data_8I9D # _model_server_result.job_id '_Skyrgz0IXrlCImwpaGwuw' _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 08:34:57' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8i9d # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"IB","auth_seq_id":1408}' # _entry.id 8I9D # _exptl.entry_id 8I9D _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 28 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N ? 4 ZA N N ? 4 AB N N ? 4 BB N N ? 4 CB N N ? 4 DB N N ? 4 EB N N ? 4 FB N N ? 4 GB N N ? 4 HB N N ? 4 IB N N ? 4 JB N N ? 4 KB N N ? 4 LB N N ? 4 MB N N ? 4 NB N N ? 4 OB N N ? 4 PB N N ? 4 QB N N ? 4 RB N N ? 4 SB N N ? 4 TB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 1406 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 1407 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 1408 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 1409 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 1414 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 1415 NAG 3 n J NAG 1 J 1 NAG A 1416 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG A 1417 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG A 1418 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG A 1419 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG A 1420 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG A 1421 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG A 1422 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG A 1423 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG B 1406 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG B 1407 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG B 1408 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG B 1409 NAG 3 n P NAG 1 P 1 NAG B 1413 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG B 1414 NAG 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1415 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1416 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG B 1417 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG B 1418 NAG 3 n S NAG 1 S 1 NAG B 1419 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG B 1420 NAG 3 n T NAG 1 T 1 NAG B 1421 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG B 1422 NAG 3 n U NAG 1 U 1 NAG B 1423 NAG 3 n U NAG 2 U 2 NAG B 1424 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG C 1406 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG C 1407 NAG 3 n W NAG 1 W 1 NAG C 1408 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG C 1409 NAG 3 n X NAG 1 X 1 NAG C 1413 NAG 3 n X NAG 2 X 2 NAG C 1414 NAG 3 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 1415 NAG 3 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 1416 NAG 3 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1417 NAG 3 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1418 NAG 3 n AA NAG 1 a 1 NAG C 1419 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG C 1420 NAG 3 n BA NAG 1 b 1 NAG C 1421 NAG 3 n BA NAG 2 b 2 NAG C 1422 NAG 3 n CA NAG 1 c 1 NAG C 1423 NAG 3 n CA NAG 2 c 2 NAG C 1424 NAG 3 n DA NAG 1 d 1 NAG F 901 NAG 3 n DA NAG 2 d 2 NAG F 902 NAG 3 n EA NAG 1 e 1 NAG F 903 NAG 3 n EA NAG 2 e 2 NAG F 904 NAG 3 n FA NAG 1 f 1 NAG F 905 NAG 3 n FA NAG 2 f 2 NAG F 906 NAG 3 n GA NAG 1 g 1 NAG F 908 NAG 3 n GA NAG 2 g 2 NAG F 909 NAG 3 n HA NAG 1 h 1 NAG F 910 NAG 3 n HA NAG 2 h 2 NAG F 911 NAG 3 n IA NAG 1 i 1 NAG D 901 NAG 3 n IA NAG 2 i 2 NAG D 902 NAG 3 n JA NAG 1 j 1 NAG D 903 NAG 3 n JA NAG 2 j 2 NAG D 904 NAG 3 n KA NAG 1 k 1 NAG D 905 NAG 3 n KA NAG 2 k 2 NAG D 906 NAG 3 n LA NAG 1 l 1 NAG D 908 NAG 3 n LA NAG 2 l 2 NAG D 909 NAG 3 n MA NAG 1 m 1 NAG D 910 NAG 3 n MA NAG 2 m 2 NAG D 911 NAG 3 n NA NAG 1 n 1 NAG E 901 NAG 3 n NA NAG 2 n 2 NAG E 902 NAG 3 n OA NAG 1 o 1 NAG E 903 NAG 3 n OA NAG 2 o 2 NAG E 904 NAG 3 n PA NAG 1 p 1 NAG E 905 NAG 3 n PA NAG 2 p 2 NAG E 906 NAG 3 n QA NAG 1 q 1 NAG E 908 NAG 3 n QA NAG 2 q 2 NAG E 909 NAG 3 n RA NAG 1 r 1 NAG E 910 NAG 3 n RA NAG 2 r 2 NAG E 911 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 128 A CYS 131 1_555 A SG CYS 162 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 287 A CYS 291 1_555 A SG CYS 297 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 375 A CYS 379 1_555 A SG CYS 428 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 387 A CYS 391 1_555 A SG CYS 521 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 476 A CYS 480 1_555 A SG CYS 484 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 534 A CYS 538 1_555 A SG CYS 586 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 613 A CYS 617 1_555 A SG CYS 645 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 658 A CYS 662 1_555 A SG CYS 667 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 734 A CYS 738 1_555 A SG CYS 756 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 739 A CYS 743 1_555 A SG CYS 745 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1028 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1039 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1078 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1122 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 128 B CYS 131 1_555 B SG CYS 162 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 287 B CYS 291 1_555 B SG CYS 297 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 375 B CYS 379 1_555 B SG CYS 428 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 387 B CYS 391 1_555 B SG CYS 521 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 476 B CYS 480 1_555 B SG CYS 484 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 534 B CYS 538 1_555 B SG CYS 586 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 613 B CYS 617 1_555 B SG CYS 645 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 658 B CYS 662 1_555 B SG CYS 667 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 734 B CYS 738 1_555 B SG CYS 756 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 739 B CYS 743 1_555 B SG CYS 745 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 1028 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1039 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 1078 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1122 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 128 C CYS 131 1_555 C SG CYS 162 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 287 C CYS 291 1_555 C SG CYS 297 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 375 C CYS 379 1_555 C SG CYS 428 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 387 C CYS 391 1_555 C SG CYS 521 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 476 C CYS 480 1_555 C SG CYS 484 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 534 C CYS 538 1_555 C SG CYS 586 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 613 C CYS 617 1_555 C SG CYS 645 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 658 C CYS 662 1_555 C SG CYS 667 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 734 C CYS 738 1_555 C SG CYS 756 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 739 C CYS 743 1_555 C SG CYS 745 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 1028 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1039 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 1078 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1122 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 134 F CYS 133 1_555 D SG CYS 142 F CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 345 F CYS 344 1_555 D SG CYS 362 F CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 E SG CYS 134 D CYS 133 1_555 E SG CYS 142 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf40 E SG CYS 345 D CYS 344 1_555 E SG CYS 362 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf41 F SG CYS 134 E CYS 133 1_555 F SG CYS 142 E CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 345 E CYS 344 1_555 F SG CYS 362 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 A ASN 61 1_555 SA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 119 A ASN 122 1_555 TA C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 161 A ASN 165 1_555 UA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 230 A ASN 234 1_555 VA C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 278 A ASN 282 1_555 WA C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 327 A ASN 331 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 339 A ASN 343 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 599 A ASN 603 1_555 XA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 612 A ASN 616 1_555 YA C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 653 A ASN 657 1_555 ZA C1 NAG . A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 705 A ASN 709 1_555 AB C1 NAG . A NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 713 A ASN 717 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 797 A ASN 801 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1070 A ASN 1074 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1094 A ASN 1098 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1130 A ASN 1134 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 58 B ASN 61 1_555 BB C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 119 B ASN 122 1_555 CB C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 161 B ASN 165 1_555 DB C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 230 B ASN 234 1_555 EB C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 278 B ASN 282 1_555 FB C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 327 B ASN 331 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 339 B ASN 343 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 599 B ASN 603 1_555 GB C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 612 B ASN 616 1_555 HB C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 653 B ASN 657 1_555 IB C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 705 B ASN 709 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 713 B ASN 717 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 797 B ASN 801 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 1070 B ASN 1074 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 1094 B ASN 1098 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 1130 B ASN 1134 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 58 C ASN 61 1_555 JB C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 119 C ASN 122 1_555 KB C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 161 C ASN 165 1_555 LB C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 230 C ASN 234 1_555 MB C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 278 C ASN 282 1_555 NB C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 327 C ASN 331 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 339 C ASN 343 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 599 C ASN 603 1_555 OB C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 612 C ASN 616 1_555 PB C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 653 C ASN 657 1_555 QB C1 NAG . C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 705 C ASN 709 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 713 C ASN 717 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 797 C ASN 801 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 1070 C ASN 1074 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 1094 C ASN 1098 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 1130 C ASN 1134 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale49 D ND2 ASN 54 F ASN 53 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale50 D ND2 ASN 91 F ASN 90 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale51 D ND2 ASN 104 F ASN 103 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale52 D ND2 ASN 323 F ASN 322 1_555 RB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale53 D ND2 ASN 433 F ASN 432 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale54 D ND2 ASN 547 F ASN 546 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale55 E ND2 ASN 54 D ASN 53 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale56 E ND2 ASN 91 D ASN 90 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale57 E ND2 ASN 104 D ASN 103 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale58 E ND2 ASN 323 D ASN 322 1_555 SB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale59 E ND2 ASN 433 D ASN 432 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale60 E ND2 ASN 547 D ASN 546 1_555 MA C1 NAG . m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale61 F ND2 ASN 54 E ASN 53 1_555 NA C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale62 F ND2 ASN 91 E ASN 90 1_555 OA C1 NAG . o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale63 F ND2 ASN 104 E ASN 103 1_555 PA C1 NAG . p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale64 F ND2 ASN 323 E ASN 322 1_555 TB C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale65 F ND2 ASN 433 E ASN 432 1_555 QA C1 NAG . q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale66 F ND2 ASN 547 E ASN 546 1_555 RA C1 NAG . r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale67 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale68 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale69 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale70 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale71 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale72 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale73 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale74 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale75 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale76 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale77 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale78 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale79 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale80 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale81 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale82 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale83 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale84 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale85 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale86 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale87 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale88 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale89 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale90 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale91 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale92 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale93 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale94 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale95 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale96 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale97 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale98 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale99 MA O4 NAG . m NAG 1 1_555 MA C1 NAG . m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale100 NA O4 NAG . n NAG 1 1_555 NA C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale101 OA O4 NAG . o NAG 1 1_555 OA C1 NAG . o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale102 PA O4 NAG . p NAG 1 1_555 PA C1 NAG . p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale103 QA O4 NAG . q NAG 1 1_555 QA C1 NAG . q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale104 RA O4 NAG . r NAG 1 1_555 RA C1 NAG . r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8I9D _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code SA 4 NAG A 1 1401 1401 NAG NAG . TA 4 NAG A 1 1402 1402 NAG NAG . UA 4 NAG A 1 1403 1403 NAG NAG . VA 4 NAG A 1 1404 1404 NAG NAG . WA 4 NAG A 1 1405 1405 NAG NAG . XA 4 NAG A 1 1406 1410 NAG NAG . YA 4 NAG A 1 1407 1411 NAG NAG . ZA 4 NAG A 1 1408 1412 NAG NAG . AB 4 NAG A 1 1409 1413 NAG NAG . BB 4 NAG B 1 1401 1401 NAG NAG . CB 4 NAG B 1 1402 1402 NAG NAG . DB 4 NAG B 1 1403 1403 NAG NAG . EB 4 NAG B 1 1404 1404 NAG NAG . FB 4 NAG B 1 1405 1405 NAG NAG . GB 4 NAG B 1 1406 1410 NAG NAG . HB 4 NAG B 1 1407 1411 NAG NAG . IB 4 NAG B 1 1408 1412 NAG NAG . JB 4 NAG C 1 1401 1401 NAG NAG . KB 4 NAG C 1 1402 1402 NAG NAG . LB 4 NAG C 1 1403 1403 NAG NAG . MB 4 NAG C 1 1404 1404 NAG NAG . NB 4 NAG C 1 1405 1405 NAG NAG . OB 4 NAG C 1 1406 1410 NAG NAG . PB 4 NAG C 1 1407 1411 NAG NAG . QB 4 NAG C 1 1408 1412 NAG NAG . RB 4 NAG F 1 701 907 NAG NAG . SB 4 NAG D 1 701 907 NAG NAG . TB 4 NAG E 1 701 907 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . IB 4 198.173 152.181 179.147 1 64.52 ? C1 NAG 1408 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . IB 4 199.406 153.006 178.76 1 64.52 ? C2 NAG 1408 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . IB 4 200.291 152.23 177.787 1 64.52 ? C3 NAG 1408 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . IB 4 200.611 150.847 178.34 1 64.52 ? C4 NAG 1408 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . IB 4 199.317 150.126 178.683 1 64.52 ? C5 NAG 1408 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . IB 4 199.542 148.762 179.293 1 64.52 ? C6 NAG 1408 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . IB 4 199.395 155.46 178.659 1 64.52 ? C7 NAG 1408 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . IB 4 198.886 156.665 177.932 1 64.52 ? C8 NAG 1408 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . IB 4 199.004 154.277 178.178 1 64.52 ? N2 NAG 1408 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . IB 4 201.498 152.951 177.562 1 64.52 ? O3 NAG 1408 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . IB 4 201.338 150.086 177.385 1 64.52 ? O4 NAG 1408 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . IB 4 198.585 150.901 179.643 1 64.52 ? O5 NAG 1408 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . IB 4 199.76 147.779 178.29 1 64.52 ? O6 NAG 1408 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . IB 4 200.122 155.554 179.64 1 64.52 ? O7 NAG 1408 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 30 _model_server_stats.query_time_ms 301 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #