data_8BBJ # _model_server_result.job_id dP3HI-45AagQ2oDh1j8EnA _model_server_result.datetime_utc '2025-07-17 17:01:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8bbj # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":305}' # _entry.id 8BBJ # _exptl.entry_id 8BBJ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 136.989 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CACODYLATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8BBJ _cell.length_a 79.409 _cell.length_b 103.134 _cell.length_c 121.656 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8BBJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,F,G,H,I,N,P 1 1 B,D,J,K,L,M,O,Q 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id I _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 167 C CYS 253 1_555 C SG CYS 183 C CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf2 D SG CYS 167 D CYS 253 1_555 D SG CYS 183 D CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? covale ? covale1 A C LEU 66 A LEU 64 1_555 A N1 CRO 67 A CRO 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale2 A C3 CRO 67 A CRO 66 1_555 A N VAL 68 A VAL 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale3 B C LEU 66 B LEU 64 1_555 B N1 CRO 67 B CRO 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale4 B C3 CRO 67 B CRO 66 1_555 B N VAL 68 B VAL 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? metalc ? metalc1 C OD1 ASP 32 C ASP 118 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc2 C OD1 ASP 34 C ASP 120 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc3 C OG SER 36 C SER 122 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc4 C O PHE 38 C PHE 124 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc5 C OE1 GLU 43 C GLU 129 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc6 C OE2 GLU 43 C GLU 129 1_555 E CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.032 ? metalc ? metalc7 C OD1 ASP 76 C ASP 162 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc8 C OD1 ASN 78 C ASN 164 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc9 C OD2 ASP 80 C ASP 166 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? metalc ? metalc10 C O ARG 82 C ARG 168 1_555 F CA CA . C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc11 C OD1 ASP 124 C ASP 210 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc12 C OG SER 126 C SER 212 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc13 C OG1 THR 128 C THR 214 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc14 C O ALA 130 C ALA 216 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc15 C OE1 GLU 132 C GLU 218 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? metalc ? metalc16 C OE1 GLU 135 C GLU 221 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc ? metalc17 C OE2 GLU 135 C GLU 221 1_555 G CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.168 ? metalc ? metalc18 C OD2 ASP 168 C ASP 254 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc19 C OD1 ASN 170 C ASN 256 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc20 C OD1 ASP 172 C ASP 258 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc21 C O LYS 174 C LYS 260 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc22 C OE1 GLN 176 C GLN 262 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc23 C OE1 GLU 179 C GLU 265 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc24 C OE2 GLU 179 C GLU 265 1_555 H CA CA . C CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc25 D OD1 ASP 32 D ASP 118 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? metalc ? metalc26 D OD2 ASP 34 D ASP 120 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc27 D OG SER 36 D SER 122 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? metalc ? metalc28 D O PHE 38 D PHE 124 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc29 D OE1 GLU 43 D GLU 129 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc30 D OE2 GLU 43 D GLU 129 1_555 J CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc31 D OD1 ASP 76 D ASP 162 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc32 D OD1 ASN 78 D ASN 164 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc33 D OD2 ASP 80 D ASP 166 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc34 D O ARG 82 D ARG 168 1_555 K CA CA . D CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc35 D OD1 ASP 124 D ASP 210 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc36 D OG SER 126 D SER 212 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? metalc ? metalc37 D OG1 THR 128 D THR 214 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc38 D O ALA 130 D ALA 216 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc39 D OE2 GLU 132 D GLU 218 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc40 D OE1 GLU 135 D GLU 221 1_555 L CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.974 ? metalc ? metalc41 D OD2 ASP 168 D ASP 254 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc42 D OD1 ASN 170 D ASN 256 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc43 D OD2 ASP 172 D ASP 258 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc44 D O LYS 174 D LYS 260 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc45 D OE1 GLN 176 D GLN 262 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc46 D OE1 GLU 179 D GLU 265 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc47 D OE2 GLU 179 D GLU 265 1_555 M CA CA . D CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? metalc ? metalc48 J CA CA . D CA 301 1_555 Q O HOH . D HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? # _chem_comp.formula 'C2 H6 As O2 -1' _chem_comp.formula_weight 136.989 _chem_comp.id CAC _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CACODYLATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms dimethylarsinate # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag AS O1 CAC doub 70 n n AS O2 CAC sing 71 n n AS C1 CAC sing 72 n n AS C2 CAC sing 73 n n C1 H11 CAC sing 74 n n C1 H12 CAC sing 75 n n C1 H13 CAC sing 76 n n C2 H21 CAC sing 77 n n C2 H22 CAC sing 78 n n C2 H23 CAC sing 79 n n # _atom_sites.entry_id 8BBJ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012593 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009696 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00822 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 CA C 1 301 1 CA CA . F 3 CA C 1 302 2 CA CA . G 3 CA C 1 303 3 CA CA . H 3 CA C 1 304 4 CA CA . I 4 CAC C 1 305 301 CAC CAC . J 3 CA D 1 301 5 CA CA . K 3 CA D 1 302 6 CA CA . L 3 CA D 1 303 7 CA CA . M 3 CA D 1 304 8 CA CA . N 5 HOH A 1 301 8 HOH HOH . O 5 HOH B 1 301 11 HOH HOH . O 5 HOH B 2 302 1 HOH HOH . P 5 HOH C 1 401 6 HOH HOH . P 5 HOH C 2 402 7 HOH HOH . Q 5 HOH D 1 401 2 HOH HOH . Q 5 HOH D 2 402 9 HOH HOH . Q 5 HOH D 3 403 3 HOH HOH . Q 5 HOH D 4 404 12 HOH HOH . Q 5 HOH D 5 405 5 HOH HOH . Q 5 HOH D 6 406 10 HOH HOH . Q 5 HOH D 7 407 4 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 AS AS CAC . . . I 4 -39.529 32.975 0.861 1 95.27 ? AS CAC 305 C 1 HETATM 2 O O1 CAC . . . I 4 -39.196 33.452 2.415 1 85.68 ? O1 CAC 305 C 1 HETATM 3 O O2 CAC . . . I 4 -40.204 34.237 0.01 1 85.48 ? O2 CAC 305 C 1 HETATM 4 C C1 CAC . . . I 4 -37.978 32.507 -0.133 1 77.72 ? C1 CAC 305 C 1 HETATM 5 C C2 CAC . . . I 4 -40.717 31.483 0.792 1 86.33 ? C2 CAC 305 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 11 _model_server_stats.query_time_ms 240 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 5 #