data_8BBJ
#
_model_server_result.job_id            oQU-m1G6PSrvjUZVghtHEw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-07-15 13:12:35' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8bbj 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":304}' 
#
_entry.id    8BBJ 
#
_exptl.entry_id    8BBJ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8BBJ 
_cell.length_a            79.409 
_cell.length_b            103.134 
_cell.length_c            121.656 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8BBJ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? dimeric 2 author_defined_assembly 1 
? dimeric 2 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,E,F,G,H,I,N,P 1 1 
B,D,J,K,L,M,O,Q 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 C SG CYS 167 C CYS 253 1_555 C SG CYS 183 C CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf2 D SG CYS 167 D CYS 253 1_555 D SG CYS 183 D CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
covale ? covale1 A C LEU 66 A LEU 64 1_555 A N1 CRO 67 A CRO 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? 
covale ? covale2 A C3 CRO 67 A CRO 66 1_555 A N VAL 68 A VAL 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? 
covale ? covale3 B C LEU 66 B LEU 64 1_555 B N1 CRO 67 B CRO 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? 
covale ? covale4 B C3 CRO 67 B CRO 66 1_555 B N VAL 68 B VAL 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? 
metalc ? metalc1 C OD1 ASP 32 C ASP 118 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc2 C OD1 ASP 34 C ASP 120 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc3 C OG SER 36 C SER 122 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? 
metalc ? metalc4 C O PHE 38 C PHE 124 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc5 C OE1 GLU 43 C GLU 129 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? 
metalc ? metalc6 C OE2 GLU 43 C GLU 129 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.032 ? 
metalc ? metalc7 C OD1 ASP 76 C ASP 162 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? 
metalc ? metalc8 C OD1 ASN 78 C ASN 164 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc9 C OD2 ASP 80 C ASP 166 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? 
metalc ? metalc10 C O ARG 82 C ARG 168 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc11 C OD1 ASP 124 C ASP 210 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? 
metalc ? metalc12 C OG SER 126 C SER 212 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc13 C OG1 THR 128 C THR 214 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc14 C O ALA 130 C ALA 216 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? 
metalc ? metalc15 C OE1 GLU 132 C GLU 218 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? 
metalc ? metalc16 C OE1 GLU 135 C GLU 221 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? 
metalc ? metalc17 C OE2 GLU 135 C GLU 221 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.168 ? 
metalc ? metalc18 C OD2 ASP 168 C ASP 254 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc19 C OD1 ASN 170 C ASN 256 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc20 C OD1 ASP 172 C ASP 258 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc21 C O LYS 174 C LYS 260 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? 
metalc ? metalc22 C OE1 GLN 176 C GLN 262 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? 
metalc ? metalc23 C OE1 GLU 179 C GLU 265 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? 
metalc ? metalc24 C OE2 GLU 179 C GLU 265 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? 
metalc ? metalc25 D OD1 ASP 32 D ASP 118 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? 
metalc ? metalc26 D OD2 ASP 34 D ASP 120 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc27 D OG SER 36 D SER 122 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? 
metalc ? metalc28 D O PHE 38 D PHE 124 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? 
metalc ? metalc29 D OE1 GLU 43 D GLU 129 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? 
metalc ? metalc30 D OE2 GLU 43 D GLU 129 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? 
metalc ? metalc31 D OD1 ASP 76 D ASP 162 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc32 D OD1 ASN 78 D ASN 164 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc33 D OD2 ASP 80 D ASP 166 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? 
metalc ? metalc34 D O ARG 82 D ARG 168 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc35 D OD1 ASP 124 D ASP 210 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc36 D OG SER 126 D SER 212 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? 
metalc ? metalc37 D OG1 THR 128 D THR 214 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc38 D O ALA 130 D ALA 216 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc39 D OE2 GLU 132 D GLU 218 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? 
metalc ? metalc40 D OE1 GLU 135 D GLU 221 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.974 ? 
metalc ? metalc41 D OD2 ASP 168 D ASP 254 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc42 D OD1 ASN 170 D ASN 256 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? 
metalc ? metalc43 D OD2 ASP 172 D ASP 258 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc44 D O LYS 174 D LYS 260 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc45 D OE1 GLN 176 D GLN 262 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? 
metalc ? metalc46 D OE1 GLU 179 D GLU 265 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? 
metalc ? metalc47 D OE2 GLU 179 D GLU 265 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? 
metalc ? metalc48 J CA CA . D CA 301 1_555 Q O HOH . D HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8BBJ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012593 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009696 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00822 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 CA C 1 301 1 CA CA . 
F 3 CA C 1 302 2 CA CA . 
G 3 CA C 1 303 3 CA CA . 
H 3 CA C 1 304 4 CA CA . 
I 4 CAC C 1 305 301 CAC CAC . 
J 3 CA D 1 301 5 CA CA . 
K 3 CA D 1 302 6 CA CA . 
L 3 CA D 1 303 7 CA CA . 
M 3 CA D 1 304 8 CA CA . 
N 5 HOH A 1 301 8 HOH HOH . 
O 5 HOH B 1 301 11 HOH HOH . 
O 5 HOH B 2 302 1 HOH HOH . 
P 5 HOH C 1 401 6 HOH HOH . 
P 5 HOH C 2 402 7 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 1 401 2 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 2 402 9 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 3 403 3 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 4 404 12 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 5 405 5 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 6 406 10 HOH HOH . 
Q 5 HOH D 7 407 4 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         M 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               -37.43 
_atom_site.Cartn_y               13.504 
_atom_site.Cartn_z               27.185 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        51.69 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           304 
_atom_site.auth_asym_id          D 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              23 
_model_server_stats.parse_time_ms           44 
_model_server_stats.create_model_time_ms    17 
_model_server_stats.query_time_ms           518 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#