data_8GAS # _model_server_result.job_id A0pir2p4-FPcIfxCwL2XfQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 07:39:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8gas # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"JA","auth_seq_id":603}' # _entry.id 8GAS # _exptl.entry_id 8GAS _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 36 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8GAS _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8GAS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N ? 8 QB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 M 1 NAG G 1088 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG G 1089 NAG 5 n M BMA 3 M 3 BMA G 1090 BMA 6 n N NAG 1 N 1 NAG G 1295 NAG 6 n N NAG 2 N 2 NAG G 1296 NAG 6 n O NAG 1 O 1 NAG G 1332 NAG 6 n O NAG 2 O 2 NAG G 1333 NAG 6 n P NAG 1 P 1 NAG G 1363 NAG 6 n P NAG 2 P 2 NAG G 1364 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG G 1386 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG G 1387 NAG 5 n Q BMA 3 Q 3 BMA G 1388 BMA 5 n R NAG 1 R 1 NAG G 1448 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG G 1449 NAG 5 n R BMA 3 R 3 BMA G 1450 BMA 7 n S NAG 1 S 1 NAG G 1453 NAG 7 n S NAG 2 S 2 NAG G 1454 NAG 7 n S BMA 3 S 3 BMA G 1455 BMA 7 n S MAN 4 S 4 MAN G 1456 MAN 5 n T NAG 1 T 1 NAG D 1088 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG D 1089 NAG 5 n T BMA 3 T 3 BMA D 1090 BMA 6 n U NAG 1 U 1 NAG D 1295 NAG 6 n U NAG 2 U 2 NAG D 1296 NAG 6 n V NAG 1 V 1 NAG D 1332 NAG 6 n V NAG 2 V 2 NAG D 1333 NAG 6 n W NAG 1 W 1 NAG D 1363 NAG 6 n W NAG 2 W 2 NAG D 1364 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG D 1386 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG D 1387 NAG 5 n X BMA 3 X 3 BMA D 1388 BMA 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG D 1448 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG D 1449 NAG 5 n Y BMA 3 Y 3 BMA D 1450 BMA 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG D 1453 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG D 1454 NAG 7 n Z BMA 3 Z 3 BMA D 1455 BMA 7 n Z MAN 4 Z 4 MAN D 1456 MAN 5 n AA NAG 1 a 1 NAG J 1088 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG J 1089 NAG 5 n AA BMA 3 a 3 BMA J 1090 BMA 6 n BA NAG 1 b 1 NAG J 1295 NAG 6 n BA NAG 2 b 2 NAG J 1296 NAG 6 n CA NAG 1 c 1 NAG J 1332 NAG 6 n CA NAG 2 c 2 NAG J 1333 NAG 6 n DA NAG 1 d 1 NAG J 1363 NAG 6 n DA NAG 2 d 2 NAG J 1364 NAG 5 n EA NAG 1 e 1 NAG J 1386 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG J 1387 NAG 5 n EA BMA 3 e 3 BMA J 1388 BMA 5 n FA NAG 1 f 1 NAG J 1448 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG J 1449 NAG 5 n FA BMA 3 f 3 BMA J 1450 BMA 7 n GA NAG 1 g 1 NAG J 1453 NAG 7 n GA NAG 2 g 2 NAG J 1454 NAG 7 n GA BMA 3 g 3 BMA J 1455 BMA 7 n GA MAN 4 g 4 MAN J 1456 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 23 L CYS 23 1_555 A SG CYS 93 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 22 H CYS 22 1_555 B SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 24 G CYS 54 1_555 C SG CYS 44 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 89 G CYS 119 1_555 C SG CYS 175 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 96 G CYS 126 1_555 C SG CYS 166 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 101 G CYS 131 1_555 C SG CYS 119 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 171 G CYS 201 1_555 C SG CYS 401 G CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 188 G CYS 218 1_555 C SG CYS 217 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 198 G CYS 228 1_555 C SG CYS 209 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 266 G CYS 296 1_555 C SG CYS 300 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 347 G CYS 378 1_555 C SG CYS 413 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 354 G CYS 385 1_555 C SG CYS 386 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 469 G CYS 501 1_555 D SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 87 B CYS 598 1_555 D SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 23 A CYS 23 1_555 E SG CYS 93 A CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 22 C CYS 22 1_555 F SG CYS 96 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 G SG CYS 24 D CYS 54 1_555 G SG CYS 44 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 G SG CYS 89 D CYS 119 1_555 G SG CYS 175 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 96 D CYS 126 1_555 G SG CYS 166 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 101 D CYS 131 1_555 G SG CYS 119 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 171 D CYS 201 1_555 G SG CYS 401 D CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 188 D CYS 218 1_555 G SG CYS 217 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 198 D CYS 228 1_555 G SG CYS 209 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 266 D CYS 296 1_555 G SG CYS 300 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 347 D CYS 378 1_555 G SG CYS 413 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 354 D CYS 385 1_555 G SG CYS 386 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 469 D CYS 501 1_555 H SG CYS 94 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 H SG CYS 87 E CYS 598 1_555 H SG CYS 93 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 23 F CYS 23 1_555 I SG CYS 93 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 22 I CYS 22 1_555 J SG CYS 96 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 24 J CYS 54 1_555 K SG CYS 44 J CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 89 J CYS 119 1_555 K SG CYS 175 J CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 96 J CYS 126 1_555 K SG CYS 166 J CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 101 J CYS 131 1_555 K SG CYS 119 J CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 171 J CYS 201 1_555 K SG CYS 401 J CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf36 K SG CYS 188 J CYS 218 1_555 K SG CYS 217 J CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 198 J CYS 228 1_555 K SG CYS 209 J CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 266 J CYS 296 1_555 K SG CYS 300 J CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf39 K SG CYS 347 J CYS 378 1_555 K SG CYS 413 J CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf40 K SG CYS 354 J CYS 385 1_555 K SG CYS 386 J CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf41 K SG CYS 469 J CYS 501 1_555 L SG CYS 94 K CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf42 L SG CYS 87 K CYS 598 1_555 L SG CYS 93 K CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 58 G ASN 88 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 103 G ASN 133 1_555 HA C1 NAG . G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 118 G ASN 156 1_555 IA C1 NAG . G NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 122 G ASN 160 1_555 JA C1 NAG . G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 167 G ASN 197 1_555 KA C1 NAG . G NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 204 G ASN 234 1_555 QA C1 NAG . G NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 232 G ASN 262 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 246 G ASN 276 1_555 LA C1 NAG . G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 265 G ASN 295 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 271 G ASN 301 1_555 MA C1 NAG . G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 301 G ASN 332 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 308 G ASN 339 1_555 OA C1 NAG . G NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 324 G ASN 355 1_555 NA C1 NAG . G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 332 G ASN 363 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 355 G ASN 386 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 361 G ASN 392 1_555 PA C1 NAG . G NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 C ND2 ASN 416 G ASN 448 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 RA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 SA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 G ND2 ASN 58 D ASN 88 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale21 G ND2 ASN 103 D ASN 133 1_555 TA C1 NAG . D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale22 G ND2 ASN 118 D ASN 156 1_555 UA C1 NAG . D NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 G ND2 ASN 122 D ASN 160 1_555 VA C1 NAG . D NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 G ND2 ASN 167 D ASN 197 1_555 WA C1 NAG . D NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 G ND2 ASN 204 D ASN 234 1_555 CB C1 NAG . D NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale26 G ND2 ASN 232 D ASN 262 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale27 G ND2 ASN 246 D ASN 276 1_555 XA C1 NAG . D NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale28 G ND2 ASN 265 D ASN 295 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale29 G ND2 ASN 271 D ASN 301 1_555 YA C1 NAG . D NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale30 G ND2 ASN 301 D ASN 332 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale31 G ND2 ASN 308 D ASN 339 1_555 AB C1 NAG . D NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 G ND2 ASN 324 D ASN 355 1_555 ZA C1 NAG . D NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 332 D ASN 363 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 G ND2 ASN 355 D ASN 386 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale35 G ND2 ASN 361 D ASN 392 1_555 BB C1 NAG . D NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 416 D ASN 448 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale37 H ND2 ASN 100 E ASN 611 1_555 DB C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale38 H ND2 ASN 126 E ASN 637 1_555 EB C1 NAG . E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 K ND2 ASN 58 J ASN 88 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale40 K ND2 ASN 103 J ASN 133 1_555 FB C1 NAG . J NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale41 K ND2 ASN 118 J ASN 156 1_555 GB C1 NAG . J NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 K ND2 ASN 122 J ASN 160 1_555 HB C1 NAG . J NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale43 K ND2 ASN 167 J ASN 197 1_555 IB C1 NAG . J NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale44 K ND2 ASN 204 J ASN 234 1_555 OB C1 NAG . J NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale45 K ND2 ASN 232 J ASN 262 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale46 K ND2 ASN 246 J ASN 276 1_555 JB C1 NAG . J NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale47 K ND2 ASN 265 J ASN 295 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale48 K ND2 ASN 271 J ASN 301 1_555 KB C1 NAG . J NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale49 K ND2 ASN 301 J ASN 332 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale50 K ND2 ASN 308 J ASN 339 1_555 MB C1 NAG . J NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale51 K ND2 ASN 324 J ASN 355 1_555 LB C1 NAG . J NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale52 K ND2 ASN 332 J ASN 363 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale53 K ND2 ASN 355 J ASN 386 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale54 K ND2 ASN 361 J ASN 392 1_555 NB C1 NAG . J NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale55 K ND2 ASN 416 J ASN 448 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale56 L ND2 ASN 100 K ASN 611 1_555 PB C1 NAG . K NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale57 L ND2 ASN 126 K ASN 637 1_555 QB C1 NAG . K NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale58 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale59 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale60 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale61 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale62 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale64 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale65 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale66 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale67 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale68 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale69 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale70 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale71 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale73 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale74 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale75 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale76 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale77 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale78 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale79 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale80 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale81 Z O3 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale82 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale83 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale84 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale85 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale86 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale87 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale88 EA O4 NAG . e NAG 2 1_555 EA C1 BMA . e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale89 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale90 FA O4 NAG . f NAG 2 1_555 FA C1 BMA . f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale91 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale92 GA O4 NAG . g NAG 2 1_555 GA C1 BMA . g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale93 GA O3 BMA . g BMA 3 1_555 GA C1 MAN . g MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8GAS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code HA 8 NAG G 1 601 1133 NAG NAG . IA 8 NAG G 1 602 1156 NAG NAG . JA 8 NAG G 1 603 1160 NAG NAG . KA 8 NAG G 1 604 1197 NAG NAG . LA 8 NAG G 1 605 1276 NAG NAG . MA 8 NAG G 1 606 1301 NAG NAG . NA 8 NAG G 1 607 1335 NAG NAG . OA 8 NAG G 1 608 1339 NAG NAG . PA 8 NAG G 1 609 1392 NAG NAG . QA 8 NAG G 1 610 1452 NAG NAG . RA 8 NAG B 1 701 1611 NAG NAG . SA 8 NAG B 1 702 1637 NAG NAG . TA 8 NAG D 1 601 1133 NAG NAG . UA 8 NAG D 1 602 1156 NAG NAG . VA 8 NAG D 1 603 1160 NAG NAG . WA 8 NAG D 1 604 1197 NAG NAG . XA 8 NAG D 1 605 1276 NAG NAG . YA 8 NAG D 1 606 1301 NAG NAG . ZA 8 NAG D 1 607 1335 NAG NAG . AB 8 NAG D 1 608 1339 NAG NAG . BB 8 NAG D 1 609 1392 NAG NAG . CB 8 NAG D 1 610 1452 NAG NAG . DB 8 NAG E 1 701 1611 NAG NAG . EB 8 NAG E 1 702 1637 NAG NAG . FB 8 NAG J 1 601 1133 NAG NAG . GB 8 NAG J 1 602 1156 NAG NAG . HB 8 NAG J 1 603 1160 NAG NAG . IB 8 NAG J 1 604 1197 NAG NAG . JB 8 NAG J 1 605 1276 NAG NAG . KB 8 NAG J 1 606 1301 NAG NAG . LB 8 NAG J 1 607 1335 NAG NAG . MB 8 NAG J 1 608 1339 NAG NAG . NB 8 NAG J 1 609 1392 NAG NAG . OB 8 NAG J 1 610 1452 NAG NAG . PB 8 NAG K 1 701 1611 NAG NAG . QB 8 NAG K 1 702 1637 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . JA 8 159.791 165.058 101.793 1 46.83 ? C1 NAG 603 G 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . JA 8 161.138 164.539 101.289 1 46.83 ? C2 NAG 603 G 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . JA 8 161.421 165.082 99.892 1 46.83 ? C3 NAG 603 G 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . JA 8 160.26 164.773 98.956 1 46.83 ? C4 NAG 603 G 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . JA 8 158.951 165.277 99.557 1 46.83 ? C5 NAG 603 G 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . JA 8 157.739 164.9 98.737 1 46.83 ? C6 NAG 603 G 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . JA 8 162.8 164.02 103.021 1 46.83 ? C7 NAG 603 G 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . JA 8 163.889 164.566 103.894 1 46.83 ? C8 NAG 603 G 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . JA 8 162.211 164.898 102.202 1 46.83 ? N2 NAG 603 G 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . JA 8 162.618 164.498 99.391 1 46.83 ? O3 NAG 603 G 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . JA 8 160.47 165.4 97.697 1 46.83 ? O4 NAG 603 G 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . JA 8 158.761 164.709 100.861 1 46.83 ? O5 NAG 603 G 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . JA 8 157.805 163.549 98.3 1 46.83 ? O6 NAG 603 G 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . JA 8 162.468 162.84 103.057 1 46.83 ? O7 NAG 603 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 24 _model_server_stats.query_time_ms 274 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #