data_8D9R
#
_model_server_result.job_id            eq6UzDR9xQlZ6LnLmcYErA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-12 20:25:31' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8d9r 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"PC","auth_seq_id":1002}' 
#
_entry.id    8D9R 
#
_exptl.entry_id    8D9R 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          9 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    18 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8D9R 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8D9R 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    60-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      60 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 9 JB N N 
? 9 LB N N 
? 9 NB N N 
? 9 PB N N 
? 9 RB N N 
? 9 TB N N 
? 9 VB N N 
? 9 XB N N 
? 9 ZB N N 
? 9 BC N N 
? 9 DC N N 
? 9 FC N N 
? 9 HC N N 
? 9 JC N N 
? 9 LC N N 
? 9 NC N N 
? 9 PC N N 
? 9 RC N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 IB O1G GTP . C GTP 1001 1_555 JB MG MG . C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc2 KB O1G GTP . H GTP 1001 1_555 LB MG MG . H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc3 MB O1G GTP . Z GTP 1001 1_555 NB MG MG . Z MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc4 OB O1G GTP . J GTP 1001 1_555 PB MG MG . J MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc5 QB O1G GTP . X GTP 1001 1_555 RB MG MG . X MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc6 SB O1G GTP . 3 GTP 1001 1_555 TB MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc7 UB O1G GTP . K GTP 1001 1_555 VB MG MG . K MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc8 WB O1G GTP . a GTP 1001 1_555 XB MG MG . a MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc9 YB O1G GTP . 4 GTP 1001 1_555 ZB MG MG . 4 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc10 AC O1G GTP . O GTP 1001 1_555 BC MG MG . O MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc11 CC O1G GTP . b GTP 1001 1_555 DC MG MG . b MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc12 EC O1G GTP . 5 GTP 1001 1_555 FC MG MG . 5 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc13 GC O1G GTP . P GTP 1001 1_555 HC MG MG . P MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc14 IC O1G GTP . c GTP 1001 1_555 JC MG MG . c MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc15 KC O1G GTP . 6 GTP 1001 1_555 LC MG MG . 6 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc16 MC O1G GTP . Q GTP 1001 1_555 NC MG MG . Q MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc17 OC O1G GTP . d GTP 1001 1_555 PC MG MG . d MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc18 QC O1G GTP . 7 GTP 1001 1_555 RC MG MG . 7 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8D9R 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
IB 8 GTP C 1 1001 1001 GTP GTP . 
JB 9 MG C 1 1002 1002 MG MG . 
KB 8 GTP H 1 1001 1001 GTP GTP . 
LB 9 MG H 1 1002 1002 MG MG . 
MB 8 GTP Z 1 1001 1001 GTP GTP . 
NB 9 MG Z 1 1002 1002 MG MG . 
OB 8 GTP J 1 1001 1001 GTP GTP . 
PB 9 MG J 1 1002 1002 MG MG . 
QB 8 GTP X 1 1001 1001 GTP GTP . 
RB 9 MG X 1 1002 1002 MG MG . 
SB 8 GTP 3 1 1001 1001 GTP GTP . 
TB 9 MG 3 1 1002 1002 MG MG . 
UB 8 GTP K 1 1001 1001 GTP GTP . 
VB 9 MG K 1 1002 1002 MG MG . 
WB 8 GTP a 1 1001 1001 GTP GTP . 
XB 9 MG a 1 1002 1002 MG MG . 
YB 8 GTP 4 1 1001 1001 GTP GTP . 
ZB 9 MG 4 1 1002 1002 MG MG . 
AC 8 GTP O 1 1001 1001 GTP GTP . 
BC 9 MG O 1 1002 1002 MG MG . 
CC 8 GTP b 1 1001 1001 GTP GTP . 
DC 9 MG b 1 1002 1002 MG MG . 
EC 8 GTP 5 1 1001 1001 GTP GTP . 
FC 9 MG 5 1 1002 1002 MG MG . 
GC 8 GTP P 1 1001 1001 GTP GTP . 
HC 9 MG P 1 1002 1002 MG MG . 
IC 8 GTP c 1 1001 1001 GTP GTP . 
JC 9 MG c 1 1002 1002 MG MG . 
KC 8 GTP 6 1 1001 1001 GTP GTP . 
LC 9 MG 6 1 1002 1002 MG MG . 
MC 8 GTP Q 1 1001 1001 GTP GTP . 
NC 9 MG Q 1 1002 1002 MG MG . 
OC 8 GTP d 1 1001 1001 GTP GTP . 
PC 9 MG d 1 1002 1002 MG MG . 
QC 8 GTP 7 1 1001 1001 GTP GTP . 
RC 9 MG 7 1 1002 1002 MG MG . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         PC 
_atom_site.label_entity_id       9 
_atom_site.Cartn_x               99.658 
_atom_site.Cartn_y               268.216 
_atom_site.Cartn_z               248.859 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        57.46 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           1002 
_atom_site.auth_asym_id          d 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              64 
_model_server_stats.parse_time_ms           16 
_model_server_stats.create_model_time_ms    87 
_model_server_stats.query_time_ms           319 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#