data_8BTS
#
_model_server_result.job_id            JTwBj9geifmOmWOJroOC2Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-30 20:14:35' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8bts 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":603}' 
#
_entry.id    8BTS 
#
_exptl.entry_id    8BTS 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          104.76 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8BTS 
_cell.length_a            148.392 
_cell.length_b            73.444 
_cell.length_c            211.253 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8BTS 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 1 1 
E,F,G,H,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 K N N 
? 5 L N N 
? 5 O N N 
? 5 P N N 
? 5 Q N N 
? 5 R N N 
? 5 S N N 
? 5 Y N N 
? 5 BA N N 
? 5 CA N N 
? 5 NA N N 
? 5 QA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 70 A CYS 62 1_555 N FE3 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc2 A N CYS 96 A CYS 88 1_555 N FE5 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 96 A CYS 88 1_555 N FE4 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 96 A CYS 88 1_555 N FE5 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 162 A CYS 154 1_555 N FE1 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 283 A CYS 275 1_555 J FE1 ICS . A ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? 
metalc ? metalc7 B SG CYS 70 B CYS 70 1_555 N FE7 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc8 B SG CYS 95 B CYS 95 1_555 N FE8 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 95 B CYS 95 1_555 N FE2 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? 
metalc ? metalc10 B O ARG 108 B ARG 108 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? 
metalc ? metalc11 B OE2 GLU 109 B GLU 109 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc12 B OG SER 188 B SER 188 1_555 N FE6 1CL . B 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? 
metalc ? metalc13 B OD2 ASP 353 B ASP 353 1_555 V FE FE . B FE 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc14 B OD2 ASP 357 B ASP 357 1_555 V FE FE . B FE 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.934 ? 
metalc ? metalc15 V FE FE . B FE 709 1_555 D O ARG 108 D ARG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc16 V FE FE . B FE 709 1_555 D OE2 GLU 109 D GLU 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 70 C CYS 62 1_555 AA FE3 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 96 C CYS 88 1_555 AA FE4 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 96 C CYS 88 1_555 AA FE5 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? 
metalc ? metalc20 C SG CYS 162 C CYS 154 1_555 AA FE1 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 283 C CYS 275 1_555 X FE1 ICS . C ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc22 D SG CYS 70 D CYS 70 1_555 AA FE7 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc23 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 AA FE2 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc24 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 AA FE8 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc25 D OG SER 188 D SER 188 1_555 AA FE6 1CL . D 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? 
metalc ? metalc26 D OD1 ASP 353 D ASP 353 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.818 ? 
metalc ? metalc27 D OD1 ASP 357 D ASP 357 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? 
metalc ? metalc28 D OD2 ASP 357 D ASP 357 1_555 EA FE FE . D FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc29 E SG CYS 70 H CYS 62 1_555 IA FE3 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc30 E N CYS 96 H CYS 88 1_555 IA FE5 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc31 E SG CYS 96 H CYS 88 1_555 IA FE4 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc32 E SG CYS 96 H CYS 88 1_555 IA FE5 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? 
metalc ? metalc33 E SG CYS 162 H CYS 154 1_555 IA FE1 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc34 E SG CYS 283 H CYS 275 1_555 GA FE1 ICS . H ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc35 F SG CYS 70 I CYS 70 1_555 IA FE7 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc36 F SG CYS 95 I CYS 95 1_555 IA FE2 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc37 F SG CYS 95 I CYS 95 1_555 IA FE8 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc38 F O ARG 108 I ARG 108 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? 
metalc ? metalc39 F OE2 GLU 109 I GLU 109 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? 
metalc ? metalc40 F OG SER 188 I SER 188 1_555 IA FE6 1CL . I 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? 
metalc ? metalc41 F OD1 ASP 357 I ASP 357 1_555 KA FE FE . I FE 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? 
metalc ? metalc42 F OD2 ASP 357 I ASP 357 1_555 KA FE FE . I FE 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.797 ? 
metalc ? metalc43 KA FE FE . I FE 703 1_555 H O ARG 108 L ARG 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? 
metalc ? metalc44 G SG CYS 70 J CYS 62 1_555 PA FE3 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc45 G SG CYS 96 J CYS 88 1_555 PA FE4 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc46 G SG CYS 96 J CYS 88 1_555 PA FE5 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc47 G SG CYS 162 J CYS 154 1_555 PA FE1 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? 
metalc ? metalc48 G SG CYS 283 J CYS 275 1_555 MA FE1 ICS . J ICS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? 
metalc ? metalc49 H SG CYS 70 L CYS 70 1_555 PA FE7 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc50 H SG CYS 95 L CYS 95 1_555 PA FE8 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc51 H SG CYS 95 L CYS 95 1_555 PA FE2 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc52 H OG SER 188 L SER 188 1_555 PA FE6 1CL . L 1CL 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc53 H OD2 ASP 353 L ASP 353 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? 
metalc ? metalc54 H OD2 ASP 357 L ASP 357 1_555 TA FE FE . L FE 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 151 n n 
C1 C2 GOL sing 152 n n 
C1 H11 GOL sing 153 n n 
C1 H12 GOL sing 154 n n 
O1 HO1 GOL sing 155 n n 
C2 O2 GOL sing 156 n n 
C2 C3 GOL sing 157 n n 
C2 H2 GOL sing 158 n n 
O2 HO2 GOL sing 159 n n 
C3 O3 GOL sing 160 n n 
C3 H31 GOL sing 161 n n 
C3 H32 GOL sing 162 n n 
O3 HO3 GOL sing 163 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8BTS 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006739 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001775 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013616 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004895 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 3 HCA A 1 601 601 HCA HCA . 
J 4 ICS A 1 602 801 ICS ICS . 
K 5 GOL A 1 603 901 GOL GOL . 
L 5 GOL A 1 604 1001 GOL GOL . 
M 6 SO4 A 1 605 4 SO4 SO4 . 
N 7 1CL B 1 701 701 1CL 1CL . 
O 5 GOL B 1 702 601 GOL GOL . 
P 5 GOL B 1 703 701 GOL GOL . 
Q 5 GOL B 1 704 801 GOL GOL . 
R 5 GOL B 1 705 802 GOL GOL . 
S 5 GOL B 1 706 803 GOL GOL . 
T 6 SO4 B 1 707 7 SO4 SO4 . 
U 6 SO4 B 1 708 9 SO4 SO4 . 
V 8 FE B 1 709 2 FE FE . 
W 3 HCA C 1 601 601 HCA HCA . 
X 4 ICS C 1 602 801 ICS ICS . 
Y 5 GOL C 1 603 901 GOL GOL . 
Z 6 SO4 C 1 604 6 SO4 SO4 . 
AA 7 1CL D 1 701 701 1CL 1CL . 
BA 5 GOL D 1 702 601 GOL GOL . 
CA 5 GOL D 1 703 602 GOL GOL . 
DA 6 SO4 D 1 704 10 SO4 SO4 . 
EA 8 FE D 1 705 1 FE FE . 
FA 3 HCA H 1 601 601 HCA HCA . 
GA 4 ICS H 1 602 801 ICS ICS . 
HA 6 SO4 H 1 603 3 SO4 SO4 . 
IA 7 1CL I 1 701 701 1CL 1CL . 
JA 6 SO4 I 1 702 5 SO4 SO4 . 
KA 8 FE I 1 703 4 FE FE . 
LA 3 HCA J 1 601 601 HCA HCA . 
MA 4 ICS J 1 602 801 ICS ICS . 
NA 5 GOL J 1 603 901 GOL GOL . 
OA 6 SO4 J 1 604 1 SO4 SO4 . 
PA 7 1CL L 1 701 701 1CL 1CL . 
QA 5 GOL L 1 702 601 GOL GOL . 
RA 6 SO4 L 1 703 2 SO4 SO4 . 
SA 6 SO4 L 1 704 8 SO4 SO4 . 
TA 8 FE L 1 705 3 FE FE . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 GOL . . . Y 5 60.926 -15.451 2.133 1 55.28 ? C1 GOL 603 C 1 
HETATM 2 O O1 GOL . . . Y 5 61.409 -16.756 2.084 1 55.23 ? O1 GOL 603 C 1 
HETATM 3 C C2 GOL . . . Y 5 61.253 -14.772 0.781 1 55.35 ? C2 GOL 603 C 1 
HETATM 4 O O2 GOL . . . Y 5 60.615 -13.543 0.643 1 55.35 ? O2 GOL 603 C 1 
HETATM 5 C C3 GOL . . . Y 5 62.79 -14.646 0.742 1 55.37 ? C3 GOL 603 C 1 
HETATM 6 O O3 GOL . . . Y 5 63.313 -15.927 0.924 1 55.37 ? O3 GOL 603 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              20 
_model_server_stats.parse_time_ms           34 
_model_server_stats.create_model_time_ms    145 
_model_server_stats.query_time_ms           304 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           6 
#