data_8GTP # _model_server_result.job_id E5wLTuTzggu0C5CgHeTC8g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:07:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8gtp # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"PA","auth_seq_id":1404}' # _entry.id 8GTP # _exptl.entry_id 8GTP _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 33 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N ? 5 CB N N ? 5 DB N N ? 5 EB N N ? 5 FB N N ? 5 GB N N ? 5 HB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 D 1 NAG A 1406 NAG 4 n J NAG 2 D 2 NAG A 1407 NAG 4 n K NAG 1 E 1 NAG A 1408 NAG 4 n K NAG 2 E 2 NAG A 1409 NAG 4 n L NAG 1 F 1 NAG A 1414 NAG 4 n L NAG 2 F 2 NAG A 1415 NAG 4 n M NAG 1 G 1 NAG A 1416 NAG 4 n M NAG 2 G 2 NAG A 1417 NAG 4 n N NAG 1 K 1 NAG A 1420 NAG 4 n N NAG 2 K 2 NAG A 1421 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG A 1422 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG A 1423 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG B 1406 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG B 1407 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1408 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1409 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG B 1414 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG B 1415 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 1416 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 1417 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG B 1420 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG B 1421 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG B 1422 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG B 1423 NAG 4 n V NAG 1 V 1 NAG C 1406 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG C 1407 NAG 4 n W NAG 1 W 1 NAG C 1408 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG C 1409 NAG 4 n X NAG 1 X 1 NAG C 1414 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG C 1415 NAG 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 1416 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 1417 NAG 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1420 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1421 NAG 4 n AA NAG 1 a 1 NAG C 1422 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG C 1423 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 129 A CYS 131 1_555 A SG CYS 164 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 289 A CYS 291 1_555 A SG CYS 299 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 334 A CYS 336 1_555 A SG CYS 359 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 377 A CYS 379 1_555 A SG CYS 430 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 389 A CYS 391 1_555 A SG CYS 523 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 478 A CYS 480 1_555 A SG CYS 486 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 536 A CYS 538 1_555 A SG CYS 588 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 615 A CYS 617 1_555 A SG CYS 647 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 660 A CYS 662 1_555 A SG CYS 669 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 736 A CYS 738 1_555 A SG CYS 758 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 741 A CYS 743 1_555 A SG CYS 747 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1030 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1041 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1080 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1124 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 129 B CYS 131 1_555 B SG CYS 164 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 289 B CYS 291 1_555 B SG CYS 299 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 334 B CYS 336 1_555 B SG CYS 359 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 377 B CYS 379 1_555 B SG CYS 430 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 389 B CYS 391 1_555 B SG CYS 523 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 478 B CYS 480 1_555 B SG CYS 486 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 536 B CYS 538 1_555 B SG CYS 588 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.802 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 615 B CYS 617 1_555 B SG CYS 647 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 660 B CYS 662 1_555 B SG CYS 669 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 736 B CYS 738 1_555 B SG CYS 758 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 741 B CYS 743 1_555 B SG CYS 747 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1030 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1041 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1080 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1124 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 129 C CYS 131 1_555 C SG CYS 164 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 289 C CYS 291 1_555 C SG CYS 299 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 334 C CYS 336 1_555 C SG CYS 359 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 377 C CYS 379 1_555 C SG CYS 430 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 389 C CYS 391 1_555 C SG CYS 523 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 478 C CYS 480 1_555 C SG CYS 486 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 536 C CYS 538 1_555 C SG CYS 588 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.889 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 615 C CYS 617 1_555 C SG CYS 647 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 660 C CYS 662 1_555 C SG CYS 669 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 736 C CYS 738 1_555 C SG CYS 758 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 741 C CYS 743 1_555 C SG CYS 747 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1030 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1041 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 1080 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1124 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 22 H CYS 22 1_555 D SG CYS 95 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf41 E SG CYS 21 L CYS 22 1_555 E SG CYS 88 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 22 I CYS 22 1_555 F SG CYS 95 I CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf43 G SG CYS 21 M CYS 22 1_555 G SG CYS 88 M CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? disulf ? disulf44 H SG CYS 22 J CYS 22 1_555 H SG CYS 95 J CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf45 I SG CYS 21 N CYS 22 1_555 I SG CYS 88 N CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 120 A ASN 122 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 163 A ASN 165 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 232 A ASN 234 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 280 A ASN 282 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 329 A ASN 331 1_555 J