data_8B90
#
_model_server_result.job_id            HtRjOclmwsxjIkndSVtpOA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 10:10:48' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8b90 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1001}' 
#
_entry.id    8B90 
#
_exptl.entry_id    8B90 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              364.825 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            5-chloranyl-~{N}3-phenyl-~{N}1-(phenylmethyl)benzene-1,3-dicarboxamide 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8B90 
_cell.length_a            59.732 
_cell.length_b            85.562 
_cell.length_c            120.382 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8B90 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,E,F 1 1 
B,D,G 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             E 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C21 H17 Cl N2 O2' 
_chem_comp.formula_weight    364.825 
_chem_comp.id                Q1R 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              5-chloranyl-~{N}3-phenyl-~{N}1-(phenylmethyl)benzene-1,3-dicarboxamide 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C16 C17 Q1R doub 277 n y 
C16 C15 Q1R sing 278 n y 
C17 C18 Q1R sing 279 n y 
C15 C14 Q1R doub 280 n y 
C18 C19 Q1R doub 281 n y 
C14 C19 Q1R sing 282 n y 
C14 N7 Q1R sing 283 n n 
N7 C5 Q1R sing 284 n n 
C5 C4 Q1R sing 285 n n 
C5 O6 Q1R doub 286 n n 
C8 C4 Q1R doub 287 n y 
C8 C9 Q1R sing 288 n y 
CL10 C9 Q1R sing 289 n n 
C4 C3 Q1R sing 290 n y 
C9 C1 Q1R doub 291 n y 
C3 C2 Q1R doub 292 n y 
C1 C2 Q1R sing 293 n y 
C2 C11 Q1R sing 294 n n 
N13 C11 Q1R sing 295 n n 
N13 C20 Q1R sing 296 n n 
C11 O12 Q1R doub 297 n n 
C20 C21 Q1R sing 298 n n 
C21 C22 Q1R doub 299 n y 
C21 C26 Q1R sing 300 n y 
C22 C23 Q1R sing 301 n y 
C26 C25 Q1R doub 302 n y 
C23 C24 Q1R doub 303 n y 
C25 C24 Q1R sing 304 n y 
C8 H1 Q1R sing 305 n n 
C15 H2 Q1R sing 306 n n 
C17 H3 Q1R sing 307 n n 
C20 H4 Q1R sing 308 n n 
C20 H5 Q1R sing 309 n n 
C22 H6 Q1R sing 310 n n 
C24 H7 Q1R sing 311 n n 
C26 H8 Q1R sing 312 n n 
C23 H9 Q1R sing 313 n n 
C25 H10 Q1R sing 314 n n 
N13 H11 Q1R sing 315 n n 
C3 H12 Q1R sing 316 n n 
C1 H13 Q1R sing 317 n n 
N7 H14 Q1R sing 318 n n 
C16 H15 Q1R sing 319 n n 
C18 H16 Q1R sing 320 n n 
C19 H17 Q1R sing 321 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8B90 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016741 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011687 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008307 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 Q1R A 1 1001 1001 Q1R LIG . 
F 4 HOH A 1 1101 94 HOH HOH . 
F 4 HOH A 2 1102 35 HOH HOH . 
F 4 HOH A 3 1103 71 HOH HOH . 
F 4 HOH A 4 1104 12 HOH HOH . 
F 4 HOH A 5 1105 26 HOH HOH . 
F 4 HOH A 6 1106 36 HOH HOH . 
F 4 HOH A 7 1107 5 HOH HOH . 
F 4 HOH A 8 1108 88 HOH HOH . 
F 4 HOH A 9 1109 39 HOH HOH . 
F 4 HOH A 10 1110 40 HOH HOH . 
F 4 HOH A 11 1111 42 HOH HOH . 
F 4 HOH A 12 1112 11 HOH HOH . 
F 4 HOH A 13 1113 23 HOH HOH . 
F 4 HOH A 14 1114 20 HOH HOH . 
F 4 HOH A 15 1115 79 HOH HOH . 
F 4 HOH A 16 1116 69 HOH HOH . 
F 4 HOH A 17 1117 77 HOH HOH . 
F 4 HOH A 18 1118 64 HOH HOH . 
F 4 HOH A 19 1119 4 HOH HOH . 
F 4 HOH A 20 1120 93 HOH HOH . 
F 4 HOH A 21 1121 33 HOH HOH . 
F 4 HOH A 22 1122 87 HOH HOH . 
F 4 HOH A 23 1123 18 HOH HOH . 
F 4 HOH A 24 1124 21 HOH HOH . 
F 4 HOH A 25 1125 34 HOH HOH . 
F 4 HOH A 26 1126 6 HOH HOH . 
F 4 HOH A 27 1127 22 HOH HOH . 
F 4 HOH A 28 1128 25 HOH HOH . 
F 4 HOH A 29 1129 61 HOH HOH . 
F 4 HOH A 30 1130 62 HOH HOH . 
F 4 HOH A 31 1131 30 HOH HOH . 
F 4 HOH A 32 1132 57 HOH HOH . 
F 4 HOH A 33 1133 44 HOH HOH . 
F 4 HOH A 34 1134 89 HOH HOH . 
F 4 HOH A 35 1135 58 HOH HOH . 
F 4 HOH A 36 1136 45 HOH HOH . 
F 4 HOH A 37 1137 70 HOH HOH . 
F 4 HOH A 38 1138 19 HOH HOH . 
F 4 HOH A 39 1139 85 HOH HOH . 
F 4 HOH A 40 1140 52 HOH HOH . 
F 4 HOH A 41 1141 13 HOH HOH . 
F 4 HOH A 42 1142 10 HOH HOH . 
F 4 HOH A 43 1143 15 HOH HOH . 
F 4 HOH A 44 1144 38 HOH HOH . 
F 4 HOH A 45 1145 9 HOH HOH . 
F 4 HOH A 46 1146 8 HOH HOH . 
F 4 HOH A 47 1147 47 HOH HOH . 
F 4 HOH A 48 1148 55 HOH HOH . 
F 4 HOH A 49 1149 50 HOH HOH . 
F 4 HOH A 50 1150 67 HOH HOH . 
F 4 HOH A 51 1151 2 HOH HOH . 
F 4 HOH A 52 1152 48 HOH HOH . 
F 4 HOH A 53 1153 54 HOH HOH . 
F 4 HOH A 54 1154 17 HOH HOH . 
F 4 HOH A 55 1155 84 HOH HOH . 
F 4 HOH A 56 1156 49 HOH HOH . 
F 4 HOH A 57 1157 80 HOH HOH . 
F 4 HOH A 58 1158 68 HOH HOH . 
F 4 HOH A 59 1159 56 HOH HOH . 
F 4 HOH A 60 1160 91 HOH HOH . 
F 4 HOH A 61 1161 46 HOH HOH . 
F 4 HOH A 62 1162 24 HOH HOH . 
F 4 HOH A 63 1163 37 HOH HOH . 
F 4 HOH A 64 1164 76 HOH HOH . 
F 4 HOH A 65 1165 7 HOH HOH . 
F 4 HOH A 66 1166 83 HOH HOH . 
F 4 HOH A 67 1167 3 HOH HOH . 
F 4 HOH A 68 1168 81 HOH HOH . 
F 4 HOH A 69 1169 78 HOH HOH . 
F 4 HOH A 70 1170 92 HOH HOH . 
F 4 HOH A 71 1171 90 HOH HOH . 
F 4 HOH A 72 1172 65 HOH HOH . 
F 4 HOH A 73 1173 95 HOH HOH . 
F 4 HOH A 74 1174 82 HOH HOH . 
F 4 HOH A 75 1175 66 HOH HOH . 
G 4 HOH B 1 501 73 HOH HOH . 
G 4 HOH B 2 502 74 HOH HOH . 
G 4 HOH B 3 503 98 HOH HOH . 
G 4 HOH B 4 504 86 HOH HOH . 
G 4 HOH B 5 505 28 HOH HOH . 
G 4 HOH B 6 506 1 HOH HOH . 
G 4 HOH B 7 507 14 HOH HOH . 
G 4 HOH B 8 508 59 HOH HOH . 
G 4 HOH B 9 509 27 HOH HOH . 
G 4 HOH B 10 510 102 HOH HOH . 
G 4 HOH B 11 511 51 HOH HOH . 
G 4 HOH B 12 512 100 HOH HOH . 
G 4 HOH B 13 513 53 HOH HOH . 
G 4 HOH B 14 514 43 HOH HOH . 
G 4 HOH B 15 515 75 HOH HOH . 
G 4 HOH B 16 516 104 HOH HOH . 
G 4 HOH B 17 517 96 HOH HOH . 
G 4 HOH B 18 518 29 HOH HOH . 
G 4 HOH B 19 519 97 HOH HOH . 
G 4 HOH B 20 520 41 HOH HOH . 
G 4 HOH B 21 521 72 HOH HOH . 
G 4 HOH B 22 522 32 HOH HOH . 
G 4 HOH B 23 523 105 HOH HOH . 
G 4 HOH B 24 524 60 HOH HOH . 
G 4 HOH B 25 525 31 HOH HOH . 
G 4 HOH B 26 526 101 HOH HOH . 
G 4 HOH B 27 527 16 HOH HOH . 
G 4 HOH B 28 528 103 HOH HOH . 
G 4 HOH B 29 529 99 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C4 Q1R . . . E 3 -11.245 3.125 0.38 1 64.16 ? C4 Q1R 1001 A 1 
HETATM 2 C C5 Q1R . . . E 3 -12.596 3.52 -0.198 1 68.08 ? C5 Q1R 1001 A 1 
HETATM 3 C C8 Q1R . . . E 3 -10.096 3.799 0.008 1 63.24 ? C8 Q1R 1001 A 1 
HETATM 4 C C15 Q1R . . . E 3 -13.956 3.419 -3.492 1 58.16 ? C15 Q1R 1001 A 1 
HETATM 5 C C17 Q1R . . . E 3 -16.08 4.599 -3.708 1 54.11 ? C17 Q1R 1001 A 1 
HETATM 6 C C20 Q1R . . . E 3 -8.827 -1.372 3.754 1 60.75 ? C20 Q1R 1001 A 1 
HETATM 7 C C21 Q1R . . . E 3 -7.862 -1.06 4.866 1 60.96 ? C21 Q1R 1001 A 1 
HETATM 8 C C22 Q1R . . . E 3 -6.964 -2.046 5.275 1 63.31 ? C22 Q1R 1001 A 1 
HETATM 9 C C24 Q1R . . . E 3 -6.083 -0.518 6.91 1 61.56 ? C24 Q1R 1001 A 1 
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HETATM 11 C C23 Q1R . . . E 3 -6.065 -1.77 6.305 1 62.9 ? C23 Q1R 1001 A 1 
HETATM 12 C C25 Q1R . . . E 3 -7.002 0.45 6.504 1 63.67 ? C25 Q1R 1001 A 1 
HETATM 13 N N13 Q1R . . . E 3 -8.923 -0.225 2.86 1 57.68 ? N13 Q1R 1001 A 1 
HETATM 14 C C11 Q1R . . . E 3 -9.993 0.567 2.909 1 61.75 ? C11 Q1R 1001 A 1 
HETATM 15 O O12 Q1R . . . E 3 -10.923 0.403 3.691 1 60.23 ? O12 Q1R 1001 A 1 
HETATM 16 C C2 Q1R . . . E 3 -10.023 1.704 1.901 1 59.35 ? C2 Q1R 1001 A 1 
HETATM 17 C C3 Q1R . . . E 3 -11.213 2.088 1.32 1 60.37 ? C3 Q1R 1001 A 1 
HETATM 18 C C1 Q1R . . . E 3 -8.865 2.357 1.535 1 60.66 ? C1 Q1R 1001 A 1 
HETATM 19 C C9 Q1R . . . E 3 -8.912 3.382 0.6 1 65.4 ? C9 Q1R 1001 A 1 
HETATM 20 CL CL10 Q1R . . . E 3 -7.441 4.155 0.191 1 62.43 ? CL10 Q1R 1001 A 1 
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HETATM 22 N N7 Q1R . . . E 3 -12.623 3.702 -1.548 1 61.88 ? N7 Q1R 1001 A 1 
HETATM 23 C C14 Q1R . . . E 3 -13.747 4.004 -2.233 1 58.11 ? C14 Q1R 1001 A 1 
HETATM 24 C C16 Q1R . . . E 3 -15.12 3.717 -4.205 1 56.5 ? C16 Q1R 1001 A 1 
HETATM 25 C C18 Q1R . . . E 3 -15.882 5.194 -2.469 1 58.57 ? C18 Q1R 1001 A 1 
HETATM 26 C C19 Q1R . . . E 3 -14.719 4.886 -1.747 1 59.68 ? C19 Q1R 1001 A 1 
#
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_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           26 
#