data_8C0Z
#
_model_server_result.job_id            J9betMI9WWicYN2zQ2O3sg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-12 20:03:46' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8c0z 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":303}' 
#
_entry.id    8C0Z 
#
_exptl.entry_id    8C0Z 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    10 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8C0Z 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8C0Z 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    pentameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      5 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 F N N 
? 4 M N N 
? 4 N N N 
? 4 O N N 
? 4 P N N 
? 4 Q N N 
? 4 S N N 
? 4 T N N 
? 4 U N N 
? 4 V N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O ASN 92 A ASN 92 1_555 H MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
metalc ? metalc2 A O ALA 182 A ALA 182 1_555 H MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 295 A CYS 295 1_555 F FE4 SF4 . A SF4 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 298 A CYS 298 1_555 F FE2 SF4 . A SF4 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 302 A CYS 302 1_555 F FE1 SF4 . A SF4 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 509 A CYS 509 1_555 F FE3 SF4 . A SF4 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
metalc ? metalc7 G O5 T7R . A T7R 702 1_555 H MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
metalc ? metalc8 G O31 T7R . A T7R 702 1_555 H MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc9 B O ASN 92 B ASN 92 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc10 B O ALA 182 B ALA 182 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 295 B CYS 295 1_555 M FE4 SF4 . B SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 298 B CYS 298 1_555 M FE2 SF4 . B SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc13 B SG CYS 302 B CYS 302 1_555 M FE1 SF4 . B SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc14 B SG CYS 509 B CYS 509 1_555 M FE3 SF4 . B SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc15 J O5 T7R . B T7R 701 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
metalc ? metalc16 J O31 T7R . B T7R 701 1_555 K MG MG . B MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 46 C CYS 12 1_555 Q FE1 SF4 . C SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 49 C CYS 15 1_555 Q FE3 SF4 . C SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 52 C CYS 18 1_555 Q FE4 SF4 . C SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc20 C SG CYS 56 C CYS 22 1_555 N FE1 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 87 C CYS 53 1_555 O FE2 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc22 C SG CYS 90 C CYS 56 1_555 O FE3 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc23 C SG CYS 95 C CYS 61 1_555 O FE1 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc24 C SG CYS 99 C CYS 65 1_555 P FE4 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc25 C SG CYS 120 C CYS 86 1_555 P FE1 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc26 C SG CYS 123 C CYS 89 1_555 P FE2 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc27 C SG CYS 126 C CYS 92 1_555 P FE3 SF4 . C SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc28 C SG CYS 130 C CYS 96 1_555 O FE4 SF4 . C SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc29 C SG CYS 147 C CYS 113 1_555 N FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
metalc ? metalc30 C SG CYS 150 C CYS 116 1_555 N FE4 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc31 C SG CYS 156 C CYS 122 1_555 N FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc32 C SG CYS 160 C CYS 126 1_555 Q FE2 SF4 . C SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc33 E SG CYS 46 F CYS 12 1_555 V FE1 SF4 . F SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc34 E SG CYS 49 F CYS 15 1_555 V FE2 SF4 . F SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc35 E SG CYS 52 F CYS 18 1_555 V FE3 SF4 . F SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc36 E SG CYS 56 F CYS 22 1_555 S FE1 SF4 . F SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc37 E SG CYS 87 F CYS 53 1_555 T FE2 SF4 . F SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc38 E SG CYS 90 F CYS 56 1_555 T FE4 SF4 . F SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc39 E SG CYS 95 F CYS 61 1_555 T FE3 SF4 . F SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc40 E SG CYS 99 F CYS 65 1_555 U FE1 SF4 . F SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc41 E SG CYS 120 F CYS 86 1_555 U FE2 SF4 . F SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc42 E SG CYS 123 F CYS 89 1_555 U FE4 SF4 . F SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc43 E SG CYS 126 F CYS 92 1_555 U FE3 SF4 . F SF4 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc44 E SG CYS 130 F CYS 96 1_555 T FE1 SF4 . F SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc45 E SG CYS 147 F CYS 113 1_555 S FE2 SF4 . F SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc46 E SG CYS 150 F CYS 116 1_555 S FE4 SF4 . F SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc47 E SG CYS 156 F CYS 122 1_555 S FE3 SF4 . F SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc48 E SG CYS 160 F CYS 126 1_555 V FE4 SF4 . F SF4 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 394 n n 
FE1 S3 SF4 sing 395 n n 
FE1 S4 SF4 sing 396 n n 
FE2 S1 SF4 sing 397 n n 
FE2 S3 SF4 sing 398 n n 
FE2 S4 SF4 sing 399 n n 
FE3 S1 SF4 sing 400 n n 
FE3 S2 SF4 sing 401 n n 
FE3 S4 SF4 sing 402 n n 
FE4 S1 SF4 sing 403 n n 
FE4 S2 SF4 sing 404 n n 
FE4 S3 SF4 sing 405 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8C0Z 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
F 4 SF4 A 1 701 701 SF4 SF4 . 
G 5 T7R A 1 702 702 T7R T7R . 
H 6 MG A 1 703 703 MG MG . 
I 7 BEZ A 1 704 704 BEZ BEZ . 
J 5 T7R B 1 701 701 T7R T7R . 
K 6 MG B 1 702 702 MG MG . 
L 7 BEZ B 1 703 703 BEZ BEZ . 
M 4 SF4 B 1 704 704 SF4 SF4 . 
N 4 SF4 C 1 301 301 SF4 SF4 . 
O 4 SF4 C 1 302 302 SF4 SF4 . 
P 4 SF4 C 1 303 303 SF4 SF4 . 
Q 4 SF4 C 1 304 304 SF4 SF4 . 
R 8 FAD E 1 501 501 FAD FAD . 
S 4 SF4 F 1 301 301 SF4 SF4 . 
T 4 SF4 F 1 302 302 SF4 SF4 . 
U 4 SF4 F 1 303 303 SF4 SF4 . 
V 4 SF4 F 1 304 304 SF4 SF4 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . P 4 133.51 145.441 128.081 1 25.83 ? FE1 SF4 303 C 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . P 4 133.231 144.437 130.607 1 25.83 ? FE2 SF4 303 C 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . P 4 131.84 143.327 128.535 1 25.83 ? FE3 SF4 303 C 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . P 4 131.178 145.818 129.454 1 25.83 ? FE4 SF4 303 C 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . P 4 131.031 143.853 130.597 1 25.83 ? S1 SF4 303 C 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . P 4 131.396 145.175 127.278 1 25.83 ? S2 SF4 303 C 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . P 4 133.229 146.633 130.002 1 25.83 ? S3 SF4 303 C 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . P 4 134.099 143.362 128.797 1 25.83 ? S4 SF4 303 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              11 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    16 
_model_server_stats.query_time_ms           363 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           8 
#