C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 341 A ASN 343 1_555 K C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 601 A ASN 603 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 614 A ASN 616 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 655 A ASN 657 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 707 A ASN 709 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 715 A ASN 717 1_555 L C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 799 A ASN 801 1_555 M C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1072 A ASN 1074 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1096 A ASN 1098 1_555 N C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1132 A ASN 1134 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 120 B ASN 122 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 163 B ASN 165 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 232 B ASN 234 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 280 B ASN 282 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 329 B ASN 331 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 341 B ASN 343 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 601 B ASN 603 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 614 B ASN 616 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 655 B ASN 657 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 707 B ASN 709 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 715 B ASN 717 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 799 B ASN 801 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 1072 B ASN 1074 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 1096 B ASN 1098 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 1132 B ASN 1134 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 61 C ASN 61 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 120 C ASN 122 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 163 C ASN 165 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 232 C ASN 234 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 280 C ASN 282 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 329 C ASN 331 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.547 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 341 C ASN 343 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 601 C ASN 603 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 614 C ASN 616 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 655 C ASN 657 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 707 C ASN 709 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 715 C ASN 717 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 799 C ASN 801 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 1072 C ASN 1074 1_555 GB C1 NAG . C NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 1096 C ASN 1098 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 1132 C ASN 1134 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale49 J O4 NAG . D NAG 1 1_555 J C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale50 K O4 NAG . E NAG 1 1_555 K C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale51 L O4 NAG . F NAG 1 1_555 L C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale52 M O4 NAG . G NAG 1 1_555 M C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale53 N O4 NAG . K NAG 1 1_555 N C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale54 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale55 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale56 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale57 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale58 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale59 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale60 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale61 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale62 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale63 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale64 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale65 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale66 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8GTP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code BA 5 NAG A 1 1401 1401 NAG NAG . CA 5 NAG A 1 1402 1402 NAG NAG . DA 5 NAG A 1 1403 1403 NAG NAG . EA 5 NAG A 1 1404 1404 NAG NAG . FA 5 NAG A 1 1405 1405 NAG NAG . GA 5 NAG A 1 1406 1410 NAG NAG . HA 5 NAG A 1 1407 1411 NAG NAG . IA 5 NAG A 1 1408 1412 NAG NAG . JA 5 NAG A 1 1409 1413 NAG NAG . KA 5 NAG A 1 1410 1418 NAG NAG . LA 5 NAG A 1 1411 1419 NAG NAG . MA 5 NAG B 1 1401 1401 NAG NAG . NA 5 NAG B 1 1402 1402 NAG NAG . OA 5 NAG B 1 1403 1403 NAG NAG . PA 5 NAG B 1 1404 1404 NAG NAG . QA 5 NAG B 1 1405 1405 NAG NAG . RA 5 NAG B 1 1406 1410 NAG NAG . SA 5 NAG B 1 1407 1411 NAG NAG . TA 5 NAG B 1 1408 1412 NAG NAG . UA 5 NAG B 1 1409 1413 NAG NAG . VA 5 NAG B 1 1410 1418 NAG NAG . WA 5 NAG B 1 1411 1419 NAG NAG . XA 5 NAG C 1 1401 1401 NAG NAG . YA 5 NAG C 1 1402 1402 NAG NAG . ZA 5 NAG C 1 1403 1403 NAG NAG . AB 5 NAG C 1 1404 1404 NAG NAG . BB 5 NAG C 1 1405 1405 NAG NAG . CB 5 NAG C 1 1406 1410 NAG NAG . DB 5 NAG C 1 1407 1411 NAG NAG . EB 5 NAG C 1 1408 1412 NAG NAG . FB 5 NAG C 1 1409 1413 NAG NAG . GB 5 NAG C 1 1410 1418 NAG NAG . HB 5 NAG C 1 1411 1419 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . PA 5 161.78 144.341 99.754 1 64.97 ? C1 NAG 1404 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . PA 5 161.451 145.023 98.435 1 64.97 ? C2 NAG 1404 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . PA 5 160.638 146.294 98.679 1 64.97 ? C3 NAG 1404 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . PA 5 159.411 146.009 99.54 1 64.97 ? C4 NAG 1404 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . PA 5 159.819 145.255 100.806 1 64.97 ? C5 NAG 1404 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . PA 5 158.641 144.785 101.62 1 64.97 ? C6 NAG 1404 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . PA 5 163.011 144.692 96.581 1 64.97 ? C7 NAG 1404 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . PA 5 164.296 145.127 95.948 1 64.97 ? C8 NAG 1404 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . PA 5 162.664 145.33 97.7 1 64.97 ? N2 NAG 1404 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . PA 5 160.26 146.814 97.411 1 64.97 ? O3 NAG 1404 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . PA 5 158.795 147.226 99.951 1 64.97 ? O4 NAG 1404 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . PA 5 160.575 144.081 100.47 1 64.97 ? O5 NAG 1404 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . PA 5 158.518 143.37 101.58 1 64.97 ? O6 NAG 1404 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . PA 5 162.318 143.804 96.101 1 64.97 ? O7 NAG 1404 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 32 _model_server_stats.query_time_ms 286 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #