data_8CYA # _model_server_result.job_id txsuVVdTFGbW5UKvMRRXOA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:38:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8cya # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":1303}' # _entry.id 8CYA # _exptl.entry_id 8CYA _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 32 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8CYA _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8CYA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N ? 6 FB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 5 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG B 1148 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG B 1149 NAG 3 n G BMA 3 G 3 BMA B 1150 BMA 3 n H NAG 1 H 1 NAG B 1151 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG B 1152 NAG 3 n H BMA 3 H 3 BMA B 1153 BMA 3 n I NAG 1 I 1 NAG B 1155 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG B 1156 NAG 3 n I BMA 3 I 3 BMA B 1157 BMA 3 n J NAG 1 J 1 NAG B 1158 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG B 1159 NAG 3 n J BMA 3 J 3 BMA B 1160 BMA 4 n K NAG 1 K 1 NAG B 1161 NAG 4 n K NAG 2 K 2 NAG B 1162 NAG 4 n L NAG 1 L 1 NAG B 1167 NAG 4 n L NAG 2 L 2 NAG B 1168 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG A 1154 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG A 1155 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG A 1160 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG A 1161 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG A 1162 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG A 1163 NAG 3 n O BMA 3 O 3 BMA A 1164 BMA 5 n P NAG 1 P 1 NAG A 1166 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG A 1167 NAG 5 n P FUC 3 P 3 FUC A 1174 FUC 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1168 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1169 NAG 3 n Q BMA 3 Q 3 BMA A 1170 BMA 3 n R NAG 1 R 1 NAG A 1171 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG A 1172 NAG 3 n R BMA 3 R 3 BMA A 1173 BMA 3 n S NAG 1 S 1 NAG C 1153 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG C 1154 NAG 3 n S BMA 3 S 3 BMA C 1155 BMA 3 n T NAG 1 T 1 NAG C 1156 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG C 1157 NAG 3 n T BMA 3 T 3 BMA C 1158 BMA 3 n U NAG 1 U 1 NAG C 1163 NAG 3 n U NAG 2 U 2 NAG C 1164 NAG 3 n U BMA 3 U 3 BMA C 1165 BMA 3 n V NAG 1 V 1 NAG C 1166 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG C 1167 NAG 3 n V BMA 3 V 3 BMA C 1168 BMA 3 n W NAG 1 W 1 NAG C 1169 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG C 1170 NAG 3 n W BMA 3 W 3 BMA C 1171 BMA 5 n X NAG 1 X 1 NAG C 1172 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG C 1173 NAG 5 n X FUC 3 X 3 FUC C 1174 FUC 3 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 1175 NAG 3 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 1176 NAG 3 n Y BMA 3 Y 3 BMA C 1177 BMA 3 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1178 NAG 3 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1179 NAG 3 n Z BMA 3 Z 3 BMA C 1180 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 291 B CYS 291 1_555 A SG CYS 301 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 336 B CYS 336 1_555 A SG CYS 361 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 379 B CYS 379 1_555 A SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 391 B CYS 391 1_555 A SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 480 B CYS 480 1_555 A SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 538 B CYS 538 1_555 A SG CYS 590 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 617 B CYS 617 1_555 A SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 662 B CYS 662 1_555 A SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 738 B CYS 738 1_555 A SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 743 B CYS 743 1_555 A SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 A SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 A SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 291 A CYS 291 1_555 B SG CYS 301 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 336 A CYS 336 1_555 B SG CYS 361 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 379 A CYS 379 1_555 B SG CYS 432 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 391 A CYS 391 1_555 B SG CYS 525 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 480 A CYS 480 1_555 B SG CYS 488 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 538 A CYS 538 1_555 B SG CYS 590 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 617 A CYS 617 1_555 B SG CYS 649 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 662 A CYS 662 1_555 B SG CYS 671 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 738 A CYS 738 1_555 B SG CYS 760 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 743 A CYS 743 1_555 B SG CYS 749 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 B SG CYS 1043 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1082 