data_8GPG # _model_server_result.job_id NQkpG9xQq9vC3W_Y06F0bw _model_server_result.datetime_utc '2025-03-05 03:05:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8gpg # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"GA","auth_seq_id":701}' # _entry.id 8GPG # _exptl.entry_id 8GPG _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 21 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8GPG _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8GPG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 S N N ? 6 T N N ? 6 U N N ? 6 V N N ? 6 W N N ? 6 X N N ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 4 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 G 1 NAG X 662 NAG 4 n J NAG 2 G 2 NAG X 663 NAG 4 n J BMA 3 G 3 BMA X 664 BMA 4 n J MAN 4 G 4 MAN X 665 MAN 4 n J MAN 5 G 5 MAN X 666 MAN 5 n K NAG 1 H 1 NAG X 669 NAG 5 n K NAG 2 H 2 NAG X 670 NAG 5 n L NAG 1 I 1 NAG X 675 NAG 5 n L NAG 2 I 2 NAG X 676 NAG 4 n M NAG 1 J 1 NAG Y 662 NAG 4 n M NAG 2 J 2 NAG Y 663 NAG 4 n M BMA 3 J 3 BMA Y 664 BMA 4 n M MAN 4 J 4 MAN Y 665 MAN 4 n M MAN 5 J 5 MAN Y 666 MAN 5 n N NAG 1 K 1 NAG Y 669 NAG 5 n N NAG 2 K 2 NAG Y 670 NAG 5 n O NAG 1 L 1 NAG Y 675 NAG 5 n O NAG 2 L 2 NAG Y 676 NAG 4 n P NAG 1 M 1 NAG Z 662 NAG 4 n P NAG 2 M 2 NAG Z 663 NAG 4 n P BMA 3 M 3 BMA Z 664 BMA 4 n P MAN 4 M 4 MAN Z 665 MAN 4 n P MAN 5 M 5 MAN Z 666 MAN 5 n Q NAG 1 N 1 NAG Z 675 NAG 5 n Q NAG 2 N 2 NAG Z 676 NAG 5 n R NAG 1 O 1 NAG Z 678 NAG 5 n R NAG 2 O 2 NAG Z 679 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 95 A CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 23 B CYS 23 1_555 B SG CYS 93 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 22 C CYS 22 1_555 C SG CYS 95 C CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 23 D CYS 23 1_555 D SG CYS 93 D CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf5 E SG CYS 22 E CYS 22 1_555 E SG CYS 95 E CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 F SG CYS 23 F CYS 23 1_555 F SG CYS 93 F CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf7 G SG CYS 22 X CYS 54 1_555 G SG CYS 42 X CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 G SG CYS 195 X CYS 228 1_555 G SG CYS 224 X CYS 257 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 G SG CYS 205 X CYS 238 1_555 G SG CYS 216 X CYS 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf10 G SG CYS 273 X CYS 306 1_555 G SG CYS 307 X CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf11 G SG CYS 352 X CYS 378 1_555 G SG CYS 410 X CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf12 G SG CYS 359 X CYS 385 1_555 G SG CYS 383 X CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 G SG CYS 466 X CYS 501 1_555 G SG CYS 563 X CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 G SG CYS 556 X CYS 598 1_555 G SG CYS 562 X CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf15 H SG CYS 22 Y CYS 54 1_555 H SG CYS 42 Y CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf16 H SG CYS 195 Y CYS 228 1_555 H SG CYS 224 Y CYS 257 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 H SG CYS 205 Y CYS 238 1_555 H SG CYS 216 Y CYS 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf18 H SG CYS 273 Y CYS 306 1_555 H SG CYS 307 Y CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf19 H SG CYS 352 Y CYS 378 1_555 H SG CYS 410 Y CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 H SG CYS 359 Y CYS 385 1_555 H SG CYS 383 Y CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 H SG CYS 556 Y CYS 598 1_555 H SG CYS 562 Y CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf22 I SG CYS 22 Z CYS 54 1_555 I SG CYS 42 Z CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 I SG CYS 195 Z CYS 228 1_555 I SG CYS 224 Z CYS 257 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 I SG CYS 205 Z CYS 238 1_555 I SG CYS 216 Z CYS 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 273 Z CYS 306 1_555 I SG CYS 307 Z CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 352 Z CYS 378 1_555 I SG CYS 410 Z CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 359 Z CYS 385 1_555 I SG CYS 383 Z CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 556 Z CYS 598 1_555 I SG CYS 562 Z CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? covale ? covale1 G ND2 ASN 56 X ASN 88 1_555 J C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 G ND2 ASN 211 X ASN 244 1_555 S C1 NAG . X NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale3 G ND2 ASN 218 X ASN 251 1_555 T C1 NAG . X NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale4 G ND2 ASN 239 X ASN 272 1_555 K C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale5 G ND2 ASN 315 X ASN 339 1_555 Y C1 NAG . X NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 G ND2 ASN 360 X ASN 386 1_555 U C1 NAG . X NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 G ND2 ASN 409 X ASN 444 1_555 V C1 NAG . X NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 G ND2 ASN 413 X ASN 448 1_555 W C1 NAG . X NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 G ND2 ASN 569 X ASN 611 1_555 X C1 NAG . X NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 G ND2 ASN 583 X ASN 625 1_555 L C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale11 H ND2 ASN 56 Y ASN 88 1_555 M C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 H ND2 ASN 211 Y ASN 244 1_555 Z C1 NAG . Y NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale13 H ND2 ASN 218 Y ASN 251 1_555 AA C1 NAG . Y NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 H ND2 ASN 239 Y ASN 272 1_555 N C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale15 H ND2 ASN 315 Y ASN 339 1_555 FA C1 NAG . Y NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 H ND2 ASN 360 Y ASN 386 1_555 BA C1 NAG . Y NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 H ND2 ASN 409 Y ASN 444 1_555 CA C1 NAG . Y NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale18 H ND2 ASN 413 Y ASN 448 1_555 DA C1 NAG . Y NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 H ND2 ASN 569 Y ASN 611 1_555 EA C1 NAG . Y NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale20 H ND2 ASN 583 Y ASN 625 1_555 O C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale21 I ND2 ASN 56 Z ASN 88 1_555 P C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale22 I ND2 ASN 211 Z ASN 244 1_555 GA C1 NAG . Z NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale23 I ND2 ASN 218 Z ASN 251 1_555 HA C1 NAG . Z NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale24 I ND2 ASN 239 Z ASN 272 1_555 R C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 I ND2 ASN 315 Z ASN 339 1_555 MA C1 NAG . Z NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale26 I ND2 ASN 360 Z ASN 386 1_555 IA C1 NAG . Z NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale27 I ND2 ASN 409 Z ASN 444 1_555 JA C1 NAG . Z NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale28 I ND2 ASN 413 Z ASN 448 1_555 KA C1 NAG . Z NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 I ND2 ASN 569 Z ASN 611 1_555 LA C1 NAG . Z NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 I ND2 ASN 583 Z ASN 625 1_555 Q C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 J O4 NAG . G NAG 1 1_555 J C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale32 J O4 NAG . G NAG 2 1_555 J C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale33 J O3 BMA . G BMA 3 1_555 J C1 MAN . G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 J O6 BMA . G BMA 3 1_555 J C1 MAN . G MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 K O4 NAG . H NAG 1 1_555 K C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale36 L O4 NAG . I NAG 1 1_555 L C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale37 M O4 NAG . J NAG 1 1_555 M C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale38 M O4 NAG . J NAG 2 1_555 M C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale39 M O3 BMA . J BMA 3 1_555 M C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale40 M O6 BMA . J BMA 3 1_555 M C1 MAN . J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale41 N O4 NAG . K NAG 1 1_555 N C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale42 O O4 NAG . L NAG 1 1_555 O C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale43 P O4 NAG . M NAG 1 1_555 P C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale44 P O4 NAG . M NAG 2 1_555 P C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale45 P O3 BMA . M BMA 3 1_555 P C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale46 P O6 BMA . M BMA 3 1_555 P C1 MAN . M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale47 Q O4 NAG . N NAG 1 1_555 Q C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale48 R O4 NAG . O NAG 1 1_555 R C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8GPG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 6 NAG X 1 701 667 NAG NAG . T 6 NAG X 1 702 668 NAG NAG . U 6 NAG X 1 703 671 NAG NAG . V 6 NAG X 1 704 672 NAG NAG . W 6 NAG X 1 705 673 NAG NAG . X 6 NAG X 1 706 674 NAG NAG . Y 6 NAG X 1 707 677 NAG NAG . Z 6 NAG Y 1 701 667 NAG NAG . AA 6 NAG Y 1 702 668 NAG NAG . BA 6 NAG Y 1 703 671 NAG NAG . CA 6 NAG Y 1 704 672 NAG NAG . DA 6 NAG Y 1 705 673 NAG NAG . EA 6 NAG Y 1 706 674 NAG NAG . FA 6 NAG Y 1 707 677 NAG NAG . GA 6 NAG Z 1 701 667 NAG NAG . HA 6 NAG Z 1 702 668 NAG NAG . IA 6 NAG Z 1 703 671 NAG NAG . JA 6 NAG Z 1 704 672 NAG NAG . KA 6 NAG Z 1 705 673 NAG NAG . LA 6 NAG Z 1 706 674 NAG NAG . MA 6 NAG Z 1 707 677 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . GA 6 112.761 172.475 156.585 1 70.6 ? C1 NAG 701 Z 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . GA 6 111.646 171.571 157.119 1 70.6 ? C2 NAG 701 Z 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . GA 6 111.359 170.442 156.133 1 70.6 ? C3 NAG 701 Z 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . GA 6 111.083 171 154.745 1 70.6 ? C4 NAG 701 Z 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . GA 6 112.237 171.895 154.311 1 70.6 ? C5 NAG 701 Z 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . GA 6 112 172.56 152.976 1 70.6 ? C6 NAG 701 Z 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . GA 6 111.109 170.757 159.371 1 70.6 ? C7 NAG 701 Z 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . GA 6 111.661 170.197 160.644 1 70.6 ? C8 NAG 701 Z 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . GA 6 112.004 171.029 158.418 1 70.6 ? N2 NAG 701 Z 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . GA 6 110.238 169.69 156.584 1 70.6 ? O3 NAG 701 Z 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . GA 6 110.933 169.937 153.812 1 70.6 ? O4 NAG 701 Z 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . GA 6 112.417 172.945 155.273 1 70.6 ? O5 NAG 701 Z 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . GA 6 111.234 171.729 152.114 1 70.6 ? O6 NAG 701 Z 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . GA 6 109.91 170.955 159.213 1 70.6 ? O7 NAG 701 Z 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 296 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 14 #