data_8CY7 # _model_server_result.job_id LU8qzmCwH4b6B8-feRzNSQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:49:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8cy7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"ZA","auth_seq_id":1302}' # _entry.id 8CY7 # _exptl.entry_id 8CY7 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 50 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8CY7 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8CY7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N ? 4 NA N N ? 4 OA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N ? 4 ZA N N ? 4 AB N N ? 4 BB N N ? 4 CB N N ? 4 DB N N ? 4 EB N N ? 4 FB N N ? 4 GB N N ? 4 HB N N ? 4 IB N N ? 4 JB N N ? 4 KB N N ? 4 LB N N ? 4 MB N N ? 4 NB N N ? 4 OB N N ? 4 PB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 1311 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 1312 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 1318 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 1319 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 1321 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 1322 NAG 3 n J NAG 1 J 1 NAG A 1325 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG A 1326 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG B 1311 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG B 1312 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG B 1313 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG B 1320 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG B 1315 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG B 1316 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG B 1317 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG B 1318 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG C 1312 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG C 1313 NAG 3 n P NAG 1 P 1 NAG C 1314 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG C 1315 NAG 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 1321 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 1322 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG C 1325 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG C 1326 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 131 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 291 A CYS 291 1_555 A SG CYS 301 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 336 A CYS 336 1_555 A SG CYS 361 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 A SG CYS 432 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 391 A CYS 391 1_555 A SG CYS 525 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 480 A CYS 480 1_555 A SG CYS 488 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 617 A CYS 617 1_555 A SG CYS 649 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 662 A CYS 662 1_555 A SG CYS 671 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 738 A CYS 738 1_555 A SG CYS 760 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 743 A CYS 743 1_555 A SG CYS 749 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1043 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1082 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1126 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 131 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 291 B CYS 291 1_555 B SG CYS 301 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 336 B CYS 336 1_555 B SG CYS 361 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 379 B CYS 379 1_555 B SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 391 B CYS 391 1_555 B SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 480 B CYS 480 1_555 B SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 662 B CYS 662 1_555 B SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 738 B CYS 738 1_555 B SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 743 B CYS 743 1_555 B SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 131 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 291 C CYS 291 1_555 C SG CYS 301 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 336 C CYS 336 1_555 C SG CYS 361 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 379 C CYS 379 1_555 C SG CYS 432 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 391 C CYS 391 1_555 C SG CYS 525 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 480 C CYS 480 1_555 C SG CYS 488 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 617 C CYS 617 1_555 C SG CYS 649 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 662 C CYS 662 1_555 C SG CYS 671 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 738 C CYS 738 1_555 C SG CYS 760 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 743 C CYS 743 1_555 C SG CYS 749 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 1032 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1043 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 1082 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1126 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 22 D CYS 22 1_555 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 E SG CYS 22 E CYS 22 1_555 E SG CYS 95 E CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 F SG CYS 22 F CYS 22 1_555 F SG CYS 95 F CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 S C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 149 A ASN 149 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 234 A ASN 234 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 282 A ASN 282 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 331 A ASN 331 1_555 U C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 343 A ASN 343 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 603 A ASN 603 1_555 V C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 657 A ASN 657 1_555 X C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 709 A ASN 709 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 717 A ASN 717 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 801 A ASN 801 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1074 A ASN 1074 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1098 A ASN 1098 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1134 A ASN 1134 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 343 B ASN 343 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 603 B ASN 603 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 657 B ASN 657 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 801 B ASN 801 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 1074 B ASN 1074 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 1098 B ASN 1098 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 61 C ASN 61 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 149 C ASN 149 1_555 JB C1 NAG . C NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 165 C ASN 165 1_555 KB C1 NAG . C NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 234 C ASN 234 1_555 LB C1 NAG . C NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 282 C ASN 282 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 331 C ASN 331 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 343 C ASN 343 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 603 C ASN 603 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 616 C ASN 616 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 657 C ASN 657 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 801 C ASN 801 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 1074 C ASN 1074 1_555 GB C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 1098 C ASN 1098 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale40 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale41 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale42 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale43 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale44 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale45 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale47 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale49 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale50 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8CY7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 4 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . T 4 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . U 4 NAG A 1 1303 1304 NAG NAG . V 4 NAG A 1 1304 1306 NAG NAG . W 4 NAG A 1 1305 1307 NAG NAG . X 4 NAG A 1 1306 1308 NAG NAG . Y 4 NAG A 1 1307 1309 NAG NAG . Z 4 NAG A 1 1308 1310 NAG NAG . AA 4 NAG A 1 1309 1313 NAG NAG . BA 4 NAG A 1 1310 1314 NAG NAG . CA 4 NAG A 1 1311 1315 NAG NAG . DA 4 NAG A 1 1312 1316 NAG NAG . EA 4 NAG A 1 1313 1317 NAG NAG . FA 4 NAG A 1 1314 1320 NAG NAG . GA 4 NAG A 1 1315 1323 NAG NAG . HA 4 NAG A 1 1316 1324 NAG NAG . IA 4 NAG A 1 1317 1321 NAG NAG . JA 4 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . KA 4 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . LA 4 NAG B 1 1303 1304 NAG NAG . MA 4 NAG B 1 1304 1306 NAG NAG . NA 4 NAG B 1 1305 1307 NAG NAG . OA 4 NAG B 1 1306 1308 NAG NAG . PA 4 NAG B 1 1307 1309 NAG NAG . QA 4 NAG B 1 1308 1310 NAG NAG . RA 4 NAG B 1 1309 1319 NAG NAG . SA 4 NAG B 1 1310 1322 NAG NAG . TA 4 NAG B 1 1311 1323 NAG NAG . UA 4 NAG B 1 1312 1324 NAG NAG . VA 4 NAG B 1 1313 1325 NAG NAG . WA 4 NAG B 1 1314 1326 NAG NAG . XA 4 NAG B 1 1315 1309 NAG NAG . YA 4 NAG C 1 1301 1327 NAG NAG . ZA 4 NAG C 1 1302 1301 NAG NAG . AB 4 NAG C 1 1303 1302 NAG NAG . BB 4 NAG C 1 1304 1303 NAG NAG . CB 4 NAG C 1 1305 1304 NAG NAG . DB 4 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . EB 4 NAG C 1 1307 1307 NAG NAG . FB 4 NAG C 1 1308 1308 NAG NAG . GB 4 NAG C 1 1309 1310 NAG NAG . HB 4 NAG C 1 1310 1311 NAG NAG . IB 4 NAG C 1 1311 1316 NAG NAG . JB 4 NAG C 1 1312 1317 NAG NAG . KB 4 NAG C 1 1313 1318 NAG NAG . LB 4 NAG C 1 1314 1319 NAG NAG . MB 4 NAG C 1 1315 1320 NAG NAG . NB 4 NAG C 1 1316 1323 NAG NAG . OB 4 NAG C 1 1317 1324 NAG NAG . PB 4 NAG C 1 1318 1327 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . ZA 4 162.794 213.488 218.883 1 221.14 ? C1 NAG 1302 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . ZA 4 162.869 211.962 218.87 1 221.2 ? C2 NAG 1302 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . ZA 4 162.34 211.42 217.546 1 221 ? C3 NAG 1302 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . ZA 4 160.945 211.964 217.269 1 221.81 ? C4 NAG 1302 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . ZA 4 160.946 213.488 217.354 1 222.03 ? C5 NAG 1302 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . ZA 4 159.567 214.089 217.211 1 222.47 ? C6 NAG 1302 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . ZA 4 164.524 210.277 219.541 1 222.32 ? C7 NAG 1302 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . ZA 4 165.98 209.976 219.725 1 221.7 ? C8 NAG 1302 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . ZA 4 164.23 211.506 219.102 1 221.13 ? N2 NAG 1302 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . ZA 4 162.305 209.998 217.597 1 220.86 ? O3 NAG 1302 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . ZA 4 160.518 211.568 215.971 1 222.24 ? O4 NAG 1302 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . ZA 4 161.448 213.906 218.632 1 222.72 ? O5 NAG 1302 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . ZA 4 159.633 215.441 216.776 1 222.02 ? O6 NAG 1302 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . ZA 4 163.652 209.447 219.78 1 222.5 ? O7 NAG 1302 C 1 HETATM 15 H H2 NAG . . . ZA 4 162.3 211.622 219.586 1 221.4 ? H2 NAG 1302 C 1 HETATM 16 H H3 NAG . . . ZA 4 162.938 211.697 216.827 1 221.36 ? H3 NAG 1302 C 1 HETATM 17 H H4 NAG . . . ZA 4 160.324 211.608 217.933 1 221.77 ? H4 NAG 1302 C 1 HETATM 18 H H5 NAG . . . ZA 4 161.523 213.845 216.653 1 221.5 ? H5 NAG 1302 C 1 HETATM 19 H H61 NAG . . . ZA 4 159.112 214.053 218.073 1 221.4 ? H61 NAG 1302 C 1 HETATM 20 H H62 NAG . . . ZA 4 159.059 213.57 216.56 1 221.84 ? H62 NAG 1302 C 1 HETATM 21 H H81 NAG . . . ZA 4 166.359 210.59 220.382 1 221.63 ? H81 NAG 1302 C 1 HETATM 22 H H82 NAG . . . ZA 4 166.086 209.058 220.039 1 221.71 ? H82 NAG 1302 C 1 HETATM 23 H H83 NAG . . . ZA 4 166.445 210.084 218.873 1 221.7 ? H83 NAG 1302 C 1 HETATM 24 H HN2 NAG . . . ZA 4 164.916 212.084 218.94 1 221.21 ? HN2 NAG 1302 C 1 HETATM 25 H HO3 NAG . . . ZA 4 161.891 209.738 218.338 1 221.63 ? HO3 NAG 1302 C 1 HETATM 26 H HO4 NAG . . . ZA 4 160.999 210.872 215.7 1 221.8 ? HO4 NAG 1302 C 1 HETATM 27 H HO6 NAG . . . ZA 4 159.834 215.464 215.912 1 221.38 ? HO6 NAG 1302 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 251 _model_server_stats.parse_time_ms 17 _model_server_stats.create_model_time_ms 33 _model_server_stats.query_time_ms 284 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 27 #