A CYS 1082 1_555 B SG CYS 1126 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 291 C CYS 291 1_555 C SG CYS 301 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 336 C CYS 336 1_555 C SG CYS 361 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 379 C CYS 379 1_555 C SG CYS 432 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 391 C CYS 391 1_555 C SG CYS 525 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 480 C CYS 480 1_555 C SG CYS 488 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 538 C CYS 538 1_555 C SG CYS 590 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 617 C CYS 617 1_555 C SG CYS 649 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 662 C CYS 662 1_555 C SG CYS 671 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 738 C CYS 738 1_555 C SG CYS 760 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 743 C CYS 743 1_555 C SG CYS 749 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 1032 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1043 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 1082 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1126 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 22 D CYS 22 1_555 D SG CYS 99 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 E SG CYS 22 E CYS 22 1_555 E SG CYS 99 E CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 F SG CYS 22 F CYS 22 1_555 F SG CYS 99 F CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 17 B ASN 17 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 122 B ASN 122 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 331 B ASN 331 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 616 B ASN 616 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 709 B ASN 709 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 717 B ASN 717 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 801 B ASN 801 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 1134 B ASN 1134 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 17 A ASN 17 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 122 A ASN 122 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 282 A ASN 282 1_555 RA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 717 A ASN 717 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 1134 A ASN 1134 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 17 C ASN 17 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 C ND2 ASN 234 C ASN 234 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 282 C ASN 282 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 709 C ASN 709 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 717 C ASN 717 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 801 C ASN 801 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 1074 C ASN 1074 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 1134 C ASN 1134 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 G O4 NAG . G NAG 2 1_555 G C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale29 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale30 H O4 NAG . H NAG 2 1_555 H C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale31 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale32 I O4 NAG . I NAG 2 1_555 I C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale33 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale34 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale35 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale36 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale37 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale39 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale40 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale41 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale42 P O6 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 FUC . P FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale43 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale44 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale45 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale46 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale47 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale48 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale49 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale50 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale51 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale52 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale53 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale54 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale55 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale56 W O4 NAG . W NAG 2 1_555 W C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale57 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale58 X O6 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 FUC . X FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale59 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale60 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale61 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale62 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 282 n n C1 O1 NAG sing 283 n n C1 O5 NAG sing 284 n n C1 H1 NAG sing 285 n n C2 C3 NAG sing 286 n n C2 N2 NAG sing 287 n n C2 H2 NAG sing 288 n n C3 C4 NAG sing 289 n n C3 O3 NAG sing 290 n n C3 H3 NAG sing 291 n n C4 C5 NAG sing 292 n n C4 O4 NAG sing 293 n n C4 H4 NAG sing 294 n n C5 C6 NAG sing 295 n n C5 O5 NAG sing 296 n n C5 H5 NAG sing 297 n n C6 O6 NAG sing 298 n n C6 H61 NAG sing 299 n n C6 H62 NAG sing 300 n n C7 C8 NAG sing 301 n n C7 N2 NAG sing 302 n n C7 O7 NAG doub 303 n n C8 H81 NAG sing 304 n n C8 H82 NAG sing 305 n n C8 H83 NAG sing 306 n n N2 HN2 NAG sing 307 n n O1 HO1 NAG sing 308 n n O3 HO3 NAG sing 309 n n O4 HO4 NAG sing 310 n n O6 HO6 NAG sing 311 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8CYA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code AA 6 NAG B 1 1301 1154 NAG NAG . BA 6 NAG B 1 1302 1163 NAG NAG . CA 6 NAG B 1 1303 1164 NAG NAG . DA 6 NAG B 1 1304 1165 NAG NAG . EA 6 NAG B 1 1305 1166 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 1306 1169 NAG NAG . GA 6 NAG B 1 1307 1170 NAG NAG . HA 6 NAG B 1 1308 1171 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1309 1172 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1310 1173 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1311 1174 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1312 1175 NAG NAG . MA 6 NAG A 1 1301 1148 NAG NAG . NA 6 NAG A 1 1302 1149 NAG NAG . OA 6 NAG A 1 1303 1150 NAG NAG . PA 6 NAG A 1 1304 1151 NAG NAG . QA 6 NAG A 1 1305 1152 NAG NAG . RA 6 NAG A 1 1306 1153 NAG NAG . SA 6 NAG A 1 1307 1156 NAG NAG . TA 6 NAG A 1 1308 1157 NAG NAG . UA 6 NAG A 1 1309 1158 NAG NAG . VA 6 NAG A 1 1310 1159 NAG NAG . WA 6 NAG A 1 1311 1175 NAG NAG . XA 6 NAG C 1 1301 1148 NAG NAG . YA 6 NAG C 1 1302 1149 NAG NAG . ZA 6 NAG C 1 1303 1150 NAG NAG . AB 6 NAG C 1 1304 1151 NAG NAG . BB 6 NAG C 1 1305 1152 NAG NAG . CB 6 NAG C 1 1306 1159 NAG NAG . DB 6 NAG C 1 1307 1160 NAG NAG . EB 6 NAG C 1 1308 1161 NAG NAG . FB 6 NAG C 1 1309 1162 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . CA 6 250.289 224.632 223.276 1 135.46 ? C1 NAG 1303 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . CA 6 251.522 225.449 223.675 1 136.09 ? C2 NAG 1303 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . CA 6 252.308 224.722 224.763 1 135.06 ? C3 NAG 1303 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . CA 6 251.401 224.382 225.937 1 135.33 ? C4 NAG 1303 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . CA 6 250.184 223.6 225.452 1 137.03 ? C5 NAG 1303 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . CA 6 249.185 223.321 226.55 1 135.57 ? C6 NAG 1303 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . CA 6 252.271 226.811 221.775 1 137.86 ? C7 NAG 1303 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . CA 6 253.226 226.912 220.624 1 132.19 ? C8 NAG 1303 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . CA 6 252.37 225.707 222.522 1 136.58 ? N2 NAG 1303 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . CA 6 253.382 225.546 225.201 1 132.88 ? O3 NAG 1303 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . CA 6 252.111 223.6 226.89 1 134.24 ? O4 NAG 1303 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . CA 6 249.493 224.352 224.444 1 137.01 ? O5 NAG 1303 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . CA 6 247.883 223.768 226.194 1 137.14 ? O6 NAG 1303 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . CA 6 251.449 227.688 222.018 1 138.91 ? O7 NAG 1303 B 1 HETATM 15 H H2 NAG . . . CA 6 251.228 226.303 224.043 1 133.9 ? H2 NAG 1303 B 1 HETATM 16 H H3 NAG . . . CA 6 252.672 223.895 224.393 1 134.05 ? H3 NAG 1303 B 1 HETATM 17 H H4 NAG . . . CA 6 251.102 225.209 226.361 1 133.68 ? H4 NAG 1303 B 1 HETATM 18 H H5 NAG . . . CA 6 250.482 222.753 225.069 1 134.26 ? H5 NAG 1303 B 1 HETATM 19 H H61 NAG . . . CA 6 249.468 223.781 227.363 1 134 ? H61 NAG 1303 B 1 HETATM 20 H H62 NAG . . . CA 6 249.157 222.361 226.719 1 133.95 ? H62 NAG 1303 B 1 HETATM 21 H H81 NAG . . . CA 6 253.072 227.749 220.146 1 133.62 ? H81 NAG 1303 B 1 HETATM 22 H H82 NAG . . . CA 6 253.085 226.16 220.018 1 133.48 ? H82 NAG 1303 B 1 HETATM 23 H H83 NAG . . . CA 6 254.143 226.892 220.959 1 133.75 ? H83 NAG 1303 B 1 HETATM 24 H HN2 NAG . . . CA 6 252.999 225.086 222.298 1 133.75 ? HN2 NAG 1303 B 1 HETATM 25 H HO3 NAG . . . CA 6 253.664 225.268 225.996 1 134.01 ? HO3 NAG 1303 B 1 HETATM 26 H HO4 NAG . . . CA 6 252.165 224.044 227.657 1 133.69 ? HO4 NAG 1303 B 1 HETATM 27 H HO6 NAG . . . CA 6 247.948 224.508 225.708 1 134.01 ? HO6 NAG 1303 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 68 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 72 _model_server_stats.query_time_ms 271 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 27 #