data_8FYH # _model_server_result.job_id nlfrBEtqHqvcF5zYIMrppw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 02:45:52' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8fyh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":802}' # _entry.id 8FYH # _exptl.entry_id 8FYH _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tridecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 13 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 N N N ? 8 O N N ? 8 P N N ? 8 Q N N ? 8 R N N ? 8 S N N ? 8 T N N ? 8 U N N ? 8 V N N ? 8 W N N ? 8 X N N ? 8 Y N N ? 8 Z N N ? 8 AA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 J SG CYS 325 G CYS 325 1_555 J SG CYS 457 G CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.819 ? metalc ? metalc1 D SG CYS 286 A CYS 286 1_555 T ZN ZN . A ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc2 D SG CYS 289 A CYS 289 1_555 T ZN ZN . A ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc3 D SG CYS 294 A CYS 294 1_555 T ZN ZN . A ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc4 D ND1 HIS 297 A HIS 297 1_555 T ZN ZN . A ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc5 D SG CYS 528 A CYS 528 1_555 N ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc6 D SG CYS 528 A CYS 528 1_555 O ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc7 D NE2 HIS 530 A HIS 530 1_555 N ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc8 D SG CYS 535 A CYS 535 1_555 N ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc9 D SG CYS 535 A CYS 535 1_555 P ZN ZN . A ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc10 D SG CYS 539 A CYS 539 1_555 N ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc11 D SG CYS 541 A CYS 541 1_555 O ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc12 D SG CYS 548 A CYS 548 1_555 O ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc13 D SG CYS 548 A CYS 548 1_555 P ZN ZN . A ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc14 D SG CYS 552 A CYS 552 1_555 O ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc15 D SG CYS 554 A CYS 554 1_555 P ZN ZN . A ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 558 A CYS 558 1_555 P ZN ZN . A ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc17 D SG CYS 565 A CYS 565 1_555 Q ZN ZN . A ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc18 D SG CYS 565 A CYS 565 1_555 S ZN ZN . A ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc19 D SG CYS 567 A CYS 567 1_555 Q ZN ZN . A ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc20 D SG CYS 571 A CYS 571 1_555 Q ZN ZN . A ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc21 D SG CYS 571 A CYS 571 1_555 R ZN ZN . A ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc22 D SG CYS 576 A CYS 576 1_555 Q ZN ZN . A ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc23 D SG CYS 578 A CYS 578 1_555 S ZN ZN . A ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc24 D SG CYS 585 A CYS 585 1_555 R ZN ZN . A ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc25 D SG CYS 585 A CYS 585 1_555 S ZN ZN . A ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc26 D SG CYS 590 A CYS 590 1_555 S ZN ZN . A ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc27 D SG CYS 593 A CYS 593 1_555 R ZN ZN . A ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc28 D SG CYS 606 A CYS 606 1_555 R ZN ZN . A ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc29 J SG CYS 286 G CYS 286 1_555 AA ZN ZN . G ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc30 J SG CYS 289 G CYS 289 1_555 AA ZN ZN . G ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc31 J SG CYS 294 G CYS 294 1_555 AA ZN ZN . G ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc32 J ND1 HIS 297 G HIS 297 1_555 AA ZN ZN . G ZN 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc33 J SG CYS 528 G CYS 528 1_555 U ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc34 J SG CYS 528 G CYS 528 1_555 V ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc35 J NE2 HIS 530 G HIS 530 1_555 U ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? metalc ? metalc36 J SG CYS 535 G CYS 535 1_555 U ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc37 J SG CYS 535 G CYS 535 1_555 W ZN ZN . G ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc38 J SG CYS 539 G CYS 539 1_555 U ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc39 J SG CYS 541 G CYS 541 1_555 V ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc40 J SG CYS 548 G CYS 548 1_555 V ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc41 J SG CYS 548 G CYS 548 1_555 W ZN ZN . G ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc42 J SG CYS 