data_8IOE # _model_server_result.job_id pptZKV7YjzitQz3XpcoNpA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-20 00:30:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8ioe # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":802}' # _entry.id 8IOE # _exptl.entry_id 8IOE _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8IOE _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8IOE _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 N N N ? 3 P N N ? 3 R N N ? 3 T N N ? 3 V N N ? 3 X N N ? 3 Z N N ? 3 BA N N ? 3 DA N N ? 3 FA N N ? 3 HA N N ? 3 JA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 178 A ASP 178 1_555 N MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 211 A ASN 211 1_555 N MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc3 A O TYR 213 A TYR 213 1_555 N MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc4 M O2A TPP . A TPP 801 1_555 N MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc5 M O2B TPP . A TPP 801 1_555 N MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc6 M O3B TPP . A TPP 801 1_555 N MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASP 178 B ASP 178 1_555 P MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? metalc ? metalc8 B OD1 ASN 211 B ASN 211 1_555 P MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc9 B O TYR 213 B TYR 213 1_555 P MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? metalc ? metalc10 O O1A TPP . B TPP 801 1_555 P MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc11 O O1B TPP . B TPP 801 1_555 P MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc12 C OD1 ASP 178 C ASP 178 1_555 R MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? metalc ? metalc13 C OD1 ASN 211 C ASN 211 1_555 R MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc14 C O TYR 213 C TYR 213 1_555 R MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc15 Q O2A TPP . C TPP 801 1_555 R MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? metalc ? metalc16 Q O2B TPP . C TPP 801 1_555 R MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc17 Q O3B TPP . C TPP 801 1_555 R MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 178 D ASP 178 1_555 T MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? metalc ? metalc19 D OD2 ASP 178 D ASP 178 1_555 T MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc20 D OD1 ASN 211 D ASN 211 1_555 T MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc21 D O TYR 213 D TYR 213 1_555 T MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? metalc ? metalc22 S O1A TPP . D TPP 801 1_555 T MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc23 S O2B TPP . D TPP 801 1_555 T MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? metalc ? metalc24 E OD1 ASN 211 E ASN 211 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc ? metalc25 E O TYR 213 E TYR 213 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc26 U O2A TPP . E TPP 801 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc27 U O2B TPP . E TPP 801 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc28 U O3B TPP . E TPP 801 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc29 F OD1 ASP 178 F ASP 178 1_555 X MG MG . F MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.814 ? metalc ? metalc30 F OD1 ASN 211 F ASN 211 1_555 X MG MG . F MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc31 F O TYR 213 F TYR 213 1_555 X MG MG . F MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc32 W O1A TPP . F TPP 801 1_555 X MG MG . F MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc33 W O1B TPP . F TPP 801 1_555 X MG MG . F MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? metalc ? metalc34 G OD1 ASP 178 G ASP 178 1_555 Z MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc35 G OD1 ASN 211 G ASN 211 1_555 Z MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? metalc ? metalc36 G O TYR 213 G TYR 213 1_555 Z MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc37 Y O2A TPP . G TPP 801 1_555 Z MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc38 Y O2B TPP . G TPP 801 1_555 Z MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.69 ? metalc ? metalc39 Y O3B TPP . G TPP 801 1_555 Z MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc40 H OD1 ASP 178 H ASP 178 1_555 BA MG MG . H MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? metalc ? metalc41 H OD1 ASN 211 H ASN 211 1_555 BA MG MG . H MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc42 H O TYR 213 H TYR 213 1_555 BA MG MG . H MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc43 AA O1A TPP . H TPP 801 1_555 BA MG MG . H MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc44 AA O1B TPP . H TPP 801 1_555 BA MG MG . H MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc45 I OD1 ASP 178 I ASP 178 1_555 DA MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc46 I OD1 ASN 211 I ASN 211 1_555 DA MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc47 I O TYR 213 I TYR 213 1_555 DA MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? metalc ? metalc48 CA O2A TPP . I TPP 801 1_555 DA MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc49 CA O2B TPP . I TPP 801 1_555 DA MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc50 J OD1 ASN 211 J ASN 211 1_555 FA MG MG . J MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc51 J O TYR 213 J TYR 213 1_555 FA MG MG . J MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc52 EA O1A TPP . J TPP 801 1_555 FA MG MG . J MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc53 EA O1B TPP . J TPP 801 1_555 FA MG MG . J MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc54 EA O2B TPP . J TPP 801 1_555 FA MG MG . J MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc55 K OD1 ASP 178 K ASP 178 1_555 HA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? metalc ? metalc56 K OD1 ASN 211 K ASN 211 1_555 HA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc57 K O TYR 213 K TYR 213 1_555 HA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? metalc ? metalc58 GA O2A TPP . K TPP 801 1_555 HA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc59 GA O2B TPP . K TPP 801 1_555 HA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc60 L OD1 ASP 178 L ASP 178 1_555 JA MG MG . L MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.949 ? metalc ? metalc61 L OD1 ASN 211 L ASN 211 1_555 JA MG MG . L MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc62 L O TYR 213 L TYR 213 1_555 JA MG MG . L MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc63 IA O1A TPP . L TPP 801 1_555 JA MG MG . L MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? metalc ? metalc64 IA O1B TPP . L TPP 801 1_555 JA MG MG . L MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc65 IA O2B TPP . L TPP 801 1_555 JA MG MG . L MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8IOE _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 2 TPP A 1 801 828 TPP TPP . N 3 MG A 1 802 902 MG MG . O 2 TPP B 1 801 827 TPP TPP . P 3 MG B 1 802 902 MG MG . Q 2 TPP C 1 801 828 TPP TPP . R 3 MG C 1 802 902 MG MG . S 2 TPP D 1 801 827 TPP TPP . T 3 MG D 1 802 902 MG MG . U 2 TPP E 1 801 828 TPP TPP . V 3 MG E 1 802 902 MG MG . W 2 TPP F 1 801 827 TPP TPP . X 3 MG F 1 802 902 MG MG . Y 2 TPP G 1 801 828 TPP TPP . Z 3 MG G 1 802 902 MG MG . AA 2 TPP H 1 801 827 TPP TPP . BA 3 MG H 1 802 902 MG MG . CA 2 TPP I 1 801 827 TPP TPP . DA 3 MG I 1 802 902 MG MG . EA 2 TPP J 1 801 828 TPP TPP . FA 3 MG J 1 802 902 MG MG . GA 2 TPP K 1 801 827 TPP TPP . HA 3 MG K 1 802 902 MG MG . IA 2 TPP L 1 801 828 TPP TPP . JA 3 MG L 1 802 902 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id X _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 190.004 _atom_site.Cartn_y 85.419 _atom_site.Cartn_z 141.654 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 176.16 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 802 _atom_site.auth_asym_id F _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 24 _model_server_stats.create_model_time_ms 83 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #