data_8EAQ # _model_server_result.job_id PsN_0rusfRjbCgFS3wN97w _model_server_result.datetime_utc '2025-02-28 18:48:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8eaq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"FA","auth_seq_id":5101}' # _entry.id 8EAQ # _exptl.entry_id 8EAQ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 S N N ? 2 FA N N ? 2 SA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 2528 A CYS 2528 1_555 A SG CYS 2534 A CYS 2534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 2528 B CYS 2528 1_555 B SG CYS 2534 B CYS 2534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 2528 C CYS 2528 1_555 C SG CYS 2534 C CYS 2534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 2528 D CYS 2528 1_555 D SG CYS 2534 D CYS 2534 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 180 A ASP 180 1_555 K CA CA . A CA 5107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.199 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 2042 A GLU 2042 1_555 J CA CA . A CA 5106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.106 ? metalc ? metalc3 A OG SER 2545 A SER 2545 1_555 G CA CA . A CA 5103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.156 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 2551 A ASP 2551 1_555 F CA CA . A CA 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.062 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 2611 A CYS 2611 1_555 E ZN ZN . A ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 2614 A CYS 2614 1_555 E ZN ZN . A ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc7 A NE2 HIS 2631 A HIS 2631 1_555 E ZN ZN . A ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc8 A ND1 HIS 2636 A HIS 2636 1_555 E ZN ZN . A ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc9 A O THR 2654 A THR 2654 1_555 J CA CA . A CA 5106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.136 ? metalc ? metalc10 F CA CA . A CA 5102 1_555 C OG SER 2545 C SER 2545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? metalc ? metalc11 G CA CA . A CA 5103 1_555 B OD1 ASP 2551 B ASP 2551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.153 ? metalc ? metalc12 B OD1 ASP 180 B ASP 180 1_555 X CA CA . B CA 5106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.188 ? metalc ? metalc13 B OE2 GLU 2042 B GLU 2042 1_555 W CA CA . B CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.102 ? metalc ? metalc14 B OG SER 2545 B SER 2545 1_555 T CA CA . B CA 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 2611 B CYS 2611 1_555 S ZN ZN . B ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 2614 B CYS 2614 1_555 S ZN ZN . B ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc17 B NE2 HIS 2631 B HIS 2631 1_555 S ZN ZN . B ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc18 B ND1 HIS 2636 B HIS 2636 1_555 S ZN ZN . B ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc19 B O THR 2654 B THR 2654 1_555 W CA CA . B CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.159 ? metalc ? metalc20 T CA CA . B CA 5102 1_555 D OD1 ASP 2551 D ASP 2551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.155 ? metalc ? metalc21 C OD1 ASP 180 C ASP 180 1_555 KA CA CA . C CA 5106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.188 ? metalc ? metalc22 C OE2 GLU 2042 C GLU 2042 1_555 JA CA CA . C CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.103 ? metalc ? metalc23 C OD1 ASP 2551 C ASP 2551 1_555 GA CA CA . C CA 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.156 ? metalc ? metalc24 C SG CYS 2611 C CYS 2611 1_555 FA ZN ZN . C ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc25 C SG CYS 2614 C CYS 2614 1_555 FA ZN ZN . C ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc26 C NE2 HIS 2631 C HIS 2631 1_555 FA ZN ZN . C ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc27 C ND1 HIS 2636 C HIS 2636 1_555 FA ZN ZN . C ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc28 C O THR 2654 C THR 2654 1_555 JA CA CA . C CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.158 ? metalc ? metalc29 GA CA CA . C CA 5102 1_555 D OG SER 2545 D SER 2545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.069 ? metalc ? metalc30 D OD1 ASP 180 D ASP 180 1_555 WA CA CA . D CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.191 ? metalc ? metalc31 D OE2 GLU 2042 D GLU 2042 1_555 VA CA CA . D CA 5104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.099 ? metalc ? metalc32 D SG CYS 2611 D CYS 2611 1_555 SA ZN ZN . D ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc33 D SG CYS 2614 D CYS 2614 1_555 SA ZN ZN . D ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc34 D NE2 HIS 2631 D HIS 2631 1_555 SA ZN ZN . D ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc35 D ND1 HIS 2636 D HIS 2636 1_555 SA ZN ZN . D ZN 5101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc36 D O THR 2654 D THR 2654 1_555 VA CA CA . D CA 5104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.161 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8EAQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 ZN A 1 5101 5101 ZN ZN . F 3 CA A 1 5102 11 CA CA . G 3 CA A 1 5103 12 CA CA . H 3 CA A 1 5104 18 CA CA . I 3 CA A 1 5105 41 CA CA . J 3 CA A 1 5106 53 CA CA . K 3 CA A 1 5107 60 CA CA . L 4 PLX A 1 5108 2806 PLX PLX . M 4 PLX A 1 5109 2805 PLX PLX . N 4 PLX A 1 5110 2807 PLX PLX . O 4 PLX A 1 5111 5102 PLX PLX . P 4 PLX A 1 5112 5103 PLX PLX . Q 4 PLX A 1 5113 5104 PLX PLX . R 4 PLX A 1 5114 5105 PLX PLX . S 2 ZN B 1 5101 5101 ZN ZN . T 3 CA B 1 5102 9 CA CA . U 3 CA B 1 5103 17 CA CA . V 3 CA B 1 5104 42 CA CA . W 3 CA B 1 5105 54 CA CA . X 3 CA B 1 5106 57 CA CA . Y 4 PLX B 1 5107 2805 PLX PLX . Z 4 PLX B 1 5108 2807 PLX PLX . AA 4 PLX B 1 5109 5102 PLX PLX . BA 4 PLX B 1 5110 5103 PLX PLX . CA 4 PLX B 1 5111 5104 PLX PLX . DA 4 PLX B 1 5112 5105 PLX PLX . EA 4 PLX B 1 5113 2806 PLX PLX . FA 2 ZN C 1 5101 5101 ZN ZN . GA 3 CA C 1 5102 10 CA CA . HA 3 CA C 1 5103 19 CA CA . IA 3 CA C 1 5104 43 CA CA . JA 3 CA C 1 5105 56 CA CA . KA 3 CA C 1 5106 59 CA CA . LA 4 PLX C 1 5107 2806 PLX PLX . MA 4 PLX C 1 5108 2805 PLX PLX . NA 4 PLX C 1 5109 2807 PLX PLX . OA 4 PLX C 1 5110 5102 PLX PLX . PA 4 PLX C 1 5111 5103 PLX PLX . QA 4 PLX C 1 5112 5104 PLX PLX . RA 4 PLX C 1 5113 5105 PLX PLX . SA 2 ZN D 1 5101 5101 ZN ZN . TA 3 CA D 1 5102 20 CA CA . UA 3 CA D 1 5103 44 CA CA . VA 3 CA D 1 5104 55 CA CA . WA 3 CA D 1 5105 58 CA CA . XA 4 PLX D 1 5106 2805 PLX PLX . YA 4 PLX D 1 5107 2807 PLX PLX . ZA 4 PLX D 1 5108 5102 PLX PLX . AB 4 PLX D 1 5109 5103 PLX PLX . BB 4 PLX D 1 5110 5104 PLX PLX . CB 4 PLX D 1 5111 5105 PLX PLX . DB 4 PLX D 1 5112 2806 PLX PLX . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id FA _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 160.489 _atom_site.Cartn_y 185.639 _atom_site.Cartn_z 200.828 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 53.38 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 5101 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 32 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 124 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #