data_8FS8 # _model_server_result.job_id SinDINKOMdC-f-_YmYiENA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 11:44:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8fs8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":402}' # _entry.id 8FS8 # _exptl.entry_id 8FS8 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 13 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8FS8 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8FS8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details undecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 M N N ? 13 O N N ? 13 Q N N ? 13 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG SER 116 A SER 116 1_555 M MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 187 A GLU 187 1_555 M MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 187 A GLU 187 1_555 M MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc4 L O2B AGS . A AGS 501 1_555 M MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.94 ? metalc ? metalc5 B OG1 THR 56 B THR 56 1_555 O MG MG . B MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc6 N O2G AGS . B AGS 401 1_555 O MG MG . B MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc7 N O1B AGS . B AGS 401 1_555 O MG MG . B MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc8 C OG1 THR 60 C THR 60 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc9 P O2G AGS . C AGS 401 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc10 P O1B AGS . C AGS 401 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? metalc ? metalc11 P O3A AGS . C AGS 401 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? metalc ? metalc12 D OG1 THR 72 D THR 72 1_555 S MG MG . D MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc13 R O3G AGS . D AGS 401 1_555 S MG MG . D MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.965 ? metalc ? metalc14 R O2B AGS . D AGS 401 1_555 S MG MG . D MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 I N1 DG 11 I DG 11 1_555 K N3 DC 10 K DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 I N2 DG 11 I DG 11 1_555 K O2 DC 10 K DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 I O6 DG 11 I DG 11 1_555 K N4 DC 10 K DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog4 I N6 DA 12 I DA 12 1_555 K O4 DT 9 K DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog5 I O4 DT 13 I DT 13 1_555 K N6 DA 8 K DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog6 I N6 DA 14 I DA 14 1_555 K O4 DT 7 K DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 I N3 DC 15 I DC 15 1_555 K N1 DG 6 K DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 I N4 DC 15 I DC 15 1_555 K O6 DG 6 K DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 I O2 DC 15 I DC 15 1_555 K N2 DG 6 K DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 I N1 DG 16 I DG 16 1_555 K N3 DC 5 K DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 I N2 DG 16 I DG 16 1_555 K O2 DC 5 K DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 I O6 DG 16 I DG 16 1_555 K N4 DC 5 K DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 I N1 DA 17 I DA 17 1_555 K N3 DT 4 K DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 I N6 DA 17 I DA 17 1_555 K O4 DT 4 K DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 I N1 DA 18 I DA 18 1_555 K N3 DT 3 K DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 I N6 DA 18 I DA 18 1_555 K O4 DT 3 K DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 I N3 DT 19 I DT 19 1_555 K N1 DA 2 K DA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 I O4 DT 19 I DT 19 1_555 K N6 DA 2 K DA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 I N3 DC 20 I DC 20 1_555 K N1 DG 1 K DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 I N4 DC 20 I DC 20 1_555 K O6 DG 1 K DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 I O2 DC 20 I DC 20 1_555 K N2 DG 1 K DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 I N3 DC 32 I DC 27 1_555 J N1 DG 19 J DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 I N4 DC 32 I DC 27 1_555 J O6 DG 19 J DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 I O2 DC 32 I DC 27 1_555 J N2 DG 19 J DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 I N1 DG 33 I DG 28 1_555 J N3 DC 18 J DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 I N2 DG 33 I DG 28 1_555 J O2 DC 18 J DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 I O6 DG 33 I DG 28 1_555 J N4 DC 18 J DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 I N3 DT 34 I DT 29 1_555 J N1 DA 17 J DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 I O4 DT 34 I DT 29 1_555 J N6 DA 17 J DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 I N1 DA 35 I DA 30 1_555 J N3 DT 16 J DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 I N6 DA 35 I DA 30 1_555 J O4 DT 16 J DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 I N3 DT 36 I DT 31 1_555 J N1 DA 15 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 I O4 DT 36 I DT 31 1_555 J N6 DA 15 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 I N1 DA 37 I DA 32 1_555 J N3 DT 14 J DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 I N6 DA 37 I DA 32 1_555 J O4 DT 14 J DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 I N1 DG 38 I DG 33 1_555 J N3 DC 13 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 I N2 DG 38 I DG 33 1_555 J O2 DC 13 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 I O6 DG 38 I DG 33 1_555 J N4 DC 13 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 I N3 DC 39 I DC 34 1_555 J N1 DG 12 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 I N4 DC 39 I DC 34 1_555 J O6 DG 12 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 I O2 DC 39 I DC 34 1_555 J N2 DG 12 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 I N3 DC 40 I DC 35 1_555 J N1 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 I N4 DC 40 I DC 35 1_555 J O6 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 I O2 DC 40 I DC 35 1_555 J N2 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 I N1 DG 41 I DG 36 1_555 J N3 DC 10 J DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 I N2 DG 41 I DG 36 1_555 J O2 DC 10 J DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 I O6 DG 41 I DG 36 1_555 J N4 DC 10 J DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 I N3 DT 42 I DT 37 1_555 J N1 DA 9 J DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 I O4 DT 42 I DT 37 1_555 J N6 DA 9 J DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 I N1 DA 43 I DA 38 1_555 J N3 DT 8 J DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 I N6 DA 43 I DA 38 1_555 J O4 DT 8 J DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 I N1 DG 44 I DG 39 1_555 J N3 DC 7 J DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 I N2 DG 44 I DG 39 1_555 J O2 DC 7 J DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 I O6 DG 44 I DG 39 1_555 J N4 DC 7 J DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 I N3 DC 45 I DC 40 1_555 J N1 DG 6 J DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 I N4 DC 45 I DC 40 1_555 J O6 DG 6 J DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 I O2 DC 45 I DC 40 1_555 J N2 DG 6 J DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8FS8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code L 12 AGS A 1 501 663 AGS AGS . M 13 MG A 1 502 668 MG MG . N 12 AGS B 1 401 500 AGS AGS . O 13 MG B 1 402 505 MG MG . P 12 AGS C 1 401 500 AGS AGS . Q 13 MG C 1 402 505 MG MG . R 12 AGS D 1 401 500 AGS AGS . S 13 MG D 1 402 505 MG MG . T 14 ADP E 1 500 500 ADP ADP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Q _atom_site.label_entity_id 13 _atom_site.Cartn_x 152.699 _atom_site.Cartn_y 181.287 _atom_site.Cartn_z 171.221 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 36.51 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 22 _model_server_stats.create_model_time_ms 28 _model_server_stats.query_time_ms 252 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #