data_8CXT # _model_server_result.job_id PFER8isrQo9y4DrYLqwOmQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-17 18:51:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8cxt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":603}' # _entry.id 8CXT # _exptl.entry_id 8CXT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 357.364 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description N-benzyladenosine _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8CXT _cell.length_a 82.213 _cell.length_b 161.667 _cell.length_c 230.797 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8CXT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 2ac 2ab' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,J,K,L,U,X,Y 1 1 B,F,G,M,N,O,P,T,V,Z,AA 2 1 C,H,I,Q,R,S,W,BA,CA 3 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 L N N ? 5 P N N ? 5 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O LYS 89 A LYS 88 1_555 J K K . A K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? metalc ? metalc2 A O LYS 90 A LYS 89 1_555 J K K . A K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? metalc ? metalc3 A O TYR 92 A TYR 91 1_555 J K K . A K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 94 A GLU 93 1_555 J K K . A K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc5 A O GLY 250 A GLY 249 1_555 K K K . A K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.274 ? metalc ? metalc6 A O ALA 251 A ALA 250 1_555 K K K . A K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.35 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASN 252 A ASN 251 1_555 K K K . A K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc8 A O VAL 259 A VAL 258 1_555 K K K . A K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.148 ? metalc ? metalc9 J K K . A K 601 1_555 U O HOH . A HOH 737 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.045 ? metalc ? metalc10 J K K . A K 601 1_555 U O HOH . A HOH 738 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.489 ? metalc ? metalc11 J K K . A K 601 1_555 U O HOH . A HOH 739 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.282 ? metalc ? metalc12 B O LYS 89 B LYS 88 1_555 N K K . B K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.01 ? metalc ? metalc13 B O LYS 90 B LYS 89 1_555 N K K . B K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc14 B O TYR 92 B TYR 91 1_555 N K K . B K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? metalc ? metalc15 B OE2 GLU 94 B GLU 93 1_555 N K K . B K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? metalc ? metalc16 B O GLY 250 B GLY 249 1_555 M K K . B K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.013 ? metalc ? metalc17 B O ALA 251 B ALA 250 1_555 M K K . B K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.139 ? metalc ? metalc18 B OD1 ASN 252 B ASN 251 1_555 M K K . B K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? metalc ? metalc19 B O VAL 259 B VAL 258 1_555 M K K . B K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.007 ? metalc ? metalc20 B OG SER 260 B SER 259 1_555 M K K . B K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.079 ? metalc ? metalc21 B O LEU 366 B LEU 365 1_555 O K K . B K 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? metalc ? metalc22 B O VAL 369 B VAL 368 1_555 O K K . B K 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.32 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 371 B ASP 370 1_555 O K K . B K 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? metalc ? metalc24 M K K . B K 601 1_555 V O HOH . B HOH 739 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.281 ? metalc ? metalc25 N K K . B K 602 1_555 V O HOH . B HOH 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc26 C O GLY 250 C GLY 249 1_555 Q K K . C K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.171 ? metalc ? metalc27 C O ALA 251 C ALA 250 1_555 Q K K . C K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? metalc ? metalc28 C OD1 ASN 252 C ASN 251 1_555 Q K K . C K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc29 C O VAL 259 C VAL 258 1_555 Q K K . C K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.038 ? metalc ? metalc30 C OG SER 260 C SER 259 1_555 Q K K . C K 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc31 C O LEU 366 C LEU 365 1_555 R K K . C K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc32 C O VAL 369 C VAL 368 1_555 R K K . C K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc33 C OD1 ASP 371 C ASP 370 1_555 R K K . C K 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.956 ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog1 D N3 DT 1 D DT 1 1_555 F O2 DT 1 F DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog2 D O4 DT 1 D DT 1 1_555 F N3 DT 1 F DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 D N3 DT 2 D DT 2 1_555 E N1 DA 14 E DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 D O4 DT 2 D DT 2 1_555 E N6 DA 14 E DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 D N3 DC 3 D DC 3 1_555 E N1 DG 13 E DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 D N4 DC 3 D DC 3 1_555 E O6 DG 13 E DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 D O2 DC 3 D DC 3 1_555 E N2 DG 13 E DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 D N1 DA 4 D DA 4 1_555 E N3 DT 12 E DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 D N6 DA 4 D DA 4 1_555 E O4 DT 12 E DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 D N1 DA 5 D DA 5 1_555 E N3 DT 11 E DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 D N6 DA 5 D DA 5 1_555 E O4 DT 11 E DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 D N1 DA 6 D DA 6 1_555 E N3 DT 10 E DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 D N6 DA 6 D DA 6 1_555 E O4 DT 10 E DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 D N1 DA 7 D DA 7 1_555 E N3 DT 8 E DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 D N6 DA 7 D DA 7 1_555 E O4 DT 8 E DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 D N1 DG 9 D DG 9 1_555 E N3 DC 7 E DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 D N2 DG 9 D DG 9 1_555 E O2 DC 7 E DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 D O6 DG 9 D DG 9 1_555 E N4 DC 7 E DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 D N3 DT 10 D DT 10 1_555 E N1 DA 6 E DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 D O4 DT 10 D DT 10 1_555 E N6 DA 6 E DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 D N3 DC 11 D DC 11 1_555 E N1 DG 5 E DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 D N4 DC 11 D DC 11 1_555 E O6 DG 5 E DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 D O2 DC 11 D DC 11 1_555 E N2 DG 5 E DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 D N3 DC 12 D DC 12 1_555 E N1 DG 4 E DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 D N4 DC 12 D DC 12 1_555 E O6 DG 4 E DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 D O2 DC 12 D DC 12 1_555 E N2 DG 4 E DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 D N3 DC 13 D DC 13 1_555 E N1 DG 3 E DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 D N4 DC 13 D DC 13 1_555 E O6 DG 3 E DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 D O2 DC 13 D DC 13 1_555 E N2 DG 3 E DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 D N1 DA 14 D DA 14 1_555 E N3 DT 2 E DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 D N6 DA 14 D DA 14 1_555 E O4 DT 2 E DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 F N3 DT 2 F DT 2 1_555 G N1 DA 14 G DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 F O4 DT 2 F DT 2 1_555 G N6 DA 14 G DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 F N3 DC 3 F DC 3 1_555 G N1 DG 13 G DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 F N4 DC 3 F DC 3 1_555 G O6 DG 13 G DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 F O2 DC 3 F DC 3 1_555 G N2 DG 13 G DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 F N1 DA 4 F DA 4 1_555 G N3 DT 12 G DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 F N6 DA 4 F DA 4 1_555 G O4 DT 12 G DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 F N1 DA 5 F DA 5 1_555 G N3 DT 11 G DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 F N6 DA 5 F DA 5 1_555 G O4 DT 11 G DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 F N1 DA 6 F DA 6 1_555 G N3 DT 10 G DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 F N6 DA 6 F DA 6 1_555 G O4 DT 10 G DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 F N1 DA 7 F DA 7 1_555 G N3 DT 8 G DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 F N6 DA 7 F DA 7 1_555 G O4 DT 8 G DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 F N1 DG 9 F DG 9 1_555 G N3 DC 7 G DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 F N2 DG 9 F DG 9 1_555 G O2 DC 7 G DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 F O6 DG 9 F DG 9 1_555 G N4 DC 7 G DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 F N3 DT 10 F DT 10 1_555 G N1 DA 6 G DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 F O4 DT 10 F DT 10 1_555 G N6 DA 6 G DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 F N3 DC 11 F DC 11 1_555 G N1 DG 5 G DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 F N4 DC 11 F DC 11 1_555 G O6 DG 5 G DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 F O2 DC 11 F DC 11 1_555 G N2 DG 5 G DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 F N3 DC 12 F DC 12 1_555 G N1 DG 4 G DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 F N4 DC 12 F DC 12 1_555 G O6 DG 4 G DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 F O2 DC 12 F DC 12 1_555 G N2 DG 4 G DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 F N3 DC 13 F DC 13 1_555 G N1 DG 3 G DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 F N4 DC 13 F DC 13 1_555 G O6 DG 3 G DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 F O2 DC 13 F DC 13 1_555 G N2 DG 3 G DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 F N1 DA 14 F DA 14 1_555 G N3 DT 2 G DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 F N6 DA 14 F DA 14 1_555 G O4 DT 2 G DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog HOOGSTEEN hydrog61 G N6 DA 1 G DA 1 1_555 H O4 DT 1 H DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog HOOGSTEEN hydrog62 G N7 DA 1 G DA 1 1_555 H N3 DT 1 H DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 H N3 DT 2 H DT 2 1_555 I N1 DA 14 I DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 H O4 DT 2 H DT 2 1_555 I N6 DA 14 I DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 H N3 DC 3 H DC 3 1_555 I N1 DG 13 I DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 H N4 DC 3 H DC 3 1_555 I O6 DG 13 I DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 H O2 DC 3 H DC 3 1_555 I N2 DG 13 I DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 H N1 DA 4 H DA 4 1_555 I N3 DT 12 I DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 H N6 DA 4 H DA 4 1_555 I O4 DT 12 I DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 H N1 DA 5 H DA 5 1_555 I N3 DT 11 I DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 H N6 DA 5 H DA 5 1_555 I O4 DT 11 I DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 H N1 DA 6 H DA 6 1_555 I N3 DT 10 I DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 H N6 DA 6 H DA 6 1_555 I O4 DT 10 I DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 H N1 DA 7 H DA 7 1_555 I N3 DT 8 I DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 H N6 DA 7 H DA 7 1_555 I O4 DT 8 I DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 H N1 DG 9 H DG 9 1_555 I N3 DC 7 I DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 H N2 DG 9 H DG 9 1_555 I O2 DC 7 I DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 H O6 DG 9 H DG 9 1_555 I N4 DC 7 I DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 H N3 DT 10 H DT 10 1_555 I N1 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 H O4 DT 10 H DT 10 1_555 I N6 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 H N3 DC 11 H DC 11 1_555 I N1 DG 5 I DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 H N4 DC 11 H DC 11 1_555 I O6 DG 5 I DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 H O2 DC 11 H DC 11 1_555 I N2 DG 5 I DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 H N3 DC 12 H DC 12 1_555 I N1 DG 4 I DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 H N4 DC 12 H DC 12 1_555 I O6 DG 4 I DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 H O2 DC 12 H DC 12 1_555 I N2 DG 4 I DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 H N3 DC 13 H DC 13 1_555 I N1 DG 3 I DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 H N4 DC 13 H DC 13 1_555 I O6 DG 3 I DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 H O2 DC 13 H DC 13 1_555 I N2 DG 3 I DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 H N1 DA 14 H DA 14 1_555 I N3 DT 2 I DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 H N6 DA 14 H DA 14 1_555 I O4 DT 2 I DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C17 H19 N5 O4' _chem_comp.formula_weight 357.364 _chem_comp.id Q8C _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name N-benzyladenosine _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C14 C13 Q8C doub 435 n y C14 C15 Q8C sing 436 n y C13 C12 Q8C sing 437 n y C15 C16 Q8C doub 438 n y C12 C11 Q8C doub 439 n y C16 C11 Q8C sing 440 n y C11 C10 Q8C sing 441 n n C10 N4 Q8C sing 442 n n N4 C9 Q8C sing 443 n n N1 C5 Q8C doub 444 n y N1 C6 Q8C sing 445 n y C5 N Q8C sing 446 n y C9 C6 Q8C doub 447 n y C9 N3 Q8C sing 448 n y C6 C7 Q8C sing 449 n y N3 C8 Q8C doub 450 n y O1 C1 Q8C sing 451 n n N C7 Q8C sing 452 n y N C4 Q8C sing 453 n n C7 N2 Q8C doub 454 n y C1 C4 Q8C sing 455 n n C1 C Q8C sing 456 n n C8 N2 Q8C sing 457 n y O2 C3 Q8C sing 458 n n C4 O3 Q8C sing 459 n n C O Q8C sing 460 n n C C2 Q8C sing 461 n n O3 C2 Q8C sing 462 n n C3 C2 Q8C sing 463 n n C8 H1 Q8C sing 464 n n O1 H2 Q8C sing 465 n n C1 H3 Q8C sing 466 n n C5 H4 Q8C sing 467 n n C4 H5 Q8C sing 468 n n C3 H6 Q8C sing 469 n n C3 H7 Q8C sing 470 n n C2 H8 Q8C sing 471 n n N4 H9 Q8C sing 472 n n C H10 Q8C sing 473 n n O H11 Q8C sing 474 n n C10 H12 Q8C sing 475 n n C10 H13 Q8C sing 476 n n C12 H14 Q8C sing 477 n n C13 H15 Q8C sing 478 n n C14 H16 Q8C sing 479 n n C15 H17 Q8C sing 480 n n C16 H18 Q8C sing 481 n n O2 H19 Q8C sing 482 n n # _atom_sites.entry_id 8CXT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012164 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006186 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004333 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 4 K A 1 601 201 K K . K 4 K A 1 602 204 K K . L 5 Q8C A 1 603 601 Q8C XXX . M 4 K B 1 601 202 K K . N 4 K B 1 602 203 K K . O 4 K B 1 603 206 K K . P 5 Q8C B 1 604 602 Q8C XXX . Q 4 K C 1 601 205 K K . R 4 K C 1 602 207 K K . S 5 Q8C C 1 603 603 Q8C XXX . T 6 EDO F 1 601 601 EDO EDO . U 7 HOH A 1 701 70 HOH HOH . U 7 HOH A 2 702 136 HOH HOH . U 7 HOH A 3 703 182 HOH HOH . U 7 HOH A 4 704 18 HOH HOH . U 7 HOH A 5 705 108 HOH HOH . U 7 HOH A 6 706 174 HOH HOH . U 7 HOH A 7 707 68 HOH HOH . U 7 HOH A 8 708 60 HOH HOH . U 7 HOH A 9 709 36 HOH HOH . U 7 HOH A 10 710 53 HOH HOH . U 7 HOH A 11 711 126 HOH HOH . U 7 HOH A 12 712 140 HOH HOH . U 7 HOH A 13 713 58 HOH HOH . U 7 HOH A 14 714 184 HOH HOH . U 7 HOH A 15 715 19 HOH HOH . U 7 HOH A 16 716 73 HOH HOH . U 7 HOH A 17 717 67 HOH HOH . U 7 HOH A 18 718 164 HOH HOH . U 7 HOH A 19 719 165 HOH HOH . U 7 HOH A 20 720 49 HOH HOH . U 7 HOH A 21 721 152 HOH HOH . U 7 HOH A 22 722 23 HOH HOH . U 7 HOH A 23 723 76 HOH HOH . U 7 HOH A 24 724 10 HOH HOH . U 7 HOH A 25 725 56 HOH HOH . U 7 HOH A 26 726 22 HOH HOH . U 7 HOH A 27 727 143 HOH HOH . U 7 HOH A 28 728 86 HOH HOH . U 7 HOH A 29 729 38 HOH HOH . U 7 HOH A 30 730 177 HOH HOH . U 7 HOH A 31 731 175 HOH HOH . U 7 HOH A 32 732 77 HOH HOH . U 7 HOH A 33 733 62 HOH HOH . U 7 HOH A 34 734 90 HOH HOH . U 7 HOH A 35 735 59 HOH HOH . U 7 HOH A 36 736 84 HOH HOH . U 7 HOH A 37 737 43 HOH HOH . U 7 HOH A 38 738 106 HOH HOH . U 7 HOH A 39 739 144 HOH HOH . V 7 HOH B 1 701 171 HOH HOH . V 7 HOH B 2 702 80 HOH HOH . V 7 HOH B 3 703 128 HOH HOH . V 7 HOH B 4 704 42 HOH HOH . V 7 HOH B 5 705 17 HOH HOH . V 7 HOH B 6 706 20 HOH HOH . V 7 HOH B 7 707 54 HOH HOH . V 7 HOH B 8 708 160 HOH HOH . V 7 HOH B 9 709 172 HOH HOH . V 7 HOH B 10 710 179 HOH HOH . V 7 HOH B 11 711 146 HOH HOH . V 7 HOH B 12 712 135 HOH HOH . V 7 HOH B 13 713 145 HOH HOH . V 7 HOH B 14 714 166 HOH HOH . V 7 HOH B 15 715 9 HOH HOH . V 7 HOH B 16 716 103 HOH HOH . V 7 HOH B 17 717 50 HOH HOH . V 7 HOH B 18 718 12 HOH HOH . V 7 HOH B 19 719 151 HOH HOH . V 7 HOH B 20 720 75 HOH HOH . V 7 HOH B 21 721 24 HOH HOH . V 7 HOH B 22 722 125 HOH HOH . V 7 HOH B 23 723 45 HOH HOH . V 7 HOH B 24 724 138 HOH HOH . V 7 HOH B 25 725 72 HOH HOH . V 7 HOH B 26 726 92 HOH HOH . V 7 HOH B 27 727 89 HOH HOH . V 7 HOH B 28 728 114 HOH HOH . V 7 HOH B 29 729 105 HOH HOH . V 7 HOH B 30 730 83 HOH HOH . V 7 HOH B 31 731 155 HOH HOH . V 7 HOH B 32 732 178 HOH HOH . V 7 HOH B 33 733 88 HOH HOH . V 7 HOH B 34 734 134 HOH HOH . V 7 HOH B 35 735 78 HOH HOH . V 7 HOH B 36 736 142 HOH HOH . V 7 HOH B 37 737 46 HOH HOH . V 7 HOH B 38 738 31 HOH HOH . V 7 HOH B 39 739 122 HOH HOH . V 7 HOH B 40 740 33 HOH HOH . V 7 HOH B 41 741 113 HOH HOH . V 7 HOH B 42 742 158 HOH HOH . V 7 HOH B 43 743 4 HOH HOH . V 7 HOH B 44 744 154 HOH HOH . V 7 HOH B 45 745 69 HOH HOH . V 7 HOH B 46 746 180 HOH HOH . W 7 HOH C 1 701 79 HOH HOH . W 7 HOH C 2 702 173 HOH HOH . W 7 HOH C 3 703 131 HOH HOH . W 7 HOH C 4 704 48 HOH HOH . W 7 HOH C 5 705 63 HOH HOH . W 7 HOH C 6 706 176 HOH HOH . W 7 HOH C 7 707 13 HOH HOH . W 7 HOH C 8 708 109 HOH HOH . X 7 HOH D 1 101 1 HOH HOH . X 7 HOH D 2 102 96 HOH HOH . X 7 HOH D 3 103 85 HOH HOH . X 7 HOH D 4 104 117 HOH HOH . X 7 HOH D 5 105 57 HOH HOH . X 7 HOH D 6 106 93 HOH HOH . X 7 HOH D 7 107 14 HOH HOH . X 7 HOH D 8 108 66 HOH HOH . X 7 HOH D 9 109 26 HOH HOH . Y 7 HOH E 1 101 153 HOH HOH . Y 7 HOH E 2 102 97 HOH HOH . Y 7 HOH E 3 103 159 HOH HOH . Y 7 HOH E 4 104 11 HOH HOH . Z 7 HOH F 1 701 139 HOH HOH . Z 7 HOH F 2 702 121 HOH HOH . Z 7 HOH F 3 703 185 HOH HOH . Z 7 HOH F 4 704 161 HOH HOH . Z 7 HOH F 5 705 74 HOH HOH . Z 7 HOH F 6 706 123 HOH HOH . Z 7 HOH F 7 707 181 HOH HOH . Z 7 HOH F 8 708 81 HOH HOH . AA 7 HOH G 1 101 157 HOH HOH . AA 7 HOH G 2 102 132 HOH HOH . AA 7 HOH G 3 103 71 HOH HOH . AA 7 HOH G 4 104 156 HOH HOH . AA 7 HOH G 5 105 186 HOH HOH . BA 7 HOH H 1 101 130 HOH HOH . BA 7 HOH H 2 102 162 HOH HOH . BA 7 HOH H 3 103 163 HOH HOH . BA 7 HOH H 4 104 44 HOH HOH . CA 7 HOH I 1 101 183 HOH HOH . CA 7 HOH I 2 102 35 HOH HOH . CA 7 HOH I 3 103 55 HOH HOH . CA 7 HOH I 4 104 8 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 Q8C . . . S 5 29.927 35.152 -18.929 1 93.93 ? N1 Q8C 603 C 1 HETATM 2 C C7 Q8C . . . S 5 29.666 36.544 -17.139 1 101.19 ? C7 Q8C 603 C 1 HETATM 3 C C8 Q8C . . . S 5 28.535 36.135 -15.292 1 102.94 ? C8 Q8C 603 C 1 HETATM 4 N N2 Q8C . . . S 5 29.292 37.017 -15.95 1 101.77 ? N2 Q8C 603 C 1 HETATM 5 C C9 Q8C . . . S 5 28.514 34.474 -16.888 1 100.45 ? C9 Q8C 603 C 1 HETATM 6 O O1 Q8C . . . S 5 33.369 38.351 -17.537 1 100.2 ? O1 Q8C 603 C 1 HETATM 7 C C1 Q8C . . . S 5 32.418 38.66 -18.55 1 106.3 ? C1 Q8C 603 C 1 HETATM 8 C C5 Q8C . . . S 5 30.575 36.279 -19.114 1 102.45 ? C5 Q8C 603 C 1 HETATM 9 C C6 Q8C . . . S 5 29.344 35.31 -17.685 1 100.15 ? C6 Q8C 603 C 1 HETATM 10 N N3 Q8C . . . S 5 28.134 34.921 -15.678 1 104.24 ? N3 Q8C 603 C 1 HETATM 11 C C4 Q8C . . . S 5 31 38.52 -18.007 1 103.87 ? C4 Q8C 603 C 1 HETATM 12 C C3 Q8C . . . S 5 30.715 40.763 -20.714 1 105.78 ? C3 Q8C 603 C 1 HETATM 13 O O3 Q8C . . . S 5 30.203 39.362 -18.812 1 104.44 ? O3 Q8C 603 C 1 HETATM 14 C C2 Q8C . . . S 5 31.001 40.483 -19.255 1 105.13 ? C2 Q8C 603 C 1 HETATM 15 N N4 Q8C . . . S 5 28.017 33.292 -17.305 1 93.5 ? N4 Q8C 603 C 1 HETATM 16 N N Q8C . . . S 5 30.454 37.166 -18.079 1 98.91 ? N Q8C 603 C 1 HETATM 17 C C Q8C . . . S 5 32.462 40.146 -18.932 1 103.12 ? C Q8C 603 C 1 HETATM 18 O O Q8C . . . S 5 32.952 40.963 -17.876 1 98.02 ? O Q8C 603 C 1 HETATM 19 C C10 Q8C . . . S 5 28.223 32.743 -18.635 1 98.86 ? C10 Q8C 603 C 1 HETATM 20 C C11 Q8C . . . S 5 29.458 31.884 -18.754 1 101.32 ? C11 Q8C 603 C 1 HETATM 21 C C12 Q8C . . . S 5 29.86 31.387 -19.987 1 96.06 ? C12 Q8C 603 C 1 HETATM 22 C C13 Q8C . . . S 5 30.997 30.603 -20.095 1 99.16 ? C13 Q8C 603 C 1 HETATM 23 C C14 Q8C . . . S 5 31.745 30.306 -18.977 1 102.97 ? C14 Q8C 603 C 1 HETATM 24 C C15 Q8C . . . S 5 31.356 30.793 -17.747 1 101.21 ? C15 Q8C 603 C 1 HETATM 25 C C16 Q8C . . . S 5 30.22 31.577 -17.635 1 95.93 ? C16 Q8C 603 C 1 HETATM 26 O O2 Q8C . . . S 5 31.241 39.743 -21.555 1 100.57 ? O2 Q8C 603 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 160 _model_server_stats.parse_time_ms 158 _model_server_stats.create_model_time_ms 56 _model_server_stats.query_time_ms 333 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 26 #