data_8CTC # _model_server_result.job_id sy8RKgGaWw-BdU4psHyEcA _model_server_result.datetime_utc '2025-08-31 12:51:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8ctc # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":604}' # _entry.id 8CTC # _exptl.entry_id 8CTC _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 200.59 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MERCURY (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 M N N ? 4 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O TYR 100 A TYR 98 1_555 G NA NA . A NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 103 A THR 101 1_555 G NA NA . A NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 104 A THR 102 1_555 G NA NA . A NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? metalc ? metalc4 A O GLY 364 A GLY 362 1_555 E NA NA . A NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc5 A O THR 366 A THR 364 1_555 F NA NA . A NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc6 A O ASN 368 A ASN 366 1_555 E NA NA . A NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASN 368 A ASN 366 1_555 G NA NA . A NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 370 A ASP 368 1_555 G NA NA . A NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc9 A O SER 407 A SER 405 1_555 F NA NA . A NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc10 A O ILE 408 A ILE 406 1_555 F NA NA . A NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc ? metalc11 A O ALA 410 A ALA 408 1_555 F NA NA . A NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc12 A SG CYS 443 A CYS 441 1_555 H HG HG . A HG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 457 A ASP 455 1_555 E NA NA . A NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc14 B O TYR 100 B TYR 98 1_555 L NA NA . B NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc15 B OG1 THR 103 B THR 101 1_555 L NA NA . B NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? metalc ? metalc16 B OG1 THR 104 B THR 102 1_555 L NA NA . B NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.917 ? metalc ? metalc17 B O GLY 364 B GLY 362 1_555 J NA NA . B NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? metalc ? metalc18 B O THR 366 B THR 364 1_555 K NA NA . B NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc19 B O ASN 368 B ASN 366 1_555 J NA NA . B NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASN 368 B ASN 366 1_555 L NA NA . B NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc21 B OD1 ASP 370 B ASP 368 1_555 L NA NA . B NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc22 B O SER 407 B SER 405 1_555 K NA NA . B NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc23 B O ILE 408 B ILE 406 1_555 K NA NA . B NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc ? metalc24 B O ALA 410 B ALA 408 1_555 K NA NA . B NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc25 B SG CYS 443 B CYS 441 1_555 M HG HG . B HG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? metalc ? metalc26 B OD2 ASP 457 B ASP 455 1_555 J NA NA . B NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc27 C O TYR 100 C TYR 98 1_555 Q NA NA . C NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc28 C OG1 THR 103 C THR 101 1_555 Q NA NA . C NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? metalc ? metalc29 C OG1 THR 104 C THR 102 1_555 Q NA NA . C NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? metalc ? metalc30 C O GLY 364 C GLY 362 1_555 O NA NA . C NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc31 C O THR 366 C THR 364 1_555 P NA NA . C NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc32 C O ASN 368 C ASN 366 1_555 O NA NA . C NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc33 C OD1 ASN 368 C ASN 366 1_555 Q NA NA . C NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc34 C OD1 ASP 370 C ASP 368 1_555 Q NA NA . C NA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc35 C O SER 407 C SER 405 1_555 P NA NA . C NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc36 C O ILE 408 C ILE 406 1_555 P NA NA . C NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc ? metalc37 C O ALA 410 C ALA 408 1_555 P NA NA . C NA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc38 C SG CYS 443 C CYS 441 1_555 R HG HG . C HG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? metalc ? metalc39 C OD2 ASP 457 C ASP 455 1_555 O NA NA . C NA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? # _chem_comp.formula 'Hg 2' _chem_comp.formula_weight 200.59 _chem_comp.id HG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MERCURY (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8CTC _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 GLU A 1 600 600 GLU GLU . E 3 NA A 1 601 601 NA NA . F 3 NA A 1 602 602 NA NA . G 3 NA A 1 603 603 NA NA . H 4 HG A 1 604 604 HG HG . I 2 GLU B 1 600 600 GLU GLU . J 3 NA B 1 601 601 NA NA . K 3 NA B 1 602 602 NA NA . L 3 NA B 1 603 603 NA NA . M 4 HG B 1 604 604 HG HG . N 2 GLU C 1 600 600 GLU GLU . O 3 NA C 1 601 601 NA NA . P 3 NA C 1 602 602 NA NA . Q 3 NA C 1 603 603 NA NA . R 4 HG C 1 604 604 HG HG . S 5 HOH A 1 701 607 HOH HOH . S 5 HOH A 2 702 608 HOH HOH . S 5 HOH A 3 703 606 HOH HOH . S 5 HOH A 4 704 605 HOH HOH . T 5 HOH B 1 701 607 HOH HOH . T 5 HOH B 2 702 608 HOH HOH . T 5 HOH B 3 703 606 HOH HOH . T 5 HOH B 4 704 605 HOH HOH . U 5 HOH C 1 701 607 HOH HOH . U 5 HOH C 2 702 608 HOH HOH . U 5 HOH C 3 703 606 HOH HOH . U 5 HOH C 4 704 605 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol HG _atom_site.label_atom_id HG _atom_site.label_comp_id HG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id M _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 134.716 _atom_site.Cartn_y 106.594 _atom_site.Cartn_z 129.505 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 174.77 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id HG _atom_site.auth_comp_id HG _atom_site.auth_seq_id 604 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 5 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 397 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #