data_8HLD # _model_server_result.job_id lpWmJ-DetlyGUHDtBV5XzA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 20:49:28' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8hld # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"IB","auth_seq_id":1404}' # _entry.id 8HLD # _exptl.entry_id 8HLD _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8HLD _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8HLD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N ? 5 CB N N ? 5 DB N N ? 5 EB N N ? 5 FB N N ? 5 GB N N ? 5 HB N N ? 5 IB N N ? 5 JB N N ? 5 KB N N ? 5 LB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 D 1 NAG A 1403 NAG 4 n J NAG 2 D 2 NAG A 1404 NAG 4 n K NAG 1 E 1 NAG A 1406 NAG 4 n K NAG 2 E 2 NAG A 1407 NAG 4 n L NAG 1 F 1 NAG A 1408 NAG 4 n L NAG 2 F 2 NAG A 1409 NAG 4 n M NAG 1 G 1 NAG A 1411 NAG 4 n M NAG 2 G 2 NAG A 1412 NAG 4 n N NAG 1 K 1 NAG A 1413 NAG 4 n N NAG 2 K 2 NAG A 1414 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG A 1419 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG A 1420 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG A 1421 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG A 1422 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1423 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1424 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG A 1425 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG A 1426 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG A 1427 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG A 1428 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG B 1403 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG B 1404 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG B 1406 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG B 1407 NAG 4 n V NAG 1 V 1 NAG B 1408 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG B 1409 NAG 4 n W NAG 1 W 1 NAG B 1411 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG B 1412 NAG 4 n X NAG 1 X 1 NAG B 1413 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG B 1414 NAG 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG B 1418 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG B 1419 NAG 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG B 1420 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG B 1421 NAG 4 n AA NAG 1 a 1 NAG B 1422 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG B 1423 NAG 4 n BA NAG 1 b 1 NAG B 1426 NAG 4 n BA NAG 2 b 2 NAG B 1427 NAG 4 n CA NAG 1 c 1 NAG B 1428 NAG 4 n CA NAG 2 c 2 NAG B 1429 NAG 4 n DA NAG 1 d 1 NAG C 1403 NAG 4 n DA NAG 2 d 2 NAG C 1404 NAG 4 n EA NAG 1 e 1 NAG C 1406 NAG 4 n EA NAG 2 e 2 NAG C 1407 NAG 4 n FA NAG 1 f 1 NAG C 1408 NAG 4 n FA NAG 2 f 2 NAG C 1409 NAG 4 n GA NAG 1 g 1 NAG C 1411 NAG 4 n GA NAG 2 g 2 NAG C 1412 NAG 4 n HA NAG 1 h 1 NAG C 1413 NAG 4 n HA NAG 2 h 2 NAG C 1414 NAG 4 n IA NAG 1 i 1 NAG C 1418 NAG 4 n IA NAG 2 i 2 NAG C 1419 NAG 4 n JA NAG 1 j 1 NAG C 1420 NAG 4 n JA NAG 2 j 2 NAG C 1421 NAG 4 n KA NAG 1 k 1 NAG C 1422 NAG 4 n KA NAG 2 k 2 NAG C 1423 NAG 4 n LA NAG 1 l 1 NAG C 1424 NAG 4 n LA NAG 2 l 2 NAG C 1425 NAG 4 n MA NAG 1 m 1 NAG C 1426 NAG 4 n MA NAG 2 m 2 NAG C 1427 NAG 4 n NA NAG 1 n 1 NAG C 1428 NAG 4 n NA NAG 2 n 2 NAG C 1429 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 A SG CYS 136 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 131 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 336 A CYS 336 1_555 A SG CYS 361 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 A SG CYS 432 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 391 A CYS 391 1_555 A SG CYS 525 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 480 A CYS 480 1_555 A SG CYS 488 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 538 A CYS 538 1_555 A SG CYS 590 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 617 A CYS 617 1_555 A SG CYS 649 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 662 A CYS 662 1_555 A SG CYS 671 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 738 A CYS 738 1_555 A SG CYS 760 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 743 A CYS 743 1_555 A SG CYS 749 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1043 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1082 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1126 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 15 B CYS 15 1_555 B SG CYS 136 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 131 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 379 B CYS 379 1_555 B SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 391 B CYS 391 1_555 B SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 480 B CYS 480 1_555 B SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 538 B CYS 538 1_555 B SG CYS 590 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 662 B CYS 662 1_555 B SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 738 B CYS 738 1_555 B SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 743 B CYS 743 1_555 B SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 15 C CYS 15 1_555 C SG CYS 136 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 131 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 336 C CYS 336 1_555 C SG CYS 361 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 379 C CYS 379 1_555 C SG CYS 432 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 391 C CYS 391 1_555 C SG CYS 525 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 480 C CYS 480 1_555 C SG CYS 488 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 617 C CYS 617 1_555 C SG CYS 649 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 662 C CYS 662 1_555 C SG CYS 671 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 738 C CYS 738 1_555 C SG CYS 760 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 743 C CYS 743 1_555 C SG CYS 749 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 1032 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1043 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 1082 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1126 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 39 H CYS 22 1_555 D SG CYS 113 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf39 D SG CYS 164 H CYS 147 1_555 D SG CYS 220 H CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf40 E SG CYS 38 L CYS 22 1_555 E SG CYS 103 L CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf41 E SG CYS 150 L CYS 134 1_555 E SG CYS 209 L CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 39 I CYS 22 1_555 F SG CYS 113 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf43 F SG CYS 164 I CYS 147 1_555 F SG CYS 220 I CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf44 G SG CYS 38 M CYS 22 1_555 G SG CYS 103 M CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf45 G SG CYS 150 M CYS 134 1_555 G SG CYS 209 M CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf46 H SG CYS 39 J CYS 22 1_555 H SG CYS 113 J CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf47 H SG CYS 164 J CYS 147 1_555 H SG CYS 220 J CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf48 I SG CYS 38 N CYS 22 1_555 I SG CYS 103 N CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf49 I SG CYS 150 N CYS 134 1_555 I SG CYS 209 N CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 17 A ASN 17 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 122 A ASN 122 1_555 J C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 149 A ASN 149 1_555 QA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 K C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 234 A ASN 234 1_555 L C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 282 A ASN 282 1_555 RA C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 331 A ASN 331 1_555 M C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 343 A ASN 343 1_555 N C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 603 A ASN 603 1_555 SA C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 616 A ASN 616 1_555 TA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 657 A ASN 657 1_555 UA C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 709 A ASN 709 1_555 VA C1 NAG . A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 717 A ASN 717 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 801 A ASN 801 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1074 A ASN 1074 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 1098 A ASN 1098 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 1134 A ASN 1134 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 17 B ASN 17 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 XA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 122 B ASN 122 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 149 B ASN 149 1_555 YA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 ZA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 331 B ASN 331 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 343 B ASN 343 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 603 B ASN 603 1_555 AB C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 616 B ASN 616 1_555 BB C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 657 B ASN 657 1_555 CB C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 709 B ASN 709 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 717 B ASN 717 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 B ND2 ASN 801 B ASN 801 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale34 B ND2 ASN 1074 B ASN 1074 1_555 DB C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale35 B ND2 ASN 1098 B ASN 1098 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale36 B ND2 ASN 1134 B ASN 1134 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 17 C ASN 17 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 61 C ASN 61 1_555 GB C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 122 C ASN 122 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 149 C ASN 149 1_555 HB C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 165 C ASN 165 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 234 C ASN 234 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 282 C ASN 282 1_555 IB C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 331 C ASN 331 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 343 C ASN 343 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 603 C ASN 603 1_555 JB C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 616 C ASN 616 1_555 KB C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 657 C ASN 657 1_555 LB C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale49 C ND2 ASN 709 C ASN 709 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale50 C ND2 ASN 717 C ASN 717 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale51 C ND2 ASN 801 C ASN 801 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale52 C ND2 ASN 1074 C ASN 1074 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale53 C ND2 ASN 1098 C ASN 1098 1_555 MA C1 NAG . m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale54 C ND2 ASN 1134 C ASN 1134 1_555 NA C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.555 ? covale ? covale55 J O4 NAG . D NAG 1 1_555 J C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 K O4 NAG . E NAG 1 1_555 K C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale57 L O4 NAG . F NAG 1 1_555 L C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale58 M O4 NAG . G NAG 1 1_555 M C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale59 N O4 NAG . K NAG 1 1_555 N C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale60 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale61 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale62 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale64 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale65 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale66 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale67 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale68 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale69 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale70 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale71 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale72 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale73 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale74 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale75 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale76 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale77 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale78 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale79 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale80 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale81 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale82 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale83 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale84 MA O4 NAG . m NAG 1 1_555 MA C1 NAG . m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale85 NA O4 NAG . n NAG 1 1_555 NA C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8HLD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code OA 5 NAG A 1 1401 1401 NAG NAG . PA 5 NAG A 1 1402 1402 NAG NAG . QA 5 NAG A 1 1403 1405 NAG NAG . RA 5 NAG A 1 1404 1410 NAG NAG . SA 5 NAG A 1 1405 1415 NAG NAG . TA 5 NAG A 1 1406 1416 NAG NAG . UA 5 NAG A 1 1407 1417 NAG NAG . VA 5 NAG A 1 1408 1418 NAG NAG . WA 5 NAG B 1 1401 1401 NAG NAG . XA 5 NAG B 1 1402 1402 NAG NAG . YA 5 NAG B 1 1403 1405 NAG NAG . ZA 5 NAG B 1 1404 1410 NAG NAG . AB 5 NAG B 1 1405 1415 NAG NAG . BB 5 NAG B 1 1406 1416 NAG NAG . CB 5 NAG B 1 1407 1417 NAG NAG . DB 5 NAG B 1 1408 1424 NAG NAG . EB 5 NAG B 1 1409 1425 NAG NAG . FB 5 NAG C 1 1401 1401 NAG NAG . GB 5 NAG C 1 1402 1402 NAG NAG . HB 5 NAG C 1 1403 1405 NAG NAG . IB 5 NAG C 1 1404 1410 NAG NAG . JB 5 NAG C 1 1405 1415 NAG NAG . KB 5 NAG C 1 1406 1416 NAG NAG . LB 5 NAG C 1 1407 1417 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . IB 5 186.952 132.543 134.647 1 181.29 ? C1 NAG 1404 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . IB 5 188.383 132.928 135.143 1 181.29 ? C2 NAG 1404 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . IB 5 189.08 131.756 135.862 1 181.29 ? C3 NAG 1404 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . IB 5 188.155 131.126 136.898 1 181.29 ? C4 NAG 1404 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . IB 5 186.794 130.794 136.282 1 181.29 ? C5 NAG 1404 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . IB 5 185.806 130.237 137.28 1 181.29 ? C6 NAG 1404 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . IB 5 189.815 133.305 132.992 1 181.29 ? C7 NAG 1404 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . IB 5 189.564 131.928 132.4 1 181.29 ? C8 NAG 1404 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . IB 5 189.252 133.638 134.188 1 181.29 ? N2 NAG 1404 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . IB 5 190.269 132.226 136.486 1 181.29 ? O3 NAG 1404 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . IB 5 188.737 129.931 137.405 1 181.29 ? O4 NAG 1404 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . IB 5 186.201 131.984 135.736 1 181.29 ? O5 NAG 1404 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . IB 5 184.495 130.195 136.738 1 181.29 ? O6 NAG 1404 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . IB 5 190.519 134.115 132.396 1 181.29 ? O7 NAG 1404 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 62 _model_server_stats.query_time_ms 252 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #