 
#
_entry.id    8APE 
#
_exptl.entry_id    8APE 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              510.615 
_entity.id                          33 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8APE 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8APE 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    42-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      42 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 33 LB N N 
? 33 UB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 CA C AME 1 e AME 1 1_555 CA N GLN 2 e GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
metalc ? metalc1 A OG1 THR 213 A1 THR 213 1_555 RA MG MG . A1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc2 QA O2G ATP . A1 ATP 601 1_555 RA MG MG . A1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.945 ? 
metalc ? metalc3 QA O2B ATP . A1 ATP 601 1_555 RA MG MG . A1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? 
metalc ? metalc4 B OG1 THR 213 B1 THR 213 1_555 TA MG MG . B1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? 
metalc ? metalc5 SA O2G ATP . B1 ATP 601 1_555 TA MG MG . B1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
metalc ? metalc6 SA O2B ATP . B1 ATP 601 1_555 TA MG MG . B1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc7 C OG1 THR 213 C1 THR 213 1_555 VA MG MG . C1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.917 ? 
metalc ? metalc8 UA O2G ATP . C1 ATP 601 1_555 VA MG MG . C1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? 
metalc ? metalc9 UA O2B ATP . C1 ATP 601 1_555 VA MG MG . C1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? 
metalc ? metalc10 D OG1 THR 190 D1 THR 190 1_555 XA MG MG . D1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? 
metalc ? metalc11 WA O3B ADP . D1 ADP 601 1_555 XA MG MG . D1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc12 F OG1 THR 190 F1 THR 190 1_555 ZA MG MG . F1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.94 ? 
metalc ? metalc13 YA O2G ATP . F1 ATP 601 1_555 ZA MG MG . F1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? 
metalc ? metalc14 YA O2B ATP . F1 ATP 601 1_555 ZA MG MG . F1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
#
_chem_comp.formula           'C24 H46 O11' 
_chem_comp.formula_weight    510.615 
_chem_comp.id                LMT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE 
_chem_comp.type              d-saccharide 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8APE 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
QA 26 ATP A1 1 601 1 ATP ATP . 
RA 27 MG A1 1 602 2 MG MG . 
SA 26 ATP B1 1 601 3 ATP ATP . 
TA 27 MG B1 1 602 4 MG MG . 
UA 26 ATP C1 1 601 5 ATP ATP . 
VA 27 MG C1 1 602 6 MG MG . 
WA 28 ADP D1 1 601 1 ADP ADP . 
XA 27 MG D1 1 602 2 MG MG . 
YA 26 ATP F1 1 601 7 ATP ATP . 
ZA 27 MG F1 1 602 8 MG MG . 
AB 29 UTP H1 1 201 1 UTP UTP . 
BB 30 CDL L 1 101 12 CDL CDL . 
CB 30 CDL M 1 201 1 CDL CDL . 
DB 31 PEE M 1 202 2 PEE PEE . 
EB 32 PC1 a 1 301 3 PC1 PC1 . 
FB 30 CDL c 1 201 3 CDL CDL . 
GB 30 CDL e 1 401 2 CDL CDL . 
HB 30 CDL e 1 402 5 CDL CDL . 
IB 30 CDL e 1 403 7 CDL CDL . 
JB 30 CDL e 1 404 10 CDL CDL . 
KB 30 CDL e 1 405 11 CDL CDL . 
LB 33 LMT e 1 406 1 LMT LMT . 
MB 34 Q7G e 1 407 2 Q7G GD0 . 
NB 30 CDL f 1 201 9 CDL CDL . 
OB 31 PEE f 1 202 1 PEE PEE . 
PB 32 PC1 f 1 203 1 PC1 PC1 . 
QB 32 PC1 f 1 204 2 PC1 PC1 . 
RB 32 PC1 i 1 201 4 PC1 PC1 . 
SB 30 CDL j 1 201 4 CDL CDL . 
TB 30 CDL j 1 202 6 CDL CDL . 
UB 33 LMT j 1 203 2 LMT LMT . 
VB 30 CDL l 1 101 12 CDL CDL . 
WB 30 CDL m 1 201 1 CDL CDL . 
XB 31 PEE m 1 202 2 PEE PEE . 
YB 34 Q7G n 1 201 1 Q7G GD0 . 
ZB 30 CDL q 1 101 8 CDL CDL . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1B LMT . . . UB 33 312.196 274.388 150.958 1 32.37 ? C1B LMT 203 j 1 
HETATM 2 C C2B LMT . . . UB 33 310.686 274.265 151.121 1 32.37 ? C2B LMT 203 j 1 
HETATM 3 C C3B LMT . . . UB 33 310.359 273.251 152.207 1 32.37 ? C3B LMT 203 j 1 
HETATM 4 C C4B LMT . . . UB 33 311.06 271.931 151.926 1 32.37 ? C4B LMT 203 j 1 
HETATM 5 C C5B LMT . . . UB 33 312.556 272.173 151.76 1 32.37 ? C5B LMT 203 j 1 
HETATM 6 C C6B LMT . . . UB 33 313.315 270.921 151.389 1 32.37 ? C6B LMT 203 j 1 
HETATM 7 O O1B LMT . . . UB 33 312.726 274.933 152.141 1 32.37 ? O1B LMT 203 j 1 
HETATM 8 O O2B LMT . . . UB 33 310.133 275.533 151.457 1 32.37 ? O2B LMT 203 j 1 
HETATM 9 O O3B LMT . . . UB 33 308.952 273.05 152.275 1 32.37 ? O3B LMT 203 j 1 
HETATM 10 O O4' LMT . . . UB 33 310.847 271.023 153.002 1 32.37 ? O4' LMT 203 j 1 
HETATM 11 O O5B LMT . . . UB 33 312.774 273.121 150.704 1 32.37 ? O5B LMT 203 j 1 
HETATM 12 O O6B LMT . . . UB 33 313.165 269.912 152.377 1 32.37 ? O6B LMT 203 j 1 
HETATM 13 C C1' LMT . . . UB 33 315.578 277.731 153.273 1 32.37 ? C1' LMT 203 j 1 
HETATM 14 C C2' LMT . . . UB 33 314.304 278.283 152.644 1 32.37 ? C2' LMT 203 j 1 
HETATM 15 C C3' LMT . . . UB 33 313.213 277.221 152.661 1 32.37 ? C3' LMT 203 j 1 
HETATM 16 C C4' LMT . . . UB 33 313.728 275.952 152.005 1 32.37 ? C4' LMT 203 j 1 
HETATM 17 C C5' LMT . . . UB 33 315.015 275.495 152.676 1 32.37 ? C5' LMT 203 j 1 
HETATM 18 C C6' LMT . . . UB 33 315.638 274.285 152.02 1 32.37 ? C6' LMT 203 j 1 
HETATM 19 O O1' LMT . . . UB 33 316.579 278.701 153.144 1 32.37 ? O1' LMT 203 j 1 
HETATM 20 O O2' LMT . . . UB 33 313.87 279.436 153.357 1 32.37 ? O2' LMT 203 j 1 
HETATM 21 O O3' LMT . . . UB 33 312.057 277.695 151.979 1 32.37 ? O3' LMT 203 j 1 
HETATM 22 O O5' LMT . . . UB 33 315.985 276.551 152.606 1 32.37 ? O5' LMT 203 j 1 
HETATM 23 O O6' LMT . . . UB 33 316.842 273.904 152.671 1 32.37 ? O6' LMT 203 j 1 
HETATM 24 C C1 LMT . . . UB 33 316.674 279.607 154.246 1 32.37 ? C1 LMT 203 j 1 
HETATM 25 C C2 LMT . . . UB 33 318.057 279.496 154.842 1 32.37 ? C2 LMT 203 j 1 
HETATM 26 C C3 LMT . . . UB 33 318.347 280.517 155.933 1 32.37 ? C3 LMT 203 j 1 
HETATM 27 C C4 LMT . . . UB 33 318.219 281.964 155.479 1 32.37 ? C4 LMT 203 j 1 
HETATM 28 C C5 LMT . . . UB 33 319.112 282.94 156.233 1 32.37 ? C5 LMT 203 j 1 
HETATM 29 C C6 LMT . . . UB 33 318.809 283.071 157.718 1 32.37 ? C6 LMT 203 j 1 
HETATM 30 C C7 LMT . . . UB 33 317.459 283.699 158.023 1 32.37 ? C7 LMT 203 j 1 
HETATM 31 C C8 LMT . . . UB 33 317.351 284.284 159.424 1 32.37 ? C8 LMT 203 j 1 
HETATM 32 C C9 LMT . . . UB 33 317.642 283.296 160.539 1 32.37 ? C9 LMT 203 j 1 
HETATM 33 C C10 LMT . . . UB 33 317.635 283.918 161.923 1 32.37 ? C10 LMT 203 j 1 
HETATM 34 C C11 LMT . . . UB 33 318.058 282.972 163.03 1 32.37 ? C11 LMT 203 j 1 
HETATM 35 C C12 LMT . . . UB 33 318.181 283.65 164.372 1 32.37 ? C12 LMT 203 j 1 
HETATM 36 H H1B LMT . . . UB 33 312.455 274.927 150.05 1 32.37 ? H1B LMT 203 j 1 
HETATM 37 H H2B LMT . . . UB 33 310.248 273.947 150.177 1 32.37 ? H2B LMT 203 j 1 
HETATM 38 H H3B LMT . . . UB 33 310.707 273.63 153.166 1 32.37 ? H3B LMT 203 j 1 
HETATM 39 H H4B LMT . . . UB 33 310.661 271.499 151.011 1 32.37 ? H4B LMT 203 j 1 
HETATM 40 H H5B LMT . . . UB 33 312.959 272.55 152.697 1 32.37 ? H5B LMT 203 j 1 
HETATM 41 H "H6'2" LMT . . . UB 33 312.904 270.473 150.486 1 32.37 ? "H6'2" LMT 203 j 1 
HETATM 42 H "H6'1" LMT . . . UB 33 314.366 271.128 151.191 1 32.37 ? "H6'1" LMT 203 j 1 
HETATM 43 H H1' LMT . . . UB 33 315.41 277.503 154.323 1 32.37 ? H1' LMT 203 j 1 
HETATM 44 H H2' LMT . . . UB 33 314.499 278.553 151.608 1 32.37 ? H2' LMT 203 j 1 
HETATM 45 H H3' LMT . . . UB 33 312.938 277 153.689 1 32.37 ? H3' LMT 203 j 1 
HETATM 46 H H4' LMT . . . UB 33 313.937 276.156 150.958 1 32.37 ? H4' LMT 203 j 1 
HETATM 47 H H5' LMT . . . UB 33 314.816 275.262 153.721 1 32.37 ? H5' LMT 203 j 1 
HETATM 48 H H6D LMT . . . UB 33 315.944 274.516 151.001 1 32.37 ? H6D LMT 203 j 1 
HETATM 49 H H6E LMT . . . UB 33 314.94 273.452 151.959 1 32.37 ? H6E LMT 203 j 1 
HETATM 50 H H12 LMT . . . UB 33 315.926 279.404 155.01 1 32.37 ? H12 LMT 203 j 1 
HETATM 51 H H11 LMT . . . UB 33 316.482 280.621 153.899 1 32.37 ? H11 LMT 203 j 1 
HETATM 52 H H22 LMT . . . UB 33 318.805 279.579 154.055 1 32.37 ? H22 LMT 203 j 1 
HETATM 53 H H21 LMT . . . UB 33 318.204 278.491 155.234 1 32.37 ? H21 LMT 203 j 1 
HETATM 54 H H32 LMT . . . UB 33 319.346 280.348 156.332 1 32.37 ? H32 LMT 203 j 1 
HETATM 55 H H31 LMT . . . UB 33 317.687 280.341 156.78 1 32.37 ? H31 LMT 203 j 1 
HETATM 56 H H42 LMT . . . UB 33 318.429 282.029 154.412 1 32.37 ? H42 LMT 203 j 1 
HETATM 57 H H41 LMT . . . UB 33 317.181 282.283 155.565 1 32.37 ? H41 LMT 203 j 1 
HETATM 58 H H52 LMT . . . UB 33 319.048 283.922 155.767 1 32.37 ? H52 LMT 203 j 1 
HETATM 59 H H51 LMT . . . UB 33 320.154 282.653 156.103 1 32.37 ? H51 LMT 203 j 1 
HETATM 60 H H62 LMT . . . UB 33 319.596 283.648 158.201 1 32.37 ? H62 LMT 203 j 1 
HETATM 61 H H61 LMT . . . UB 33 318.87 282.092 158.19 1 32.37 ? H61 LMT 203 j 1 
HETATM 62 H H72 LMT . . . UB 33 317.245 284.474 157.288 1 32.37 ? H72 LMT 203 j 1 
HETATM 63 H H71 LMT . . . UB 33 316.671 282.963 157.874 1 32.37 ? H71 LMT 203 j 1 
HETATM 64 H H82 LMT . . . UB 33 318.024 285.135 159.513 1 32.37 ? H82 LMT 203 j 1 
HETATM 65 H H81 LMT . . . UB 33 316.359 284.711 159.566 1 32.37 ? H81 LMT 203 j 1 
HETATM 66 H H92 LMT . . . UB 33 318.601 282.813 160.363 1 32.37 ? H92 LMT 203 j 1 
HETATM 67 H H91 LMT . . . UB 33 316.918 282.484 160.505 1 32.37 ? H91 LMT 203 j 1 
HETATM 68 H H102 LMT . . . UB 33 316.641 284.305 162.139 1 32.37 ? H102 LMT 203 j 1 
HETATM 69 H H101 LMT . . . UB 33 318.277 284.798 161.933 1 32.37 ? H101 LMT 203 j 1 
HETATM 70 H H112 LMT . . . UB 33 319.003 282.497 162.774 1 32.37 ? H112 LMT 203 j 1 
HETATM 71 H H111 LMT . . . UB 33 317.349 282.15 163.1 1 32.37 ? H111 LMT 203 j 1 
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