data_8ASP
#
_model_server_result.job_id            p94-ejjglCBrv_OVqU5GNQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-09-17 00:13:24' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8asp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"PC","auth_seq_id":827}' 
#
_entry.id    8ASP 
#
_exptl.entry_id    8ASP 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              893.489 
_entity.id                          13 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLOROPHYLL A' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    95 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8ASP 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8ASP 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    undecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      11 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 13 M N N 
? 13 N N N 
? 13 O N N 
? 13 P N N 
? 13 Q N N 
? 13 R N N 
? 13 S N N 
? 13 T N N 
? 13 U N N 
? 13 V N N 
? 13 W N N 
? 13 X N N 
? 13 Y N N 
? 13 Z N N 
? 13 AA N N 
? 13 BA N N 
? 13 CA N N 
? 13 DA N N 
? 13 EA N N 
? 13 FA N N 
? 13 GA N N 
? 13 HA N N 
? 13 IA N N 
? 13 JA N N 
? 13 KA N N 
? 13 LA N N 
? 13 MA N N 
? 13 NA N N 
? 13 OA N N 
? 13 PA N N 
? 13 QA N N 
? 13 RA N N 
? 13 SA N N 
? 13 TA N N 
? 13 UA N N 
? 13 VA N N 
? 13 WA N N 
? 13 XA N N 
? 13 YA N N 
? 13 ZA N N 
? 13 AB N N 
? 13 MB N N 
? 13 NB N N 
? 13 PB N N 
? 13 RB N N 
? 13 SB N N 
? 13 TB N N 
? 13 UB N N 
? 13 VB N N 
? 13 WB N N 
? 13 XB N N 
? 13 YB N N 
? 13 ZB N N 
? 13 AC N N 
? 13 BC N N 
? 13 CC N N 
? 13 DC N N 
? 13 EC N N 
? 13 FC N N 
? 13 GC N N 
? 13 HC N N 
? 13 IC N N 
? 13 JC N N 
? 13 KC N N 
? 13 LC N N 
? 13 MC N N 
? 13 NC N N 
? 13 OC N N 
? 13 PC N N 
? 13 QC N N 
? 13 RC N N 
? 13 SC N N 
? 13 TC N N 
? 13 UC N N 
? 13 VC N N 
? 13 WC N N 
? 13 XC N N 
? 13 YC N N 
? 13 ZC N N 
? 13 AD N N 
? 13 BD N N 
? 13 CD N N 
? 13 DD N N 
? 13 ED N N 
? 13 TD N N 
? 13 VD N N 
? 13 WD N N 
? 13 DE N N 
? 13 EE N N 
? 13 HE N N 
? 13 IE N N 
? 13 JE N N 
? 13 LE N N 
? 13 ME N N 
? 13 NE N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 F SG CYS 32 f CYS 32 1_555 F SG CYS 67 f CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 a GLN 115 1_555 S MG CLA . a CLA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 a GLN 123 1_555 T MG CLA . a CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 497 a THR 497 1_555 UA MG CLA . a CLA 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 574 a CYS 574 1_555 QB FE3 SF4 . b SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 583 a CYS 583 1_555 QB FE2 SF4 . b SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc6 AB MG CLA . a CLA 842 1_555 JB O5 LHG . a LHG 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc7 B OD2 ASP 93 b ASP 93 1_555 YB MG CLA . b CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc8 B SG CYS 556 b CYS 556 1_555 QB FE4 SF4 . b SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 565 b CYS 565 1_555 QB FE1 SF4 . b SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc10 ED MG CLA . b CLA 842 1_555 ND O5 LHG . b LHG 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? 
metalc ? metalc11 C SG CYS 11 c CYS 11 1_555 SD FE4 SF4 . c SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc12 C SG CYS 14 c CYS 14 1_555 SD FE3 SF4 . c SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 17 c CYS 17 1_555 SD FE2 SF4 . c SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 21 c CYS 21 1_555 RD FE2 SF4 . c SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 48 c CYS 48 1_555 RD FE4 SF4 . c SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 51 c CYS 51 1_555 RD FE1 SF4 . c SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 54 c CYS 54 1_555 RD FE3 SF4 . c SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 58 c CYS 58 1_555 SD FE1 SF4 . c SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
metalc ? metalc19 F O ASP 78 f ASP 78 1_555 WD MG CLA . f CLA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc20 H OE2 GLU 28 j GLU 28 1_555 DE MG CLA . j CLA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? 
metalc ? metalc21 I O PHE 53 k PHE 53 1_555 JE MG CLA . k CLA 4004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? 
#
_chem_comp.formula           'C55 H72 Mg N4 O5' 
_chem_comp.formula_weight    893.489 
_chem_comp.id                CLA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLOROPHYLL A' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
MG NA CLA sing 407 n n 
MG NB CLA sing 408 n n 
MG NC CLA sing 409 n n 
MG ND CLA sing 410 n n 
CHA C1A CLA sing 411 n n 
CHA C4D CLA doub 412 n n 
CHA CBD CLA sing 413 n n 
CHB C4A CLA doub 414 n n 
CHB C1B CLA sing 415 n n 
CHB HHB CLA sing 416 n n 
CHC C4B CLA sing 417 n n 
CHC C1C CLA doub 418 n n 
CHC HHC CLA sing 419 n n 
CHD C4C CLA sing 420 n n 
CHD C1D CLA doub 421 n n 
CHD HHD CLA sing 422 n n 
NA C1A CLA doub 423 n n 
NA C4A CLA sing 424 n n 
C1A C2A CLA sing 425 n n 
C2A C3A CLA sing 426 n n 
C2A CAA CLA sing 427 n n 
C2A H2A CLA sing 428 n n 
C3A C4A CLA sing 429 n n 
C3A CMA CLA sing 430 n n 
C3A H3A CLA sing 431 n n 
CMA HMA1 CLA sing 432 n n 
CMA HMA2 CLA sing 433 n n 
CMA HMA3 CLA sing 434 n n 
CAA CBA CLA sing 435 n n 
CAA HAA1 CLA sing 436 n n 
CAA HAA2 CLA sing 437 n n 
CBA CGA CLA sing 438 n n 
CBA HBA1 CLA sing 439 n n 
CBA HBA2 CLA sing 440 n n 
CGA O1A CLA doub 441 n n 
CGA O2A CLA sing 442 n n 
O2A C1 CLA sing 443 n n 
NB C1B CLA sing 444 n y 
NB C4B CLA sing 445 n y 
C1B C2B CLA doub 446 n y 
C2B C3B CLA sing 447 n y 
C2B CMB CLA sing 448 n n 
C3B C4B CLA doub 449 n y 
C3B CAB CLA sing 450 n n 
CMB HMB1 CLA sing 451 n n 
CMB HMB2 CLA sing 452 n n 
CMB HMB3 CLA sing 453 n n 
CAB CBB CLA doub 454 n n 
CAB HAB CLA sing 455 n n 
CBB HBB1 CLA sing 456 n n 
CBB HBB2 CLA sing 457 n n 
NC C1C CLA sing 458 n n 
NC C4C CLA doub 459 n n 
C1C C2C CLA sing 460 n n 
C2C C3C CLA doub 461 n n 
C2C CMC CLA sing 462 n n 
C3C C4C CLA sing 463 n n 
C3C CAC CLA sing 464 n n 
CMC HMC1 CLA sing 465 n n 
CMC HMC2 CLA sing 466 n n 
CMC HMC3 CLA sing 467 n n 
CAC CBC CLA sing 468 n n 
CAC HAC1 CLA sing 469 n n 
CAC HAC2 CLA sing 470 n n 
CBC HBC1 CLA sing 471 n n 
CBC HBC2 CLA sing 472 n n 
CBC HBC3 CLA sing 473 n n 
ND C1D CLA sing 474 n n 
ND C4D CLA sing 475 n n 
C1D C2D CLA sing 476 n n 
C2D C3D CLA doub 477 n n 
C2D CMD CLA sing 478 n n 
C3D C4D CLA sing 479 n n 
C3D CAD CLA sing 480 n n 
CMD HMD1 CLA sing 481 n n 
CMD HMD2 CLA sing 482 n n 
CMD HMD3 CLA sing 483 n n 
CAD OBD CLA doub 484 n n 
CAD CBD CLA sing 485 n n 
CBD CGD CLA sing 486 n n 
CBD HBD CLA sing 487 n n 
CGD O1D CLA doub 488 n n 
CGD O2D CLA sing 489 n n 
O2D CED CLA sing 490 n n 
CED HED1 CLA sing 491 n n 
CED HED2 CLA sing 492 n n 
CED HED3 CLA sing 493 n n 
C1 C2 CLA sing 494 n n 
C1 H11 CLA sing 495 n n 
C1 H12 CLA sing 496 n n 
C2 C3 CLA doub 497 e n 
C2 H2 CLA sing 498 n n 
C3 C4 CLA sing 499 n n 
C3 C5 CLA sing 500 n n 
C4 H41 CLA sing 501 n n 
C4 H42 CLA sing 502 n n 
C4 H43 CLA sing 503 n n 
C5 C6 CLA sing 504 n n 
C5 H51 CLA sing 505 n n 
C5 H52 CLA sing 506 n n 
C6 C7 CLA sing 507 n n 
C6 H61 CLA sing 508 n n 
C6 H62 CLA sing 509 n n 
C7 C8 CLA sing 510 n n 
C7 H71 CLA sing 511 n n 
C7 H72 CLA sing 512 n n 
C8 C9 CLA sing 513 n n 
C8 C10 CLA sing 514 n n 
C8 H8 CLA sing 515 n n 
C9 H91 CLA sing 516 n n 
C9 H92 CLA sing 517 n n 
C9 H93 CLA sing 518 n n 
C10 C11 CLA sing 519 n n 
C10 H101 CLA sing 520 n n 
C10 H102 CLA sing 521 n n 
C11 C12 CLA sing 522 n n 
C11 H111 CLA sing 523 n n 
C11 H112 CLA sing 524 n n 
C12 C13 CLA sing 525 n n 
C12 H121 CLA sing 526 n n 
C12 H122 CLA sing 527 n n 
C13 C14 CLA sing 528 n n 
C13 C15 CLA sing 529 n n 
C13 H13 CLA sing 530 n n 
C14 H141 CLA sing 531 n n 
C14 H142 CLA sing 532 n n 
C14 H143 CLA sing 533 n n 
C15 C16 CLA sing 534 n n 
C15 H151 CLA sing 535 n n 
C15 H152 CLA sing 536 n n 
C16 C17 CLA sing 537 n n 
C16 H161 CLA sing 538 n n 
C16 H162 CLA sing 539 n n 
C17 C18 CLA sing 540 n n 
C17 H171 CLA sing 541 n n 
C17 H172 CLA sing 542 n n 
C18 C19 CLA sing 543 n n 
C18 C20 CLA sing 544 n n 
C18 H18 CLA sing 545 n n 
C19 H191 CLA sing 546 n n 
C19 H192 CLA sing 547 n n 
C19 H193 CLA sing 548 n n 
C20 H201 CLA sing 549 n n 
C20 H202 CLA sing 550 n n 
C20 H203 CLA sing 551 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8ASP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
L 12 CL0 a 1 801 1011 CL0 CL0 . 
M 13 CLA a 1 802 1013 CLA CLA . 
N 13 CLA a 1 803 1101 CLA CLA . 
O 13 CLA a 1 804 1102 CLA CLA . 
P 13 CLA a 1 805 1103 CLA CLA . 
Q 13 CLA a 1 806 1104 CLA CLA . 
R 13 CLA a 1 807 1105 CLA CLA . 
S 13 CLA a 1 808 1106 CLA CLA . 
T 13 CLA a 1 809 1107 CLA CLA . 
U 13 CLA a 1 810 1108 CLA CLA . 
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