data_8G3V # _model_server_result.job_id od4OVjDiLyvBnMa4F9Kz1A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 00:01:17' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8g3v # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":1102}' # _entry.id 8G3V # _exptl.entry_id 8G3V _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8G3V _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8G3V _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 5 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 6 ? 5 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 7 ? 5 7 6 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 8 ? 5 8 6 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n M NAG 1 E 1 NAG G 900 NAG 4 n M NAG 2 E 2 NAG G 901 NAG 5 n N NAG 1 F 1 NAG G 1000 NAG 5 n N NAG 2 F 2 NAG G 1001 NAG 5 n N BMA 3 F 3 BMA G 1002 BMA 5 n N MAN 4 F 4 MAN G 1006 MAN 5 n N MAN 5 F 5 MAN G 1007 MAN 5 n N MAN 6 F 6 MAN G 1003 MAN 5 n N MAN 7 F 7 MAN G 1005 MAN 5 n N MAN 8 F 8 MAN G 1004 MAN 4 n O NAG 1 K 1 NAG G 1400 NAG 4 n O NAG 2 K 2 NAG G 1401 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG H 900 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG H 901 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG H 1000 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG H 1001 NAG 5 n Q BMA 3 Q 3 BMA H 1002 BMA 5 n Q MAN 4 Q 4 MAN H 1006 MAN 5 n Q MAN 5 Q 5 MAN H 1007 MAN 5 n Q MAN 6 Q 6 MAN H 1003 MAN 5 n Q MAN 7 Q 7 MAN H 1005 MAN 5 n Q MAN 8 Q 8 MAN H 1004 MAN 4 n R NAG 1 R 1 NAG H 1400 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG H 1401 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG I 900 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG I 901 NAG 5 n T NAG 1 T 1 NAG I 1000 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG I 1001 NAG 5 n T BMA 3 T 3 BMA I 1002 BMA 5 n T MAN 4 T 4 MAN I 1006 MAN 5 n T MAN 5 T 5 MAN I 1007 MAN 5 n T MAN 6 T 6 MAN I 1003 MAN 5 n T MAN 7 T 7 MAN I 1005 MAN 5 n T MAN 8 T 8 MAN I 1004 MAN 4 n U NAG 1 U 1 NAG I 1400 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG I 1401 NAG 4 n V NAG 1 V 1 NAG J 900 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG J 901 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG J 1000 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG J 1001 NAG 5 n W BMA 3 W 3 BMA J 1002 BMA 5 n W MAN 4 W 4 MAN J 1006 MAN 5 n W MAN 5 W 5 MAN J 1007 MAN 5 n W MAN 6 W 6 MAN J 1003 MAN 5 n W MAN 7 W 7 MAN J 1005 MAN 5 n W MAN 8 W 8 MAN J 1004 MAN 4 n X NAG 1 X 1 NAG J 1400 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG J 1401 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 115 G CYS 92 1_555 A SG CYS 440 G CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 147 G CYS 124 1_555 A SG CYS 152 G CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 198 G CYS 175 1_555 A SG CYS 216 G CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 206 G CYS 183 1_555 A SG CYS 253 G CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 255 G CYS 232 1_555 A SG CYS 260 G CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 301 G CYS 278 1_555 A SG CYS 314 G CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 303 G CYS 280 1_555 A SG CYS 312 G CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 341 G CYS 318 1_555 A SG CYS 360 G CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 444 G CYS 421 1_555 A SG CYS 470 G CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 22 A CYS 22 1_555 B SG CYS 96 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 23 L CYS 23 1_555 C SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 115 H CYS 92 1_555 D SG CYS 440 H CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf13 D SG CYS 147 H CYS 124 1_555 D SG CYS 152 H CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 198 H CYS 175 1_555 D SG CYS 216 H CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 206 H CYS 183 1_555 D SG CYS 253 H CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 255 H CYS 232 1_555 D SG CYS 260 H CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 301 H CYS 278 1_555 D SG CYS 314 H CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 303 H CYS 280 1_555 D SG CYS 312 H CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 341 H CYS 318 1_555 D SG CYS 360 H CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 444 H CYS 421 1_555 D SG CYS 470 H CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 22 B CYS 22 1_555 E SG CYS 96 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 23 M CYS 23 1_555 F SG CYS 88 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 115 I CYS 92 1_555 G SG CYS 440 I CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 147 I CYS 124 1_555 G SG CYS 152 I CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 198 I CYS 175 1_555 G SG CYS 216 I CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 206 I CYS 183 1_555 G SG CYS 253 I CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 255 I CYS 232 1_555 G SG CYS 260 I CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 301 I CYS 278 1_555 G SG CYS 314 I CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 303 I CYS 280 1_555 G SG CYS 312 I CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 341 I CYS 318 1_555 G SG CYS 360 I CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 444 I CYS 421 1_555 G SG CYS 470 I CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? disulf ? disulf32 H SG CYS 22 C CYS 22 1_555 H SG CYS 96 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 23 N CYS 23 1_555 I SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf34 J SG CYS 115 J CYS 92 1_555 J SG CYS 440 J CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf35 J SG CYS 147 J CYS 124 1_555 J SG CYS 152 J CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf36 J SG CYS 198 J CYS 175 1_555 J SG CYS 216 J CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 J SG CYS 206 J CYS 183 1_555 J SG CYS 253 J CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf38 J SG CYS 255 J CYS 232 1_555 J SG CYS 260 J CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? disulf ? disulf39 J SG CYS 301 J CYS 278 1_555 J SG CYS 314 J CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? disulf ? disulf40 J SG CYS 303 J CYS 280 1_555 J SG CYS 312 J CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? disulf ? disulf41 J SG CYS 341 J CYS 318 1_555 J SG CYS 360 J CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? disulf ? disulf42 J SG CYS 444 J CYS 421 1_555 J SG CYS 470 J CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? disulf ? disulf43 K SG CYS 22 D CYS 22 1_555 K SG CYS 96 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf44 L SG CYS 23 O CYS 23 1_555 L SG CYS 88 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 109 G ASN 86 1_555 M C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 169 G ASN 146 1_555 Y C1 NAG . G NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 223 G ASN 200 1_555 N C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 257 G ASN 234 1_555 O C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 390 G ASN 367 1_555 Z C1 NAG . G NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale6 D ND2 ASN 109 H ASN 86 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale7 D ND2 ASN 169 H ASN 146 1_555 CA C1 NAG . H NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale8 D ND2 ASN 223 H ASN 200 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale9 D ND2 ASN 257 H ASN 234 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale10 D ND2 ASN 390 H ASN 367 1_555 DA C1 NAG . H NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale11 G ND2 ASN 109 I ASN 86 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale12 G ND2 ASN 169 I ASN 146 1_555 FA C1 NAG . I NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale13 G ND2 ASN 223 I ASN 200 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale14 G ND2 ASN 257 I ASN 234 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale15 G ND2 ASN 390 I ASN 367 1_555 GA C1 NAG . I NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale16 J ND2 ASN 109 J ASN 86 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale17 J ND2 ASN 169 J ASN 146 1_555 IA C1 NAG . J NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale18 J ND2 ASN 223 J ASN 200 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale19 J ND2 ASN 257 J ASN 234 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale20 J ND2 ASN 390 J ASN 367 1_555 JA C1 NAG . J NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale21 M O4 NAG . E NAG 1 1_555 M C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale22 N O4 NAG . F NAG 1 1_555 N C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 N O4 NAG . F NAG 2 1_555 N C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale24 N O3 BMA . F BMA 3 1_555 N C1 MAN . F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale25 N O6 BMA . F BMA 3 1_555 N C1 MAN . F MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale26 N O2 MAN . F MAN 4 1_555 N C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale27 N O3 MAN . F MAN 6 1_555 N C1 MAN . F MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale28 N O6 MAN . F MAN 6 1_555 N C1 MAN . F MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale29 O O4 NAG . K NAG 1 1_555 O C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale30 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale31 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale33 Q O3 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale34 Q O6 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale35 Q O2 MAN . Q MAN 4 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale36 Q O3 MAN . Q MAN 6 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale37 Q O6 MAN . Q MAN 6 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale38 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale39 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale40 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale41 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale42 T O3 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale43 T O6 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale44 T O2 MAN . T MAN 4 1_555 T C1 MAN . T MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale45 T O3 MAN . T MAN 6 1_555 T C1 MAN . T MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale46 T O6 MAN . T MAN 6 1_555 T C1 MAN . T MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale47 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale48 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale49 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale50 W O4 NAG . W NAG 2 1_555 W C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale51 W O3 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale52 W O6 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale53 W O2 MAN . W MAN 4 1_555 W C1 MAN . W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale54 W O3 MAN . W MAN 6 1_555 W C1 MAN . W MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale55 W O6 MAN . W MAN 6 1_555 W C1 MAN . W MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale56 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? metalc ? metalc1 A O ASP 316 G ASP 293 1_555 AA CA CA . G CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc2 A O GLY 320 G GLY 297 1_555 AA CA CA . G CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 347 G ASP 324 1_555 AA CA CA . G CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc4 A O GLY 368 G GLY 345 1_555 AA CA CA . G CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc5 A O HIS 370 G HIS 347 1_555 AA CA CA . G CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc6 D O ASP 316 H ASP 293 1_555 EA CA CA . H CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc7 D O GLY 320 H GLY 297 1_555 EA CA CA . H CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc8 D OD2 ASP 347 H ASP 324 1_555 EA CA CA . H CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc9 D O GLY 368 H GLY 345 1_555 EA CA CA . H CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc10 D O HIS 370 H HIS 347 1_555 EA CA CA . H CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc11 G O ASP 316 I ASP 293 1_555 HA CA CA . I CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc12 G O GLY 320 I GLY 297 1_555 HA CA CA . I CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc13 G OD2 ASP 347 I ASP 324 1_555 HA CA CA . I CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc14 G O GLY 368 I GLY 345 1_555 HA CA CA . I CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc15 G O HIS 370 I HIS 347 1_555 HA CA CA . I CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc16 J O ASP 316 J ASP 293 1_555 KA CA CA . J CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc17 J O GLY 320 J GLY 297 1_555 KA CA CA . J CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc18 J OD2 ASP 347 J ASP 324 1_555 KA CA CA . J CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc19 J O GLY 368 J GLY 345 1_555 KA CA CA . J CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc20 J O HIS 370 J HIS 347 1_555 KA CA CA . J CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8G3V _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 6 NAG G 1 1101 1101 NAG NAG . Z 6 NAG G 1 1102 1301 NAG NAG . AA 7 CA G 1 1103 2000 CA CA . BA 7 CA G 1 1104 2000 CA CA . CA 6 NAG H 1 1101 1101 NAG NAG . DA 6 NAG H 1 1102 1301 NAG NAG . EA 7 CA H 1 1103 2000 CA CA . FA 6 NAG I 1 1101 1101 NAG NAG . GA 6 NAG I 1 1102 1301 NAG NAG . HA 7 CA I 1 1103 2000 CA CA . IA 6 NAG J 1 1101 1101 NAG NAG . JA 6 NAG J 1 1102 1301 NAG NAG . KA 7 CA J 1 1103 2000 CA CA . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . Z 6 204.047 162.333 174.486 1 65.32 ? C1 NAG 1102 G 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . Z 6 204.881 163.306 175.323 1 71.78 ? C2 NAG 1102 G 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . Z 6 205.018 162.824 176.776 1 73.85 ? C3 NAG 1102 G 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . Z 6 203.674 162.423 177.384 1 76.44 ? C4 NAG 1102 G 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . Z 6 202.894 161.457 176.477 1 75.11 ? C5 NAG 1102 G 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . Z 6 201.476 161.199 176.997 1 77.95 ? C6 NAG 1102 G 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . Z 6 206.575 164.472 173.962 1 82.33 ? C7 NAG 1102 G 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . Z 6 208.016 164.495 173.531 1 85.28 ? C8 NAG 1102 G 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . Z 6 206.216 163.472 174.766 1 75.8 ? N2 NAG 1102 G 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . Z 6 205.603 163.865 177.577 1 80.91 ? O3 NAG 1102 G 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . Z 6 203.916 161.844 178.676 1 85.53 ? O4 NAG 1102 G 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . Z 6 202.801 162.004 175.155 1 67.8 ? O5 NAG 1102 G 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . Z 6 200.753 160.342 176.101 1 73.82 ? O6 NAG 1102 G 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . Z 6 205.779 165.324 173.595 1 84.55 ? O7 NAG 1102 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 40 _model_server_stats.create_model_time_ms 81 _model_server_stats.query_time_ms 292 _model_server_stats.encode_time_ms 11 _model_server_stats.element_count 14 #