data_8D9G # _model_server_result.job_id sZHuHTog3mIbx3JsKhbMbw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-12 15:29:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8d9g # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":1704}' # _entry.id 8D9G # _exptl.entry_id 8D9G _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8D9G _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8D9G _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 F N N ? 5 G N N ? 5 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B SG CYS 83 B CYS 83 1_555 E ZN ZN . B ZN 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 116 B CYS 116 1_555 E ZN ZN . B ZN 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 122 B CYS 122 1_555 E ZN ZN . B ZN 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 125 B CYS 125 1_555 E ZN ZN . B ZN 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 460 B CYS 486 1_555 F ZN ZN . B ZN 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc6 B SG CYS 470 B CYS 496 1_555 F ZN ZN . B ZN 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 472 B CYS 498 1_555 F ZN ZN . B ZN 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 475 B CYS 501 1_555 F ZN ZN . B ZN 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc9 B ND1 HIS 716 B HIS 742 1_555 G ZN ZN . B ZN 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? metalc ? metalc10 B SG CYS 721 B CYS 747 1_555 G ZN ZN . B ZN 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc11 B SG CYS 971 B CYS 1013 1_555 H ZN ZN . B ZN 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 999 B CYS 1401 1_555 H ZN ZN . B ZN 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 1007 B CYS 1409 1_555 H ZN ZN . B ZN 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 1010 B CYS 1412 1_555 H ZN ZN . B ZN 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog1 C O2 U 5 C U 16 1_555 C N6 A 7 C A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N3 C 19 C C 30 1_555 D N1 G 18 D G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N4 C 19 C C 30 1_555 D O6 G 18 D G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C O2 C 19 C C 30 1_555 D N2 G 18 D G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N3 C 20 C C 31 1_555 D N1 G 17 D G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N4 C 20 C C 31 1_555 D O6 G 17 D G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C O2 C 20 C C 31 1_555 D N2 G 17 D G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N1 A 21 C A 32 1_555 D N3 U 16 D U 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N6 A 21 C A 32 1_555 D O4 U 16 D U 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog10 C N3 U 23 C U 34 1_555 D N1 A 14 D A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N3 U 24 C U 35 1_555 D N1 A 13 D A 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C O4 U 24 C U 35 1_555 D N6 A 13 D A 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N3 U 25 C U 36 1_555 D N1 A 12 D A 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O4 U 25 C U 36 1_555 D N6 A 12 D A 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N3 U 26 C U 37 1_555 D N1 A 11 D A 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C O4 U 26 C U 37 1_555 D N6 A 11 D A 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N3 C 27 C C 38 1_555 D N1 G 10 D G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N4 C 27 C C 38 1_555 D O6 G 10 D G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O2 C 27 C C 38 1_555 D N2 G 10 D G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N1 G 29 C G 40 1_555 D N3 C 8 D C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N2 G 29 C G 40 1_555 D O2 C 8 D C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C O6 G 29 C G 40 1_555 D N4 C 8 D C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N3 C 30 C C 41 1_555 D N1 G 7 D G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N4 C 30 C C 41 1_555 D O6 G 7 D G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C O2 C 30 C C 41 1_555 D N2 G 7 D G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N3 C 31 C C 42 1_555 D N1 G 6 D G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N4 C 31 C C 42 1_555 D O6 G 6 D G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C O2 C 31 C C 42 1_555 D N2 G 6 D G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N3 C 32 C C 43 1_555 D N1 G 5 D G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N4 C 32 C C 43 1_555 D O6 G 5 D G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C O2 C 32 C C 43 1_555 D N2 G 5 D G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N3 C 33 C C 44 1_555 D N1 G 4 D G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N4 C 33 C C 44 1_555 D O6 G 4 D G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C O2 C 33 C C 44 1_555 D N2 G 4 D G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog35 C N1 G 34 C G 45 1_555 D N3 C 3 D C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N1 G 35 C G 46 1_555 D N3 C 2 D C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N2 G 35 C G 46 1_555 D O2 C 2 D C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C O6 G 35 C G 46 1_555 D N4 C 2 D C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N1 A 36 C A 47 1_555 D N3 U 1 D U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N6 A 36 C A 47 1_555 D O4 U 1 D U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8D9G _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 ZN B 1 1701 1701 ZN ZN . F 5 ZN B 1 1702 1702 ZN ZN . G 5 ZN B 1 1703 1703 ZN ZN . H 5 ZN B 1 1704 1704 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 131.062 _atom_site.Cartn_y 112.09 _atom_site.Cartn_z 170.973 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 95.47 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1704 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 23 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 344 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #