data_8DBF # _model_server_result.job_id WtbTVNleqVrS5T49yDDinw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 22:21:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8dbf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":406}' # _entry.id 8DBF # _exptl.entry_id 8DBF _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 427.201 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8DBF _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8DBF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 R N N ? 3 T N N ? 3 X N N ? 3 Y N N ? 3 CA N N ? 3 DA N N ? 3 HA N N ? 3 IA N N ? 3 LA N N ? 3 NA N N ? 3 RA N N ? 3 SA N N ? 3 VA N N ? 3 XA N N ? 3 BB N N ? 3 CB N N ? 3 GB N N ? 3 HB N N ? 3 LB N N ? 3 MB N N ? 3 PB N N ? 3 RB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 171 A ASP 171 1_555 Q MG MG . A MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc2 M O2 HSX . A HSX 401 1_555 Q MG MG . A MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc3 M O1 HSX . A HSX 401 1_555 Q MG MG . A MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc4 O O1A ADP . A ADP 403 1_555 P MG MG . A MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc5 O O3A ADP . A ADP 403 1_555 P MG MG . A MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc6 P MG MG . A MG 404 1_555 UB O HOH . A HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc7 P MG MG . A MG 404 1_555 UB O HOH . A HOH 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc8 P MG MG . A MG 404 1_555 UB O HOH . A HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.868 ? metalc ? metalc9 R O2A ADP . A ADP 406 1_555 U MG MG . B MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc10 R O3A ADP . A ADP 406 1_555 U MG MG . B MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc11 UB O HOH . A HOH 505 1_555 U MG MG . B MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc12 UB O HOH . A HOH 507 1_555 U MG MG . B MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc13 B OD2 ASP 171 B ASP 171 1_555 V MG MG . B MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc14 S O2 HSX . B HSX 401 1_555 V MG MG . B MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc15 S O1 HSX . B HSX 401 1_555 V MG MG . B MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc16 U MG MG . B MG 403 1_555 VB O HOH . B HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc17 C OD2 ASP 171 C ASP 171 1_555 AA MG MG . C MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc18 W O2 HSX . C HSX 401 1_555 AA MG MG . C MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc19 W O1 HSX . C HSX 401 1_555 AA MG MG . C MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc20 Y O1A ADP . C ADP 403 1_555 Z MG MG . C MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc21 Y O3A ADP . C ADP 403 1_555 Z MG MG . C MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc22 Z MG MG . C MG 404 1_555 WB O HOH . C HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc23 Z MG MG . C MG 404 1_555 WB O HOH . C HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc24 Z MG MG . C MG 404 1_555 WB O HOH . C HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc25 D OD2 ASP 171 D ASP 171 1_555 FA MG MG . D MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc26 BA O2 HSX . D HSX 401 1_555 FA MG MG . D MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc27 BA O1 HSX . D HSX 401 1_555 FA MG MG . D MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc28 DA O2A ADP . D ADP 403 1_555 EA MG MG . D MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc29 DA O3A ADP . D ADP 403 1_555 EA MG MG . D MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc30 EA MG MG . D MG 404 1_555 XB O HOH . D HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc31 EA MG MG . D MG 404 1_555 XB O HOH . D HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc32 EA MG MG . D MG 404 1_555 XB O HOH . D HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.868 ? metalc ? metalc33 E OD2 ASP 171 E ASP 171 1_555 KA MG MG . E MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc34 GA O2 HSX . E HSX 401 1_555 KA MG MG . E MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc35 GA O1 HSX . E HSX 401 1_555 KA MG MG . E MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc36 IA O1A ADP . E ADP 403 1_555 JA MG MG . E MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc37 IA O3A ADP . E ADP 403 1_555 JA MG MG . E MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc38 JA MG MG . E MG 404 1_555 YB O HOH . E HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? metalc ? metalc39 JA MG MG . E MG 404 1_555 YB O HOH . E HOH 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc40 JA MG MG . E MG 404 1_555 YB O HOH . E HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.866 ? metalc ? metalc41 LA O2A ADP . E ADP 406 1_555 OA MG MG . F MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc42 LA O3A ADP . E ADP 406 1_555 OA MG MG . F MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc43 YB O HOH . E HOH 506 1_555 OA MG MG . F MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc44 YB O HOH . E HOH 507 1_555 OA MG MG . F MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc45 F OD2 ASP 171 F ASP 171 1_555 PA MG MG . F MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc46 MA O2 HSX . F HSX 401 1_555 PA MG MG . F MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc47 MA O1 HSX . F HSX 401 1_555 PA MG MG . F MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc48 OA MG MG . F MG 403 1_555 ZB O HOH . F HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.868 ? metalc ? metalc49 G OD2 ASP 171 G ASP 171 1_555 UA MG MG . G MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc50 QA O2 HSX . G HSX 401 1_555 UA MG MG . G MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc51 QA O1 HSX . G HSX 401 1_555 UA MG MG . G MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc52 SA O1A ADP . G ADP 403 1_555 TA MG MG . G MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc53 SA O3A ADP . G ADP 403 1_555 TA MG MG . G MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc54 TA MG MG . G MG 404 1_555 AC O HOH . G HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc55 TA MG MG . G MG 404 1_555 AC O HOH . G HOH 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc56 TA MG MG . G MG 404 1_555 AC O HOH . G HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.868 ? metalc ? metalc57 VA O2A ADP . G ADP 406 1_555 YA MG MG . H MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc58 VA O3A ADP . G ADP 406 1_555 YA MG MG . H MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc59 AC O HOH . G HOH 505 1_555 YA MG MG . H MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc60 AC O HOH . G HOH 507 1_555 YA MG MG . H MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc61 H OD2 ASP 171 H ASP 171 1_555 ZA MG MG . H MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc62 WA O2 HSX . H HSX 401 1_555 ZA MG MG . H MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc63 WA O1 HSX . H HSX 401 1_555 ZA MG MG . H MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc64 YA MG MG . H MG 403 1_555 BC O HOH . H HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc65 I OD2 ASP 171 I ASP 171 1_555 EB MG MG . I MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc66 AB O2 HSX . I HSX 401 1_555 EB MG MG . I MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc67 AB O1 HSX . I HSX 401 1_555 EB MG MG . I MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc68 CB O1A ADP . I ADP 403 1_555 DB MG MG . I MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc69 CB O3A ADP . I ADP 403 1_555 DB MG MG . I MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc70 DB MG MG . I MG 404 1_555 CC O HOH . I HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc71 DB MG MG . I MG 404 1_555 CC O HOH . I HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc72 DB MG MG . I MG 404 1_555 CC O HOH . I HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc73 J OD2 ASP 171 J ASP 171 1_555 JB MG MG . J MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc74 FB O2 HSX . J HSX 401 1_555 JB MG MG . J MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc75 FB O1 HSX . J HSX 401 1_555 JB MG MG . J MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc76 HB O2A ADP . J ADP 403 1_555 IB MG MG . J MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc77 HB O3A ADP . J ADP 403 1_555 IB MG MG . J MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc78 IB MG MG . J MG 404 1_555 DC O HOH . J HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc79 IB MG MG . J MG 404 1_555 DC O HOH . J HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc80 IB MG MG . J MG 404 1_555 DC O HOH . J HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc81 K OD2 ASP 171 K ASP 171 1_555 OB MG MG . K MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc82 KB O2 HSX . K HSX 401 1_555 OB MG MG . K MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc83 KB O1 HSX . K HSX 401 1_555 OB MG MG . K MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc84 MB O1A ADP . K ADP 403 1_555 NB MG MG . K MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc85 MB O3A ADP . K ADP 403 1_555 NB MG MG . K MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc86 NB MG MG . K MG 404 1_555 EC O HOH . K HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc87 NB MG MG . K MG 404 1_555 EC O HOH . K HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc88 NB MG MG . K MG 404 1_555 EC O HOH . K HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc89 PB O2A ADP . K ADP 406 1_555 SB MG MG . L MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc90 PB O3A ADP . K ADP 406 1_555 SB MG MG . L MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc91 EC O HOH . K HOH 505 1_555 SB MG MG . L MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc92 EC O HOH . K HOH 508 1_555 SB MG MG . L MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc93 L OD2 ASP 171 L ASP 171 1_555 TB MG MG . L MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc94 QB O2 HSX . L HSX 401 1_555 TB MG MG . L MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc95 QB O1 HSX . L HSX 401 1_555 TB MG MG . L MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc96 SB MG MG . L MG 403 1_555 FC O HOH . L HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O10 P2' _chem_comp.formula_weight 427.201 _chem_comp.id ADP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B ADP doub 1 n n PB O2B ADP sing 2 n n PB O3B ADP sing 3 n n PB O3A ADP sing 4 n n O2B HOB2 ADP sing 5 n n O3B HOB3 ADP sing 6 n n PA O1A ADP doub 7 n n PA O2A ADP sing 8 n n PA O3A ADP sing 9 n n PA O5' ADP sing 10 n n O2A HOA2 ADP sing 11 n n O5' C5' ADP sing 12 n n C5' C4' ADP sing 13 n n C5' "H5'1" ADP sing 14 n n C5' "H5'2" ADP sing 15 n n C4' O4' ADP sing 16 n n C4' C3' ADP sing 17 n n C4' H4' ADP sing 18 n n O4' C1' ADP sing 19 n n C3' O3' ADP sing 20 n n C3' C2' ADP sing 21 n n C3' H3' ADP sing 22 n n O3' HO3' ADP sing 23 n n C2' O2' ADP sing 24 n n C2' C1' ADP sing 25 n n C2' H2' ADP sing 26 n n O2' HO2' ADP sing 27 n n C1' N9 ADP sing 28 n n C1' H1' ADP sing 29 n n N9 C8 ADP sing 30 n y N9 C4 ADP sing 31 n y C8 N7 ADP doub 32 n y C8 H8 ADP sing 33 n n N7 C5 ADP sing 34 n y C5 C6 ADP sing 35 n y C5 C4 ADP doub 36 n y C6 N6 ADP sing 37 n n C6 N1 ADP doub 38 n y N6 HN61 ADP sing 39 n n N6 HN62 ADP sing 40 n n N1 C2 ADP sing 41 n y C2 N3 ADP doub 42 n y C2 H2 ADP sing 43 n n N3 C4 ADP sing 44 n y # _atom_sites.entry_id 8DBF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 2 HSX A 1 401 401 HSX HSX . N 3 ADP A 1 402 402 ADP ADP . O 3 ADP A 1 403 403 ADP ADP . P 4 MG A 1 404 421 MG MG . Q 4 MG A 1 405 422 MG MG . R 3 ADP A 1 406 403 ADP ADP . S 2 HSX B 1 401 401 HSX HSX . T 3 ADP B 1 402 402 ADP ADP . U 4 MG B 1 403 421 MG MG . V 4 MG B 1 404 422 MG MG . W 2 HSX C 1 401 401 HSX HSX . X 3 ADP C 1 402 402 ADP ADP . Y 3 ADP C 1 403 403 ADP ADP . Z 4 MG C 1 404 421 MG MG . AA 4 MG C 1 405 422 MG MG . BA 2 HSX D 1 401 401 HSX HSX . CA 3 ADP D 1 402 402 ADP ADP . DA 3 ADP D 1 403 403 ADP ADP . EA 4 MG D 1 404 421 MG MG . FA 4 MG D 1 405 422 MG MG . GA 2 HSX E 1 401 401 HSX HSX . HA 3 ADP E 1 402 402 ADP ADP . IA 3 ADP E 1 403 403 ADP ADP . JA 4 MG E 1 404 421 MG MG . KA 4 MG E 1 405 422 MG MG . LA 3 ADP E 1 406 403 ADP ADP . MA 2 HSX F 1 401 401 HSX HSX . NA 3 ADP F 1 402 402 ADP ADP . OA 4 MG F 1 403 421 MG MG . PA 4 MG F 1 404 422 MG MG . QA 2 HSX G 1 401 401 HSX HSX . RA 3 ADP G 1 402 402 ADP ADP . SA 3 ADP G 1 403 403 ADP ADP . TA 4 MG G 1 404 421 MG MG . UA 4 MG G 1 405 422 MG MG . VA 3 ADP G 1 406 403 ADP ADP . WA 2 HSX H 1 401 401 HSX HSX . XA 3 ADP H 1 402 402 ADP ADP . YA 4 MG H 1 403 421 MG MG . ZA 4 MG H 1 404 422 MG MG . AB 2 HSX I 1 401 401 HSX HSX . BB 3 ADP I 1 402 402 ADP ADP . CB 3 ADP I 1 403 403 ADP ADP . DB 4 MG I 1 404 421 MG MG . EB 4 MG I 1 405 422 MG MG . FB 2 HSX J 1 401 401 HSX HSX . GB 3 ADP J 1 402 402 ADP ADP . HB 3 ADP J 1 403 403 ADP ADP . IB 4 MG J 1 404 421 MG MG . JB 4 MG J 1 405 422 MG MG . KB 2 HSX K 1 401 401 HSX HSX . LB 3 ADP K 1 402 402 ADP ADP . MB 3 ADP K 1 403 403 ADP ADP . NB 4 MG K 1 404 421 MG MG . OB 4 MG K 1 405 422 MG MG . PB 3 ADP K 1 406 403 ADP ADP . QB 2 HSX L 1 401 401 HSX HSX . RB 3 ADP L 1 402 402 ADP ADP . SB 4 MG L 1 403 421 MG MG . TB 4 MG L 1 404 422 MG MG . UB 5 HOH A 1 501 435 HOH HOH . UB 5 HOH A 2 502 434 HOH HOH . UB 5 HOH A 3 503 436 HOH HOH . UB 5 HOH A 4 504 437 HOH HOH . UB 5 HOH A 5 505 433 HOH HOH . UB 5 HOH A 6 506 433 HOH HOH . UB 5 HOH A 7 507 431 HOH HOH . UB 5 HOH A 8 508 431 HOH HOH . UB 5 HOH A 9 509 432 HOH HOH . VB 5 HOH B 1 501 435 HOH HOH . VB 5 HOH B 2 502 434 HOH HOH . VB 5 HOH B 3 503 436 HOH HOH . VB 5 HOH B 4 504 437 HOH HOH . VB 5 HOH B 5 505 432 HOH HOH . WB 5 HOH C 1 501 435 HOH HOH . WB 5 HOH C 2 502 434 HOH HOH . WB 5 HOH C 3 503 436 HOH HOH . WB 5 HOH C 4 504 437 HOH HOH . WB 5 HOH C 5 505 433 HOH HOH . WB 5 HOH C 6 506 431 HOH HOH . WB 5 HOH C 7 507 432 HOH HOH . XB 5 HOH D 1 501 435 HOH HOH . XB 5 HOH D 2 502 434 HOH HOH . XB 5 HOH D 3 503 436 HOH HOH . XB 5 HOH D 4 504 437 HOH HOH . XB 5 HOH D 5 505 433 HOH HOH . XB 5 HOH D 6 506 431 HOH HOH . XB 5 HOH D 7 507 432 HOH HOH . YB 5 HOH E 1 501 435 HOH HOH . YB 5 HOH E 2 502 434 HOH HOH . YB 5 HOH E 3 503 436 HOH HOH . YB 5 HOH E 4 504 437 HOH HOH . YB 5 HOH E 5 505 433 HOH HOH . YB 5 HOH E 6 506 433 HOH HOH . YB 5 HOH E 7 507 431 HOH HOH . YB 5 HOH E 8 508 431 HOH HOH . YB 5 HOH E 9 509 432 HOH HOH . ZB 5 HOH F 1 501 435 HOH HOH . ZB 5 HOH F 2 502 434 HOH HOH . ZB 5 HOH F 3 503 436 HOH HOH . ZB 5 HOH F 4 504 437 HOH HOH . ZB 5 HOH F 5 505 432 HOH HOH . AC 5 HOH G 1 501 435 HOH HOH . AC 5 HOH G 2 502 434 HOH HOH . AC 5 HOH G 3 503 436 HOH HOH . AC 5 HOH G 4 504 437 HOH HOH . AC 5 HOH G 5 505 433 HOH HOH . AC 5 HOH G 6 506 433 HOH HOH . AC 5 HOH G 7 507 431 HOH HOH . AC 5 HOH G 8 508 431 HOH HOH . AC 5 HOH G 9 509 432 HOH HOH . BC 5 HOH H 1 501 435 HOH HOH . BC 5 HOH H 2 502 434 HOH HOH . BC 5 HOH H 3 503 436 HOH HOH . BC 5 HOH H 4 504 437 HOH HOH . BC 5 HOH H 5 505 432 HOH HOH . CC 5 HOH I 1 501 435 HOH HOH . CC 5 HOH I 2 502 434 HOH HOH . CC 5 HOH I 3 503 436 HOH HOH . CC 5 HOH I 4 504 437 HOH HOH . CC 5 HOH I 5 505 433 HOH HOH . CC 5 HOH I 6 506 431 HOH HOH . CC 5 HOH I 7 507 432 HOH HOH . DC 5 HOH J 1 501 435 HOH HOH . DC 5 HOH J 2 502 434 HOH HOH . DC 5 HOH J 3 503 436 HOH HOH . DC 5 HOH J 4 504 437 HOH HOH . DC 5 HOH J 5 505 433 HOH HOH . DC 5 HOH J 6 506 431 HOH HOH . DC 5 HOH J 7 507 432 HOH HOH . EC 5 HOH K 1 501 435 HOH HOH . EC 5 HOH K 2 502 434 HOH HOH . EC 5 HOH K 3 503 436 HOH HOH . EC 5 HOH K 4 504 437 HOH HOH . EC 5 HOH K 5 505 433 HOH HOH . EC 5 HOH K 6 506 433 HOH HOH . EC 5 HOH K 7 507 431 HOH HOH . EC 5 HOH K 8 508 431 HOH HOH . EC 5 HOH K 9 509 432 HOH HOH . FC 5 HOH L 1 501 435 HOH HOH . FC 5 HOH L 2 502 434 HOH HOH . FC 5 HOH L 3 503 436 HOH HOH . FC 5 HOH L 4 504 437 HOH HOH . FC 5 HOH L 5 505 432 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB ADP . . . R 3 163.848 122.169 160.913 1 32.16 ? PB ADP 406 A 1 HETATM 2 O O1B ADP . . . R 3 162.633 121.964 160.007 1 34.57 ? O1B ADP 406 A 1 HETATM 3 O O2B ADP . . . R 3 165.129 121.706 160.312 1 41.65 ? O2B ADP 406 A 1 HETATM 4 O O3B ADP . . . R 3 163.876 123.623 161.37 1 27.76 ? O3B ADP 406 A 1 HETATM 5 P PA ADP . . . R 3 163.018 119.853 162.5 1 27.65 ? PA ADP 406 A 1 HETATM 6 O O1A ADP . . . R 3 164.161 118.945 162.68 1 20.86 ? O1A ADP 406 A 1 HETATM 7 O O2A ADP . . . R 3 162.057 119.911 163.685 1 35.08 ? O2A ADP 406 A 1 HETATM 8 O O3A ADP . . . R 3 163.508 121.344 162.234 1 25.71 ? O3A ADP 406 A 1 HETATM 9 O O5' ADP . . . R 3 162.144 119.472 161.229 1 27.29 ? O5' ADP 406 A 1 HETATM 10 C C5' ADP . . . R 3 160.745 119.749 161.009 1 23.62 ? C5' ADP 406 A 1 HETATM 11 C C4' ADP . . . R 3 160.263 118.949 159.826 1 18.49 ? C4' ADP 406 A 1 HETATM 12 O O4' ADP . . . R 3 160.199 117.551 160.183 1 25.55 ? O4' ADP 406 A 1 HETATM 13 C C3' ADP . . . R 3 158.866 119.297 159.329 1 24.66 ? C3' ADP 406 A 1 HETATM 14 O O3' ADP . . . R 3 158.907 120.37 158.396 1 35.65 ? O3' ADP 406 A 1 HETATM 15 C C2' ADP . . . R 3 158.426 117.991 158.667 1 28.24 ? C2' ADP 406 A 1 HETATM 16 O O2' ADP . . . R 3 158.963 117.859 157.356 1 35.51 ? O2' ADP 406 A 1 HETATM 17 C C1' ADP . . . R 3 159.053 116.952 159.602 1 27.64 ? C1' ADP 406 A 1 HETATM 18 N N9 ADP . . . R 3 158.173 116.506 160.676 1 22.31 ? N9 ADP 406 A 1 HETATM 19 C C8 ADP . . . R 3 157.09 117.171 161.19 1 20.69 ? C8 ADP 406 A 1 HETATM 20 N N7 ADP . . . R 3 156.466 116.521 162.142 1 18.83 ? N7 ADP 406 A 1 HETATM 21 C C5 ADP . . . R 3 157.191 115.344 162.266 1 16.84 ? C5 ADP 406 A 1 HETATM 22 C C6 ADP . . . R 3 157.045 114.223 163.105 1 17.3 ? C6 ADP 406 A 1 HETATM 23 N N6 ADP . . . R 3 156.073 114.095 164.013 1 15.64 ? N6 ADP 406 A 1 HETATM 24 N N1 ADP . . . R 3 157.94 113.222 162.973 1 20.58 ? N1 ADP 406 A 1 HETATM 25 C C2 ADP . . . R 3 158.91 113.341 162.063 1 21.17 ? C2 ADP 406 A 1 HETATM 26 N N3 ADP . . . R 3 159.146 114.346 161.218 1 19.9 ? N3 ADP 406 A 1 HETATM 27 C C4 ADP . . . R 3 158.245 115.323 161.37 1 20.57 ? C4 ADP 406 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 43 _model_server_stats.query_time_ms 309 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 27 #