data_8BTS # _model_server_result.job_id HTPtK43rGvBh828dFRsyYQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 14:32:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8bts # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":603}' # _entry.id 8BTS # _exptl.entry_id 8BTS _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 104.76 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8BTS _cell.length_a 148.392 _cell.length_b 73.444 _cell.length_c 211.253 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8BTS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 1 1 E,F,G,H,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 K N N ? 5 L N N ? 5 O N N ? 5 P N N ? 5 Q N N ? 5 R N N ? 5 S N N ? 5 Y N N ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 NA N N ? 5 QA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 70 A CYS 62 1_555 N FE3 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc2 A N CYS 96 A CYS 88 1_555 N FE5 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 96 A CYS 88 1_555 N FE4 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 96 A CYS 88 1_555 N FE5 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 162 A CYS 154 1_555 N FE1 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 283 A CYS 275 1_555 J FE1 ICS . A ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 70 B CYS 70 1_555 N FE7 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 95 B CYS 95 1_555 N FE8 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc9 B SG CYS 95 B CYS 95 1_555 N FE2 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? metalc ? metalc10 B O ARG 108 B ARG 108 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc11 B OE2 GLU 109 B GLU 109 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc12 B OG SER 188 B SER 188 1_555 N FE6 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc13 B OD2 ASP 353 B ASP 353 1_555 V FE FE . B FE 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc14 B OD2 ASP 357 B ASP 357 1_555 V FE FE . B FE 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.934 ? metalc ? metalc15 V FE FE . B FE 709 1_555 D O ARG 108 D ARG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc16 V FE FE . B FE 709 1_555 D OE2 GLU 109 D GLU 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc17 C SG CYS 70 C CYS 62 1_555 AA FE3 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc18 C SG CYS 96 C CYS 88 1_555 AA FE4 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc19 C SG CYS 96 C CYS 88 1_555 AA FE5 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc20 C SG CYS 162 C CYS 154 1_555 AA FE1 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc21 C SG CYS 283 C CYS 275 1_555 X FE1 ICS . C ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc22 D SG CYS 70 D CYS 70 1_555 AA FE7 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc23 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 AA FE2 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc24 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 AA FE8 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc25 D OG SER 188 D SER 188 1_555 AA FE6 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc26 D OD1 ASP 353 D ASP 353 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.818 ? metalc ? metalc27 D OD1 ASP 357 D ASP 357 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc ? metalc28 D OD2 ASP 357 D ASP 357 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? metalc ? metalc29 E SG CYS 70 H CYS 62 1_555 IA FE3 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc30 E N CYS 96 H CYS 88 1_555 IA FE5 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc31 E SG CYS 96 H CYS 88 1_555 IA FE4 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc32 E SG CYS 96 H CYS 88 1_555 IA FE5 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc ? metalc33 E SG CYS 162 H CYS 154 1_555 IA FE1 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc34 E SG CYS 283 H CYS 275 1_555 GA FE1 ICS . H ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc35 F SG CYS 70 I CYS 70 1_555 IA FE7 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc36 F SG CYS 95 I CYS 95 1_555 IA FE2 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc37 F SG CYS 95 I CYS 95 1_555 IA FE8 