data_8B9Z
#
_model_server_result.job_id            P62Pz29ARRkQuiP9HJ4mKQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 04:44:46' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8b9z 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"HB","auth_seq_id":302}' 
#
_entry.id    8B9Z 
#
_exptl.entry_id    8B9Z 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          45 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8B9Z 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8B9Z 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    43-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      43 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 45 UA N N 
? 45 ZA N N 
? 45 AB N N 
? 45 BB N N 
? 45 GB N N 
? 45 HB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 W SG CYS 79 X CYS 80 1_555 W SG CYS 112 X CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf2 W SG CYS 89 X CYS 90 1_555 W SG CYS 102 X CYS 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
covale ? covale1 D C HIS 84 D HIS 122 1_555 D N 2MR 85 D 2MR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale2 D C 2MR 85 D 2MR 123 1_555 D N GLY 86 D GLY 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale3 S OG SER 41 T SER 108 1_555 UB P1 EHZ . T EHZ 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.651 ? 
covale ? covale4 T OG SER 41 U SER 108 1_555 VB P1 EHZ . U EHZ 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.64 ? 
metalc ? metalc1 B SG CYS 57 B CYS 96 1_555 UA FE3 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? 
metalc ? metalc2 B SG CYS 58 B CYS 97 1_555 UA FE4 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 122 B CYS 161 1_555 UA FE1 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 152 B CYS 191 1_555 UA FE2 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc5 E SG CYS 100 E CYS 128 1_555 XA FE1 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc6 E SG CYS 105 E CYS 133 1_555 XA FE1 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc7 E SG CYS 141 E CYS 169 1_555 XA FE2 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc8 E SG CYS 145 E CYS 173 1_555 XA FE2 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? 
metalc ? metalc9 F SG CYS 361 F CYS 394 1_555 ZA FE4 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? 
metalc ? metalc10 F SG CYS 364 F CYS 397 1_555 ZA FE1 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc11 F SG CYS 367 F CYS 400 1_555 ZA FE2 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? 
metalc ? metalc12 F SG CYS 407 F CYS 440 1_555 ZA FE3 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? 
metalc ? metalc13 G SG CYS 74 G CYS 74 1_555 CB FE1 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc14 G SG CYS 85 G CYS 85 1_555 CB FE1 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? 
metalc ? metalc15 G SG CYS 88 G CYS 88 1_555 CB FE2 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
metalc ? metalc16 G SG CYS 102 G CYS 102 1_555 CB FE2 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc17 G SG CYS 138 G CYS 138 1_555 AB FE2 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc18 G SG CYS 141 G CYS 141 1_555 AB FE4 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? 
metalc ? metalc19 G SG CYS 147 G CYS 147 1_555 AB FE1 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? 
metalc ? metalc20 G SG CYS 190 G CYS 190 1_555 BB FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc21 G SG CYS 193 G CYS 193 1_555 BB FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? 
metalc ? metalc22 G SG CYS 196 G CYS 196 1_555 BB FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc23 G O ILE 237 G ILE 237 1_555 DB NA NA . G NA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.92 ? 
metalc ? metalc24 G SG CYS 240 G CYS 240 1_555 BB FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc25 G O CYS 240 G CYS 240 1_555 DB NA NA . G NA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? 
metalc ? metalc26 G O VAL 242 G VAL 242 1_555 DB NA NA . G NA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.972 ? 
metalc ? metalc27 G O LEU 245 G LEU 245 1_555 DB NA NA . G NA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? 
metalc ? metalc28 I SG CYS 87 I CYS 118 1_555 HB FE2 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc29 I SG CYS 90 I CYS 121 1_555 HB FE4 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc30 I SG CYS 93 I CYS 124 1_555 HB FE3 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc31 I SG CYS 97 I CYS 128 1_555 GB FE4 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? 
metalc ? metalc32 I SG CYS 126 I CYS 157 1_555 GB FE2 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc33 I SG CYS 129 I CYS 160 1_555 GB FE1 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc34 I SG CYS 132 I CYS 163 1_555 GB FE3 SF4 . I SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc35 I SG CYS 136 I CYS 167 1_555 HB FE1 SF4 . I SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc36 R SG CYS 55 R CYS 87 1_555 TB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc37 R NE2 HIS 64 R HIS 96 1_555 TB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc38 R SG CYS 79 R CYS 111 1_555 TB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc39 R SG CYS 82 R CYS 114 1_555 TB ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 1122 n n 
FE1 S3 SF4 sing 1123 n n 
FE1 S4 SF4 sing 1124 n n 
FE2 S1 SF4 sing 1125 n n 
FE2 S3 SF4 sing 1126 n n 
FE2 S4 SF4 sing 1127 n n 
FE3 S1 SF4 sing 1128 n n 
FE3 S2 SF4 sing 1129 n n 
FE3 S4 SF4 sing 1130 n n 
FE4 S1 SF4 sing 1131 n n 
FE4 S2 SF4 sing 1132 n n 
FE4 S3 SF4 sing 1133 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8B9Z 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
RA 43 PC1 A 1 201 705 PC1 PC1 . 
SA 44 3PE A 1 202 708 3PE 3PE . 
TA 44 3PE A 1 203 717 3PE 3PE . 
UA 45 SF4 B 1 301 301 SF4 SF4 . 
VA 44 3PE B 1 302 700 3PE 3PE . 
WA 46 CDL B 1 303 701 CDL CDL . 
XA 47 FES E 1 301 301 FES FES . 
YA 48 FMN F 1 501 501 FMN FMN . 
ZA 45 SF4 F 1 502 502 SF4 SF4 . 
AB 45 SF4 G 1 801 801 SF4 SF4 . 
BB 45 SF4 G 1 802 802 SF4 SF4 . 
CB 47 FES G 1 803 803 FES FES . 
DB 49 NA G 1 804 804 NA NA . 
EB 50 UQ9 H 1 501 501 UQ9 UQ9 . 
FB 44 3PE H 1 502 715 3PE 3PE . 
GB 45 SF4 I 1 301 302 SF4 SF4 . 
HB 45 SF4 I 1 302 303 SF4 SF4 . 
IB 43 PC1 J 1 201 201 PC1 PC1 . 
JB 44 3PE J 1 202 706 3PE 3PE . 
KB 44 3PE J 1 203 709 3PE 3PE . 
LB 44 3PE L 1 601 601 3PE 3PE . 
MB 44 3PE L 1 602 719 3PE 3PE . 
NB 44 3PE L 1 603 723 3PE 3PE . 
OB 44 3PE M 1 501 602 3PE 3PE . 
PB 44 3PE N 1 401 718 3PE 3PE . 
QB 51 DGT O 1 501 501 DGT DGT . 
RB 52 NDP P 1 501 501 NDP NDP . 
SB 46 CDL P 1 502 801 CDL CDL . 
TB 53 ZN R 1 201 201 ZN ZN . 
UB 54 EHZ T 1 201 201 EHZ EHZ . 
VB 54 EHZ U 1 201 201 EHZ EHZ . 
WB 44 3PE X 1 201 707 3PE 3PE . 
XB 44 3PE Y 1 301 301 3PE 3PE . 
YB 44 3PE Y 1 302 702 3PE 3PE . 
ZB 44 3PE Y 1 303 704 3PE 3PE . 
AC 44 3PE d 1 201 712 3PE 3PE . 
BC 46 CDL h 1 201 703 CDL CDL . 
CC 46 CDL h 1 202 720 CDL CDL . 
DC 43 PC1 i 1 201 721 PC1 PC1 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . HB 45 237.585 219.925 168.104 1 55.02 ? FE1 SF4 302 I 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . HB 45 234.949 219.727 167.455 1 55.02 ? FE2 SF4 302 I 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . HB 45 235.789 219.031 169.945 1 55.02 ? FE3 SF4 302 I 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . HB 45 236.445 217.478 167.813 1 55.02 ? FE4 SF4 302 I 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . HB 45 234.351 217.864 168.624 1 55.02 ? S1 SF4 302 I 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . HB 45 237.827 218.137 169.491 1 55.02 ? S2 SF4 302 I 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . HB 45 236.722 219.049 166.19 1 55.02 ? S3 SF4 302 I 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . HB 45 235.863 221.108 169.015 1 55.02 ? S4 SF4 302 I 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              31 
_model_server_stats.parse_time_ms           16 
_model_server_stats.create_model_time_ms    99 
_model_server_stats.query_time_ms           268 
_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           8 
#