552 G CYS 552 1_555 V ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc43 J SG CYS 554 G CYS 554 1_555 W ZN ZN . G ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc44 J SG CYS 558 G CYS 558 1_555 W ZN ZN . G ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc45 J SG CYS 565 G CYS 565 1_555 X ZN ZN . G ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc46 J SG CYS 565 G CYS 565 1_555 Z ZN ZN . G ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc47 J SG CYS 567 G CYS 567 1_555 X ZN ZN . G ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc48 J SG CYS 571 G CYS 571 1_555 X ZN ZN . G ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc49 J SG CYS 571 G CYS 571 1_555 Y ZN ZN . G ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc50 J SG CYS 576 G CYS 576 1_555 X ZN ZN . G ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc51 J SG CYS 578 G CYS 578 1_555 Z ZN ZN . G ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc52 J SG CYS 585 G CYS 585 1_555 Y ZN ZN . G ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc53 J SG CYS 585 G CYS 585 1_555 Z ZN ZN . G ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc54 J SG CYS 590 G CYS 590 1_555 Z ZN ZN . G ZN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc55 J SG CYS 593 G CYS 593 1_555 Y ZN ZN . G ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc56 J SG CYS 606 G CYS 606 1_555 Y ZN ZN . G ZN 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog1 M N1 G 1 M G 1 1_555 M O6 G 7 M G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog2 M N2 G 1 M G 1 1_555 M N7 G 7 M G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog3 M N7 G 1 M G 1 1_555 M N2 G 19 M G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog4 M O6 G 1 M G 1 1_555 M N1 G 19 M G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog5 M N2 G 2 M G 2 1_555 M O4 U 4 M U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog6 M N1 G 2 M G 2 1_555 M O6 G 8 M G 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog7 M N2 G 2 M G 2 1_555 M N7 G 8 M G 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog8 M N7 G 2 M G 2 1_555 M N2 G 20 M G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog9 M O6 G 2 M G 2 1_555 M N1 G 20 M G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog10 M N1 G 3 M G 3 1_555 M O6 G 9 M G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog11 M N2 G 3 M G 3 1_555 M N7 G 9 M G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog12 M N7 G 3 M G 3 1_555 M N2 G 21 M G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog13 M O6 G 3 M G 3 1_555 M N1 G 21 M G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog14 M N1 G 7 M G 7 1_555 M O6 G 13 M G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog15 M N2 G 7 M G 7 1_555 M N7 G 13 M G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog16 M N1 G 8 M G 8 1_555 M O6 G 14 M G 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog17 M N2 G 8 M G 8 1_555 M N7 G 14 M G 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog18 M N1 G 9 M G 9 1_555 M O6 G 15 M G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog19 M N2 G 9 M G 9 1_555 M N7 G 15 M G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog20 M N1 G 13 M G 13 1_555 M O6 G 19 M G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog21 M N2 G 13 M G 13 1_555 M N7 G 19 M G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog22 M N1 G 14 M G 14 1_555 M O6 G 20 M G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog23 M N2 G 14 M G 14 1_555 M N7 G 20 M G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog24 M N1 G 15 M G 15 1_555 M O6 G 21 M G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog25 M N2 G 15 M G 15 1_555 M N7 G 21 M G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8FYH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code N 8 ZN A 1 801 801 ZN ZN . O 8 ZN A 1 802 802 ZN ZN . P 8 ZN A 1 803 803 ZN ZN . Q 8 ZN A 1 804 804 ZN ZN . R 8 ZN A 1 805 805 ZN ZN . S 8 ZN A 1 806 806 ZN ZN . T 8 ZN A 1 807 807 ZN ZN . U 8 ZN G 1 801 801 ZN ZN . V 8 ZN G 1 802 802 ZN ZN . W 8 ZN G 1 803 803 ZN ZN . X 8 ZN G 1 804 804 ZN ZN . Y 8 ZN G 1 805 805 ZN ZN . Z 8 ZN G 1 806 806 ZN ZN . AA 8 ZN G 1 807 807 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id V _atom_site.label_entity_id 8 _atom_site.Cartn_x 132.208 _atom_site.Cartn_y 171.508 _atom_site.Cartn_z 149.434 _atom_site.occupancy 0.29 _atom_site.B_iso_or_equiv 59.72 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 802 _atom_site.auth_asym_id G _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 57 _model_server_stats.query_time_ms 309 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #