data_8GCC # _model_server_result.job_id bBwxKDQJlrMNlsnJSU5wtw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 06:30:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8gcc # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":101}' # _entry.id 8GCC # _exptl.entry_id 8GCC _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 398.341 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-{3-[(Z)-iminomethyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}-1-{(3M)-3-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-6H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-6-yl}ethan-1-one _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8GCC _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8GCC _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A SG CYS 78 A CYS 477 1_555 F C4 YWX . D YWX 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.766 ? covale ? covale2 B SG CYS 78 B CYS 477 1_555 E C4 YWX . C YWX 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.766 ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog1 C N1 DG 3 C DG 2 1_555 D O2 DC 26 D DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog2 C N2 DG 3 C DG 2 1_555 D N3 DC 26 D DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N1 DA 4 C DA 3 1_555 D N3 DT 25 D DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N6 DA 4 C DA 3 1_555 D O4 DT 25 D DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N3 DT 5 C DT 4 1_555 D N1 DA 24 D DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C O4 DT 5 C DT 4 1_555 D N6 DA 24 D DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C N1 DA 6 C DA 5 1_555 D N3 DT 23 D DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N6 DA 6 C DA 5 1_555 D O4 DT 23 D DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N1 DA 7 C DA 6 1_555 D N3 DT 22 D DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N6 DA 7 C DA 6 1_555 D O4 DT 22 D DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N3 DC 8 C DC 7 1_555 D N1 DG 21 D DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N4 DC 8 C DC 7 1_555 D O6 DG 21 D DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C O2 DC 8 C DC 7 1_555 D N2 DG 21 D DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C N1 DA 9 C DA 8 1_555 D N3 DT 20 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N6 DA 9 C DA 8 1_555 D O4 DT 20 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N1 DA 10 C DA 9 1_555 D N3 DT 19 D DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N6 DA 10 C DA 9 1_555 D O4 DT 19 D DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N3 DT 11 C DT 10 1_555 D N1 DA 18 D DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O4 DT 11 C DT 10 1_555 D N6 DA 18 D DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N1 DG 12 C DG 11 1_555 D N3 DC 17 D DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N2 DG 12 C DG 11 1_555 D O2 DC 17 D DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C O6 DG 12 C DG 11 1_555 D N4 DC 17 D DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N1 DA 13 C DA 12 1_555 D N3 DT 16 D DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N6 DA 13 C DA 12 1_555 D O4 DT 16 D DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N1 DG 14 C DG 13 1_555 D N3 DC 15 D DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N2 DG 14 C DG 13 1_555 D O2 DC 15 D DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C O6 DG 14 C DG 13 1_555 D N4 DC 15 D DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C N3 DC 15 C DC 14 1_555 D N1 DG 14 D DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N4 DC 15 C DC 14 1_555 D O6 DG 14 D DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C O2 DC 15 C DC 14 1_555 D N2 DG 14 D DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N3 DT 16 C DT 15 1_555 D N1 DA 13 D DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C O4 DT 16 C DT 15 1_555 D N6 DA 13 D DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N3 DC 17 C DC 16 1_555 D N1 DG 12 D DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N4 DC 17 C DC 16 1_555 D O6 DG 12 D DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C O2 DC 17 C DC 16 1_555 D N2 DG 12 D DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N1 DA 18 C DA 17 1_555 D N3 DT 11 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N6 DA 18 C DA 17 1_555 D O4 DT 11 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C N3 DT 19 C DT 18 1_555 D N1 DA 10 D DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C O4 DT 19 C DT 18 1_555 D N6 DA 10 D DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N3 DT 20 C DT 19 1_555 D N1 DA 9 D DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C O4 DT 20 C DT 19 1_555 D N6 DA 9 D DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C N1 DG 21 C DG 20 1_555 D N3 DC 8 D DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 C N2 DG 21 C DG 20 1_555 D O2 DC 8 D DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 C O6 DG 21 C DG 20 1_555 D N4 DC 8 D DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 C N3 DT 22 C DT 21 1_555 D N1 DA 7 D DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 C O4 DT 22 C DT 21 1_555 D N6 DA 7 D DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 C N3 DT 23 C DT 22 1_555 D N1 DA 6 D DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 C O4 DT 23 C DT 22 1_555 D N6 DA 6 D DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 C N1 DA 24 C DA 23 1_555 D N3 DT 5 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 C N6 DA 24 C DA 23 1_555 D O4 DT 5 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 C N3 DT 25 C DT 24 1_555 D N1 DA 4 D DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 C O4 DT 25 C DT 24 1_555 D N6 DA 4 D DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog53 C N3 DC 26 C DC 25 1_555 D N2 DG 3 D DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog54 C O2 DC 26 C DC 25 1_555 D N1 DG 3 D DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C19 H13 F3 N6 O' _chem_comp.formula_weight 398.341 _chem_comp.id YWX _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-{3-[(Z)-iminomethyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}-1-{(3M)-3-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-6H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-6-yl}ethan-1-one _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'inhibitor CT1, bound form' # _atom_sites.entry_id 8GCC _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 YWX C 1 101 2 YWX LI1 . F 3 YWX D 1 101 1 YWX LI1 . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 YWX . . . E 3 151.891 172.498 142.583 1 28.09 ? C1 YWX 101 C 1 HETATM 2 C C2 YWX . . . E 3 150.488 173.689 139.638 1 35.39 ? C2 YWX 101 C 1 HETATM 3 C C3 YWX . . . E 3 149.712 172.772 141.343 1 38.32 ? C3 YWX 101 C 1 HETATM 4 C C11 YWX . . . E 3 156.866 168.674 150.235 1 19.89 ? C11 YWX 101 C 1 HETATM 5 C C12 YWX . . . E 3 158.147 169.175 150.375 1 25.73 ? C12 YWX 101 C 1 HETATM 6 C C13 YWX . . . E 3 158.817 169.68 149.286 1 26.25 ? C13 YWX 101 C 1 HETATM 7 C C14 YWX . . . E 3 158.214 169.693 148.041 1 25.91 ? C14 YWX 101 C 1 HETATM 8 C C15 YWX . . . E 3 154.853 168.127 148.896 1 32.36 ? C15 YWX 101 C 1 HETATM 9 C C16 YWX . . . E 3 155.289 170.182 146.239 1 35.96 ? C16 YWX 101 C 1 HETATM 10 C C17 YWX . . . E 3 154.783 170.294 144.952 1 37.44 ? C17 YWX 101 C 1 HETATM 11 C C18 YWX . . . E 3 153.711 171.206 144.433 1 32.96 ? C18 YWX 101 C 1 HETATM 12 N N YWX . . . E 3 151.022 172.942 141.507 1 35.97 ? N YWX 101 C 1 HETATM 13 C C YWX . . . E 3 152.836 171.398 142.101 1 34.24 ? C YWX 101 C 1 HETATM 14 O O YWX . . . E 3 152.84 171.047 140.932 1 43.27 ? O YWX 101 C 1 HETATM 15 C C10 YWX . . . E 3 156.246 168.68 148.995 1 12.96 ? C10 YWX 101 C 1 HETATM 16 C C4 YWX . . . E 3 150.576 174.294 138.307 1 39.77 ? C4 YWX 101 C 1 HETATM 17 C C5 YWX . . . E 3 154.613 169.794 142.673 1 35.23 ? C5 YWX 101 C 1 HETATM 18 C C6 YWX . . . E 3 155.341 169.478 143.968 1 36.08 ? C6 YWX 101 C 1 HETATM 19 C C7 YWX . . . E 3 156.803 168.529 145.447 1 32.65 ? C7 YWX 101 C 1 HETATM 20 C C8 YWX . . . E 3 156.326 169.291 146.51 1 28.4 ? C8 YWX 101 C 1 HETATM 21 C C9 YWX . . . E 3 156.92 169.2 147.872 1 18.33 ? C9 YWX 101 C 1 HETATM 22 F F YWX . . . E 3 154.73 167.226 147.932 1 50.55 ? F YWX 101 C 1 HETATM 23 F F1 YWX . . . E 3 153.95 169.063 148.644 1 41.71 ? F1 YWX 101 C 1 HETATM 24 F F2 YWX . . . E 3 154.465 167.532 150.014 1 36 ? F2 YWX 101 C 1 HETATM 25 N N1 YWX . . . E 3 151.548 173.551 140.418 1 34.37 ? N1 YWX 101 C 1 HETATM 26 N N2 YWX . . . E 3 149.324 173.225 140.167 1 33.61 ? N2 YWX 101 C 1 HETATM 27 N N3 YWX . . . E 3 151.609 174.759 137.738 1 37.63 ? N3 YWX 101 C 1 HETATM 28 N N4 YWX . . . E 3 153.656 170.847 143.016 1 36.75 ? N4 YWX 101 C 1 HETATM 29 N N5 YWX . . . E 3 156.333 168.605 144.196 1 29.95 ? N5 YWX 101 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 256 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 29 #