data_8J7B
#
_model_server_result.job_id            xWJTDvEJE6AZNgTnmAx0Vg 
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_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          8j7b 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"YB","auth_seq_id":607}' 
#
_entry.id    8J7B 
#
_exptl.entry_id    8J7B 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              907.472 
_entity.id                          17 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLOROPHYLL B' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8J7B 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8J7B 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      16 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 17 Q N N 
? 17 V N N 
? 17 GA N N 
? 17 HA N N 
? 17 JA N N 
? 17 NA N N 
? 17 QA N N 
? 17 ZA N N 
? 17 NB N N 
? 17 RB N N 
? 17 UB N N 
? 17 YB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O TRP 48 1 TRP 48 1_555 Q MG CHL . 1 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 87 1 GLU 87 1_555 R MG CLA . 1 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 153 1 GLU 153 1_555 X MG CLA . 1 CLA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? 
metalc ? metalc4 Z MG CLA . 1 CLA 610 1_555 EA O3 LHG . 1 LHG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc5 Z MG CLA . 1 CLA 610 1_555 EA O4 LHG . 1 LHG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? 
metalc ? metalc6 B O TRP 55 2 TRP 55 1_555 JA MG CHL . 2 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 94 2 GLU 94 1_555 PA MG CLA . 2 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 168 2 ASP 168 1_555 HA MG CHL . 2 CHL 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? 
metalc ? metalc9 B OE1 GLN 226 2 GLN 226 1_555 LA MG CLA . 2 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? 
metalc ? metalc10 VA MG CLA . 2 CLA 610 1_555 UA O5 LHG . 2 LHG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc11 D O TRP 57 4 TRP 57 1_555 PB MG CLA . 4 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc12 D OE2 GLU 96 4 GLU 96 1_555 OB MG CLA . 4 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? 
metalc ? metalc13 D OE1 GLU 154 4 GLU 154 1_555 SB MG CLA . 4 CLA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc14 D OD2 ASP 170 4 ASP 170 1_555 RB MG CHL . 4 CHL 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? 
metalc ? metalc15 E OE1 GLN 121 A GLN 121 1_555 VC MG CLA . A CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? 
metalc ? metalc16 E O THR 495 A THR 495 1_555 IE MG CLA . A CLA 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc17 ED MG CLA . A CLA 845 1_555 JD O4 LHG . A LHG 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? 
metalc ? metalc18 F OE1 GLN 53 B GLN 53 1_555 MF MG CLA . B CLA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc19 F OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 YE MG CLA . B CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc20 CF MG CLA . B CLA 841 1_555 LF O4 LHG . B LHG 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc21 J O ASN 141 F ASN 141 1_555 LG MG CLA . F CLA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? 
metalc ? metalc22 K OD2 ASP 123 G ASP 123 1_555 SG MG CLA . G CLA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? 
metalc ? metalc23 O O LEU 72 K LEU 72 1_555 XG MG CLA . K CLA 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc24 O OD2 ASP 97 K ASP 97 1_555 YG MG CLA . K CLA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? 
#
_chem_comp.formula           'C55 H70 Mg N4 O6 2' 
_chem_comp.formula_weight    907.472 
_chem_comp.id                CHL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLOROPHYLL B' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
MG NA CHL sing 167 n n 
MG NB CHL sing 168 n n 
MG NC CHL sing 169 n n 
MG ND CHL sing 170 n n 
CHA C1A CHL sing 171 n n 
CHA C4D CHL doub 172 n n 
CHA CBD CHL sing 173 n n 
CHB C4A CHL doub 174 n n 
CHB C1B CHL sing 175 n n 
CHC C4B CHL sing 176 n n 
CHC C1C CHL doub 177 n n 
CHD C4C CHL sing 178 n n 
CHD C1D CHL doub 179 n n 
NA C1A CHL doub 180 n n 
NA C4A CHL sing 181 n n 
C1A C2A CHL sing 182 n n 
C2A C3A CHL sing 183 n n 
C2A CAA CHL sing 184 n n 
C3A C4A CHL sing 185 n n 
C3A CMA CHL sing 186 n n 
CAA CBA CHL sing 187 n n 
CBA CGA CHL sing 188 n n 
CGA O1A CHL doub 189 n n 
CGA O2A CHL sing 190 n n 
O2A C1 CHL sing 191 n n 
NB C1B CHL sing 192 n y 
NB C4B CHL sing 193 n y 
C1B C2B CHL doub 194 n y 
C2B C3B CHL sing 195 n y 
C2B CMB CHL sing 196 n n 
C3B C4B CHL doub 197 n y 
C3B CAB CHL sing 198 n n 
CAB CBB CHL doub 199 n n 
NC C1C CHL sing 200 n n 
NC C4C CHL doub 201 n n 
C1C C2C CHL sing 202 n n 
C2C C3C CHL doub 203 n n 
C2C CMC CHL sing 204 n n 
C3C C4C CHL sing 205 n n 
C3C CAC CHL sing 206 n n 
CMC OMC CHL doub 207 n n 
CAC CBC CHL sing 208 n n 
ND C1D CHL sing 209 n n 
ND C4D CHL sing 210 n n 
C1D C2D CHL sing 211 n n 
C2D C3D CHL doub 212 n n 
C2D CMD CHL sing 213 n n 
C3D C4D CHL sing 214 n n 
C3D CAD CHL sing 215 n n 
CAD OBD CHL doub 216 n n 
CAD CBD CHL sing 217 n n 
CBD CGD CHL sing 218 n n 
CGD O1D CHL doub 219 n n 
CGD O2D CHL sing 220 n n 
O2D CED CHL sing 221 n n 
C1 C2 CHL sing 222 n n 
C2 C3 CHL doub 223 e n 
C3 C4 CHL sing 224 n n 
C3 C5 CHL sing 225 n n 
C5 C6 CHL sing 226 n n 
C6 C7 CHL sing 227 n n 
C7 C8 CHL sing 228 n n 
C8 C9 CHL sing 229 n n 
C8 C10 CHL sing 230 n n 
C10 C11 CHL sing 231 n n 
C11 C12 CHL sing 232 n n 
C12 C13 CHL sing 233 n n 
C13 C14 CHL sing 234 n n 
C13 C15 CHL sing 235 n n 
C15 C16 CHL sing 236 n n 
C16 C17 CHL sing 237 n n 
C17 C18 CHL sing 238 n n 
C18 C19 CHL sing 239 n n 
C18 C20 CHL sing 240 n n 
CHB H1 CHL sing 241 n n 
CHC H2 CHL sing 242 n n 
CHD H3 CHL sing 243 n n 
CMA H4 CHL sing 244 n n 
CMA H5 CHL sing 245 n n 
CMA H6 CHL sing 246 n n 
CAA H7 CHL sing 247 n n 
CAA H8 CHL sing 248 n n 
CBA H9 CHL sing 249 n n 
CBA H10 CHL sing 250 n n 
CMB H11 CHL sing 251 n n 
CMB H12 CHL sing 252 n n 
CMB H13 CHL sing 253 n n 
CAB H14 CHL sing 254 n n 
CBB H15 CHL sing 255 n n 
CBB H16 CHL sing 256 n n 
CMC H17 CHL sing 257 n n 
CAC H18 CHL sing 258 n n 
CAC H19 CHL sing 259 n n 
CBC H20 CHL sing 260 n n 
CBC H21 CHL sing 261 n n 
CBC H22 CHL sing 262 n n 
CMD H23 CHL sing 263 n n 
CMD H24 CHL sing 264 n n 
CMD H25 CHL sing 265 n n 
CBD H26 CHL sing 266 n n 
CED H27 CHL sing 267 n n 
CED H28 CHL sing 268 n n 
CED H29 CHL sing 269 n n 
C1 H30 CHL sing 270 n n 
C1 H31 CHL sing 271 n n 
C2 H32 CHL sing 272 n n 
C4 H33 CHL sing 273 n n 
C4 H34 CHL sing 274 n n 
C4 H35 CHL sing 275 n n 
C5 H36 CHL sing 276 n n 
C5 H37 CHL sing 277 n n 
C6 H38 CHL sing 278 n n 
C6 H39 CHL sing 279 n n 
C7 H40 CHL sing 280 n n 
C7 H41 CHL sing 281 n n 
C8 H42 CHL sing 282 n n 
C9 H43 CHL sing 283 n n 
C9 H44 CHL sing 284 n n 
C9 H45 CHL sing 285 n n 
C10 H46 CHL sing 286 n n 
C10 H47 CHL sing 287 n n 
C11 H48 CHL sing 288 n n 
C11 H49 CHL sing 289 n n 
C12 H50 CHL sing 290 n n 
C12 H51 CHL sing 291 n n 
C13 H52 CHL sing 292 n n 
C14 H53 CHL sing 293 n n 
C14 H54 CHL sing 294 n n 
C14 H55 CHL sing 295 n n 
C15 H56 CHL sing 296 n n 
C16 H57 CHL sing 297 n n 
C17 H58 CHL sing 298 n n 
C17 H59 CHL sing 299 n n 
C18 H60 CHL sing 300 n n 
C19 H61 CHL sing 301 n n 
C19 H62 CHL sing 302 n n 
C19 H63 CHL sing 303 n n 
C20 H64 CHL sing 304 n n 
C20 H65 CHL sing 305 n n 
C20 H66 CHL sing 306 n n 
C2A H67 CHL sing 307 n n 
C3A H68 CHL sing 308 n n 
C15 H69 CHL sing 309 n n 
C16 H70 CHL sing 310 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8J7B 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Q 17 CHL 1 1 601 601 CHL CHL . 
R 18 CLA 1 1 602 602 CLA CLA . 
S 18 CLA 1 1 603 603 CLA CLA . 
T 18 CLA 1 1 604 604 CLA CLA . 
U 18 CLA 1 1 605 605 CLA CLA . 
V 17 CHL 1 1 606 606 CHL CHL . 
W 18 CLA 1 1 607 607 CLA CLA . 
X 18 CLA 1 1 608 608 CLA CLA . 
Y 18 CLA 1 1 609 609 CLA CLA . 
Z 18 CLA 1 1 610 610 CLA CLA . 
AA 18 CLA 1 1 611 611 CLA CLA . 
BA 18 CLA 1 1 612 612 CLA CLA . 
CA 18 CLA 1 1 613 613 CLA CLA . 
DA 19 XAT 1 1 614 614 XAT XAT . 
EA 20 LHG 1 1 615 615 LHG LHG . 
FA 21 LUT 1 1 616 616 LUT LUT . 
GA 17 CHL 2 1 605 605 CHL CHL . 
HA 17 CHL 2 1 615 615 CHL CHL . 
IA 18 CLA 2 1 611 611 CLA CLA . 
JA 17 CHL 2 1 601 601 CHL CHL . 
KA 21 LUT 2 1 616 616 LUT LUT . 
LA 18 CLA 2 1 612 612 CLA CLA . 
MA 21 LUT 2 1 619 619 LUT LUT . 
NA 17 CHL 2 1 606 606 CHL CHL . 
OA 18 CLA 2 1 609 609 CLA CLA . 
PA 18 CLA 2 1 602 602 CLA CLA . 
QA 17 CHL 2 1 607 607 CHL CHL . 
RA 18 CLA 2 1 604 604 CLA CLA . 
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