data_8BOZ # _model_server_result.job_id d2xIPknqaNdBk-tkls4EuQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-13 00:28:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8boz # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":701}' # _entry.id 8BOZ # _exptl.entry_id 8BOZ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 93.18 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8BOZ _cell.length_a 67.86 _cell.length_b 449.07 _cell.length_c 116.23 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8BOZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 5 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 6 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 7 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,Q 1 1 B,E,R 2 1 D,F,S 3 1 G,H,T 4 1 I,J,U 5 1 K,L,V 6 1 M,N,W 7 1 O,P,X 8 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N ? 3 W N N ? 3 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 88 B CYS 88 1_555 C SG CYS 259 B CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 141 B CYS 141 1_555 C SG CYS 148 B CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 E SG CYS 88 D CYS 88 1_555 E SG CYS 259 D CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 E SG CYS 141 D CYS 141 1_555 E SG CYS 148 D CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf5 F SG CYS 88 F CYS 88 1_555 F SG CYS 259 F CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 F SG CYS 141 F CYS 141 1_555 F SG CYS 148 F CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 H SG CYS 88 H CYS 88 1_555 H SG CYS 259 H CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 H SG CYS 141 H CYS 141 1_555 H SG CYS 148 H CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 J SG CYS 88 J CYS 88 1_555 J SG CYS 259 J CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 J SG CYS 141 J CYS 141 1_555 J SG CYS 148 J CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 L SG CYS 88 L CYS 88 1_555 L SG CYS 259 L CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf12 L SG CYS 141 L CYS 141 1_555 L SG CYS 148 L CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 N SG CYS 88 N CYS 88 1_555 N SG CYS 259 N CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 N SG CYS 141 N CYS 141 1_555 N SG CYS 148 N CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 P SG CYS 88 P CYS 88 1_555 P SG CYS 259 P CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 P SG CYS 141 P CYS 141 1_555 P SG CYS 148 P CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 444 A ASP 444 1_555 Q CA CA . A CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 484 A ASP 484 1_555 Q CA CA . A CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc3 A O GLN 485 A GLN 485 1_555 Q CA CA . A CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 573 A ASP 573 1_555 Q CA CA . A CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.056 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 573 A ASP 573 1_555 Q CA CA . A CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc6 B OD1 ASP 444 C ASP 444 1_555 R CA CA . C CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? metalc ? metalc7 B OD2 ASP 444 C ASP 444 1_555 R CA CA . C CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc8 B OD1 ASP 484 C ASP 484 1_555 R CA CA . C CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc9 B OD2 ASP 573 C ASP 573 1_555 R CA CA . C CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc10 D OD1 ASP 444 E ASP 444 1_555 S CA CA . E CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.939 ? metalc ? metalc11 D OD2 ASP 444 E ASP 444 1_555 S CA CA . E CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc12 D OD1 ASP 484 E ASP 484 1_555 S CA CA . E CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.809 ? metalc ? metalc13 D O GLN 485 E GLN 485 1_555 S CA CA . E CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc ? metalc14 D OD1 ASP 573 E ASP 573 1_555 S CA CA . E CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc15 G OD1 ASP 444 G ASP 444 1_555 T CA CA . G CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? metalc ? metalc16 G OD2 ASP 444 G ASP 444 1_555 T CA CA . G CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc17 G OD1 ASP 484 G ASP 484 1_555 T CA CA . G CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc18 G OD1 ASP 573 G ASP 573 1_555 T CA CA . G CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc19 I OD1 ASP 444 I ASP 444 1_555 U CA CA . I CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? metalc ? metalc20 I OD2 ASP 444 I ASP 444 1_555 U CA CA . I CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc21 I OD1 ASP 484 I ASP 484 1_555 U CA CA . I CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc22 I O GLN 485 I GLN 485 1_555 U CA CA . I CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.973 ? metalc ? metalc23 I OD1 ASP 573 I ASP 573 1_555 U CA CA . I CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc24 K OD2 ASP 444 K ASP 444 1_555 V CA CA . K CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc25 K O GLN 485 K GLN 485 1_555 V CA CA . K CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? metalc ? metalc26 K O PRO 571 K PRO 571 1_555 V CA CA . K CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.948 ? metalc ? metalc27 K OD1 ASP 573 K ASP 573 1_555 V CA CA . K CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.199 ? metalc ? metalc28 K OD2 ASP 573 K ASP 573 1_555 V CA CA . K CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc29 M OD1 ASP 444 M ASP 444 1_555 W CA CA . M CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc30 M OD2 ASP 444 M ASP 444 1_555 W CA CA . M CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc31 M OD1 ASP 484 M ASP 484 1_555 W CA CA . M CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? metalc ? metalc32 M OD2 ASP 573 M ASP 573 1_555 W CA CA . M CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc33 O OD1 ASP 444 O ASP 444 1_555 X CA CA . O CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc34 O OD2 ASP 444 O ASP 444 1_555 X CA CA . O CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? metalc ? metalc35 O OD1 ASP 484 O ASP 484 1_555 X CA CA . O CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc36 O O GLN 485 O GLN 485 1_555 X CA CA . O CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.123 ? metalc ? metalc37 O OD2 ASP 573 O ASP 573 1_555 X CA CA . O CA 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8BOZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014736 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000819 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.002227 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008617 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 3 CA A 1 701 1 CA CA . R 3 CA C 1 701 2 CA CA . S 3 CA E 1 701 3 CA CA . T 3 CA G 1 701 4 CA CA . U 3 CA I 1 701 5 CA CA . V 3 CA K 1 701 6 CA CA . W 3 CA M 1 701 7 CA CA . X 3 CA O 1 701 8 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id U _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 46.238 _atom_site.Cartn_y 16.312 _atom_site.Cartn_z 92.261 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 70.75 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 701 _atom_site.auth_asym_id I _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 27 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 70 _model_server_stats.query_time_ms 328 _model_server_stats.encode_time_ms 25 _model_server_stats.element_count 1 #