data_8DR0 # _model_server_result.job_id ZJ6P2GUqCZKAwDbXByh7kQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 08:34:24' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8dr0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":401}' # _entry.id 8DR0 # _exptl.entry_id 8DR0 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 10 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8DR0 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8DR0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 10 L N N ? 10 M N N ? 10 O N N ? 10 Q N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG1 THR 360 A THR 360 1_555 L MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc2 K O2G AGS . A AGS 901 1_555 L MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc3 K O1B AGS . A AGS 901 1_555 L MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc4 B OG1 THR 56 B THR 56 1_555 M MG MG . B MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc5 M MG MG . B MG 401 1_555 N O2G AGS . B AGS 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? metalc ? metalc6 M MG MG . B MG 401 1_555 N O2B AGS . B AGS 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc7 C OG1 THR 60 C THR 60 1_555 O MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc8 O MG MG . C MG 401 1_555 P O2G AGS . C AGS 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc9 O MG MG . C MG 401 1_555 P O2B AGS . C AGS 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc10 D OG1 THR 72 D THR 72 1_555 Q MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc11 Q MG MG . D MG 401 1_555 R O2G AGS . D AGS 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc12 Q MG MG . D MG 401 1_555 R O2B AGS . D AGS 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog1 I N3 DC 7 I DC 1 1_555 J N2 DG 16 J DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 I N1 DG 8 I DG 2 1_555 J N3 DC 15 J DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 I N2 DG 8 I DG 2 1_555 J O2 DC 15 J DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 I O6 DG 8 I DG 2 1_555 J N4 DC 15 J DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 I N1 DG 9 I DG 3 1_555 J N3 DC 14 J DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 I N2 DG 9 I DG 3 1_555 J O2 DC 14 J DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 I O6 DG 9 I DG 3 1_555 J N4 DC 14 J DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 I N1 DG 10 I DG 4 1_555 J N3 DC 13 J DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 I N2 DG 10 I DG 4 1_555 J O2 DC 13 J DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 I O6 DG 10 I DG 4 1_555 J N4 DC 13 J DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 I N1 DG 11 I DG 5 1_555 J N3 DC 12 J DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 I N2 DG 11 I DG 5 1_555 J O2 DC 12 J DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 I O6 DG 11 I DG 5 1_555 J N4 DC 12 J DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 I N1 DG 12 I DG 6 1_555 J N3 DC 11 J DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 I N2 DG 12 I DG 6 1_555 J O2 DC 11 J DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 I O6 DG 12 I DG 6 1_555 J N4 DC 11 J DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 I N1 DG 13 I DG 7 1_555 J N3 DC 10 J DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 I N2 DG 13 I DG 7 1_555 J O2 DC 10 J DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 I O6 DG 13 I DG 7 1_555 J N4 DC 10 J DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 I N1 DG 14 I DG 8 1_555 J N3 DC 9 J DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 I N2 DG 14 I DG 8 1_555 J O2 DC 9 J DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 I O6 DG 14 I DG 8 1_555 J N4 DC 9 J DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog23 I N3 DC 15 I DC 9 1_555 J N2 DG 8 J DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog24 I N3 DC 16 I DC 10 1_555 J N2 DG 7 J DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 I N3 DC 17 I DC 11 1_555 J N1 DG 6 J DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 I N4 DC 17 I DC 11 1_555 J O6 DG 6 J DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 I O2 DC 17 I DC 11 1_555 J N2 DG 6 J DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 I N3 DC 18 I DC 12 1_555 J N1 DG 5 J DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 I N4 DC 18 I DC 12 1_555 J O6 DG 5 J DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 I O2 DC 18 I DC 12 1_555 J N2 DG 5 J DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 I N1 DG 19 I DG 13 1_555 J N3 DC 4 J DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 I N2 DG 19 I DG 13 1_555 J O2 DC 4 J DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 I O6 DG 19 I DG 13 1_555 J N4 DC 4 J DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 I N1 DG 20 I DG 14 1_555 J N3 DC 3 J DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 I N2 DG 20 I DG 14 1_555 J O2 DC 3 J DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 I O6 DG 20 I DG 14 1_555 J N4 DC 3 J DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 I N1 DG 21 I DG 15 1_555 J N3 DC 2 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 I N2 DG 21 I DG 15 1_555 J O2 DC 2 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 I O6 DG 21 I DG 15 1_555 J N4 DC 2 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 I N1 DG 22 I DG 16 1_555 J N3 DC 1 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 I N2 DG 22 I DG 16 1_555 J O2 DC 1 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 I O6 DG 22 I DG 16 1_555 J N4 DC 1 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8DR0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code K 9 AGS A 1 901 801 AGS AGS . L 10 MG A 1 902 802 MG MG . M 10 MG B 1 401 828 MG MG . N 9 AGS B 1 402 829 AGS AGS . O 10 MG C 1 401 803 MG MG . P 9 AGS C 1 402 804 AGS AGS . Q 10 MG D 1 401 797 MG MG . R 9 AGS D 1 402 798 AGS AGS . S 11 GDP E 1 401 401 GDP GDP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id M _atom_site.label_entity_id 10 _atom_site.Cartn_x 143.693 _atom_site.Cartn_y 177.881 _atom_site.Cartn_z 177.924 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 25.59 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 401 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 21 _model_server_stats.parse_time_ms 23 _model_server_stats.create_model_time_ms 45 _model_server_stats.query_time_ms 277 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #