data_8BQ2
#
_model_server_result.job_id            w7pDDrNhy23MWqge3UARPg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-10 13:32:30' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8bq2 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":402}' 
#
_entry.id    8BQ2 
#
_exptl.entry_id    8BQ2 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    18 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8BQ2 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8BQ2 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 L N N 
? 4 M N N 
? 4 N N N 
? 4 P N N 
? 4 Q N N 
? 4 S N N 
? 4 T N N 
? 4 V N N 
? 4 W N N 
? 4 Y N N 
? 4 Z N N 
? 4 BA N N 
? 4 CA N N 
? 4 EA N N 
? 4 FA N N 
? 4 HA N N 
? 4 IA N N 
? 4 KA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG1 THR 134 A THR 134 1_555 L CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc2 A O ALA 293 A ALA 293 1_555 N CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.099 ? 
metalc ? metalc3 A O SER 296 A SER 296 1_555 N CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 316 A ASP 316 1_555 N CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc5 K O2G ATP . A ATP 401 1_555 L CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc6 K O3G ATP . A ATP 401 1_555 M CA CA . A CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc7 N CA CA . A CA 404 1_555 O O3G ATP . B ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc8 B OG1 THR 134 B THR 134 1_555 P CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc9 B O ALA 293 B ALA 293 1_555 Q CA CA . B CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.132 ? 
metalc ? metalc10 B O SER 296 B SER 296 1_555 Q CA CA . B CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc11 B OD2 ASP 316 B ASP 316 1_555 Q CA CA . B CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc12 O O2G ATP . B ATP 400 1_555 P CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc13 Q CA CA . B CA 402 1_555 R O3G ATP . C ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc14 C OG1 THR 134 C THR 134 1_555 S CA CA . C CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc15 C O SER 296 C SER 296 1_555 T CA CA . C CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc16 C OD2 ASP 316 C ASP 316 1_555 T CA CA . C CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? 
metalc ? metalc17 R O2G ATP . C ATP 400 1_555 S CA CA . C CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc18 T CA CA . C CA 402 1_555 U O3G ATP . D ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc19 D OG1 THR 134 D THR 134 1_555 V CA CA . D CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc20 D O ALA 293 D ALA 293 1_555 W CA CA . D CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.12 ? 
metalc ? metalc21 D O SER 296 D SER 296 1_555 W CA CA . D CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc22 D OD2 ASP 316 D ASP 316 1_555 W CA CA . D CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? 
metalc ? metalc23 U O2G ATP . D ATP 400 1_555 V CA CA . D CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc24 W CA CA . D CA 402 1_555 X O3G ATP . E ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc25 E OG1 THR 134 E THR 134 1_555 Y CA CA . E CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc26 E O ALA 293 E ALA 293 1_555 Z CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? 
metalc ? metalc27 E O SER 296 E SER 296 1_555 Z CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc28 E OD2 ASP 316 E ASP 316 1_555 Z CA CA . E CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? 
metalc ? metalc29 X O2G ATP . E ATP 400 1_555 Y CA CA . E CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc30 Z CA CA . E CA 402 1_555 AA O3G ATP . F ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc31 F OG1 THR 134 F THR 134 1_555 BA CA CA . F CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc32 F O ALA 293 F ALA 293 1_555 CA CA CA . F CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.158 ? 
metalc ? metalc33 F O SER 296 F SER 296 1_555 CA CA CA . F CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc34 F OD2 ASP 316 F ASP 316 1_555 CA CA CA . F CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? 
metalc ? metalc35 AA O2G ATP . F ATP 400 1_555 BA CA CA . F CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc36 CA CA CA . F CA 402 1_555 DA O3G ATP . G ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc37 G OG1 THR 134 G THR 134 1_555 EA CA CA . G CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc38 G O ALA 293 G ALA 293 1_555 FA CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.148 ? 
metalc ? metalc39 G O SER 296 G SER 296 1_555 FA CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc40 G OD2 ASP 316 G ASP 316 1_555 FA CA CA . G CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? 
metalc ? metalc41 DA O2G ATP . G ATP 400 1_555 EA CA CA . G CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc42 FA CA CA . G CA 402 1_555 GA O3G ATP . H ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc43 H OG1 THR 134 H THR 134 1_555 HA CA CA . H CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc44 H O ALA 293 H ALA 293 1_555 IA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.121 ? 
metalc ? metalc45 H O SER 296 H SER 296 1_555 IA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc46 H OD2 ASP 316 H ASP 316 1_555 IA CA CA . H CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? 
metalc ? metalc47 GA O2G ATP . H ATP 400 1_555 HA CA CA . H CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc48 IA CA CA . H CA 402 1_555 JA O3G ATP . I ATP 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc49 I OG1 THR 134 I THR 134 1_555 KA CA CA . I CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc50 JA O2G ATP . I ATP 400 1_555 KA CA CA . I CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8BQ2 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 3 ATP A 1 401 400 ATP ATP . 
L 4 CA A 1 402 401 CA CA . 
M 4 CA A 1 403 402 CA CA . 
N 4 CA A 1 404 402 CA CA . 
O 3 ATP B 1 400 400 ATP ATP . 
P 4 CA B 1 401 401 CA CA . 
Q 4 CA B 1 402 402 CA CA . 
R 3 ATP C 1 400 400 ATP ATP . 
S 4 CA C 1 401 401 CA CA . 
T 4 CA C 1 402 402 CA CA . 
U 3 ATP D 1 400 400 ATP ATP . 
V 4 CA D 1 401 401 CA CA . 
W 4 CA D 1 402 402 CA CA . 
X 3 ATP E 1 400 400 ATP ATP . 
Y 4 CA E 1 401 401 CA CA . 
Z 4 CA E 1 402 402 CA CA . 
AA 3 ATP F 1 400 400 ATP ATP . 
BA 4 CA F 1 401 401 CA CA . 
CA 4 CA F 1 402 402 CA CA . 
DA 3 ATP G 1 400 400 ATP ATP . 
EA 4 CA G 1 401 401 CA CA . 
FA 4 CA G 1 402 402 CA CA . 
GA 3 ATP H 1 400 400 ATP ATP . 
HA 4 CA H 1 401 401 CA CA . 
IA 4 CA H 1 402 402 CA CA . 
JA 3 ATP I 1 400 400 ATP ATP . 
KA 4 CA I 1 401 401 CA CA . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         Z 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               130.946 
_atom_site.Cartn_y               124.429 
_atom_site.Cartn_z               136.297 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        35.03 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           402 
_atom_site.auth_asym_id          E 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              13 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    25 
_model_server_stats.query_time_ms           279 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#