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc38 F O ARG 108 I ARG 108 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc39 F OE2 GLU 109 I GLU 109 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc40 F OG SER 188 I SER 188 1_555 IA FE6 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? metalc ? metalc41 F OD1 ASP 357 I ASP 357 1_555 KA FE FE . I FE 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc42 F OD2 ASP 357 I ASP 357 1_555 KA FE FE . I FE 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.797 ? metalc ? metalc43 KA FE FE . I FE 703 1_555 H O ARG 108 L ARG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc44 G SG CYS 70 J CYS 62 1_555 PA FE3 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc45 G SG CYS 96 J CYS 88 1_555 PA FE4 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc46 G SG CYS 96 J CYS 88 1_555 PA FE5 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? metalc ? metalc47 G SG CYS 162 J CYS 154 1_555 PA FE1 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc48 G SG CYS 283 J CYS 275 1_555 MA FE1 ICS . J ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc49 H SG CYS 70 L CYS 70 1_555 PA FE7 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc50 H SG CYS 95 L CYS 95 1_555 PA FE8 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc51 H SG CYS 95 L CYS 95 1_555 PA FE2 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc52 H OG SER 188 L SER 188 1_555 PA FE6 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc53 H OD2 ASP 353 L ASP 353 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc54 H OD2 ASP 357 L ASP 357 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 151 n n C1 C2 GOL sing 152 n n C1 H11 GOL sing 153 n n C1 H12 GOL sing 154 n n O1 HO1 GOL sing 155 n n C2 O2 GOL sing 156 n n C2 C3 GOL sing 157 n n C2 H2 GOL sing 158 n n O2 HO2 GOL sing 159 n n C3 O3 GOL sing 160 n n C3 H31 GOL sing 161 n n C3 H32 GOL sing 162 n n O3 HO3 GOL sing 163 n n # _atom_sites.entry_id 8BTS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006739 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001775 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013616 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004895 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 HCA A 1 601 601 HCA HCA . J 4 ICS A 1 602 801 ICS ICS . K 5 GOL A 1 603 901 GOL GOL . L 5 GOL A 1 604 1001 GOL GOL . M 6 SO4 A 1 605 4 SO4 SO4 . N 7 1CL B 1 701 701 1CL 1CL . O 5 GOL B 1 702 601 GOL GOL . P 5 GOL B 1 703 701 GOL GOL . Q 5 GOL B 1 704 801 GOL GOL . R 5 GOL B 1 705 802 GOL GOL . S 5 GOL B 1 706 803 GOL GOL . T 6 SO4 B 1 707 7 SO4 SO4 . U 6 SO4 B 1 708 9 SO4 SO4 . V 8 FE B 1 709 2 FE FE . W 3 HCA C 1 601 601 HCA HCA . X 4 ICS C 1 602 801 ICS ICS . Y 5 GOL C 1 603 901 GOL GOL . Z 6 SO4 C 1 604 6 SO4 SO4 . AA 7 1CL D 1 701 701 1CL 1CL . BA 5 GOL D 1 702 601 GOL GOL . CA 5 GOL D 1 703 602 GOL GOL . DA 6 SO4 D 1 704 10 SO4 SO4 . EA 8 FE D 1 705 1 FE FE . FA 3 HCA H 1 601 601 HCA HCA . GA 4 ICS H 1 602 801 ICS ICS . HA 6 SO4 H 1 603 3 SO4 SO4 . IA 7 1CL I 1 701 701 1CL 1CL . JA 6 SO4 I 1 702 5 SO4 SO4 . KA 8 FE I 1 703 4 FE FE . LA 3 HCA J 1 601 601 HCA HCA . MA 4 ICS J 1 602 801 ICS ICS . NA 5 GOL J 1 603 901 GOL GOL . OA 6 SO4 J 1 604 1 SO4 SO4 . PA 7 1CL L 1 701 701 1CL 1CL . QA 5 GOL L 1 702 601 GOL GOL . RA 6 SO4 L 1 703 2 SO4 SO4 . SA 6 SO4 L 1 704 8 SO4 SO4 . TA 8 FE L 1 705 3 FE FE . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . K 5 26.198 -25.53 93.625 1 28.28 ? C1 GOL 603 A 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . K 5 26.074 -25.821 92.266 1 28.31 ? O1 GOL 603 A 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . K 5 25.86 -24.037 93.781 1 28.28 ? C2 GOL 603 A 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . K 5 24.832 -23.658 92.933 1 28.15 ? O2 GOL 603 A 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . K 5 25.501 -23.867 95.287 1 28.41 ? C3 GOL 603 A 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . K 5 25.198 -22.51 95.524 1 28.48 ? O3 GOL 603 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 21 _model_server_stats.parse_time_ms 32 _model_server_stats.create_model_time_ms 44 _model_server_stats.query_time_ms 346 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 6 #