data_8FMN # _model_server_result.job_id ilZ62gsU9k3XJTGb-y1MNA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-23 06:20:51' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8fmn # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":202}' # _entry.id 8FMN # _exptl.entry_id 8FMN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 101.72 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8FMN _cell.length_a 40.272 _cell.length_b 170.503 _cell.length_c 69.462 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8FMN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,H,I 1 1 D,E,F,J,K,L 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 G N N ? 4 H N N ? 4 I N N ? 4 J N N ? 4 K N N ? 4 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 68 A ASP 65 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.01 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 70 A ASP 67 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.065 ? metalc ? metalc3 A O THR 74 A THR 71 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 79 A GLU 76 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 79 A GLU 76 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.954 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 108 A ASP 105 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASN 110 A ASN 107 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 112 A ASP 109 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc9 A O TYR 114 A TYR 111 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc10 A OE1 GLU 119 A GLU 116 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc11 A OE2 GLU 119 A GLU 116 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 144 A ASP 141 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASN 146 A ASN 143 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 148 A ASP 145 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 148 A ASP 145 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc ? metalc16 A O ARG 150 A ARG 147 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 155 A GLU 152 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc18 A OE2 GLU 155 A GLU 152 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? metalc ? metalc19 D OD1 ASP 70 D ASP 67 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc20 D OD2 ASP 70 D ASP 67 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc21 D OG SER 72 D SER 69 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc22 D O THR 74 D THR 71 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc23 D OE1 GLU 79 D GLU 76 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc24 D OE2 GLU 79 D GLU 76 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc ? metalc25 D OD1 ASP 108 D ASP 105 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc26 D OD1 ASN 110 D ASN 107 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc ? metalc27 D OD1 ASP 112 D ASP 109 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc28 D O TYR 114 D TYR 111 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc29 D OE1 GLU 119 D GLU 116 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc30 D OE2 GLU 119 D GLU 116 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc31 D OD1 ASP 144 D ASP 141 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc32 D OD1 ASN 146 D ASN 143 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc33 D OD1 ASP 148 D ASP 145 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc34 D O ARG 150 D ARG 147 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc35 D OE1 GLU 155 D GLU 152 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc36 D OE2 GLU 155 D GLU 152 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8FMN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.024831 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005149 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005865 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014703 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 CA A 1 201 201 CA CA . H 4 CA A 1 202 202 CA CA . I 4 CA A 1 203 203 CA CA . J 4 CA D 1 201 201 CA CA . K 4 CA D 1 202 202 CA CA . L 4 CA D 1 203 203 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 8.22 _atom_site.Cartn_y -23.806 _atom_site.Cartn_z 9.87 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 35.96 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 202 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 394 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #