data_8CSJ # _model_server_result.job_id mUBUwrKfqR7owL98QxOBiw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:04:49' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8csj # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":1202}' # _entry.id 8CSJ # _exptl.entry_id 8CSJ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 33 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8CSJ _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8CSJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 P N N ? 6 Q N N ? 6 R N N ? 6 S N N ? 6 T N N ? 6 U N N ? 6 V N N ? 6 W N N ? 6 X N N ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C2 H2 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 I 1 NAG A 1313 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG A 1314 NAG 4 n K NAG 1 J 1 NAG A 1318 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG A 1419 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG B 1518 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG B 1519 NAG 5 n M NAG 1 M 1 NAG C 1302 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG C 1310 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG C 1415 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG C 1416 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG C 1420 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG C 1421 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 2 A CYS 15 1_555 A SG CYS 123 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 118 A CYS 131 1_555 A SG CYS 153 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 278 A CYS 291 1_555 A SG CYS 288 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 323 A CYS 336 1_555 A SG CYS 348 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 366 A CYS 379 1_555 A SG CYS 419 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 378 A CYS 391 1_555 A SG CYS 512 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 467 A CYS 480 1_555 A SG CYS 475 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 525 A CYS 538 1_555 A SG CYS 577 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 604 A CYS 617 1_555 A SG CYS 636 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 649 A CYS 662 1_555 A SG CYS 658 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 725 A CYS 738 1_555 A SG CYS 747 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 730 A CYS 743 1_555 A SG CYS 736 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 827 A CYS 840 1_555 A SG CYS 838 A CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1019 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1030 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 1069 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1113 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 2 B CYS 15 1_555 D SG CYS 123 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 118 B CYS 131 1_555 D SG CYS 153 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 278 B CYS 291 1_555 D SG CYS 288 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 323 B CYS 336 1_555 D SG CYS 348 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 366 B CYS 379 1_555 D SG CYS 419 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 D SG CYS 378 B CYS 391 1_555 D SG CYS 512 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 467 B CYS 480 1_555 D SG CYS 475 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 525 B CYS 538 1_555 D SG CYS 577 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 604 B CYS 617 1_555 D SG CYS 636 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 649 B CYS 662 1_555 D SG CYS 658 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 725 B CYS 738 1_555 D SG CYS 747 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 730 B CYS 743 1_555 D SG CYS 736 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 827 B CYS 840 1_555 D SG CYS 838 B CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 1019 B CYS 1032 1_555 D SG CYS 1030 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 1069 B CYS 1082 1_555 D SG CYS 1113 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 2 C CYS 15 1_555 E SG CYS 123 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 118 C CYS 131 1_555 E SG CYS 153 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 E SG CYS 278 C CYS 291 1_555 E SG CYS 288 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf34 E SG CYS 323 C CYS 336 1_555 E SG CYS 348 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf35 E SG CYS 366 C CYS 379 1_555 E SG CYS 419 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf36 E SG CYS 378 C CYS 391 1_555 E SG CYS 512 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 E SG CYS 467 C CYS 480 1_555 E SG CYS 475 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 E SG CYS 525 C CYS 538 1_555 E SG CYS 577 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 E SG CYS 604 C CYS 617 1_555 E SG CYS 636 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf40 E SG CYS 649 C CYS 662 1_555 E SG CYS 658 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf41 E SG CYS 725 C CYS 738 1_555 E SG CYS 747 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf42 E SG CYS 730 C CYS 743 1_555 E SG CYS 736 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 1019 C CYS 1032 1_555 E SG CYS 1030 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 1069 C CYS 1082 1_555 E SG CYS 1113 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 4 A ASN 17 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 48 A ASN 61 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 61 A ASN 74 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 136 A ASN 149 1_555 W C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 152 A ASN 165 1_555 V C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 221 A ASN 234 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 269 A ASN 282 1_555 X C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 318 A ASN 331 1_555 P C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 330 A ASN 343 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 590 A ASN 603 1_555 R C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 603 A ASN 616 1_555 S C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 644 A ASN 657 1_555 T C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 696 A ASN 709 1_555 U C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 BA C1 NAG . A NAG 1313 1_555 D ND2 ASN 221 B ASN 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale15 D ND2 ASN 4 B ASN 17 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 48 B ASN 61 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 61 B ASN 74 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 109 B ASN 122 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 136 B ASN 149 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 269 B ASN 282 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 590 B ASN 603 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 603 B ASN 616 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 644 B ASN 657 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 696 B ASN 709 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 1061 B ASN 1074 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 4 C ASN 17 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 48 C ASN 61 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 61 C ASN 74 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 109 C ASN 122 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 136 C ASN 149 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 221 C ASN 234 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 269 C ASN 282 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 318 C ASN 331 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 330 C ASN 343 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 603 C ASN 616 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 644 C ASN 657 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 696 C ASN 709 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 1061 C ASN 1074 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale40 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale41 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale42 M O3 NAG . M NAG 1 1_555 M C2 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale43 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale44 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8CSJ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code P 6 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . Q 6 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . R 6 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . S 6 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . T 6 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . U 6 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . V 6 NAG A 1 1307 1310 NAG NAG . W 6 NAG A 1 1308 1311 NAG NAG . X 6 NAG A 1 1309 1312 NAG NAG . Y 6 NAG A 1 1310 1315 NAG NAG . Z 6 NAG A 1 1311 1316 NAG NAG . AA 6 NAG A 1 1312 1317 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 1313 1522 NAG NAG . CA 6 NAG B 1 1201 1303 NAG NAG . DA 6 NAG B 1 1202 1304 NAG NAG . EA 6 NAG B 1 1203 1305 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 1204 1306 NAG NAG . GA 6 NAG B 1 1205 1307 NAG NAG . HA 6 NAG B 1 1206 1408 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1207 1413 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1208 1520 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1209 1521 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1210 1523 NAG NAG . MA 6 NAG C 1 1201 1303 NAG NAG . NA 6 NAG C 1 1202 1304 NAG NAG . OA 6 NAG C 1 1203 1305 NAG NAG . PA 6 NAG C 1 1204 1306 NAG NAG . QA 6 NAG C 1 1205 1307 NAG NAG . RA 6 NAG C 1 1206 1308 NAG NAG . SA 6 NAG C 1 1207 1309 NAG NAG . TA 6 NAG C 1 1208 1417 NAG NAG . UA 6 NAG C 1 1209 1418 NAG NAG . VA 6 NAG C 1 1210 1419 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . DA 6 230.198 239.755 198.693 1 267.26 ? C1 NAG 1202 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . DA 6 229.135 240.836 198.492 1 267.26 ? C2 NAG 1202 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . DA 6 229.418 241.623 197.214 1 267.26 ? C3 NAG 1202 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . DA 6 230.841 242.168 197.225 1 267.26 ? C4 NAG 1202 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . DA 6 231.839 241.039 197.479 1 267.26 ? C5 NAG 1202 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . DA 6 233.26 241.529 197.628 1 267.26 ? C6 NAG 1202 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . DA 6 226.964 240.276 199.491 1 267.26 ? C7 NAG 1202 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . DA 6 225.629 239.632 199.272 1 267.26 ? C8 NAG 1202 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . DA 6 227.802 240.256 198.45 1 267.26 ? N2 NAG 1202 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . DA 6 228.488 242.694 197.1 1 267.26 ? O3 NAG 1202 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . DA 6 231.137 242.782 195.975 1 267.26 ? O4 NAG 1202 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . DA 6 231.505 240.357 198.698 1 267.26 ? O5 NAG 1202 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . DA 6 234.196 240.535 197.232 1 267.26 ? O6 NAG 1202 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . DA 6 227.27 240.792 200.561 1 267.26 ? O7 NAG 1202 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 37 _model_server_stats.create_model_time_ms 37 _model_server_stats.query_time_ms 316 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #