data_8ESW
#
_model_server_result.job_id            VE4q1_SSC12TF7kLQyyHrQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 01:04:39' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8esw 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"UA","auth_seq_id":802}' 
#
_entry.id    8ESW 
#
_exptl.entry_id    8ESW 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          45 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8ESW 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8ESW 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    43-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      43 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 45 TA N N 
? 45 UA N N 
? 45 XA N N 
? 45 BB N N 
? 45 CB N N 
? 45 GC N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 L SG CYS 38 A8 CYS 38 1_555 L SG CYS 68 A8 CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf2 L SG CYS 48 A8 CYS 48 1_555 L SG CYS 58 A8 CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf3 L SG CYS 80 A8 CYS 80 1_555 L SG CYS 113 A8 CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf4 L SG CYS 90 A8 CYS 90 1_555 L SG CYS 103 A8 CYS 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf5 O SG CYS 27 S5 CYS 27 1_555 O SG CYS 60 S5 CYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
disulf ? disulf6 O SG CYS 37 S5 CYS 37 1_555 O SG CYS 50 S5 CYS 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf7 Q SG CYS 54 BL CYS 54 1_555 Q SG CYS 61 BL CYS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
disulf ? disulf8 Q SG CYS 90 BL CYS 90 1_555 Q SG CYS 102 BL CYS 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf9 T SG CYS 57 B7 CYS 57 1_555 T SG CYS 88 B7 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf10 T SG CYS 67 B7 CYS 67 1_555 T SG CYS 78 B7 CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf11 HA SG CYS 301 V1 CYS 301 1_555 HA SG CYS 319 V1 CYS 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
metalc ? metalc1 B SG CYS 87 S6 CYS 87 1_555 SA ZN ZN . S6 ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc2 B NE2 HIS 96 S6 HIS 96 1_555 SA ZN ZN . S6 ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 111 S6 CYS 111 1_555 SA ZN ZN . S6 ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 114 S6 CYS 114 1_555 SA ZN ZN . S6 ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc5 C SG CYS 74 S1 CYS 74 1_555 VA FE1 FES . S1 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc6 C SG CYS 85 S1 CYS 85 1_555 VA FE1 FES . S1 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc7 C SG CYS 88 S1 CYS 88 1_555 VA FE2 FES . S1 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc8 C SG CYS 102 S1 CYS 102 1_555 VA FE2 FES . S1 FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc9 C ND1 HIS 134 S1 HIS 134 1_555 TA FE3 SF4 . S1 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc10 C NE2 HIS 134 S1 HIS 134 1_555 TA FE3 SF4 . S1 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc11 C SG CYS 138 S1 CYS 138 1_555 TA FE2 SF4 . S1 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
metalc ? metalc12 C SG CYS 141 S1 CYS 141 1_555 TA FE4 SF4 . S1 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 147 S1 CYS 147 1_555 TA FE1 SF4 . S1 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 190 S1 CYS 190 1_555 UA FE2 SF4 . S1 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 193 S1 CYS 193 1_555 UA FE1 SF4 . S1 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 196 S1 CYS 196 1_555 UA FE3 SF4 . S1 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 240 S1 CYS 240 1_555 UA FE4 SF4 . S1 SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc18 E SG CYS 128 V2 CYS 128 1_555 WA FE1 FES . V2 FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc19 E SG CYS 133 V2 CYS 133 1_555 WA FE1 FES . V2 FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc20 E SG CYS 169 V2 CYS 169 1_555 WA FE2 FES . V2 FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc21 E SG CYS 173 V2 CYS 173 1_555 WA FE2 FES . V2 FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc22 F SG CYS 97 S7 CYS 97 1_555 XA FE1 SF4 . S7 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc23 F SG CYS 161 S7 CYS 161 1_555 XA FE2 SF4 . S7 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc24 G NE2 HIS 106 S8 HIS 106 1_555 BB FE2 SF4 . S8 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc25 G SG CYS 118 S8 CYS 118 1_555 CB FE3 SF4 . S8 SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc26 G SG CYS 121 S8 CYS 121 1_555 CB FE1 SF4 . S8 SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc27 G SG CYS 124 S8 CYS 124 1_555 CB FE4 SF4 . S8 SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc28 G SG CYS 128 S8 CYS 128 1_555 BB FE4 SF4 . S8 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc29 G SG CYS 157 S8 CYS 157 1_555 BB FE2 SF4 . S8 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc30 G SG CYS 160 S8 CYS 160 1_555 BB FE1 SF4 . S8 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc31 G SG CYS 163 S8 CYS 163 1_555 BB FE3 SF4 . S8 SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc32 G SG CYS 167 S8 CYS 167 1_555 CB FE2 SF4 . S8 SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc33 HA SG CYS 394 V1 CYS 394 1_555 GC FE4 SF4 . V1 SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc34 HA SG CYS 397 V1 CYS 397 1_555 GC FE1 SF4 . V1 SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? 
metalc ? metalc35 HA SG CYS 397 V1 CYS 397 1_555 GC FE2 SF4 . V1 SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? 
metalc ? metalc36 HA SG CYS 400 V1 CYS 400 1_555 GC FE2 SF4 . V1 SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc37 HA SG CYS 440 V1 CYS 440 1_555 GC FE3 SF4 . V1 SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 1005 n n 
FE1 S3 SF4 sing 1006 n n 
FE1 S4 SF4 sing 1007 n n 
FE2 S1 SF4 sing 1008 n n 
FE2 S3 SF4 sing 1009 n n 
FE2 S4 SF4 sing 1010 n n 
FE3 S1 SF4 sing 1011 n n 
FE3 S2 SF4 sing 1012 n n 
FE3 S4 SF4 sing 1013 n n 
FE4 S1 SF4 sing 1014 n n 
FE4 S2 SF4 sing 1015 n n 
FE4 S3 SF4 sing 1016 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8ESW 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
RA 43 CDL AN 1 201 201 CDL CDL . 
SA 44 ZN S6 1 201 201 ZN ZN . 
TA 45 SF4 S1 1 801 801 SF4 SF4 . 
UA 45 SF4 S1 1 802 802 SF4 SF4 . 
VA 46 FES S1 1 803 803 FES FES . 
WA 46 FES V2 1 301 301 FES FES . 
XA 45 SF4 S7 1 301 301 SF4 SF4 . 
YA 43 CDL S7 1 302 302 CDL CDL . 
ZA 47 PC1 S7 1 303 403 PC1 PC1 . 
AB 47 PC1 S7 1 304 202 PC1 PC1 . 
BB 45 SF4 S8 1 301 301 SF4 SF4 . 
CB 45 SF4 S8 1 302 302 SF4 SF4 . 
DB 47 PC1 1 1 401 401 PC1 PC1 . 
EB 47 PC1 4 1 501 501 PC1 PC1 . 
FB 47 PC1 4 1 502 503 PC1 PC1 . 
GB 48 3PE 4 1 503 205 3PE 3PE . 
HB 48 3PE 4 1 504 403 3PE 3PE . 
IB 48 3PE 5 1 601 502 3PE 3PE . 
JB 48 3PE 5 1 602 606 3PE 3PE . 
KB 48 3PE 5 1 603 607 3PE 3PE . 
LB 43 CDL 5 1 604 610 CDL CDL . 
MB 48 3PE 5 1 605 611 3PE 3PE . 
NB 48 3PE 5 1 606 612 3PE 3PE . 
OB 48 3PE 5 1 607 613 3PE 3PE . 
PB 43 CDL 5 1 608 614 CDL CDL . 
QB 48 3PE AM 1 201 201 3PE 3PE . 
RB 47 PC1 AM 1 202 202 PC1 PC1 . 
SB 48 3PE AM 1 203 203 3PE 3PE . 
TB 48 3PE AM 1 204 204 3PE 3PE . 
UB 47 PC1 AM 1 205 404 PC1 PC1 . 
VB 47 PC1 B6 1 201 202 PC1 PC1 . 
WB 48 3PE B6 1 202 203 3PE 3PE . 
XB 43 CDL B6 1 203 204 CDL CDL . 
YB 47 PC1 B4 1 201 405 PC1 PC1 . 
ZB 43 CDL B5 1 201 201 CDL CDL . 
AC 49 ZMP B9 1 201 201 ZMP ZMP . 
BC 47 PC1 C2 1 201 202 PC1 PC1 . 
CC 50 NDP A9 1 501 501 NDP NDP . 
DC 43 CDL A9 1 502 502 CDL CDL . 
EC 43 CDL A9 1 503 503 CDL CDL . 
FC 51 FMN V1 1 501 501 FMN FMN . 
GC 45 SF4 V1 1 502 502 SF4 SF4 . 
HC 48 3PE 2 1 401 206 3PE 3PE . 
IC 47 PC1 2 1 402 401 PC1 PC1 . 
JC 47 PC1 2 1 403 402 PC1 PC1 . 
KC 47 PC1 6 1 201 402 PC1 PC1 . 
LC 47 PC1 6 1 202 203 PC1 PC1 . 
MC 52 DGT AL 1 501 501 DGT DGT . 
NC 49 ZMP AB 1 201 201 ZMP ZMP . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . UA 45 224.149 196.507 319.428 1 7.72 ? FE1 SF4 802 S1 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . UA 45 224.795 198.524 321.142 1 7.72 ? FE2 SF4 802 S1 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . UA 45 226.435 196.382 320.869 1 7.72 ? FE3 SF4 802 S1 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . UA 45 226.187 198.204 318.845 1 7.72 ? FE4 SF4 802 S1 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . UA 45 227.08 198.588 320.929 1 7.72 ? S1 SF4 802 S1 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . UA 45 226.223 195.916 318.633 1 7.72 ? S2 SF4 802 S1 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . UA 45 223.961 198.757 319.011 1 7.72 ? S3 SF4 802 S1 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . UA 45 224.296 196.351 321.719 1 7.72 ? S4 SF4 802 S1 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              29 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    96 
_model_server_stats.query_time_ms           317 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           8 
#