data_8DNP
#
_model_server_result.job_id            8fcSWitiASNbt-wGiifugQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-15 13:15:03' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8dnp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"AA","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    8DNP 
#
_exptl.entry_id    8DNP 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              55.845 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'FE (III) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    24 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    24-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      24 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 Y N N 
? 2 Z N N 
? 2 AA N N 
? 2 BA N N 
? 2 CA N N 
? 2 DA N N 
? 2 EA N N 
? 2 FA N N 
? 2 GA N N 
? 2 HA N N 
? 2 IA N N 
? 2 JA N N 
? 2 KA N N 
? 2 LA N N 
? 2 MA N N 
? 2 NA N N 
? 2 OA N N 
? 2 PA N N 
? 2 QA N N 
? 2 RA N N 
? 2 SA N N 
? 2 TA N N 
? 2 UA N N 
? 2 VA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE1 GLU 28 A GLU 28 1_555 Y FE FE . A FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.768 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 63 A GLU 63 1_555 Y FE FE . A FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? 
metalc ? metalc3 A ND1 HIS 66 A HIS 66 1_555 Y FE FE . A FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? 
metalc ? metalc4 B OE1 GLU 28 B GLU 28 1_555 Z FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.789 ? 
metalc ? metalc5 B OE1 GLU 63 B GLU 63 1_555 Z FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc6 B ND1 HIS 66 B HIS 66 1_555 Z FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc7 C OE1 GLU 28 C GLU 28 1_555 AA FE FE . C FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? 
metalc ? metalc8 C OE1 GLU 63 C GLU 63 1_555 AA FE FE . C FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? 
metalc ? metalc9 C ND1 HIS 66 C HIS 66 1_555 AA FE FE . C FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc10 D OE1 GLU 28 D GLU 28 1_555 BA FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? 
metalc ? metalc11 D OE1 GLU 63 D GLU 63 1_555 BA FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc12 D ND1 HIS 66 D HIS 66 1_555 BA FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc13 E OE1 GLU 28 E GLU 28 1_555 CA FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc14 E OE1 GLU 63 E GLU 63 1_555 CA FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? 
metalc ? metalc15 E ND1 HIS 66 E HIS 66 1_555 CA FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc16 F OE1 GLU 28 F GLU 28 1_555 DA FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? 
metalc ? metalc17 F OE1 GLU 63 F GLU 63 1_555 DA FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? 
metalc ? metalc18 F ND1 HIS 66 F HIS 66 1_555 DA FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc19 G OE1 GLU 28 G GLU 28 1_555 EA FE FE . G FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc20 G OE1 GLU 63 G GLU 63 1_555 EA FE FE . G FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc21 G ND1 HIS 66 G HIS 66 1_555 EA FE FE . G FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc22 H OE1 GLU 28 H GLU 28 1_555 FA FE FE . H FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? 
metalc ? metalc23 H OE1 GLU 63 H GLU 63 1_555 FA FE FE . H FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? 
metalc ? metalc24 H ND1 HIS 66 H HIS 66 1_555 FA FE FE . H FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc25 I OE1 GLU 28 I GLU 28 1_555 GA FE FE . I FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc26 I OE1 GLU 63 I GLU 63 1_555 GA FE FE . I FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc27 I ND1 HIS 66 I HIS 66 1_555 GA FE FE . I FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? 
metalc ? metalc28 J OE1 GLU 28 J GLU 28 1_555 HA FE FE . J FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? 
metalc ? metalc29 J OE1 GLU 63 J GLU 63 1_555 HA FE FE . J FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc30 J ND1 HIS 66 J HIS 66 1_555 HA FE FE . J FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc31 K OE1 GLU 28 K GLU 28 1_555 IA FE FE . K FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? 
metalc ? metalc32 K OE1 GLU 63 K GLU 63 1_555 IA FE FE . K FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc33 K ND1 HIS 66 K HIS 66 1_555 IA FE FE . K FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? 
metalc ? metalc34 L OE1 GLU 28 L GLU 28 1_555 JA FE FE . L FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? 
metalc ? metalc35 L OE1 GLU 63 L GLU 63 1_555 JA FE FE . L FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? 
metalc ? metalc36 L ND1 HIS 66 L HIS 66 1_555 JA FE FE . L FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc37 M OE1 GLU 28 M GLU 28 1_555 KA FE FE . M FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc38 M OE1 GLU 63 M GLU 63 1_555 KA FE FE . M FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc39 M ND1 HIS 66 M HIS 66 1_555 KA FE FE . M FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc40 N OE1 GLU 28 N GLU 28 1_555 LA FE FE . N FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? 
metalc ? metalc41 N OE1 GLU 63 N GLU 63 1_555 LA FE FE . N FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? 
metalc ? metalc42 N ND1 HIS 66 N HIS 66 1_555 LA FE FE . N FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc43 O OE1 GLU 28 O GLU 28 1_555 MA FE FE . O FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
metalc ? metalc44 O OE1 GLU 63 O GLU 63 1_555 MA FE FE . O FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc45 O ND1 HIS 66 O HIS 66 1_555 MA FE FE . O FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc46 P OE1 GLU 28 P GLU 28 1_555 NA FE FE . P FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? 
metalc ? metalc47 P OE1 GLU 63 P GLU 63 1_555 NA FE FE . P FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc48 P ND1 HIS 66 P HIS 66 1_555 NA FE FE . P FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc49 Q OE1 GLU 28 Q GLU 28 1_555 OA FE FE . Q FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? 
metalc ? metalc50 Q OE1 GLU 63 Q GLU 63 1_555 OA FE FE . Q FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? 
metalc ? metalc51 Q ND1 HIS 66 Q HIS 66 1_555 OA FE FE . Q FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc52 R OE1 GLU 28 R GLU 28 1_555 PA FE FE . R FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? 
metalc ? metalc53 R OE1 GLU 63 R GLU 63 1_555 PA FE FE . R FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? 
metalc ? metalc54 R ND1 HIS 66 R HIS 66 1_555 PA FE FE . R FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc55 S OE1 GLU 28 S GLU 28 1_555 QA FE FE . S FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc56 S OE1 GLU 63 S GLU 63 1_555 QA FE FE . S FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc57 S ND1 HIS 66 S HIS 66 1_555 QA FE FE . S FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc58 T OE1 GLU 28 T GLU 28 1_555 RA FE FE . T FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? 
metalc ? metalc59 T OE1 GLU 63 T GLU 63 1_555 RA FE FE . T FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? 
metalc ? metalc60 T ND1 HIS 66 T HIS 66 1_555 RA FE FE . T FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc61 U OE1 GLU 28 U GLU 28 1_555 SA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
metalc ? metalc62 U OE1 GLU 63 U GLU 63 1_555 SA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? 
metalc ? metalc63 U ND1 HIS 66 U HIS 66 1_555 SA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc64 V OE1 GLU 28 V GLU 28 1_555 TA FE FE . V FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? 
metalc ? metalc65 V OE1 GLU 63 V GLU 63 1_555 TA FE FE . V FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc66 V ND1 HIS 66 V HIS 66 1_555 TA FE FE . V FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc67 W OE1 GLU 28 W GLU 28 1_555 UA FE FE . W FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc68 W OE1 GLU 63 W GLU 63 1_555 UA FE FE . W FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc69 W ND1 HIS 66 W HIS 66 1_555 UA FE FE . W FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc70 X OE1 GLU 28 X GLU 28 1_555 VA FE FE . X FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? 
metalc ? metalc71 X OE1 GLU 63 X GLU 63 1_555 VA FE FE . X FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? 
metalc ? metalc72 X ND1 HIS 66 X HIS 66 1_555 VA FE FE . X FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe 3' 
_chem_comp.formula_weight    55.845 
_chem_comp.id                FE 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'FE (III) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8DNP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Y 2 FE A 1 201 1 FE FE . 
Z 2 FE B 1 201 6 FE FE . 
AA 2 FE C 1 201 9 FE FE . 
BA 2 FE D 1 201 12 FE FE . 
CA 2 FE E 1 201 17 FE FE . 
DA 2 FE F 1 201 20 FE FE . 
EA 2 FE G 1 201 24 FE FE . 
FA 2 FE H 1 201 29 FE FE . 
GA 2 FE I 1 201 32 FE FE . 
HA 2 FE J 1 201 35 FE FE . 
IA 2 FE K 1 201 40 FE FE . 
JA 2 FE L 1 201 43 FE FE . 
KA 2 FE M 1 201 47 FE FE . 
LA 2 FE N 1 201 52 FE FE . 
MA 2 FE O 1 201 55 FE FE . 
NA 2 FE P 1 201 58 FE FE . 
OA 2 FE Q 1 201 63 FE FE . 
PA 2 FE R 1 201 66 FE FE . 
QA 2 FE S 1 201 70 FE FE . 
RA 2 FE T 1 201 75 FE FE . 
SA 2 FE U 1 201 78 FE FE . 
TA 2 FE V 1 201 81 FE FE . 
UA 2 FE W 1 201 86 FE FE . 
VA 2 FE X 1 201 89 FE FE . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           FE 
_atom_site.label_atom_id         FE 
_atom_site.label_comp_id         FE 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         AA 
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